Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae): bbp_017
Help
Entry
bbp_017 CDS
T00111
Symbol
thdF
Name
(GenBank) putative tRNA modification GTPase trmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
bab
Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
bab03016
]
bbp_017 (thdF)
Transfer RNA biogenesis [BR:
bab03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
bbp_017 (thdF)
Prokaryotic type
Methyltransferases
bbp_017 (thdF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
G-alpha
MMR_HSR1_Xtn
nSTAND3
cobW
Roc
AAA_28
NOG1
TFX_C
ABC_ATPase
AAA_29
Ras
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAO26761
UniProt:
P59569
LinkDB
All DBs
Position
17419..18798
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MNVFNDTIVSRVTSEGKSSVGIIRISGKLAFEVSIKVLNRDYLPIRTACYLSFLDLSGKI
IDQGIVLWFPGPSSFTGEDVLELQGHGNPIIIDLLITTILSIPGIRLANPGEFSERAFLN
GKIDLAQAESISDLINATSEQAARSAMQSLQGLFSIYINNLIKDFTKFRAKIEAQINFSD
HEINADNLDVFIEHEINRIISRIKKIRNTAIQGSVLREGIKVVISGAPNSGKSSLLNALS
LTNRAIVTNFPGTTRDVIYENIIINGVLFILIDTAGLRITNNPIENIGIERAWNEIKLAE
HILFVIDGSRSVQNQLKNYNNFIKSLSKTSCITIVFNKSDLSKFKINSDLRNLNNGVLVS
SKTGVGIEALRQHLYFSFKSSFEVNNSEGVVSARRRHINILSMVLEKFLSSKKDWKKINN
IELLADDLRTCQDLLGGITGKITSDELLSEIFSEFCIGK
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtttttaatgatacaattgtatcaagagtaacttcagaaggtaaaagtagtgtt
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aaaattacttctgatgaacttttatctgaaatattttcggagttttgtattggaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
