Borreliella afzelii K78: BAFK78_096
Help
Entry
BAFK78_096 CDS
T03895
Name
(GenBank) mutS2 family protein
KO
K07456
DNA mismatch repair protein MutS2
Organism
bafe
Borreliella afzelii K78
Pathway
bafe03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bafe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
BAFK78_096
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bafe03400
]
BAFK78_096
DNA repair and recombination proteins [BR:
bafe03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
BAFK78_096
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
Smr
MSSS
AAA_21
DUF1108
Formyl_trans_C_2
AAA_27
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJY72096
LinkDB
All DBs
Position
complement(94583..96919)
Genome browser
AA seq
778 aa
AA seq
DB search
MQDKYLKNIDFYEILSLVSKYVSNPDTVNLLNNQKILKTRESLEKMFSFVNLIRMLFETC
KGYPNSFINSLKYPISLLSKENSRVSIENLRDIVGFLDEVLRINLFLDKNGDTKYFNAHI
LSDLLFLIPELKNLLSELKEYIDFDTLELKSGVVKEYDSIEFEIKNLNRRVEKQIKKIIS
LNVEYLASNFVYYKSNKYTLALKSNFKSKIKGNVISISSSGETFYIEPNDIVNDNNRLNY
LSLEKKRIILKILQNLSSKVHSNIVFLDNLYNNFLYYDSLKARAIYGIETKGVFPEISDV
LNIFDAHHPLLKDSKAITFTPIENRVVIITGPNAGGKTVTLKTIGLLSAMFQFGIPIAVS
ESSTFKIFDNIFIDIGDEQSISNSLSTFSSHMSNISYILKHATKNSLIIFDEFCSGTDID
QGQALAISILEYLISINSYVLISTHYNALKYFAYTHEGVINASMRMDLETMQPNYDLIFS
IPGESYAFNVASRVLIDSSIIIRANEIYSSQKTEVNKILERLIEKEKDLLFIKESMNEKL
IQIELQKKEVENIYQDLLLKEKNIEIELLNEQNEFLKNSRKVLENLVREIKEGNINVAKN
KAFISDLEKNIDFKSNKVSSLNNKRNVATDFKIGDKVRIVNSNAKGKIVGISKKKITVNV
GAFNVSVSSSEISLENFTEHKKEGSKNFSFSIDYNKEDMLSFTIDIRGMRAIDALDFLNK
KIDNIILNGINKFEIIHGKGEGHLMREVHSLLKDLKFVKKYYFAHPSDGGAGKTIVEI
NT seq
2337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagataaatatttaaaaaatattgacttttatgaaattttatctttagtatccaaa
tatgtttctaatccagatactgttaatttactaaataatcaaaaaatattaaaaacaaga
gaaagtttagaaaaaatgttttcctttgtaaatcttattagaatgctttttgagacttgt
aaaggatatccaaactcttttataaatagcttgaaatatcccatttcattattatcaaaa
gaaaattcaagagtttctattgaaaatttaagagatattgtggggtttttagatgaggtt
ttaagaataaatttatttttggataaaaatggtgataccaagtattttaatgctcatatt
ttgtctgatttattatttttaattccagagttaaaaaatttgcttagtgaattgaaagaa
tatatagattttgacactcttgaattgaaaagtggtgttgtaaaagaatatgattcgatt
gaatttgaaattaaaaatttaaataggcgagttgaaaagcagataaaaaaaataattagc
ttgaatgtagaatatttggcttctaattttgtttattataaatcaaataaatatactctt
gctcttaagtctaattttaaaagtaaaattaagggtaatgttatttctatttcctcatca
ggtgaaacattttatattgaaccaaatgatattgtaaatgataacaatagactaaattat
ttgagtttagaaaaaaaaagaataattttgaaaattttacaaaatctttctagtaaagtt
catagtaacattgtttttttagataatctttataataattttttgtattatgattcttta
aaagcacgagctatttatggaatcgaaactaaaggggtatttcctgagatttcagatgta
ttaaatatttttgatgcacatcatcctttgttaaaggattcaaaggcaataacttttact
cctattgaaaatcgtgttgtgattattactggtcctaatgctggtggaaaaactgtaact
ttaaagacaattggactgcttagtgcaatgtttcaatttgggattcctattgctgttagt
gagtctagcacttttaaaatttttgacaacatttttattgacattggtgatgaacagtca
atttctaattctctttcaactttttcaagtcatatgagtaatatttcttatattttaaaa
catgctacaaaaaatagccttataatatttgatgaattttgctcaggaacagacattgat
caagggcaggctcttgctatttcaattcttgaatatttaattagtattaattcttatgtt
ttaatatcaactcattataatgctcttaaatattttgcgtatacccatgaaggtgttatt
aatgcttctatgcgaatggatttagagacaatgcagcccaattatgatttaattttttcc
attcctggtgaaagttatgcgtttaatgttgctagtagagttttgattgacagcagtata
ataattcgtgctaatgaaatttattcatctcaaaaaacagaagttaataaaattttagaa
agattaatagagaaagagaaagatttgcttttcattaaagaaagcatgaatgagaaatta
atccaaatagaattgcaaaaaaaagaagtagaaaatatttaccaagatcttttgttaaaa
gaaaaaaatattgagatagagcttttaaatgagcagaatgaatttttaaaaaattcaaga
aaagttttggagaatttagtcagagaaataaaagagggcaatattaatgttgcaaagaat
aaagcttttatatcagatttggagaaaaatatagatttcaagtcaaataaagtaagttct
cttaataataagagaaatgtagccacagattttaaaataggagacaaggttagaatagtt
aattctaatgcaaaaggaaaaatagtcgggatttctaaaaagaaaattactgttaatgta
ggtgcttttaatgttagtgtttctagctcagagatatctttggaaaactttacagagcat
aaaaaagagggtagtaaaaatttcagcttttcaattgattataataaggaagacatgtta
agttttaccattgatattaggggtatgagggctattgatgctctagactttttgaataag
aaaatagataatattatattaaatggcattaataaatttgagattattcatggaaaaggt
gaggggcatcttatgagggaagttcacagcttgttaaaagacttgaagtttgttaaaaaa
tattattttgctcatcctagtgatggaggggctggaaaaactatagttgagatttag
DBGET
integrated database retrieval system
