Borrelia afzelii (FLI): BAPKO_0539
Help
Entry
BAPKO_0539 CDS
T00383
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
baf
Borrelia afzelii (FLI)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABH01782
LinkDB
All DBs
Position
520233..526721
Genome browser
AA seq
2162 aa
AA seq
DB search
MIDFATILVNLFLVSIVLFVYRQYDKRSRALDKIKKFIDLTKVNLEDFIEDKTKEINDLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIEEVQQKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTFKVQENIE
RLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFDKTNKENLESIKIASWEKFDTNI
KDLVFKMDNLNKEIDLYEKDLANIEERKKDILVKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIVKYNKE
IENSFGFYEDKYKLIENSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELQNKFKDIFTYVDDRS
KEIQDKLEDKLILVDDEISSMSSSFKDNVYSRINSLEESIRIEMGKYEEQVDDVFDKFRS
QVELNLKNIYEDYEDKINQVDKNIKERVELSLLDLNSKMESVQVGAIDLMKRLEDDSNKI
YLEFKNKFEEDIKVFSGSFKDDINQLKMQLESQLLDVDSNIQDKLIKLNDNLISNFEEIG
GKFNNNYSNLSDSINAKYTALFESLDSSSSKFEDQMESKYKVFTDKLTAEMDDFSLIYGK
KFDTFSQEAINNYQEFQDLNKKLENEIGSLCNMLEENQEILKRDFNTSLINIKDEIGKNI
IEFKDRYYDEVNIFVSQLEESKLQYSKWQSEMDSNLKNIESQINKTNEEFLSLIQIQKDK
GIELSESVFNDLSDHIQKKAIDMHGSWKDELIALNKSLLDIKISSEELLSSATLKIENLE
KDINDRMEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILEIKEFINRQTEIIKDKSVF
MLEDLNKKFDDKNNFVISKIEECDYKLKDFKIESEDVLNNFKSDLNEFIESKLQIVSDIK
SDNQKQIDDFLDRISKDILNRKDSINNEVDIKLSDWQSKLNEITVKIENLLSSGKVDLDL
IDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGAIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL
SKKFAVVLNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLSVKFNDINKEINEKYNE
VISNYRGYSENISSKLENEIMHEIENLNRRLTDRMDSLSKGMDENLQKLKESFDVSKYQV
EKFELKVKDLTDDGETKISEFVKEIEQYYKSRLEEAIDYRRTIDSDIMQAKERFGEITND
LKNNIESKSEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTINDENL
QIKIAEMDHNFEIIEQRSKDILEFEKELRDKIQDCYGVINSQFGEIKVSVEEDIKNHFEV
CIKKANTLIDDDIIKYENEIHKRIDSLKSIENTFDSIEKNLNDKVNGCIDKIANDFNLKY
IELEERCNEGQLNLESKIDNKIKAIDNLASSQYGGLEKKYADMYDEFLERLNSYITTLSE
EFKHSNKEMIFELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL
KIRGEELKYSLENFVASYNDKIQNLEYDLSKNLENKTELIQSFHLDIEQKMKNDKENFYL
DFTKEFSSKKKDMESEIALMETNITGRVDEFIDFVNNRQNIIDSWFLNIKDDVKNWQEKS
YSTIEKKINLAELGIKSFENDILNVKIGLESFKDGFEVKAEEIFSNLQSEAKKIEQSVHL
DFKNIGESLNLKVLDLERFVDFKVEKIDEKVNKKTEDILTQAEVKFLTQQKNLEDRIFEL
NQKLEQEFTTLSSNLDKVRREMVDVISSDKESFEGQIELMHKNISEFSEKISLYRSNIET
SIENEYSSFSKSIKSEFGLLENELKKSLKHSTLEIESVKNDLQEQIDKFEVEFKKNHKEL
LKEVDTNVLELESKILNCDITFNKFISDIKDNLVEYKSDLRKEFEDSYDKLNFQIENFKK
LDAELEKNNSIFLEAYSLKDKLEKLWETLKNEIDLAQEYKNNFENVNKEFYNIQKETLGI
IETFNDLKLEHESIQAIKNDLNKFFEFYSSFDSRYKSLVESYDEMQIYKAKIKEISVEQR
TILDNYERISNKESILKSTIESVDKNFDLINEVEKRFNTLSKESTEFQNNLKDMENVVSN
LLLNKGLSEEVMVNAQNLKEMLLDIENRLKNTLTMREKVVKSETRLENLNIAAEERIKTL
GILVKTDSKYQDNVGLNNKTVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELGISNK
GD
NT seq
6489 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgcgactattttagttaacctttttttggtttcaatagttttgtttgtt
tataggcaatatgataaacgttctagagctttagataaaattaaaaagttcattgacctt
acaaaggttaatcttgaagattttattgaagataagacaaaagagattaatgatcttgct
gttgatatggaagcttatcaaagatctagcatagaaataataaaaaagattgaggaagtt
cagcaaaagattaaaaacaaaagcaatgattttgcagaggttgaaaaaaagatagcttat
catgattctatgcttaaggatcttgatgagatgacctttaaagttcaagagaatatagaa
agattgcaagttgatgggaaaatagtagataaactttcaaaaactttaaaaggatttaat
actcaaattgattcggttgaatcaaatttaaattcggtgttagaaaaatttgacaagacc
aataaggaaaatctcgagtctattaaaattgctagttgggaaaagtttgatactaatatt
aaagaccttgtttttaaaatggacaatttgaataaagagattgatctttatgaaaaagat
ttagcaaatattgaagagagaaaaaaggatattttagttaagggtaatgagaaattagat
ttagaatttaacgattttcttgaaaaagttgaatttaatattgttaaatataataaagag
atagaaaattcttttggtttttatgaagacaaatataagttaatagaaaattctatagag
cttattatggagagcgtaaagaataaaattaatgagaaagaagattttattttaaataga
ctaaatgaagaattgcaaaataaatttaaggatatctttacatacgttgatgatcgttct
aaggaaattcaagataaacttgaggataagttgattttagtagatgatgaaatttcttct
atgagctcttcttttaaggacaatgtttattcaagaattaattcacttgaagaatcaata
cgaatagagatgggaaaatatgaggagcaggttgatgatgtttttgataaatttagatct
caagttgaattaaatcttaaaaatatttatgaagattatgaagataaaataaaccaagtt
gataagaacattaaagaaagggtagaacttagtttgttagatttgaattctaaaatggaa
agcgttcaagtaggtgctatcgatcttatgaagaggcttgaagatgattctaataaaata
tatcttgaatttaaaaataagtttgaagaagatattaaagtatttagtggaagttttaag
gatgatattaatcaacttaaaatgcaattagaatctcaacttttagatgttgattcaaat
attcaagacaagcttattaagcttaatgataatttgatttctaattttgaagaaattggt
ggcaaatttaataataattattcaaatttaagtgatagtataaatgctaagtacacagct
ctttttgaatctttggattctagcagctctaaatttgaagatcaaatggaatctaaatat
aaagtctttacagataaattaacggcagaaatggatgatttttctttaatttatggtaaa
aaatttgacacattctctcaagaagcgattaataattatcaagaatttcaagatttaaac
aaaaaattagaaaatgaaattggatctttgtgtaatatgttagaagaaaaccaagagatt
ttaaagcgagattttaatactagtttaattaacattaaagatgaaattggtaaaaatata
atagagtttaaggatcgttattacgatgaggtaaatatttttgttagtcagctagaagaa
agtaagctccaatattcaaagtggcaaagtgaaatggattctaatttaaaaaatattgaa
tctcaaataaataaaacaaatgaagaatttttaagtttaattcagattcaaaaagacaaa
ggaatagagcttagtgagagtgtttttaatgatctttctgatcatattcaaaaaaaagct
attgatatgcatggtagttggaaagatgagcttattgctttaaataaatctttgcttgat
attaagatctctagtgaagagctgctttcatctgctactttaaaaatagaaaatctagaa
aaagatattaacgatagaatggaatatgttttgttaaaaacaggtgatattgagagttta
gttatagaaaaatataaagaattaaaggatatgtcatattcacaaagtgatgaagctata
ttagaaattaaagaatttattaatagacaaacagaaataattaaagataaaagtgtattt
atgcttgaggatttaaacaaaaaatttgatgataagaataattttgttataagtaagatt
gaagaatgtgattataaattaaaagatttcaagattgaatcagaagatgttttaaataat
tttaaatctgatcttaatgaatttattgagtcaaaactacaaattgtctctgatataaaa
tcagacaatcaaaagcaaattgatgattttttagatagaatttccaaagatattttaaat
aggaaagattcaattaacaatgaagtagacattaagcttagtgattggcaaagcaaatta
aacgaaataactgttaaaattgaaaatttattgtcttcaggcaaggtagatttggattta
atagattctgaagtaactacaaaaatcaaagagcttaaattttccatagaaagtcttgag
agttattatcttgagaaaatagatgaatttagaaatcagggtgctatatattctgatgag
cttttacaggatataatgaaccattttaataaagagactagagaacttgaggaaaatttg
tcaaaaaagtttgctgtagttttaaataattcagaggaatttgttaaagaggttgatagt
ttattgcaggataaaagaactgatattgcttcttttcaggctaatatagatattactctt
gattctcttagtgtaaagtttaatgatataaacaaagaaattaatgaaaaatataatgaa
gtgatatctaattacagagggtattcagaaaatatttctagcaaacttgaaaatgaaata
atgcatgagattgaaaatctaaatagaagattaacagatagaatggatagtcttagcaaa
ggtatggatgaaaatcttcaaaaacttaaggaatcttttgatgtgtcaaaatatcaggtt
gaaaaatttgaattgaaagttaaagatctaacagatgatggagagacaaaaattagtgag
tttgttaaagagatcgaacagtattataaatctagattagaagaagcaattgattatagg
agaactattgatagtgatattatgcaagcaaaagagagatttggagagataacaaatgat
cttaaaaataatattgagagtaaatctgagtttttaaatgatctttataaggaaagattt
aaacttattgagagtaattttgaagagagatattctacatttttaattgaaagtgaggga
gctatttcaaaaattagagatgagatctataaaacacttacaattaatgatgaaaatttg
cagattaagattgctgaaatggatcataattttgagataatagaacaaagatcaaaagat
attttagagtttgaaaaagaattgcgagataaaattcaggattgttacggtgttataaat
tctcaatttggagagattaaggtaagtgttgaagaggatataaaaaatcattttgaagtt
tgtataaaaaaggcaaacactttgattgatgatgacattataaagtatgaaaatgaaatt
cataagagaattgattctttaaaatcaattgaaaatacttttgatagcatagagaaaaat
ttgaatgacaaagtgaatgggtgtattgataaaatagccaatgattttaatcttaagtat
attgaacttgaagaaaggtgcaatgaagggcaattgaatttagaaagtaaaattgacaac
aaaattaaagccattgataatttagcttcaagtcaatatggtgggcttgagaaaaagtat
gctgatatgtatgatgaatttttagagagattaaattcttatattacaactttaagtgaa
gagtttaagcattcaaataaagagatgatttttgaacttgaatctcaattaaaaaatctt
aaaaatcttgagtctgatttaaataatgttgaaaaggatgttattagattaaaagaagag
tcttatcacaatgtttcatcacatcttaaactattagaagaagatttttttaaagatttg
aaaattagaggcgaagagcttaaatattctttggaaaactttgttgcttcatataatgat
aaaattcaaaatttagaatatgatttgtctaaaaatttggaaaacaagacagaacttatt
caaagctttcacttagatattgaacaaaaaatgaaaaatgataaagaaaatttttatttg
gattttactaaggaattttcttccaaaaaaaaagatatggagagtgagatagccttaatg
gaaaccaatattactgggagagtagatgaatttattgattttgtaaataacaggcaaaat
attattgattcttggtttttaaatattaaagatgatgtaaaaaattggcaagaaaaatct
tatagtacaatagagaagaaaataaatcttgctgaacttggaattaaatcatttgagaat
gatattcttaatgttaaaattggtttagaatcttttaaagatggttttgaagttaaggct
gaagagatttttagcaatttgcaaagcgaggctaaaaaaattgaacaatcagttcatctt
gattttaaaaatattggtgaatcattaaatcttaaagttttagatcttgaaagatttgtt
gattttaaagtagaaaagatagacgaaaaggttaataagaaaactgaagatatcttgact
caggcagaagtgaaatttttaactcagcaaaagaatcttgaagataggatttttgagctt
aatcaaaaattggagcaagaatttacaactttatcttctaatcttgataaagtaaggcgg
gaaatggttgatgtaatttctagtgataaagaaagctttgaaggtcaaattgaattaatg
cataaaaatatttcagaattttctgaaaaaattagtttatacagaagtaatattgagaca
tcaattgagaatgaatatagttctttttctaaatctataaaatcagagttcggtttactt
gagaacgagcttaaaaaaagtttaaaacattcaacgttggagattgaatccgtaaagaat
gacttacaagaacaaattgataagtttgaggttgaattcaaaaaaaatcataaagaatta
ttaaaagaagttgatactaatgttttagaacttgaatctaaaatattaaattgtgatatt
acatttaataaatttattagtgacattaaagacaatctggttgaatataaatccgatttg
agaaaagaatttgaagatagttatgataaattaaattttcaaattgaaaattttaaaaaa
ctagatgctgagcttgaaaaaaataattcaatatttttagaggcctattctcttaaggat
aagttagagaaattatgggaaactttaaaaaatgagatagatcttgctcaggaatataaa
aataattttgaaaacgttaacaaagaattctataatattcaaaaagaaacattaggtatt
attgaaacctttaatgatttaaagttagaacatgaatctattcaagctattaagaatgat
ttaaataaattttttgaattttattcttcatttgatagtagatataagagtttagttgaa
tcttatgatgaaatgcaaatttataaagctaaaataaaagagatatctgttgagcagaga
accattcttgataattatgaaagaattagcaacaaagagagtatattaaagagtactata
gagtccgttgataaaaactttgatttaataaatgaagtagagaaaagatttaatacttta
agtaaagagagcactgagtttcagaacaatcttaaagacatggaaaatgttgtttctaat
ctcttattaaacaaagggttgtctgaagaagtgatggttaatgctcagaatttaaaggaa
atgctcttagatattgaaaataggttgaaaaacactttaactatgagagagaaggtggtg
aaatctgagacaaggttagagaatttaaatattgcagcagaagagagaataaaaactctt
ggcattcttgtcaaaacagattctaaatatcaagataatgttggtcttaataataaaact
gttaggaattctgtaataaaattaatgaggcaaggatggagcgctgaagaaatttctaga
gctactaaattatctattggagaagttgagcttattttagaacttggtataagcaacaag
ggtgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
