Arcobacter venerupis: AVENP_2005
Help
Entry
AVENP_2005 CDS
T06858
Name
(GenBank) DUF3584 domain-containing protein
Organism
avp
Arcobacter venerupis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3584
AAA_29
AAA_23
AAA_15
ABC_tran
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF67546
LinkDB
All DBs
Position
complement(2017949..2021647)
Genome browser
AA seq
1232 aa
AA seq
DB search
MNYNKLGLKEIRFINSGHFPNESIIIDDFTLLLGSSGVGKTTVMSAICYFYTMDKSKTRP
LEKELSFYDWHLKGIYAHLIYIYENSIGRNALILSKDDGKVKHTFINIHNYEEDLSTLYL
DSDKRCLSLKEILANCVKKSLTYYKSETVATFRKMMCRKSYRMLPNKDKPELDFSFYDSE
ESANIFGKYLFNIYSNSSVRDKGIKDMLISLIGEKEYFLDISDFKSKLADALTNVAHFEL
IKDRRERILRLDDTVISYKALCDEIDNITFELETISYNKDRIKTVISDNHLDLLTHQKIK
SDKKDELSKEWKIKSSTYSTQISDLNIEIKTNKETYNNFHEKYRIENLITQQDRQSEFEK
KLNELNIKVSAISSDIKELESKEEIEKQKANSLINEKKDNEKKELDSKKDNLTTEILKLS
KDKEIEIEEGLSSYDKELEVKNSEYYQLDKKISQDETALSYLPKQVLENSNTKKFKDEIE
RLSNFKNSIESQVLILEKEKDNLENEKNIKLKETNDKIQSEVSEYIKIKNDIQLKIDELN
VKLDLGKNNLFGFLNKNKVPNKTKILALCSDEVLFKETKLKFSIETSNDTFYGLKIDGDV
ESLATKYEIEILENNKASFQKQRDELVAKHNIKYKNFQDNLKDISNKYQKLIQEKSRATY
ELTPKVKDNEIKISNERKRLEEEIIRLKDELDKNIIDKKEHLKKDKEQLTSLKEYLTNIK
ANKLNFISEINKKYSSEDFRLNTEVIKCQQNINSINKKYKEQIEDSDKRIHEIYNEIKKN
ENINTEELESFQRTIKELEKSIKDINNNRALVTRYKDEVLPKYNKIPFLKEQYAQIIKQR
DNDRDYFEKEIAVLDEKLNEIEKNIDIWKSYAESFKTFELEISEANPNKTYEAYCDDEIK
LLLNSKKNIKILERFKTLINQQSEKEKTIILETGKIIDGIPSDNMMKLKTKFDINSFEDN
IDQYIVIAKSYADFIKTKFDIEGTSLQLHRLIEAINDAVSKISHIKGTFNSIVKDVNKIN
LTIKKGIENITVIDYIKLNFKDTGRDEIVTSIENIGDMLSANMLIGYENSHRSEQVKNEL
VKIAHDLQIVLDKTFKKNITVADISTLTFDVSENAQVTKGIATLDSVGSNGTSIMIKAII
YITLLRMVANKFTNSEDMKYHCIIDEIGQISADYFTELMKYARHLEFVFINGTAANDDDI
IEAYPRIYMGTRESSNHVELNLIDARNAMENW
NT seq
3699 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattataataagcttggattaaaagagatacgatttataaatagtggacatttccct
aatgaaagtataataattgatgattttacccttttacttggtagttcaggtgttgggaaa
acaactgttatgagtgctatttgttacttttatactatggataaatctaaaactagacca
cttgaaaaagaacttagtttttatgattggcatttaaaaggtatctatgctcatttgatt
tatatttatgaaaatagtattggaagaaatgcacttattttaagtaaagatgatggaaaa
gtaaaacatacatttatcaatattcacaattatgaagaagacctaagtactttatatcta
gattctgataaaagatgtttaagtttaaaagagattttagcaaattgtgtaaaaaaatct
ttgacatattataaaagtgaaacggtagcaacttttagaaaaatgatgtgtagaaaaagt
tatagaatgttaccaaataaagataaacctgaattagatttctctttttatgatagtgaa
gaatcggcaaatatctttggtaaatatctttttaatatctattcaaattcatcagttagg
gataaaggtatcaaagatatgcttatttcactaattggagaaaaagagtattttttagat
atttcagatttcaaaagtaaattagcagatgctttaacaaatgtggctcattttgaacta
atcaaagatagaagagaaaggatattaagacttgatgatactgttatctcttataaggct
ttgtgtgatgaaatagacaatattacttttgaacttgagacgatttcttacaacaaagat
agaataaaaacagttataagtgataatcatttggatttattaactcatcaaaaaataaaa
agtgataaaaaagatgagctttcaaaagaatggaaaattaaatctagcacttacagtaca
caaatctcagatttaaatatagaaataaaaacaaataaagagacatataataattttcat
gaaaaatatagaatagaaaatttaataactcaacaagatagacaaagtgaatttgaaaaa
aagttaaatgaactaaatatcaaagtaagtgcaatatcaagtgatattaaagagttagaa
tcaaaagaagagatagaaaaacaaaaagctaattctttaataaatgagaaaaaagataat
gagaaaaaagagttagactctaaaaaagataatttaactactgaaatattaaaactatca
aaagataaagagattgaaattgaagagggtttatcttcatatgataaagaacttgaagtt
aaaaatagtgaatattatcaattagataaaaaaatatctcaagatgaaacagcactttca
tatttgccaaaacaagtattagaaaatagcaatacaaaaaagttcaaagatgagattgaa
agattatctaattttaaaaactctattgaatcacaagttttaattttggagaaagaaaaa
gataatcttgaaaatgaaaagaatataaaattaaaagagaccaatgataagattcaaagt
gaagttagtgaatatattaaaatcaaaaatgacattcaattaaaaattgatgaactaaat
gtaaaactagatttagggaaaaacaatttatttggatttttaaataaaaacaaagttcct
aataaaacaaaaattttagctctttgtagtgatgaggttttatttaaagagacaaaatta
aaattttcaatagaaacaagtaatgatactttttatggtctaaaaattgacggtgatgtt
gaatccctagcaactaaatatgagattgaaatacttgaaaataataaagcatcttttcaa
aagcaacgagatgaattggtagctaaacataatattaagtataaaaattttcaagataat
ttaaaagatatatcaaataaataccaaaagttaatacaagaaaaatcaagagctacttat
gaattaactccaaaagttaaagataatgagataaaaatatctaatgaaagaaaaagacta
gaagaagaaataataagattaaaagatgaacttgataaaaatattattgataaaaaagag
catcttaaaaaagacaaagaacaattaacttctctaaaagagtatttaacaaatataaaa
gctaataagttaaattttatttcagaaatcaataaaaaatatagtagtgaagattttaga
ttaaatacagaagtaatcaagtgccaacaaaatataaatagtattaataaaaaatataaa
gaacaaatagaagattcggataaaagaatccatgaaatatacaatgaaatcaaaaaaaat
gaaaatattaatacagaagaacttgaatcctttcaaagaactattaaagaattagaaaaa
tctattaaagatattaataataatagagccttagttacaagatataaggatgaagtatta
ccaaaatataataaaattccttttttaaaggagcaatatgcccaaataatcaaacaaaga
gacaatgacagagattattttgaaaaagagattgcagttcttgatgaaaaactaaatgaa
atagaaaaaaatattgatatttggaaaagttatgctgaatcatttaaaacttttgaactt
gaaatttctgaagcaaatccaaataaaacatatgaagcttactgtgatgatgaaataaaa
ctattactgaatagtaaaaaaaatatcaagatacttgaaagatttaaaactcttataaat
caacaaagtgaaaaagaaaaaactatcatacttgaaactggaaaaataattgatggaatt
ccatctgataatatgatgaaattaaaaacgaaatttgacataaatagttttgaagataat
atagaccagtatattgtaatagccaaatcctatgcagattttattaaaacaaaatttgat
atagaaggaacgagcctacaattacaccgactaattgaggctataaatgatgctgtaagt
aaaatatctcatataaaagggacttttaatagtattgtaaaagatgtaaacaaaataaat
ctaacaatcaaaaaagggattgaaaatattacagtaattgattacataaaattaaatttt
aaagatacaggtagagatgaaatagtaacaagtatcgaaaatattggcgatatgttaagt
gctaatatgttgattggatatgaaaatagccatagatctgaacaagtaaaaaatgaactt
gtaaaaatagcccatgatttacaaatagttcttgataaaacattcaaaaaaaatattaca
gttgcagatattagtactttaacctttgatgttagtgaaaatgctcaagtaacaaaagga
attgcaacccttgatagtgtaggaagtaatggaacatctattatgataaaagccattatt
tatattactttacttcgtatggttgcaaacaaatttacaaatagtgaagatatgaaatat
cattgtattatcgatgaaatagggcaaatatcggcagattattttacagaattaatgaaa
tatgcaagacatttagagtttgtatttataaatggaacagctgctaatgatgatgatatt
atagaagcatatccaagaatatacatgggaacaagagagagctcaaatcatgtagaactt
aatttaatagatgcaagaaacgcaatggaaaattggtaa
DBGET
integrated database retrieval system