Aliivibrio wodanis: AWOD_II_1083
Help
Entry
AWOD_II_1083 CDS
T03808
Name
(GenBank) TonB dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
awd
Aliivibrio wodanis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
awd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
awd02000
]
AWOD_II_1083
Transporters [BR:
awd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AWOD_II_1083
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
DEXQc_Suv3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CED57702
UniProt:
A0A090IB26
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1223699..1225783)
Genome browser
AA seq
694 aa
AA seq
DB search
MFSKSQLALVIGAVLSTPLAYAETDASTTDEHMVVTGRDYGYKADTNSTSMRMEATQLET
PGQVTVIDEQIIDEQRASTLGEVLKNDSSISEGSKSTNRERFYLRGFELSSSSSFLRDGV
QHWSHYRQPIELLERVEVVKGPAGLLYGKSTPGGLVNMISKKPTYETQVNLSQDIGSNNS
TRTMADISGALNEDKTLRARVVLSEEHKESWRTRFDGTAVETDRTVGGLFVDYDINDDIM
LSAHYDRTNEQGDLDNGSKVDTTTGEVIDPNTVKDQHWAETDNDVANYGLGLTANLTDSW
SVKTGISRQFYERQRTESDIHKDGSGYKSSDRHDEWTFDTAYVDFTGDVDALGVNHRLLV
GGNGLHYDYKREYDKTTSCTTGTDTCSEGFNRPDDLSSNNDTVGSHSKSQHYGIYLQDLV
TFNDSWQLLAGVRFAVDKTESSKGVKADYSNVLPKVGAIYHPAENGSIYAVYSESFEPVA
DINDEDDVNHGKEQDPQKGHLYELGTKWELLDNSLYVSGALFQIVQSNMQVSEDLKDGTD
RTRTSQVGEQVHTGIELAATGYVTEAFSLSASTTILDAKYENDPALEGKTPADVPEFSAS
IWSQYDFNNGTGINLGVYHVGERYYDSSNELKKDAYTRVDMGISHTIKYDENLDFVARFN
VENLLDTDYLAGGSASGVVVGEGRNYMATLQVKY
NT seq
2085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttctaaaagtcagttggctcttgttattggcgcagttttgtctacccctcttgct
tacgctgaaacagacgcatcaaccactgatgagcacatggtcgttactggtcgtgattac
ggttataaagcagacacaaactcaacgtcaatgcgtatggaagcaacgcaattagaaact
cctggacaagtaacggtgattgatgagcaaatcattgatgaacaacgtgcgagtacacta
ggtgaagtgttgaagaatgactcaagtatttcagaagggtctaaatcaacaaaccgtgaa
cgtttttatttacgtggttttgagctaagcagtagttcaagcttcttacgtgatggtgtt
caacactggtctcattatcgtcaaccaattgagttactagaacgagtcgaagtcgttaag
gggccagcaggtttactttacggtaaatcgacacctggtggcttagtgaatatgatctct
aaaaaaccaacgtatgaaacgcaagtaaatcttagccaagatatcggttcaaataattca
actcgtaccatggctgatattagtggtgcattgaatgaagataaaacattgcgtgcccgt
gttgttttatctgaagaacataaagagtcatggcgaactcgttttgatggtactgccgtt
gaaactgatcgtactgtcggtggtctgtttgttgattacgatattaatgacgacattatg
ttatctgcacactatgacagaactaatgagcaaggcgatttagataacggttcaaaagta
gataccacaacgggtgaagtcattgatccaaatacagtgaaggatcaacattgggctgaa
actgataacgatgtggctaactatggtctggggcttacagcgaacttgactgattcatgg
tctgttaaaacgggtattagtcgtcagttttatgagcgtcaacgtacagaatctgacata
cataaagatggtagtggctataaatcatcagatcgtcatgatgagtggacattcgatacc
gcttatgttgatttcacgggggatgttgatgctctaggtgttaaccaccgtttattagtt
ggtggtaatggtttgcattatgactacaagcgtgaatacgacaaaacaacatcatgtact
acaggtacagatacgtgtagtgagggttttaatcgcccagatgatttgagttcaaataat
gatactgttggttctcattcaaagagccaacattacggaatttatttacaagatttagtg
acatttaatgattcttggcaattacttgcaggggtacgctttgctgttgataaaactgaa
agtagcaagggtgtaaaagcagattactcaaatgttcttccaaaagtgggtgctatttat
catccagctgaaaacggttctatttatgccgtgtactctgaaagctttgagccagtggca
gatattaacgatgaagatgatgttaaccacggtaaagaacaagatcctcaaaaaggtcac
ttatacgagttgggtacaaaatgggaattattagataacagcctatatgtatcaggtgct
ttattccaaattgtacaatcgaatatgcaagtatctgaagacttaaaggatggaacagat
cgtacaagaacatcacaagttggtgagcaagttcatacaggtattgagttagcagcaaca
ggctatgtaacggaagcgttctcattaagtgcatcaaccactattctcgatgctaaatat
gaaaatgatccagcgctagaaggtaaaacacctgcagatgtacctgagtttagtgcaagc
atttggtcgcagtatgatttcaacaatggcacagggattaaccttggtgtttaccatgta
ggtgagcgttactatgattcttcaaacgagcttaagaaagacgcatatacacgagttgat
atgggtatttctcatactattaaatatgacgagaacttagattttgttgctcgattcaat
gtggaaaacctattggataccgattatctagcaggtggtagtgcaagtggtgtggtggtt
ggtgaaggccgaaactacatggcgacactacaagttaaatactaa
DBGET
integrated database retrieval system
