Bacterium AB1: AB837_00123
Help
Entry
AB837_00123 CDS
T04673
Symbol
rnjA
Name
(GenBank) Ribonuclease J1
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
baab
Bacterium AB1
Pathway
baab03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
AB837_00123 (rnjA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
baab03019
]
AB837_00123 (rnjA)
Messenger RNA biogenesis [BR:
baab03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
AB837_00123 (rnjA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
Lactamase_B_2
RMMBL
Lactamase_B
LAMTOR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOP70212
UniProt:
A0A1D7W9H0
LinkDB
All DBs
Position
107791..109404
Genome browser
AA seq
537 aa
AA seq
DB search
MTKFLNIYAMGGIEEIGANCTAYWNDDLCFFVDYGICLQNIDDITPYNGYYMDLVPFLKK
INQKTINIVITHCHEDHVGGIAYIHNQIKELKANNININIYVSSTFNQKVVIGKCHKSLN
EIKINIINASNNQYFYIGNVKLKFLKVDHSALECNGVLIEYQNKKIFHTGDWRFKYLIKN
LDQLSNSDTYQTMLKIKKCDIIVGESTKFNDINVANTEQDVENELSKIIQDLSKKQIDII
ITMFSSNMIRLKNIIKIAIKYEQKISYMSYTLKNYISISNQTNQFTSQEYSVLKHENSIE
KLLKSKNKIKIVSGCQNEYNSTLNKIAYNPKNAQFIKKGTTVIFSATAIPSSKKRIEHLH
RKLDDCGINVIDSDSNNFVHTSGHALPSDMYFMYKKLEPKYLIPIHGNILKIKSHVKLAQ
SLQIQPLMPKKNKYIQFIFQENNLTHKEFIIYFPIKKKYILDRKTFNEEDPVIQERKNLI
VGGAIFICKATNIIHCIGAKIGYKDTQTILLCLKNNKDANYIKTTIGFQGEIIISEN
NT seq
1614 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaatttttaaatatttatgcaatgggtggtatagaagaaatcggtgctaactgc
acagcatattggaatgatgatttgtgtttttttgtggattatggaatttgtttacaaaac
attgatgatattacgccatacaatggttattatatggatttagttccatttttgaaaaaa
ataaatcaaaaaacaattaatatagtcataactcattgtcatgaagatcatgttgggggt
attgcatatatacataatcaaataaaagaattaaaagctaataatattaatattaatatt
tatgtttcctcaacatttaatcaaaaagtagtaataggaaaatgtcataaatcattaaat
gaaattaaaattaatatcatcaatgcatctaataatcaatatttttatattgggaatgtt
aaattaaagtttttaaaagtagaccattctgctttagagtgtaatggagttttaattgaa
tatcaaaacaaaaaaatatttcatactggagattggagatttaaatatctaataaaaaat
ttagatcaattatctaattctgatacttatcaaacaatgttaaaaatcaaaaaatgtgat
attatagttggtgaaagtactaagtttaatgatataaacgtagcaaatacagaacaagat
gttgaaaatgaattaagtaaaattattcaagatttatcaaaaaaacaaatagatattatt
atcacaatgttttcttctaatatgataagattaaaaaatataattaaaatagctataaaa
tatgaacaaaaaatttcatacatgagctatacattaaaaaattatattagcatatctaat
caaactaatcaatttacatcacaagaatatagtgttttaaaacatgaaaacagtattgaa
aaactattaaaatcaaaaaacaaaattaaaattgttagtgggtgtcaaaacgaatataat
tctactttaaataaaattgcatataatcctaaaaacgcacaatttataaaaaaaggaaca
acagtaatattttcagcaactgctataccatcatcaaaaaaaagaattgagcacttacat
agaaaattagatgattgtggaattaatgttattgatagcgatagcaataactttgtacat
acatctggtcatgcattgcctagtgatatgtactttatgtacaaaaaattagaacctaaa
tacttaattccaatacatggtaatatattaaaaattaagtcacatgtcaaattagcacaa
tctttacaaattcaacctttaatgcctaaaaaaaataaatatatacaatttatattccaa
gaaaataatttgacacacaaagaatttattatatacttcccaatcaaaaagaaatacata
ctagatagaaaaacatttaatgaagaagacccagttatacaggaaagaaaaaacttaatt
gttggaggagcaatttttatatgtaaagcaacaaatataatacattgtataggagctaaa
ataggatataaagatactcaaacaattttattatgtctaaaaaataataaagatgctaat
tatataaaaacaacaataggttttcaaggagaaattataatttcagaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system