Acinetobacter wuhouensis: BEN71_05665
Help
Entry
BEN71_05665 CDS
T05823
Name
(GenBank) type I secretion C-terminal target domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
awu
Acinetobacter wuhouensis
Pathway
awu02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
awu00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
BEN71_05665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_12
Big_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXQ21593
LinkDB
All DBs
Position
1052226..1060217
Genome browser
AA seq
2663 aa
AA seq
DB search
MITGEDGLPLKDIDGNLVPAPSWTTPDGGITWTGKVPPNVDGEVTVKVPAKDANDNPTYT
DKTGNPGTGNDATVAVDTTPPGVKVEITPNGDIKVTFDPDVDPSTIDPNTDFVITGEDGL
PLKDIDGNPVDAPQFETTDGGITWTGKVPPNVESEIKVEVPAGTYTDKVGNPGKLGNSNI
GSDGQPDPEGEPVFVDTAPPGVKVEITPDGKITVTFDPDVDTNTISLDDIQVTLTDEKGE
PILDDDGRPVTIPLISTDGGIIWTGEVPPNLDGIVKVEVPENSYKDKTGNLGTGDDATVA
VDTTPPGVKIEITTDGDIKVTFDPDVDPSTIDPNTDFVITGEDGLPLKDIDGNLVPAPSW
TTPDGGITWTGKVPPNVDGEVTVKVPAKDANDNPIYTDKTGNPGTGNDATVAVDTTPPGV
KVEITPDGKITVTFDPDVDPSTIDPNTDFVITDGNAEPLKDKNGDLVPALSWTTPDGGIT
WTGKIPPNVESEVKVEVPADSYTDKVGNPGKLGNSNIDSEGQPDPEGEPVFVDTAPPSVK
VEIGTDGKITVTFDPDVDPSTIDPNTDFVITGEDGLPLKDKNGNPFTLEKTDDPLIWTGK
VPPNVDGEVTVKVPENSYKDKTGNLGTGDDATVPVDTTPPGVKVEITPDGKITVTFDPDV
DTDTISLDDIQVTLTDKEGKPILDKEGKPVTVPPLTSADGGITWTGKVPPNIDGKVNVEV
PAKDADGNPTYTDKTGNPGTGNDATVAVDTTPPTVTVEIEPETIKTVIISGVTSLELGDI
VTNGQIVEDSLIDNGDGTWTVKVKVNGDLEIKEIIGQPEATTEIKDSVIVSNNNGTNNST
VTFKFSETLKDGSFTEADIKVTGGTLVPNSLNYDPVTDTWTAEIKVTLGQEVTVEVRDQS
YEDLAGNKGSDGHDVLETIKITSVKPTEDGQSTEITVKSSQKPEDIILIVDGKPISIVEW
IDNGDGTYTFRTEGDVKGDKITATTTTTPTDDHPDGEQISDTVSLPFVSIDTIAFDDVIN
KAEWEDLTQGGDTITITGKISNSDPDTLTVTVNGETYTYDKNLTNNTVAINGDGTWSIQV
PKDSIKDTNHITAVATAEGGRSISNTAESDPIRDIKPPTVKVVVDEDGNITVTFDSDVDR
DSIKPETDIVITDKNSNPLKDKDGKLVTIKLEASEDGLTWTGKVPSNVEGGVKVEVPALG
EDGKPTYTDKAGNPGEPNRGENDINMVPPTVTVIVDKDGNITVTFDPDVDPSTIDPETDI
VITDKEGNPLKDQDGKPVEITLTPSEDHLTWTGKVPSNVEGGVKVEVPATDAEGNPTYTD
KAGNPGEPNSGGNDINMVPPGVTVVVDKNGNITVTFDPDVDPDTIDPDTGFVITDRDGNP
IEITLKPSEDGLTWTGKVPEDVEGKVTVEVPEGSYTDKAGNPGEPNSGGNDINMVPPTVT
VIVDKEGNITVTFDPDVDPDTIDPETDFVITDRDGNPIEITLKPSEDGLTWTGKVPEDVE
GKVTVEVPEGSYTDKAGNPGESNSDENDINMVPPTVIITLEESNLADPHIIIEFSEVPCG
ANGVPLTAEQVKDLLTTQGFNFDSGLVSKDGGLTWAAPITYTSGDAKADIANDTYFDAAK
NAGSGNGDILKAPEVISKEPTQTVKVTGGDDGNGSFSSSNSDKSSSSPSDSKAKKHNTYV
ELSADDLDTARIIINLTLVDNSFALLVNGQSIIDKGTNTNTPVFQLQAGDKVHGTNQIIL
QTADGKPFGDSNGTTPWNENANGLPRIQVVIDKDGIRFFASSSTSSSELIELFISDADKS
RINLPELIAGKNEISVWNHDGTGVDAIAGNVKVLTGEGFVISDEDGAEVSKAVIKVSGEL
QGALIIPVLPKGIKASWSKDGSELTLTATNGALSHKDFSDAINLLMFGVKKDQTVTDGER
TIEVTIYDEDGLKSSTATGTFDYKAGLGNIYVNQFDFTDPTVTTVSPAQADEGEDLVHTI
TLSKATTHDTEFSFKLGGGINDSATADDYGTPRFSNGVTYDATTGKITVPKGVDSFTVTY
TATTDNEVEGTETVTLEVGGVTGQGEITDALIVPENGVTATLVDLIELSGVYDDSLPGLS
EVYKDQNGNYDVYDTFSVNLGLSPEQKEQLAAGNIKVTVTGPNGEQIQVTVDKDGVITGK
ISDIGNLSGDDLKVSVSVETVGSSTPVVTEHPITVTPVENIKVIDYAQNIQTQIDDILAK
IKVDYIANGNPQPTYDGVFHKLYKAEVDKYLKEHGLNSEWDITDPSVKQSIREQVWNDNP
DLLFTAFQSEIENKVQGDMNGHSSKDDKISDIHVIDIDAYLALKALAPGFSNKLTLNIDG
PRDQASDWIIFDKPFDSSMFIIESKMTNNGKTNFFDNYGVIYKNPITGEPLSFMFNNIQG
VAFGDGTVITANADGVITSFKNFSMTLSSAMVGDDVDGKLLGGLKFSSSFIDSATETILV
SDQEKTIKPEIYLNGKLLVAEKGWYVLTDSQAAAFKTANFELTIKVPTQLYDDENDPFGS
AEDFKAQFEAFLNKEANLEALLVEPTAQASMMRMSMDYEDTSDIIFDLLNDDNTGGNTLT
TVEHFTSTDHINVSDLLDTNASLENINEYLTVSYDADADQAVISIDRDGTAGSYQSTELL
VLNNQTTDVTLKELLENNQIIIF
NT seq
7992 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgatcacgggtgaagatggcttaccattaaaagatatagatggtaatctagtgcctgct
ccatcatggactacaccagatggtggtattacgtggacaggtaaagtaccgccaaatgtc
gatggtgaagtcacagtaaaagtccctgcgaaagacgctaatgataatccaacttacact
gacaaaacaggcaatccaggtacaggtaatgatgctacagtagctgtagatacaacacct
ccaggtgtaaaagtagaaatcacgccaaacggtgatatcaaggttacatttgatccagat
gtagatccaagcacgattgatccaaatacagactttgtgatcacgggcgaagatggctta
ccattaaaagatatagatggtaatccagtggatgccccacaatttgaaaccacagatggt
ggtattacgtggacaggtaaagtaccgccaaatgtcgaaagtgaaattaaggtagaagta
ccagcaggcacttacacagataaagtaggtaaccctggtaagcttggtaactcaaatatt
ggttctgatggtcagccagatcctgaaggtgaacctgtttttgttgatacagctcctcca
ggtgtaaaagtagaaatcacgccagatggtaagatcacagtaacttttgatccagatgta
gatacaaatacaattagtttggatgatattcaggtcactttaactgatgaaaaaggtgag
ccaattctggatgatgatggtcgcccagtcactattccattaataagtacagatggtggc
attatttggacaggcgaagtaccgccaaatctcgatggtatcgtgaaggttgaagtccct
gagaatagctacaaagataaaacaggcaaccttggtacaggtgatgacgctacagtagct
gtggatacaacacctccaggtgtaaaaattgaaattactacagacggtgatatcaaggtt
acatttgatccagatgtagatccaagcacgattgatccaaatacagactttgtgatcacg
ggtgaagatggcttaccattaaaagatatagatggtaatctagtgcctgctccatcatgg
actacaccagatggtggtattacgtggacaggtaaagtaccgccaaatgtcgatggtgaa
gtcacagtaaaagtccctgcgaaagacgctaatgataatccaatttacactgacaaaaca
ggcaatccaggtacaggtaatgatgctacagtagctgtagatacaacacctccaggtgta
aaagtagaaatcacgccagatggtaagatcacagtcacatttgatccagatgtagatcca
agcacgattgatccaaatacagactttgtgatcacagatggaaatgctgaaccgttaaaa
gacaaaaatggcgatctagtgcctgctctatcatggactacaccagatggtggtattacg
tggacaggtaagataccgccaaatgttgaaagtgaagttaaggttgaagtaccagcagac
agttacacagataaagtaggtaaccctggtaagcttggtaattcaaatattgattctgaa
ggtcagccagatcctgaaggtgaacctgtttttgttgacacagctcctccgagtgtgaag
gttgaaattggcacagacggtaagatcactgtaacttttgatccagatgttgatccaagc
acgattgacccgaatacagactttgtgatcacgggcgaagatggcttaccattaaaagat
aaaaatggtaatccatttactttagaaaaaactgatgatccactgatttggacaggtaaa
gtgccgccaaatgtcgatggtgaagtcacagtaaaagtccccgagaatagctacaaagac
aaaacaggcaacttgggtacaggtgatgacgctacagtacctgtagatacaacacctcca
ggtgtaaaagtagaaatcacgccagatggtaagatcactgttacatttgatccagatgtg
gatacagatacaattagcttagatgatattcaggtcactttaacagataaagaaggcaag
ccaattcttgataaagaaggcaagccagtgactgttccaccactgacatcagcagatggt
ggtatcacttggacaggtaaagtaccgccaaatattgacggaaaagtaaacgtagaggtg
cctgcgaaagatgcagatggaaacccaacctacactgacaaaacaggcaatcctggtaca
ggtaatgacgctacagtagctgtagatacaactccaccgacagtgacagtagaaatcgaa
cctgaaacgattaaaaccgtcattatttcaggtgtcacttcacttgaacttggtgatatt
gtgacaaatggtcagattgttgaagatagtctaatagacaatggtgatggtacttggact
gtaaaagttaaagtcaatggtgatctagagatcaaggagattataggtcagccagaggcg
acgacagagattaaagacagcgttattgtttcaaataataatggtacaaataactctaca
gtgacatttaaattctcagaaacacttaaggatggcagttttacagaggcagatattaaa
gtcactggtggaactttagttccaaatagcctgaattatgatccagttactgatacttgg
acagctgaaatcaaggtaacacttggtcaagaagttactgttgaagtgagagatcagagc
tatgaagaccttgcaggaaataaaggatcagatggtcatgatgtcttagaaacgatcaaa
atcactagtgttaaaccgactgaagatggtcaaagcacagaaatcactgtgaaaagctct
cagaaaccagaagatattattttaatagtagatggtaagcctatcagtattgttgaatgg
atagacaatggggatggtacatatacctttagaacagagggcgatgttaagggggataaa
atcacagcgactacgactacaacaccaactgatgatcatcctgatggtgagcagatctca
gatacagtgagcttaccatttgtgagtattgacaccattgcatttgatgatgtgatcaat
aaagctgaatgggaagatttaacccaaggtggtgatacgattacgatcacagggaagatc
agtaactctgatccagatacactgacagtaactgtgaatggggagacgtatacctatgat
aaaaatcttactaataatacagtcgcaatcaatggcgatggtacatggtcaattcaagtg
cctaaagattcaattaaagacaccaatcatattacagcagtagcaacagctgaaggtggt
agatctatatcgaatacagctgaaagtgatccaatccgagatattaagccaccaacagtg
aaagttgtagtagatgaagacggtaacatcactgttacatttgactcagatgtagaccgt
gattcgattaaaccagaaactgacatcgtgatcacggacaaaaacagtaatccactcaaa
gataaagatggcaaactagttacgatcaagcttgaagcttcggaagatggtttgacttgg
acaggtaaagtgccatcaaatgttgaaggtggtgtaaaagttgaggttcctgcactaggt
gaggatggtaagccaacgtataccgacaaagcaggtaacccaggtgaaccaaatcgtggt
gagaatgacatcaatatggttccaccgacagtgacagttattgtagataaagacggtaac
atcacagtcacctttgatccggatgtggatccaagtacgattgatccagaaactgacatt
gtgatcacggataaagaaggcaatccactcaaagaccaagatggtaaaccagttgagatc
accttaacaccaagtgaagatcatttaacgtggacaggcaaagtgccatcaaatgttgaa
ggtggtgtgaaagttgaggttcctgcaacagatgctgagggtaacccaacttataccgac
aaagcgggtaacccaggtgaaccaaatagtggtggcaatgacatcaatatggttccacca
ggtgtgactgttgttgttgataaaaacggtaacatcacagtcacctttgaccctgatgtg
gatccagatacgattgatccagacacaggctttgtgatcacggatagagatggtaatccg
attgaaatcacacttaagccttcagaagatggtttaacgtggacaggtaaagtaccagaa
gacgttgaaggtaaagtgactgtagaagttcctgagggtagctataccgacaaagcgggt
aaccctggtgaaccaaatagtggtggcaatgacatcaatatggttccaccaacagtgacg
gttattgtagataaagaaggtaatatcacagtcacctttgaccctgatgtagatccagac
acgattgatccagaaacagactttgtgatcacggatagagatggtaatccgattgaaatc
acacttaaaccttcagaagatggtttaacgtggacaggtaaagtaccagaagacgttgaa
ggtaaagtgactgtggaagttcctgagggcagttataccgacaaagcgggtaacccaggc
gaatcaaatagtgatgagaatgacatcaatatggttccaccaacagtaataatcacactt
gaagaaagtaatttagctgacccacatatcatcattgagttcagtgaagttccttgtggt
gccaatggtgttcctttaacagctgaacaagtgaaagatttacttacaactcaaggattt
aactttgacagtggtttggtaagtaaggatggtggtttgacttgggctgcgcctattacc
tatacatctggcgatgcaaaagctgatatagcgaatgatacttattttgacgcagcaaaa
aatgctggttcaggaaatggtgatatattaaaagcgccagaagttatttctaaagaacca
acacagactgtgaaagttactggtggtgatgacggtaatggttcgtttagtagttctaat
tctgataagagttcaagctcacctagtgattcaaaagctaagaaacataatacatatgtt
gaattaagcgctgatgatcttgacacagcacggattattattaacttgacattggttgat
aactcatttgcattattggtaaatggtcaatcaatcattgataaaggaactaataccaat
acaccagtattccagttgcaagctggtgataaggtacatgggacaaatcagatcatattg
caaacggctgatggaaaaccatttggtgattctaatgggactacaccatggaatgaaaat
gccaatgggttacctcgtatccaagttgtgatagataaagatggtattcgtttctttgct
agttcatccacttcatcatctgagttaattgagttatttatttctgatgcagataaaagt
cgaattaatttaccagaattaattgctgggaagaatgagatttctgtctggaatcatgat
ggtacaggtgtagatgcgattgctgggaatgtaaaagttctgacaggtgagggttttgta
atatctgacgaagatggtgctgaggtatcaaaagctgttatcaaagtatctggcgagttg
caaggtgcacttatcataccagtcttgccaaaagggattaaagcttcatggagtaaggat
ggtagtgaattaaccctcactgcgacaaatggtgcattgtcacataaagatttctctgat
gcgatcaacttgctcatgtttggtgtgaaaaaagatcaaactgttacagatggtgagcgt
acgattgaagttacgatttatgatgaagatggtttaaaatctagtacagcgactggtact
tttgattataaagcaggcttaggtaatatttatgttaaccagtttgatttcactgatcca
actgttacaacagtttctccagctcaagcagatgagggtgaggatttagttcataccatc
acattgagtaaagccactacgcacgatactgaatttagctttaaattgggtggtgggatt
aatgatagtgcgaccgctgatgattatggaacaccacgctttagcaatggtgttacttat
gatgcaactacaggaaaaattactgtacctaagggcgtagatagtttcactgtgacctat
acagcgacaacagataatgaagttgaaggtactgaaactgtgacacttgaagttgggggt
gtgacaggacaaggtgaaattacggatgcactaatagttccagaaaacggtgtaacagca
actttagttgacttaattgaattgtctggtgtctatgatgactcattaccaggtttgtca
gaggtatataaagatcaaaacggtaattatgacgtttacgatactttctctgtcaatctt
ggattatcacctgagcaaaaagaacagttggcagctggaaatattaaggtgaccgtaact
ggcccgaatggtgagcaaattcaggttaccgtggataaagatggtgtaattactgggaaa
atttcagatattggtaatttatctggtgatgatcttaaagtttcagtcagtgttgaaacc
gtaggttcttcaacgccagttgtaacagagcatccaattactgtaacacctgtcgaaaat
attaaagttattgattatgctcagaatattcagacccaaattgatgatattttagcgaaa
attaaagtggattatattgcaaacggtaatccacaaccaacttacgatggtgtgtttcac
aagctatataaagctgaagttgataaatatttgaaagaacacggtttgaatagcgaatgg
gacattactgatccaagtgttaaacaatcaattcgtgaacaagtatggaatgataatcca
gatttattatttacagcgtttcaaagcgagattgaaaataaagttcagggtgatatgaat
ggacacagctcgaaagacgataagatatcagatattcatgttatcgatattgatgcatat
ctagcacttaaagcactagctccgggtttcagtaataagctaacattgaatatcgatggt
ccacgtgatcaagccagcgattggattatttttgataaaccatttgatagttcaatgttt
attattgaaagtaaaatgaccaataatggtaaaaccaacttctttgataattatggtgtt
atttataaaaatccgattactggtgagcctttgagctttatgtttaataacatacaaggt
gttgcgtttggtgatggtactgttattacagcaaatgctgatggagttattacatcattt
aaaaacttctcaatgacactttcatcagcgatggttggtgatgatgtcgatggtaaatta
ttgggtggtcttaaatttagttctagcttcattgatagtgcgaccgaaaccattttagtg
agtgatcaggaaaaaactattaagccagaaatttacttaaatggtaagcttttggtagcg
gaaaaaggatggtatgtccttactgattcacaagctgcggcatttaaaacagctaatttt
gagttaaccataaaagttccaactcaattgtatgatgatgaaaatgatccatttggtagt
gcggaagattttaaagctcaatttgaagcgttcttaaataaagaagctaatctagaagcg
ttattggttgaaccaacagcacaagcttctatgatgcgtatgtcaatggattatgaagac
acgagtgacatcatcttcgatctactcaacgatgacaacactggtggcaatacattaaca
acagtggagcacttcacatctacagatcatatcaatgtttcagacttgcttgacaccaat
gcaagccttgaaaacatcaatgaatacctcacagtaagttatgatgccgatgcagaccaa
gcagtgatttcgatcgaccgtgacggtacagcaggcagctatcaaagtactgaattgtta
gtgttgaataatcaaacaactgatgtaacgttgaaagaattattggaaaacaatcaaatc
atcattttctga
DBGET
integrated database retrieval system
