Bacterium AB1: AB837_00281
Help
Entry
AB837_00281 CDS
T04673
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
baab
Bacterium AB1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
baab03032
]
AB837_00281 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
baab03400
]
AB837_00281 (gyrA)
Enzymes [BR:
baab01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
AB837_00281 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
baab03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
AB837_00281 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
baab03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
AB837_00281 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Methyltransf_31
Dzip-like_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOP70361
LinkDB
All DBs
Position
complement(260769..263261)
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MNKKKQNSFLEKEDKEIFDIDFVEELSSSYAEYAISVISNRAIPDIRDGLKAVQRRIIYS
MYESNNTHNYRFRKCAYIIGLVSGKYHAHGEVAIYDTMVRMAQTFSTNMPLISSQGNFGS
IDGDEAAAQRYTEARLSQITSYIIDDLNYNIIEMSKTYDGSYYEPNYLPFKIPVSIINGN
SGIAVCFASCIPPHNPIEVIDALLHMIKKNNYEDTKTDEIMNFIPGPDFPVKCIVNSKNL
KELYETGKNIININAPLEYVEEINAIVITGIPYTIKKIKLIKSIYERMQTNDIVGISDIV
DESGENNINIKILLKPNQSHEVIIRRLYKYTDCSISLGCSFRFIANKKPQIIPLVECLVN
FLDNRTQIIKNRLQLEIISATKDIEKIIALFIVTKTKKIIDFIKRVLNNASIQETRQELK
KLTFDITEIAEYLPYNKEKINLKKFQLSALQIEYLLSTQIIKLNQEKTNELINVLKEKSS
IINKNKNYLNHPNNINSIIEEELTKCRKILKDCKRNCPIKDIELIKKDKNLYNEEHVIIL
LCPQNTILFKELKLFKTQKRGGKGKDVSIEYKVIKAIQCTTHEDILIFTKLGYAFKINTV
LLYYENKKINELISIKENDEIISLSKLNYSEENNIIVIVTEKGYIKKHGMKELIFAHKGG
KKIYNISNDDKICKILTGSSGSLVSLFTQCGRSITIELDEIRELSTYNTVGVIGIKLKNE
DLLQDAILTKKGEDLLIINSNGNGKIFSNDDIKINHRNTTGINFINKKHGQLISVTVLSK
EENNNILIITSSGKTIIFETIDIRTTKRLAKGVKLINLDDHDSIVFSSKI
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagaaaaaacaaaatagctttttagaaaaagaagataaagaaatttttgatata
gactttgtagaagagctttcttcatcatatgcagagtatgcaatatcagttatttctaat
agagctataccagacattagagatggattaaaagcagttcaaagaagaattatatatagt
atgtatgaaagcaataatacacataattatagatttagaaaatgtgcctatattattggt
ttagtaagtggtaaatatcatgcacacggagaagttgctatatatgatactatggtaaga
atggctcaaacattttctacaaatatgccattaattagtagtcaaggtaattttggttct
attgacggagatgaagcagcagcacaaagatatactgaagctagattatcacaaattaca
tcttatataatagatgatttaaattacaatattattgaaatgtctaaaacttatgacgga
tcgtactatgagccaaattatttaccttttaaaattccagtatctattattaatggaaac
tctggaattgctgtatgttttgcttcttgtataccaccacataatccaattgaagttatt
gatgctttattacatatgattaaaaaaaataactatgaagacactaaaacagatgaaata
atgaattttataccaggtcctgattttcctgtaaaatgtattgtcaattctaaaaattta
aaagaattatatgaaactggtaaaaatataattaatatcaatgcgccacttgagtatgta
gaagaaatcaacgcaattgttattactggaattccatatactataaaaaaaattaaatta
attaaatctatttatgaaagaatgcaaactaatgatatagtaggtattagtgatatagta
gatgaatctggtgaaaataatattaatataaaaatactattaaaaccaaaccaatctcac
gaagtaattattcgtagattatataaatatacagattgtagtatttcattaggatgctct
tttagatttatagctaataaaaagccacaaataattccactagtagaatgtttagtaaat
ttcttagataatagaacgcaaattattaaaaacagattacaattagaaattattagtgct
acaaaagatattgaaaaaattattgctttgtttattgtaactaaaacaaagaaaattata
gattttattaaacgtgttttaaacaatgcaagcatacaagaaacaagacaagaattaaaa
aaactaacatttgatattacggaaatagcagaatacttaccatataataaagaaaaaatt
aatttaaaaaaatttcaattaagtgcattacaaattgaatatttgctatctactcaaatt
attaaattaaatcaagaaaaaacaaatgaactaattaatgtattaaaagaaaagtctagt
atcattaataaaaataaaaactatttaaatcatcctaataatattaattcaataatagaa
gaagaattaacaaaatgtagaaaaatactaaaagactgcaaaagaaattgtccaattaaa
gatatagagttaatcaaaaaagacaagaacttatataatgaagaacatgttattatatta
ctatgtccacaaaacacaatattattcaaagaattaaaattatttaaaacacaaaaaaga
ggaggtaaaggaaaagacgtatctattgaatacaaagttataaaagctatacaatgtaca
acgcatgaagacatacttatatttacaaaactaggttatgcttttaaaattaatacagta
cttctatattatgaaaataaaaaaattaatgaactaattagtatcaaagaaaatgatgaa
attattagtttgtctaaattaaattattctgaagaaaacaatattattgttattgttaca
gaaaaaggatatattaaaaaacatggtatgaaagaactaatatttgctcataagggaggt
aagaaaatttataatatatctaatgatgataaaatatgtaaaatattaacaggttcatca
ggatctttagtatctctatttactcaatgtggaagatctattacaattgaactagatgaa
ataagggaactttcaacatataacacagttggagttattggtattaaattaaaaaacgaa
gacttattacaagatgcaatattaacaaaaaaaggagaagatttattaattatcaactca
aatggaaatggtaaaatattttctaatgatgatattaaaattaatcatagaaacacaaca
ggaattaacttcattaataaaaaacatggtcaattaattagtgtaacagtattatctaaa
gaagaaaataataatatactaattattacatctagtggtaaaactattatttttgaaaca
atagatataagaacaacaaaaagactagctaaaggtgtaaaattaattaatttagatgat
catgattctatagtattttcatctaaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
