Acetobacterium wieringae: CHL1_000870
Help
Entry
CHL1_000870 CDS
T08273
Name
(GenBank) leucine-rich repeat protein
Organism
awi
Acetobacterium wieringae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Y_Y_Y
K319L-like_PKD
PKD
Ig_Pom152
LRR_5
MtxA_IG-like
Ig_SIBA-E_2nd
EMP24_GP25L
SprB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URN85238
LinkDB
All DBs
Position
874635..880238
Genome browser
AA seq
1867 aa
AA seq
DB search
MKKRIKQGVSWILVFMMILTSMPLNVWAEDSGITTMETNGTFTWTTVDGGVEITAYSFAD
GGPTVEIPDTLGGKKVVGIGSNVFKGLAITSINFPDYLLYLKDGVFYDCDVLVEIELPST
LTAIYSTEGNPTFGNCSNLLRVSIPKSVTIMEGYGMFKDSLLVELYGESPSTAKDYAMEA
NPEIPFNVIEFLTVDEFLVSPDTEIGVGNPVTLTSAVSGGTGTIKYDFFWDLISYDGTES
TGTIAMDTASNAVNFPPTLAGTYTFYVRATDGSGKTALKAVSGYKVTNEPVIAENGFKAS
KVSPQYYDSEILLTVETVADTGSGTLNYRFYYTSGEVSQELGNSATPQATFTPSQPGIYN
LYVEVTDQQGLIAKSEMLNYTIVDDLAVKSFTASPDNSQAHAIGTEILLNAEGSGGKTAY
QYRFSALHEDGEEILIQDFSTAATANFTPTKAGYYDLILELKNGSGRIIEETIENFEIVP
VVALSAAKADGSPAYVWDEVSLTTNITGAKAGYVYSYYYTLGSDSTKIPIVSKVAETTQA
FNLPSAGNYQFYVEVYENDVMVASATSNTVTVLPKPEVTLKSDKTSPQNRNTTVKFTATA
SGGKGPYTYQFSCDRDGESVYKGVAMATNNFSLPLVEAGEFTVTVVASDANGIQTEAESL
VFIIQDNPLVQLTTDRDEESLHYAGDEVILQADVEGGTAPFTYHFYYKLGTKTVELTDPQ
VDGSAASISVTPSVAGTYTYLVEVTDQTGLKTTATKTGYKVLSAVATKSFVTDKLSGQNV
NTPIKLTANGSGGKTPYTYKFSYQLDGASPVELDQKALPTTNTVLFTPTQVGNYTLKVEI
TDDNGNGQTTTETIENYKIVNGPVIGEITAVNSNDPGAAIYVNDPILITAVLQEGTGTGS
IQYRFTIKNGSNVVKTVTQTDDNSFEFTPTTAGTYSVVVDVSDADQLIASRTLKNVVVLK
TLTAVLKTDKASGTSINSAIKLSASAAGGKSPYSYTFEWEDALGTTATIQEDSIVKTAVL
TFSNPENVGFYTLRVTVTDANGIKVVSELPNYQIKNPPIINEFSTNPVKGTPVYPGKEIT
LKADVAEGSGENALEYAFYVNGSTEKLPDNDGDPSDVIYTPLSGGSYTFEVVVSDGVSSV
RKKITGYKVNTGLEVTSLKASKTSGLIIGDTIRLTAAGKGGVSPYTYQFSYKIEDDEGHV
IKAQTDIDSANPSLKSIDFSLTEAGNYTFFVEITDKNGAVSLNTIEKTLALTVTDPPIIT
GLTVTDPEAEEPQPSLTSSYVKEAINLTATKKTGAGGDNLTYTFGYKVGSKSGTIDAANV
TGNVASFTPNIAGTYTFYVSAKDEDSGLTSETYTLSKFVVFRTFGVKSLKTNKPSGQDIN
TEIKLTATPDGGKAPFTYTFYQKLRENEADTIDEADYAACLIPSDKTKNYATFKPETEGT
YILLVKITDANGIASTESIDFDVYNPPVVSLTTNKTGLPVYAGDSVELTATVASNTGIGE
MSYLFYWTKGTVTEYMDTKSTADLRIANADFVPDQAGTYNLFVEVTDDNYATTTAKIGSF
KVLGNVGVKSLVVDKKTPQNVGTTIKLTATGIGGKTPYKYQFYYKLDSENDEDDVETWTK
IGSSTTSRYISYRPMKPGLYSFGVVVTDANNLISNIDGDGATLMEYQVIDPPIIRRFSVS
PTGKQYEGEDVTLTTSVTGGSGDYNYEFAYQRGSEEPVTITETADATPGIISFKLDEVGT
YQFFVKVTDNKNEDVTSNTTEKTIDSYAVIKKASIKDFLISKTSMALGSSVRLSATGQDG
IKPYFYQFSMKKEGDSEETIIRAFSTTYYYTYKPPTAGNYTFYVDIKDSKNETISRSEVT
NSLAVTE
NT seq
5604 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacgaatcaaacaaggggtaagctggatactggtatttatgatgatactgacc
tctatgccacttaacgtatgggccgaagacagtggaataacgacgatggagacgaatggc
acgttcacctggacgacagtggatggaggggtcgagatcaccgcgtattcctttgctgat
ggaggaccaacagtagaaatccccgacacgctgggtggcaaaaaggttgtgggtattggc
agcaacgtttttaagggcctggcaatcaccagcattaactttccggattacctcctttac
ctgaaagatggggtgttttacgattgtgatgtcctggttgaaatcgaactgccctctacc
ctgactgccatttattcaacagaaggaaacccgacctttggcaattgctcaaacttgcta
cgtgtcagcatcccaaaatccgtgacaatcatggaggggtacggcatgtttaaagacagc
ttattggtagaactttacggtgaatcaccctcaacggcaaaagactatgcaatggaagca
aatccggaaataccatttaacgttatcgaatttttgacagtggatgaatttctggtctca
cccgatactgaaattggagtgggtaatcccgttacgctaacgagcgcagtctctggtggt
accggaaccattaaatatgactttttctgggatctgatcagctatgatgggacggagtcg
acaggcacaattgcgatggacaccgcctcgaatgcagttaatttccccccgactttggcc
ggcacctataccttttatgtcagggcaaccgatggcagtggtaagacagcattaaaggct
gtaagtggttacaaggtaaccaatgaaccagtgattgccgaaaatggctttaaagccagc
aaggtctcgcctcagtattatgacagtgagattttgctgacggtagaaacagtcgccgat
accggcagcgggacgctaaattaccgtttctattataccagtggtgaggtttctcaggaa
cttggcaattcggcaacaccccaagccacctttactcccagtcaaccgggcatatataat
ctttatgtggaagtcactgatcaacaaggtttaatagctaaaagtgagatgttgaattat
accattgtggatgatctggctgtcaaatcgtttacggcatcaccggataattcgcaggcc
catgctatcgggacggagatcctattaaatgccgaaggttctggcgggaaaacggcctat
caatatcgtttctcggcactccatgaggatggcgaagaaattttgattcaggatttttca
accgcagcgacggccaactttactccgacaaaggccggctattacgatcttattctggaa
ctaaaaaacggcagtggtcgaattattgaagaaaccattgaaaattttgaaattgttccg
gtagtcgctttgtctgcggcaaaagctgatggcagtccagcgtatgtttgggatgaagtc
agcctgacaacgaacataaccggagccaaggcgggttatgtgtactcctactattatacc
cttggttcagattcgacaaaaatcccgattgtttccaaagtggccgaaacgacacaagct
ttcaatctgccatcagctggtaattaccagttctatgttgaagtgtatgaaaatgacgtt
atggtagccagtgccacatccaacacggttacagtattacctaaaccagaggtaaccctg
aaatcagataagacatcgccccagaaccgcaatacaaccgtaaaatttaccgcaacagca
agtggcggcaaggggccctatacctatcagtttagctgtgaccgtgacggagaaagtgta
tataagggcgtagccatggcaacgaacaattttagtctgccgttggttgaagccggggaa
tttaccgttactgtagttgccagcgatgccaatgggattcagacggaagcggaatcactt
gtttttatcattcaggataatccgctggttcagctaaccacagatcgtgatgaggaaagc
cttcattatgctggggatgaagtcatccttcaggcagatgtggagggtggtaccgcaccc
tttacgtatcatttttattataaattgggtaccaaaacagtggaactgaccgatcctcag
gttgatggcagtgcagcgtcgatcagtgtgacgccatcagtggccggcacctatacttat
ctagtcgaagtcaccgatcagaccggtttgaagacgacggcgacaaaaaccggctataag
gtcttgtcagcagtagccactaaaagctttgtgacggacaaattatctggtcagaatgtt
aataccccgatcaaattgacggccaatggcagtggtggcaaaacaccatacacttacaag
ttttcctatcaactagatggtgccagtccggttgaattagatcaaaaagcgctgccgaca
accaatacagtattattcacaccgactcaggttggtaactacaccctgaaagtagaaata
accgatgacaatggcaacgggcaaaccacgaccgagaccattgaaaactataaaattgtc
aatggtccagtgattggtgaaattactgcggtcaatagcaatgatcccggagcggcaata
tatgtcaatgatcccattctgatcaccgcagtattgcaggagggcaccggaacgggatcg
attcaatatcgttttaccatcaaaaatggatcgaatgtcgttaagacggtgacccagact
gatgataacagttttgaatttacgccgaccacggcaggaacctacagtgtggtcgtggat
gttagtgatgcggatcagttgatagcgagccgaaccctaaaaaatgtggtggtattaaaa
acgctgacagcagtgcttaaaacagataaagcttcgggaacatcaattaactcagccata
aaactgtcggcctcggcggctggcgggaaatcaccttattcttatacttttgaatgggaa
gatgctttgggcactacagcgaccattcaagaagattcgatcgttaaaacagcagtgctc
acctttagcaatccggaaaatgtgggcttctatacactgcgggtgacggtgactgatgcc
aatggaattaaagtcgtttcagaactgccgaactatcaaatcaagaatccaccgattatt
aatgaattttcgaccaaccctgtcaaagggacaccggtttatcctggaaaagaaatcact
ctaaaggctgatgtcgcagagggaagcggtgaaaatgcactggaatacgccttttatgtc
aatggcagcacagaaaagctcccggataacgatggtgatccatccgatgttatttataca
cctttgagcggtggttcctatacctttgaggtagttgtttctgatggcgtcagtagcgtc
aggaaaaaaataactggttataaggtcaacactggactggaagtcaccagtctaaaagcc
agtaaaaccagcggactgattatcggtgatacgattcgcttaacagcagccggtaaaggc
ggagtttcaccctacacctatcaattctcatataaaattgaagatgatgaaggccatgta
attaaagcgcaaaccgatattgattcggcaaacccttcattgaaaagtatcgatttttca
ttgactgaagctggaaactacaccttttttgtagaaattaccgataaaaacggggctgtc
agtttaaacaccattgaaaagacgctggcattgacagtaacagatccgccaattataacc
ggtttgacagtaacagatcctgaagcagaagaaccgcaacccagcttgaccagttcctat
gtaaaagaagcgattaacttaaccgccaccaaaaaaaccggtgccggcggcgacaatttg
acctataccttcggttacaaggttggttcaaaatcaggcaccatcgatgctgccaatgta
acaggaaatgtggccagtttcacaccgaacattgccggtacgtataccttttatgttagt
gccaaggatgaagattctggcttgacgagtgaaacgtataccctcagcaagtttgtggtt
tttagaaccttcggggtaaaaagtcttaaaaccaacaaaccgtcaggtcaggatattaac
accgaaattaagttgacagccactccagatggtggaaaagcaccatttacctatactttt
taccagaaactgcgagaaaatgaagcggatacaatcgatgaagctgattatgcagcatgt
ctgatcccgagcgataaaacaaagaattatgccaccttcaagccggaaacggaaggaacc
tatattctgttggtaaaaattaccgatgccaacgggattgcgtccaccgaaagcattgat
tttgatgtctataatccaccggtggtgagcttaacaaccaataaaaccggattgccggtt
tatgctggggactcggttgagctgaccgcaacggtggcttccaataccgggattggtgaa
atgagctatctcttctattggaccaagggaacagtgaccgaatacatggatacgaagtcc
acagcagatctccggatagcaaacgctgattttgtaccagatcaggcaggtacctataac
ctttttgtggaagtgacggatgacaattatgcaacgactacggcaaaaattggcagcttt
aaggtgctgggaaatgttggtgtcaagagtttggtggtggataagaaaacacctcagaat
gttggtacaacaattaaattgaccgccaccggaatcggtggaaaaactccttataagtat
cagttctattacaagctggatagcgaaaacgacgaagatgatgtagaaacatggacaaaa
attggttcatcgaccacatcccgatatatcagctatcggccaatgaagccgggactttat
tcctttggggtagtagttaccgatgccaataatctgatcagcaacattgatggcgatggc
gcaacattgatggaatatcaggtgattgatccaccgatcatccgacgtttttccgtgtcg
cctactggcaagcagtatgaaggagaagatgttacgttgacaaccagcgttactggcggt
agtggcgattataactatgaattcgcgtatcagcgggggagtgaagaaccggtgacgatt
accgaaacagccgatgcgacaccgggaatcattagctttaagctagacgaagtgggcacc
tatcaattcttcgttaaggtaaccgataataaaaatgaggatgtaacttcaaatactacc
gaaaaaaccatcgacagctacgccgtgattaaaaaagcttcgataaaagattttctcatc
agcaaaaccagcatggcattgggaagcagtgtccgactgtcggccactggacaagatggc
atcaaaccctatttctatcagttctccatgaaaaaagagggcgacagtgaagagacgatt
attcgagctttttcaacgacctactactacacctacaagccaccaacagcagggaattat
accttctatgtggatataaaagacagtaaaaatgaaacgatatcgcgaagtgaagtgacc
aactcacttgctgtaacagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
