Aliivibrio wodanis: AWOD_I_0149
Help
Entry
AWOD_I_0149 CDS
T03808
Symbol
rfaF
Name
(GenBank) ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II
KO
K02843
lipopolysaccharide heptosyltransferase II [EC:
2.4.99.24
]
Organism
awd
Aliivibrio wodanis
Pathway
awd00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
awd01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
awd00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
AWOD_I_0149 (rfaF)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
awd01005
]
AWOD_I_0149 (rfaF)
Enzymes [BR:
awd01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.24 lipopolysaccharide heptosyltransferase II
AWOD_I_0149 (rfaF)
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
awd01005
]
Core region
AWOD_I_0149 (rfaF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_transf_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CED70246
UniProt:
A0A090IIE2
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(170290..171360)
Genome browser
AA seq
356 aa
AA seq
DB search
MKILIIGPSWVGDMVMSQSLYITLKQQHPDAIIDVMAPAWCKPILDRMPEVNQAIEMPLG
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QKSVFNLAGDTSLIEAVDLLAACKTVVSNDSGLMHVAAAVGCHVVGVYGSTSPKYTPPLA
EKVDIVSTDIKCRPCFKRECEFKHLKCLTELNPQLVLDKISPKNISNESAIQVTSC
NT seq
1071 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaattttaattattggcccatcatgggttggcgacatggtgatgtctcaatcactg
tatatcacgcttaaacaacaacaccctgatgctattattgatgtgatggctcctgcgtgg
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agtcctaaaaatatttcgaatgaatctgcaattcaggttacttcatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
