KEGG   Avibacterium volantium: NCTC3438_00391
Entry
NCTC3438_00391    CDS       T06626                                 
Name
(GenBank) Uncharacterized protein with a C-terminal OMP (outer membrane protein) domain
Organism
avt  Avibacterium volantium
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter LOR
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEB22331
UniProt: A0A3S4J840
LinkDB
Position
1:complement(388409..391798)
AA seq 1129 aa
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NT seq 3390 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system