Bacterioplanoides sp. SCSIO 12839: KFF03_16615 Help Entry KFF03_16615       CDS       T08310                                  Name (GenBank) OmpA family protein Organism bacz  Bacterioplanoides sp. SCSIO 12839 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TSP3_bac OmpA Cadherin Pilus_CpaD Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  UTW48152 UniProt:  A0A9J7AF37 LinkDB All DBs Position complement(3680010..3686681) Genome browser AA seq 2223 aa AA seqDB search MGRNIVLQVALGLSLVAPVQAADNAPGGVDGAVLWLDASDPNADGSTSGGAFSGISSANP WKDKTSNGYLTVPVGSSPGNTTPWNNQSDIGDQPAFSFREANAVAYQIKNSRDEALDLRS GVEPDVTIFTVYRTSGVSTSQGSALWGLDDNNWDRMFFNSFNFSSNRENGIVGIGPVSQN ISITNAGIADENRLVTVSYQFGESNGSFVSFNGVTGGTAFTRFTDTTSDDLDTDPSNPLG QQPVFAIGWDGNNNYAQADIAEIIVFDKALTACEAHKVNFFLSEKYKNDFWGPIPDSEPC LVDLFQKIKDYADGDGTSPAALTVQDYINVSGDNVSAENLAAVNAAILAKSSSDINTVAD VQRIIDESIIQNYADTNGTSKPVPTPEMYDSIGVTGVTDSNINQVNIEIAGKTKEEVDTT AEVQAIVDAIGAFVIDINPLNRNLVEGEAFAVTPARSGTPNGNVRWSISGIDAALFSIDE NTGRLTLKTPADFDTLTNNPIQVTITATDDGGNTDSKNLVLTILKDTDGDGTADINDNDI DGDGLSNVDENTVHGTDPNKADTDGDGVNDAQEINTDGTDPLKKDSDEDGVEDGQEKTDG TDPLKKDSDEDGVEDGQEKTDGTDPLKKDTDGDGIEDGQEKTNGTDPLKKDTDGDGSDDG VDVFPNDRNEQVDTDGDGTGNNADTDDDNDGVSDADEATNGTDPLKEDTDGDGSDDGVDA FPNDRNEQVDTDGDGTGNNADTDDDNDGVSDTDEATNGTDPLKKDTDDDGVNDNEDAFPT NKDESVDTDGDGTGNNADTDDDNDGVSDADEATNGTDPLKKDTDGDGSDDGVDAFPNDRN EQVDTDGDGTGNNADTDDDNDGVSDTDEATNGTDPLKKDTDGDGVNDNEDAFPTDKDESV DTDGDGIGNNADDDDDNDGVSDADEATNGTDPLKKDTDDDGVNDNEDAFPTNKDESVDTD GDGTGNNADTDDDNDGVSDADEATNGTDPLKKDTDGDGSDDGVDAFPNDRNEQVDTDGDG TGNNADTDDDNDGVSDTDEATNGTDPLKKDTDDDGVNDNEDAFPTDKDESVDTDGDGIGN NADDDDDNDGVKDEDDAEPTNSDNDDDGDGVSNADEKRIGTDPTKSDSDNDGINDKDEIG DDLNNPRNTDGEDEIDALDSDSDNDGVSDADEKRIGTDPTKSDSDNDGINDKDEIGDDLN NPRNTDGEDEIDALDSDSDNDGVSDADEKRIGTDPLKEDSDNDGINDKDEIGDDLNNPRN TDGEDEIDALDSDSDNDGVSDADEKRIGTDPLKEDSDNDGINDKDEIGDDLNNPRNTDGE DEIDALDSDSDNDGVSDADEKRIGTDPLKEDSDNDGINDKDEIGDDLNNPRNTDGEDEID ALDNDSDNDGVNDKDDSEPLNPENDSDNDGVPNSGDTAPEDGTNDTDGDGISNEDEVAAG TDPEKKDSDGDGVDDNAEVAAGTDPLKEDTDGDGVNDKDDVDPNDKNSDSDNDGISDEKE TELGLNPLDEDSDSDGIKDSDEITNNGEGTQRDTDGDGTIDALDNDDDGDGTPTADELSD NNDDADNNPLTPVMDTDGDNIPDYLDNSDDTTDGTGGDSDNDGLTDKQECASAPNCADSD QDGIPDFMDDDSDNNGIKDEDENAPLIDTDGDGTADFADTDDDNDGTSDTDELNGVTDPG NAVDSDADGIDDYKDADDKANEAGTSDNSGDSDKDGISDEVERGDGEEPRDSDGDNIPDY MDDDSDNDGIKDSDEKGDSETPRDTDEDGTPDYRDEDSDNDGKTDAEECPDASACNDNND DTTPDYLDNDIDGSADPDTSPVAPTPGPTPTPEPSPAPGAGDNSGAQEPGKVKTGVSGAG NMSVNLLLVLALLVILGRTRRVRSFGFMLMAALPLTSHAEWWDEMNVYVGAGVGQSTLDP DTSDTNLDQKDDHDTGWKLTAGWDWNDHISIEGYYAELGDAKFRPQGSINYRMVGGDVIG HYWLMGEPRRQGSIALYAKGGLNHMTNDGKNLAYEKQEVAQLMLGAGAEYYLPKAFSLRL EFESYDKDASLLSLNLIKRFGASSQYQPAAKATEPQPVVAEVVEPAIAEEPVVEALVVEE AVAAEPSIKDVDVIVADIGFAVNSSKLAEKEQDLLKQVAADIQQSENLQVEVQAHTDASG SAKYNEWLSQRRAESVAAFLIEQGVNAEQLTAIGYGESQPRASNETAEGRAQNRRVEFKV LQR NT seq 6672 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgggtcgaaatattgttttacaggtcgctttggggttgtcccttgttgcgcctgtacaa gccgctgataacgctccgggtggcgttgatggcgcagttttgtggttggatgcctctgat cctaatgcggatggctctacatccggtggagcgtttagcgggatttccagtgctaatccc tggaaagataaaacatcgaacgggtatttgacggtaccggttggttccagccctggcaac acgaccccatggaataatcagtcagatattggtgatcagccagcattttctttcagagaa gctaatgctgttgcttatcagatcaaaaacagccgcgacgaagccttagatctgcgctca ggtgtggagcctgacgttactatttttaccgtttaccgcacgtccggtgtcagtacttca cagggcagtgctttatgggggctggatgacaataactgggatcgaatgttcttcaattcc tttaatttcagcagcaatagagaaaacggcattgtaggtattggtcctgtctcgcaaaac atctcgatcaccaatgcgggtattgctgatgaaaaccgtctggtaaccgtcagttatcag tttggtgaaagcaatgggtcatttgtgagctttaatggggtaacgggtggtacggctttt acccgttttaccgatactacttcggatgatttagatactgacccttctaaccctctcggt cagcagcctgtatttgctattggttgggatggtaataataactatgctcaagctgatatt gctgaaattattgtttttgacaaagcgttaacggcttgtgaagcgcacaaagttaatttc ttcctgtctgaaaagtataaaaatgatttttggggcccaattccggacagcgaaccttgt ctggtcgacttatttcaaaaaattaaagattacgccgatggcgatggcaccagtccagca gcactaaccgtacaagattatattaatgttagtggtgacaacgtttctgctgaaaatctg gctgccgttaatgctgccatcctggctaaatcttcttcagatattaatactgttgctgat gttcagcgcattattgatgaatccattattcagaattatgcggatacaaatggtacctct aagcctgtgccaacgcctgaaatgtatgactccattggtgtgacaggtgtaactgatagc aatattaatcaagttaatattgaaattgcagggaaaacaaaagaagaggttgatacaacg gcagaggtacaggcgattgttgatgcgattggtgcttttgttattgatattaatccgctg aatcgaaacctggtcgaaggtgaagcttttgccgtcactccagcgcgttcaggtactcct aacggtaatgtccgttggagcatatcaggaatcgatgcagccttattttcaatcgatgag aataccggccgtttaacactgaaaactccggctgatttcgatacgttaaccaataaccct atccaggttacgattactgcgacggatgatggtggtaataccgactctaaaaaccttgtt ctcactattttaaaagatactgatggcgatggtactgcagatatcaatgataacgatatt gatggcgacggcctgagcaacgttgatgaaaatacagttcatggtaccgacccgaataaa gccgatactgatggtgatggtgttaatgatgcgcaggaaattaatactgatggcactgat ccgctgaaaaaagactccgatgaagatggtgttgaagatggccaggaaaaaacggatggc accgacccactgaaaaaagactccgatgaagatggtgttgaagatggccaggaaaaaaca gatggcactgaccctctgaaaaaagataccgatggtgacggtatcgaagacggtcaggaa aaaaccaacggcaccgatccacttaagaaagataccgatggtgatggttctgacgacggc gttgatgtattcccgaatgaccgcaacgagcaggtcgataccgacggcgacggtacgggc aacaatgccgataccgacgatgataacgacggtgtatcggatgcggatgaagccactaac ggcactgacccgctgaaggaagacactgacggcgatggttccgacgacggcgttgatgcg ttcccgaatgaccgcaacgagcaggtcgataccgacggcgacggtacgggcaataatgcc gataccgacgatgataacgatggtgtatcggatacagacgaggccactaacggtactgat ccgctgaagaaagataccgatgacgatggcgtaaacgataacgaagacgctttcccaacg aataaagacgagtcagttgataccgacggcgacggtactggcaacaatgccgataccgac gatgataacgatggtgtatcggatgcggacgaggccactaacggcacggacccacttaag aaagacactgacggcgatggttctgacgacggcgttgatgcgttcccgaatgaccgcaac gagcaggtagatactgacggcgacggtacgggcaacaatgccgataccgacgatgataac gatggtgtatcggatacggatgaagccaccaatggcactgatccgctgaagaaagacact gatggtgatggcgtaaacgataatgaagatgccttcccaaccgataaagatgaatcggtt gataccgatggtgatggtattggtaacaacgctgacgacgacgatgataacgacggtgta tcggatgcggacgaggccactaacggcactgatccgctgaagaaagataccgacgatgat ggcgtaaacgataacgaagatgctttcccaacgaataaagacgaatcagttgatactgat ggtgatggcacaggcaacaatgctgataccgacgatgataacgatggtgtatcggatgcg gatgaagccactaacggcaccgacccactgaaaaaagatactgacggcgatggttctgac gacggcgttgatgcgttcccgaatgaccgcaacgagcaggtcgataccgacggcgacggt acgggtaacaatgccgataccgacgatgataacgacggtgtatcggatacagacgaggcc actaacggcactgatccgctgaagaaagatacggatgacgatggcgtaaacgataatgaa gatgccttcccaaccgataaagatgaatcggttgataccgatggtgatggtattggtaac aacgctgacgatgacgatgataacgacggcgttaaagatgaagatgatgctgagcctact aactctgacaacgatgatgatggtgatggtgtttcaaatgcggatgaaaaacgcattggt accgatccgacgaagtctgactcagataacgacggcatcaacgataaagatgaaatcggc gatgatctgaataatcctcgtaacaccgacggtgaagatgaaatcgatgcattggacagc gactccgataacgacggtgttagcgatgccgatgaaaaacgcattggtaccgatccgacg aagtctgactcagataacgacggcatcaacgataaagatgaaatcggcgatgatctgaat aatcctcgtaacaccgacggtgaagatgaaatcgatgcattggacagcgactccgataac gacggtgttagcgatgccgatgaaaaacgcattggtacggatccgttaaaagaggactca gacaacgatggcatcaacgataaagatgaaatcggcgatgatctgaataatccgcgtaac accgacggtgaagatgaaatcgatgcattggacagcgactctgataacgacggtgttagc gatgccgatgaaaaacgcattggcacggatccgttaaaagaggactcagacaacgacggc atcaacgataaagatgaaatcggcgatgatctgaataaccctcgtaacaccgatggtgaa gatgaaatcgatgcattggacagcgactccgataacgacggtgttagcgatgccgatgaa aaacgcattggtacggatccgttaaaagaggactcagacaacgacggcatcaacgataaa gatgaaatcggcgatgatctgaataatccgcgtaacaccgacggtgaagatgaaatcgat gcgctggataacgactccgataacgatggtgttaatgacaaagatgattctgagccatta aatccagaaaatgattctgataatgatggtgtcccgaattcaggtgatacagcaccagaa gacggtacgaacgacaccgatggcgacggtatttcaaacgaagacgaagttgcagcgggc actgatcctgagaagaaggacagtgatggtgacggtgttgatgataatgctgaagttgct gcagggactgatccgttaaaagaagacactgatggcgatggcgtgaacgataaggacgat gtcgacccgaatgataaaaacagtgactccgataacgacggtatttcggatgaaaaagaa actgagctgggtctgaaccctctggatgaagactctgacagcgatggcatcaaagactct gatgaaatcaccaacaatggtgaaggtactcagcgtgatacagacggtgacggtaccatc gatgcattggacaatgacgatgatggtgacggtactccgactgctgatgaattgagtgat aacaatgatgacgcggataacaatccattaacaccggtcatggataccgatggcgataat atcccagattatctggataacagtgatgacacgacggatggtaccggtggtgattcggac aacgatggtctgaccgataagcaagaatgtgcatctgcgccaaactgtgccgatagcgac caagacggtattccagactttatggatgatgattccgataacaacggcatcaaagatgaa gatgaaaatgctccgctgatcgatactgatggtgatggcacggctgatttcgccgatacc gacgatgacaacgacggtacttcggatacggacgaactgaatggcgtgactgatcctggc aatgctgtggactcggatgcggatggtatcgatgattacaaagatgccgacgataaggct aatgaagccggtacttcggataactcaggtgattcggataaagacggtatcagtgacgag gtcgagcgtggtgatggcgaagagccgcgtgacagtgatggcgataatattccggattac atggatgacgactcggataacgatggcatcaaagattcagatgaaaaaggtgattctgaa acacctcgtgataccgatgaagacggtacaccggattaccgcgatgaagactccgataat gatggcaagacggatgctgaagagtgcccggatgcgtcggcgtgtaacgacaataatgac gataccacaccggactatctggataacgacatagacggctctgctgatccggatacttct ccagtcgcgccaacacctgggccaactccaacacctgaaccaagcccagcgcctggtgca ggtgataactcgggtgctcaggagcctggcaaagtgaaaaccggtgttagcggtgctggt aatatgagcgttaacctgctgctggttctggcattgctggtgatcttgggtcggactcgc cgagtacgctcttttggttttatgttgatggcagctctgccattaacctctcatgccgaa tggtgggatgaaatgaatgtgtatgtgggggctggtgtaggtcaaagcacactggatcct gatacatccgatactaatttggatcagaaagatgatcatgatacgggctggaaattaacc gctggctgggattggaatgatcatatttcaattgaaggttattacgctgagctgggcgat gcgaagttccgcccgcaaggttcgatcaattaccgcatggtgggcggtgatgtgattggc cattattggttaatgggggagccgcgccgtcagggcagcatcgctctttacgccaaaggt ggtttgaaccatatgaccaacgatggcaaaaacctggcttatgaaaaacaggaagtggct caattaatgttgggtgcgggggctgaatattacctgccaaaagcctttagtctgcgtttg gaatttgagtcttacgataaagatgcctcgttattatcgcttaacctgattaaacgtttt ggagcaagcagccagtatcagcctgctgcaaaagccactgaacctcaaccggttgttgct gaggttgtggagccagcaatcgcagaagagccggtcgtagaagctttggttgttgaagaa gcagtagccgcagagccatccattaaagacgtggatgtgattgttgcggatatcggcttt gcggttaactcatcaaagctggctgaaaaagagcaagacttgctgaaacaggtagcagct gacattcaacaaagtgaaaaccttcaggttgaagttcaggcgcataccgatgcttctggt tcggctaaatacaacgaatggttatcacagcgccgtgctgaatcggtagccgctttcttg attgagcagggtgttaatgctgagcaattaaccgcgatcggttatggtgaaagtcagcct cgggcgagcaatgaaaccgcagaaggccgggcgcaaaaccgtcgggttgagtttaaagtg ttacagcgctaa

DBGET integrated database retrieval system