KEGG   Bacterium AB1: AB837_00369
Entry
AB837_00369       CDS       T04673                                 
Symbol
rpoD
Name
(GenBank) RNA polymerase sigma factor RpoD
  KO
K03086  RNA polymerase primary sigma factor
Organism
baab  Bacterium AB1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:baab00001]
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   02040 Flagellar assembly
    AB837_00369 (rpoD)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:baab03021]
    AB837_00369 (rpoD)
Transcription machinery [BR:baab03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     AB837_00369 (rpoD)
SSDB
Motif
Pfam: Sigma70_r2 Sigma70_r4 BORCS7 Sigma70_ner Sigma70_r4_2 DUF4351 Cnd1 Sigma70_r3
Other DBs
NCBI-ProteinID: AOP70443
LinkDB
Position
346795..348072
AA seq 425 aa
MFSIPYIADLFVGHFHKTRGSIIHAKFVFELSKYVFQESALKEESDSDDLEEEDSSSDDM
AKDKSDDDDDLEVKKKKKNIFNDIKNIINLKIKNNINDIISLLRKLKNTSEEEEILILKQ
LEKIFGELYLSEQIIKEMYSIVIEKYNDVIKEEKPLEYIYGMRSKLFFNAIENIKKYYKS
MLFYTEKMILSNLRLVISVSKKYINKRIDFMDIVQEGNLGLIKAIKKFDYKRGYKFSTYA
TWWIKQSITRDIYDNYDVLRVPVHMKEHVSKVFKNINSLSDDLSYDERISAIVKQTNLDE
KKVKKVFKIQRGHVSLDKAALDGSSEDVVDYIDTNKSGMSPYQYMIIKDKRRIIDKLISN
LNEREKSIFNLRFLSQSKYDREMTLEMIGYLKGITRERVRQILHKIITKLVQNKNNAKYS
CVLNN
NT seq 1278 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtttagtataccatatatagctgacttatttgttggtcattttcataaaactagagga
agtattattcatgctaagtttgtttttgaattaagtaaatatgtatttcaagaatctgca
ttaaaagaagaaagtgatagtgatgatttagaagaagaagacagtagtagtgatgatatg
gcgaaagacaagtctgatgatgatgatgatttagaggttaaaaagaaaaagaaaaatatt
ttcaatgatattaaaaatataattaatttaaaaattaaaaataatattaatgatattatt
tcattattacgtaaattaaaaaatacatctgaagaagaagaaattttaattttaaaacaa
ttagaaaaaatttttggagagttatatttaagtgagcaaattattaaagaaatgtacagc
attgttattgaaaaatataatgatgttattaaagaagaaaaacctttagaatatatttat
ggaatgagatcaaaattattttttaatgctattgaaaatattaaaaaatattataaaagt
atgctcttttatacagagaaaatgattttatctaatttaagattagtaatttcagtatcc
aaaaagtatattaataaaagaattgattttatggatatagttcaagagggaaatctaggt
ttaattaaagcaattaaaaaatttgattataaaagaggttataaattttctacttatgct
acttggtggattaaacaatctattactcgtgatatatatgataattatgatgtattaaga
gttcctgttcacatgaaagaacatgtatctaaagtatttaaaaatattaactcattaagc
gatgatttaagttacgatgaaagaatttctgctattgtaaaacaaactaatttagatgaa
aagaaagttaaaaaggtttttaaaattcaaagaggtcatgttagtttagataaagctgca
ttagatggtagtagtgaagatgttgtagattatattgatacaaataaaagcggaatgtct
ccatatcaatatatgattattaaagataagcgtagaattattgataaattaattagtaat
ttaaacgaaagagaaaaaagtatttttaatttaagatttttaagtcaaagtaaatatgat
agagagatgactttagaaatgataggttatttaaaaggtattacaagagagagagtgaga
caaattttacataaaatcattactaaattagtacaaaataaaaataatgctaaatattct
tgtgttttaaataattaa

DBGET integrated database retrieval system