Anabaena sp. WA102: AA650_11040
Help
Entry
AA650_11040 CDS
T04059
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
awa
Anabaena sp. WA102
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
awa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
awa02000
]
AA650_11040
Transporters [BR:
awa02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AA650_11040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALB40941
LinkDB
All DBs
Position
2553682..2559150
Genome browser
AA seq
1822 aa
AA seq
DB search
MSNSPSQNSRPGNSGINRLWWTIIGRAGLGIGALLLLGIIGGVWRLKGFVDHDLVPLATQ
GLTNTLNRPVKLGAVKSFSLTGVQFAASEIPATPTDPDRVNVKAVDVGFDIWKLVINRNL
RLDVTLINPDVYVEQDRQGSWLTTTIAPPTEAGLIKTDLDKLRFRDANLVLVPKVSEGAK
ISLPVPVGFSGVNGTAQLFLDKNRLIKLDLAGKAVSGGDITIVGDLIPEKTLVGDFRLKA
QNLLAADITRIVTLPLILQTGKVNGDLRIKVIPKQKTLLYGNAALEGVTVQIPNLPQLLN
NSQGNLSFDGLLIKLDHIVTNYGKIPLTASGTIDQQAGFNLKGRVNAVSLANAQTTLKVK
LPFPVSGIAQADLQIVGRVSQPVLSGNVRTLKIAQIDKVDFGQVSSKFELISSQSLLKIT
DIQGKTTYGGEVKGGGIIKLGKVSALNLQLQAENVPGDAIAQVYNIKTGFPIGLMTATAE
LKGVATNTQTVVKWQAPQAKYPATGTSIIHSDRTVSFSDIVAKVGGGIVTGSGNYSYDSK
RWQALTQASKIQLTSFVDQKQQENISLAGAEFNGRLRLSGNSSPFQIETIIPENANVNIA
GGTVNISQIQLNNQNFTALLQGKDLRLATIVKQANPILNNPLSGNFMITSNRENFSLKTF
SGIGEAFLYIGGRTIKAANIQVAEGRYQAKIQADNIPLTKLVGAQGLRPEMQGMITGQLQ
VAGSVESFQPETIQGEGKGYLTLPSGIVKASEIQLNNGHYQALLATSGLQLKPFNQQLKG
QLAGKLQVSGTLAAPTLADVAAVGQVRLSQGLSGMDAPIQADIGWNGEKLTIDGYNSANF
QANSSTALAIKGYLLANAKKSGIPEITDVNLNIQARNYSLEGLPVQLPDLVDIAGRLDFS
GQVTGKPTAPNITAKLGLRNLKVQELAFEPLLTGNLNSVSGQGLSLDVAGVKDRIAVNLD
GNNRPKSILVQWQQALLSGTATGSDWDINVTNFPLKALNIALPANTPLSPGGVRGLLTGN
LQINSQTWATTGNIAIEEPELGRIKGDRFATQLRYDNNTFILNNSELRKGESRYTFTANI
KPWAKKPQLRANINIDKGNIQDILTAAQIFDIQDFQRGLNPPIYGTAVDLTTQSQGLPLE
SLFNQIQRLSEINALLNSQKQKRLDTQPIPELRDLKGILNGDISINTATTDEPRIKFNLQ
GQNFTWGNPTEPSRFYRAEKIIAEGGFTEGTLRLQPLRIQSENKLIAFTGYVSGKTQSGK
LTVENFPIQRFNNLVKLPLGITGKLKLNAAIAGSIANPQATGELNITEGTIDKKPVESAN
ASFSYANGRLNFGSQVLGVGSEPANIDGSIPYTLPFASEKSDSDNVTLNVNIKNEGLTLL
NLFTNEIAFEKGQGELDLKVRGTRKQPFVKGTASLDNATFSAQALPGKLTNVNGKAIFDL
TRVFIKSLEGKFSNGKVEAVGELPIANSKNVQIDIPLMVNLRQLSLNLKDLYQGGANGDL
TITGSLLQPIISGNIELFNGQVLLAESKDENSSSAKINDLNKLDTAGKITKLNDLKLRLG
KNIQISKPPVFKFQASGDLTVNGSLAEPIPDGPIKLTKGTVNLFTTQLNLAKGYPQTATF
SPRQPRDPDLNIRLFAKVLDITQNSDLSRQGSLGLAGLETVRVEASINGLASQINDNLQL
KSNPSRSETQIVTLLGGGFVDNQGRGDSTLGLINIAGSAVFSNFQGAFNEIGDAFGLSEL
RIFPTILSERPEAGRNNSSLELALEAGIDISAKFSLSTIKILTANDPLQWGVNYRINNQF
RVRSSTNLTDDSRAVIEFERKF
NT seq
5469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaactctcctagtcaaaattctcgccccggtaattctgggattaatcgcctatgg
tggacgataattggtcgtgctggcttaggtataggtgctttgttattattaggaattatt
ggtggtgtttggcgattaaagggttttgttgatcatgatttagtaccattagcaacccaa
ggtcttactaatactctcaatcgtccagtaaaattgggagcagttaaatccttttccctg
actggtgttcagtttgccgcttcggagattcccgctacaccgacagatccagatcgggta
aatgtcaaagcagtagatgtaggatttgatatttggaagttagttattaaccgcaatctt
cgattagatgtaactttaattaatccagatgtttatgttgagcaggataggcagggaagc
tggttaacgactactatcgctccacctacggaggcaggactgattaaaaccgatttagat
aaattgcggtttcgggatgcaaatttggtattagtgccgaaagttagtgaaggggcaaaa
atttctttaccagtccctgtgggattttctggggttaatggcacggctcaactcttctta
gataaaaatcgcctaattaaattagacttggctggtaaggctgtcagtgggggtgatatt
accattgttggcgatttaattcctgagaaaactttagttggggattttcgacttaaagct
caaaatcttcttgccgcagatattacccggattgtaactttaccactgattttacagact
ggtaaggttaatggtgatttgcgaattaaggtgataccaaagcagaaaaccttactttat
ggcaatgcggctctagaaggggtgacggtgcaaattcccaatctgccccaattgctcaat
aatagtcagggaaatctcagttttgatggactgttaattaaattagatcatatagttaca
aattatggaaagattccgttaacagcatcgggtactattgatcagcaagcagggtttaat
ttaaaagggcgtgtaaatgcggtaagtttagctaatgcccaaacaacgctaaaggtaaag
ttaccatttccggtgagtggtatagctcaagccgatttacagatagtggggagagtttcc
caacctgtattgtctggtaatgtgaggacgttaaaaattgcccaaattgataaagttgat
tttgggcaagttagcagtaaatttgagcttattagtagtcaatctcttctgaaaattaca
gatattcaaggtaaaactacctatggcggcgaggttaagggtggggggataattaaactt
ggtaaagtatcggcgctgaacttgcaattacaagcggaaaatgtgcctggggatgcgatc
gctcaagtatataatatcaaaacaggcttccccattggcctgatgacagctaccgcggaa
ttgaagggtgtggctactaatacccaaactgtagttaaatggcaagctcctcaagccaaa
tacccggcaacagggacaagtattattcatagcgatcgcacagtttcctttagtgatata
gttgccaaggttggcggcggtatagttactggtagtggtaattatagttatgatagcaag
cgttggcaagctttaactcaagctagtaaaatccaattaacatcttttgttgaccaaaaa
cagcaggaaaatatttctctagctggggcagaatttaacggtaggttgcgtttatcagga
aattcctcgccatttcaaatagaaacaattattcctgaaaatgccaatgtcaacattgca
ggtggcacagtcaatatttcccaaatccaattaaataaccaaaattttaccgctttgttg
caaggaaaagacttacggttagcaacaattgttaaacaagctaacccaattttaaataat
cccctatcaggtaattttatgattaccagtaacagggaaaatttcagtctaaaaaccttt
tctggaatcggtgaagcctttctatatattggtggaaggacaattaaagctgctaatatt
caagtagcagaaggtcgctatcaggcgaaaattcaagctgataatatacctttaacaaaa
ctcgtaggggcgcagggcctgcgcccagaaatgcagggaatgatcactggtcaattgcaa
gtagcgggttcggtagaatcattccaaccagaaactattcaaggagaagggaaaggctat
ttaacattacctagtggtatagttaaagcttccgagattcaactgaataatggccattat
caagccttgttagctacttcaggtttgcaattaaagccttttaatcagcagttaaaagga
cagttggcaggaaagttgcaagtatcgggaactctagctgctcccacattagcagatgta
gctgctgttggtcaggtgcggttgagtcaaggtttatcaggtatggatgcacctattcaa
gctgatattggttggaatggagaaaagctaactattgatggttataatagtgccaatttt
caagctaatagttcaacggcgctcgctataaaaggttatttattagctaatgctaagaaa
tcgggtattccagaaattactgatgttaatttgaatatccaggcaagaaactatagtctg
gaaggattgccagtgcaactacctgatcttgttgatattgctggcagattggattttagc
ggacaggtgacgggaaaacctaccgctccaaatattacagctaagttagggttacggaat
ttaaaagttcaggaattggcttttgagccattattgactggtaatttaaattctgtgtca
ggacaggggttgagtttagatgttgctggtgtgaaagaccgcatagcagttaatttagat
ggtaataatcgcccaaaatccattttagttcagtggcaacaagcattgttatcaggtaca
gcaacaggatctgattgggatataaatgtgactaattttcctttaaaagctttgaatata
gctttaccagcaaatactcctttaagtccaggaggagtgagaggattattaacagggaat
ttgcaaattaattcgcagacatgggctacaacgggaaatatagccattgaagaaccggaa
ctggggagaattaaaggcgatcgctttgcaactcaactgcgatacgataataataccttc
atcctcaataacagcgaacttcgcaaaggtgaaagtagatatacctttactgccaacatc
aaaccctgggcaaaaaaaccgcaactgcgagcaaatatcaacattgacaaaggcaatatt
caagacattctcaccgcagcacaaatctttgatattcaagacttccagcgggggttaaac
ccacctatctacggcacggctgtggatttaaccacccaatctcaaggcttaccattagag
tctctatttaaccaaatacaacgattatcagaaattaatgccctactaaatagccaaaaa
caaaaacgattagatactcaacctatcccagaattaagagacttaaaggggattttgaat
ggtgacatttccattaatactgccacaacggatgaaccaagaataaaatttaacctccaa
ggacaaaattttacctgggggaacccaacagaaccaagtcgcttttatcgggcagaaaaa
atcatagctgaaggtggttttacagaaggaactttgcggttacaacctttacgaattcaa
tcggaaaacaagttaattgcctttacaggttacgttagtggtaaaacccaatcaggtaaa
ttaacagttgaaaactttcccattcagcgatttaataatttagtgaaactgccgctggga
attacaggtaagctaaaacttaacgcagccatagcaggtagtattgccaatcctcaagct
acaggagaattaaacattacagaaggaacaattgataaaaaaccagtggaatcagctaat
gctagtttcagttatgctaatggacgtttaaactttggtagtcaggtactaggagtgggg
tctgaacctgcaaatattgatggtagtattccctatactttaccctttgcttctgaaaaa
tcggacagtgacaacgttactttaaatgtcaatatcaaaaatgaagggttgacactttta
aatctctttactaatgagatagcttttgaaaagggacaaggagaattagatttaaaagtt
cgaggaactagaaaacaacctttcgtgaaaggaactgcttctcttgataatgctaccttt
agcgcccaagccttaccaggaaagttaactaatgtgaatggtaaagcaatttttgattta
actcgtgtgtttattaaaagtcttgaaggtaaatttagcaatggtaaagtggaagctgtg
ggagaattgccaattgctaatagtaaaaatgtgcaaatagatattcccttgatggttaat
ttaagacaattatctttaaatctcaaagatttatatcaaggaggtgctaatggtgattta
acaattactggttctcttctccaaccaataattagcggtaatatagaattattcaatggt
caagtattgttagcagaatctaaagatgaaaattcatcatctgcaaaaattaatgacctt
aataaactagatacagcgggtaaaattactaagttaaatgatttaaaattaagattagga
aaaaatatccaaatttctaaaccaccagtgttcaagttccaagcttctggagatctaact
gtgaatggttctttagctgaacccataccagatggacctattaagttaaccaaaggtaca
gtaaacttatttactacccagttaaatttagcaaaaggttatccacaaactgctactttt
agtcctcgtcaaccccgtgaccctgatttgaatattcgcctatttgcgaaggttttagac
ataactcaaaatagtgatttaagtagacaaggttctctaggtttagcagggttagaaact
gtgcgagtagaagctagtattaatggtttagctagtcaaattaatgataatttgcaatta
aaaagtaatccttcccgttcagaaacacaaattgtcaccttgctaggaggcggatttgtt
gacaatcaaggacgtggtgatagtaccctgggtttaattaatattgccggttcggctgtt
ttcagtaatttccaaggtgcatttaatgaaattggtgatgcttttggtttaagtgaattg
cgaatatttcccactattctatctgaaagaccagaagcagggagaaataactcatcttta
gaattagctttagaagcaggaattgatatttctgcaaaattctctctttctaccattaaa
atcctcacagcaaatgatcccttacaatggggggttaattaccgcataaataatcaattc
cgtgtccgttcttccactaatttaactgatgatagtcgggctgtaattgaatttgaaaga
aaattttga
DBGET
integrated database retrieval system
