Arcobacter venerupis: AVENP_0729
Help
Entry
AVENP_0729 CDS
T06858
Name
(GenBank) OmpA domain-containing protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
avp
Arcobacter venerupis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
avp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
avp02000
]
AVENP_0729
Transporters [BR:
avp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AVENP_0729
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
OMP_b-brl
OprF
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF66298
UniProt:
A0AAE7B6L5
LinkDB
All DBs
Position
complement(750594..751655)
Genome browser
AA seq
353 aa
AA seq
DB search
MRRILIISILSISMSFATSNPSKEYSYEVTPFVSGILTDSKAGLNDDNYFNGGISVGKNI
DDSFINQIEVNYLRSNRVKYKDSAGNTHLNRIFLNAIKIFPLNERLSAYTLAGLGYQNVT
NEAFDNEDSTVLNYGAGLKYDIPYYGISIKGDVRHLLAVKNTQNDLMYTIGLAMPLGKKY
SDDIKPIVPIVVEEKKELKETHQKIEEPVVVIQDDDNDGVSNKLDKCPNTSKGVKVNAVG
CVDTINLNINFDNNSTEIKNIYNDKLLSFANILQKNKNLTAVIEAHTDAKGSDSYNQTLS
DRRAISVVNALKTFNIDSSRLRAVGYGETQPIDTNDTPEGKAKNRRVTALINQ
NT seq
1062 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagaattctaataatctcaattttatctatttctatgtcttttgctactagtaat
ccaagtaaagaatatagttatgaagttactccttttgtatcaggaattttgactgatagt
aaagctggattaaatgatgacaactattttaatggtggtatctctgttggtaaaaatata
gatgattcatttattaatcaaatagaagtaaattatttaagaagtaatagagttaaatat
aaagattctgctggaaatacacatttaaatagaatatttttaaatgctataaaaatattc
cctctaaatgaaagactttcagcttatacccttgcagggttaggatatcaaaatgttaca
aatgaagcttttgataatgaagattcaactgtattaaattatggtgcaggtttaaaatat
gatataccatattatggaatttcaataaaaggtgatgttagacatttacttgctgtaaaa
aatacgcaaaatgaccttatgtacacaatagggttagccatgcctttaggtaaaaaatat
agtgatgatattaagcccattgttcctattgttgtagaagaaaaaaaagagcttaaagaa
actcatcaaaaaattgaagaacctgttgtagtaatacaagatgatgataatgatggagta
tctaataaattagataaatgtcctaatacatcaaaaggggtaaaagtcaatgcagttggg
tgtgttgatacaattaatttaaatataaattttgacaataattcaactgaaattaaaaat
atatataatgataaacttctatcatttgcaaatattttacaaaaaaataagaatttaaca
gctgtaattgaagcacatacagatgcaaaaggaagtgattcttataatcaaactttatca
gatagaagagctatttctgttgttaatgcattaaaaacatttaatattgactcaagtaga
ctaagagctgttggatatggtgagactcaaccaattgatacaaatgatacacctgaggga
aaagctaaaaatagaagagttacggctttaattaatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system