Acetobacterium woodii: Awo_c05450
Help
Entry
Awo_c05450 CDS
T01732
Symbol
opuD1
Name
(GenBank) choline/carnitine/betaine transporter OpuD1
KO
K05020
glycine betaine transporter
Organism
awo
Acetobacterium woodii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
awo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
awo02000
]
Awo_c05450 (opuD1)
Transporters [BR:
awo02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Awo_c05450 (opuD1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
DUF2368
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFA47344
UniProt:
H6LIH0
LinkDB
All DBs
Position
627201..628805
Genome browser
AA seq
534 aa
AA seq
DB search
MNSQETVTKKWNPVLIISLIITLSIVAWGVFAPENFEEVGGFAFGLLTGSFGWFYTASVG
AFLLFSLWIGFSKYGNIKLGADDSKPEYSTTSWFAMLFSAGMGIGLIFWGVAEPLNHYLN
PLYVEPGTPAAAEFAIEKSFLHWALHPWACFAVMALALAFMQFRKNKKGLISSIFIPLVG
EKIVNGWFGKTIDILAVFATVAGVATSLGLGTMQINSGLNFLFGVPESKLIQIIIIVVVT
CLFILSAVSGIGRGIKILSNTNMVLAGAIVIIAFLVGPKVTTLSFLTEGIGNYFQSIVGE
TFAIGAFGDSEWYGGWTIFYWAWWIAWAPFVGSFIARISKGRTIREFVAGVLLVPSILTF
IWFSVFGSMGISLGPDIAAEAIKSTSTACFVVFSHYPMGILLSIVTLTLVCTFFITSADS
ATFVLGVFSSNGNLDPSNKIKVVWGILESSLALVLLVGTESGLSMLQSVSIVAAFPFAFV
MIGAMFAMVKLVRTDPGYEEATEKTGMPDFKDPVFPDIDIELSKLETKPALTEE
NT seq
1605 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcacaagaaacagtcacaaagaaatggaatccagtattgattatctcactgatc
attactttgtccattgttgcctggggtgtttttgctccggagaattttgaagaagttggg
ggttttgcttttggtttgctgaccggttcattcggttggttttataccgcttccgtaggc
gcatttttgctttttagcttatggattggattttcaaaatacggcaatattaaattaggt
gccgatgattccaaaccggaatatagcacaacttcgtggtttgcgatgttgttttcagcc
gggatgggaatcggactgatattctggggggtagccgaaccgctaaaccattatctcaat
cccttgtatgtggaacccggaaccccggcagcggcagagtttgcaattgaaaaatcgttt
ttacactgggcgctgcacccctgggcatgttttgctgtgatggcactggcattagctttt
atgcagtttagaaaaaacaaaaaaggattgatcagtagtatttttattcctttggttggt
gaaaaaattgtaaatggctggtttggaaaaaccatcgatattctggctgtttttgcaact
gttgccggcgttgccacttcgcttggtctgggaacgatgcagatcaatagtggactgaac
tttttgtttggggtaccggaatcgaaactcattcagattattattattgtggtagtaact
tgtttgtttatcttatcagcggtttccgggattggacggggaattaaaattctttcgaac
accaatatggttttggccggagctattgtaatcattgcttttctggtaggaccaaaagtt
accacgcttagctttttgaccgaagggattggtaattacttccagtcaattgtgggcgaa
acctttgctattggcgcttttggtgattcggaatggtatggcggctggacaatcttttat
tgggcgtggtggattgcctgggctccatttgttggttcttttattgcccgaatttctaaa
ggaagaacgatcagagaatttgtggccggggttttactggtaccatcgattttgacgttt
atctggttttcggtttttggaagcatggggatcagtttaggaccggatatcgccgccgaa
gcaatcaaatcaacatcgactgcttgttttgtagtattcagtcattatccaatgggtatt
ttgttgtcaatcgtaacactcactttggtatgtaccttttttattacttcagcagattca
gcaacctttgtattaggcgtttttagctcaaatggaaatttagatccttcaaataaaata
aaggtagtctggggtattttagaatcttcactggcgctggtgctattagttggaacagaa
agtggattatcgatgttacagagtgtttcaattgtggcagcgtttccttttgcctttgtc
atgattggagcgatgtttgcgatggtaaaactggtcagaactgatccgggatatgaggaa
gcaactgagaaaacagggatgccagattttaaagacccggtatttcccgatattgacatt
gagttgtcaaaactcgaaacaaaacctgctttgacagaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system