Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126915946
Help
Entry
126915946 CDS
T09368
Name
(RefSeq) condensin-2 complex subunit D3-like isoform X1
KO
K11491
condensin-2 complex subunit D3
Organism
baff
Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baff00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
baff03036
]
126915946
Chromosome and associated proteins [BR:
baff03036
]
Eukaryotic type
Chromosome condensation proteins
Condensin II
126915946
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cnd1
HEAT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126915946
NCBI-ProteinID:
XP_050577129
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(14588825..14594210)
Genome browser
AA seq
1322 aa
AA seq
DB search
MEPLKIFDNFKFSELNEDWIQSVWDGEFMIYNEPPDEYQMFLESEDMRLLLNESCTVVKT
WLEKGDDQNNSENYDSEISWNTLISMDINVRALLAVLGYIIKNGQSKTANEETRQSCLYA
TNLYFILLAIPGSCAFNVFHPALYQRAIETIKIGSEHLLPSLKKHNKTIGLDDLNITEQS
MNETIILSQSEKESLIQNLNIIICSFILMIKSFWFKDHAQLLDITILRLIEVTKVEDNYI
IGQCFNKKAGTLNVSLPQNAYAALKELCNNKHGPVKITITIIAKYLLPCLLYSHMDAQTK
IITNIREHTINFVKNLLDEYEKEAKTAILTLIQHIMLFCPDRLEARQKQANVLLKLFGIC
NQNIALEAFKDLMLLSHHSKIPFRLFAQEIIGKLLLESFLVNCSITDCLKAKVKRVFFAI
VLTRCMDCSSMVRGKAMAIIAEFTESSNEKDKEIFLTIFKKSDVDKQFLTFHDIKNSLSE
DTDLLPGSNALITMLADRVEDERAMVRRSTLQILKNLIVMIPFLIHEIVPIISLRCRDPV
LIVRRFAVQVLSQLLEQFPDNSQLLNEWVQTVIPQIFDIEIKVQEKVLGCLEELLLNRIQ
NISTTTDTIADNLPWKILNAVANMKMRRHLSKACSLWVKNGVITNSIMKNIQSHIGTNNN
IEAWVFLVALAENTKLPDMNKYFSNYQQIFLENNFYTSLVLQVLRCSWKSLDYEILEDLH
TYLYKCLQQFKINFGLISICLDIIHNITHYLNPDKNNNLLESNMLNLVKISEIEIAKIFK
GENEDVEAPPNYLRAMFTLGHATILCSCKISPLTLRILQGMLLEWETLPEIIKPIEELQA
SAVVILGQQAMRDREIAKEVVQIFGKLMREETNLDSIVQIAVKINAAKALADICVRFTAL
VEPYLSDMCVSMKNSTPQVREAIVVIFIQLLLEDYIKIKGPFFFHILTMLSDSDNMIREL
TIFLIEERLLTKNKSLISQQFLQSIYHYNNYQSQHKIYHHKMCEKEKKALTLPGRRNEKK
RRIIYDFMLDHLDPPGKMKLLVKVTSQILDGTCVDLIDIKKEEGAGVLKDALYIISHERL
RPSSFNRQGDDDQQEDEECRAQTNIPTSNAISIIIEGIKKYGLDVLLPRLIKLRIKLSTL
KSPLENVVKKILVKTYSEYNKDQLLNIVTEYPELEKEVEQFKKQMEDITVDDENFTEEEN
SASEINNQSASNKNLDLTMCNLHPKIVLERLSVSQLLNSNSPIRALDSLNSPTYSNSILC
SPSQPGPSTSTPTCFNSESNNTVGRASRVRRLSSFFQNENELFDHEIRERNISQVQDDSE
SD
NT seq
3969 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacctttaaaaatattcgataattttaaatttagtgaattaaacgaagactggatt
caatctgtgtgggatggagaatttatgatttataatgaaccacctgatgagtatcaaatg
tttttagagagtgaggacatgagattgcttttaaacgaatcctgtactgttgtaaaaact
tggctagaaaaaggtgatgatcagaataactcagaaaattatgattctgaaatatcttgg
aatacattgatttctatggatataaatgtacgtgctttattagctgtattgggttatata
ataaaaaatggtcaaagcaaaacagccaatgaagaaacaagacaatcatgtttatatgcg
actaatttatattttatacttttggctattccgggtagctgcgcattcaatgtatttcat
cctgctttatatcaacgagccatagagacaataaaaataggctctgaacatttattgcct
tctcttaagaaacataataaaacaataggtctagatgatctaaatatcactgaacaatca
atgaatgaaaccataattctttcacaaagtgaaaaagaaagtctcatacaaaatttaaat
attataatttgcagttttattttaatgataaaatcattctggtttaaagatcatgcacag
ttactagatattaccattcttagattaattgaagttacaaaggtagaggataattacata
attggtcaatgttttaataaaaaagcaggtactttgaatgtttcattgccacaaaatgct
tatgcagctttgaaagaattatgtaataataaacacggaccagtcaaaataactataacc
atcatagcaaagtacctattaccatgtttgttatatagtcatatggatgcacaaacaaaa
attattacaaatattcgtgagcatactataaattttgtaaaaaatttattggatgaatat
gagaaagaagccaaaactgcaattttaacattgatacaacatataatgttgttctgtcca
gatcgacttgaagctagacaaaaacaagctaatgtgttgctaaaactgtttggaatatgt
aaccaaaatattgcactagaagcctttaaggatttaatgctattgtcacatcattcaaag
ataccttttagattatttgcccaagaaataattggaaaattattacttgagtcctttttg
gtgaattgcagtataactgattgcttaaaagctaaggtaaaaagagtattctttgcaatt
gtattgactagatgtatggattgttcaagtatggtaagaggaaaagccatggctataatt
gctgaatttacagaatcaagcaatgaaaaggacaaagaaatatttttaactatatttaaa
aagtcagatgtagataaacaatttcttacatttcatgatataaagaattctctatctgag
gatactgatttattaccaggatcaaatgcactaataactatgttggcagatagagtagaa
gatgaaagagcaatggtaagacgaagcacattgcaaatcttaaaaaatttgattgtaatg
attccatttctgatacatgaaattgtacctataattagcctcagatgcagagatccagta
ttaatcgtacggcgatttgctgtacaagttctatctcaacttttagaacaatttccagat
aattctcaactcctaaatgaatgggtacagactgttataccacaaatatttgacattgaa
attaaagtacaagaaaaggtgctaggttgtttagaagagttattattaaatagaatacaa
aatatttctacaactactgatactattgcagataatttgccatggaaaattttaaatgct
gtagcaaatatgaaaatgagaagacatttatcaaaagcctgtagcttatgggttaaaaat
ggtgttattactaattctataatgaaaaatatacaatctcatattggaacaaataataac
atagaagcttgggtctttttggttgcattggctgaaaataccaagttaccagatatgaac
aaatatttttcaaattatcagcaaatttttctagaaaataatttttacacaagtttagtt
ttgcaagttttaagatgttcttggaagtctttagattatgagattctagaagatcttcat
acctatctatataaatgcttgcaacaattcaagattaattttggattaattagcatttgt
ttggatattatacacaacataactcattatttaaatcctgataaaaataataatttgtta
gaatcaaacatgctaaatctggtaaagatttcagagatagaaattgcaaaaatttttaaa
ggtgaaaacgaagatgtagaggcaccacccaattatttaagagctatgtttacattagga
catgcaacaattttatgcagctgcaaaatttcaccattaacgctacggattttgcaagga
atgttattagaatgggaaacactaccagaaattataaaaccaatagaagaactgcaagct
tcagcagttgttattcttggacagcaagcaatgagagatcgtgaaattgctaaagaagta
gtccaaatatttggtaaattaatgagagaagaaacaaatctagattcgattgttcaaatt
gctgtgaaaataaatgctgcaaaagctttagctgatatttgtgttaggttcactgctttg
gtggaaccatacttatcagatatgtgtgtaagtatgaaaaattcaactccacaagtacga
gaggctattgtggtgatatttattcaacttcttctggaagattacataaaaattaagggt
cctttcttttttcatatattaacaatgttgtcggattcggacaatatgatacgtgaatta
acaatttttctcatagaagaacggcttttaacaaagaataagtcactaatatcacaacaa
tttctacagagcatatatcattataataattatcaatctcaacataaaatttatcaccat
aaaatgtgtgagaaagaaaagaaagctttaacacttcctggaagaagaaatgaaaagaaa
cggagaataatttatgatttcatgctggatcatttagatcctccaggaaagatgaaattg
cttgtaaaagtaactagtcaaatacttgatggaacttgtgttgatttgattgacattaaa
aaagaagaaggagcaggtgtattaaaggatgcattgtatataataagtcacgagcgtcta
cgaccatcatcttttaatagacaaggtgatgatgaccaacaagaagatgaagaatgtaga
gctcaaacaaatattccaacttctaatgctattagcattattattgaaggaattaagaaa
tatggtttagatgttctactacctagattaataaaacttagaataaaattatctacttta
aaatcaccattagaaaatgttgtaaaaaagattctagttaaaacatattctgaatataac
aaggaccaactattaaacatagtaaccgaatatcctgaattggaaaaagaagtggagcag
tttaaaaaacagatggaagacattacagttgatgatgagaattttactgaagaagaaaat
tctgcatcagaaattaataatcaaagtgcgtccaataaaaatttagatctaacgatgtgt
aatttacaccctaagattgtattagagcgtctttcggtttcgcaattgttaaattctaat
tcaccaatcagggctttagatagtttgaattccccaacatattcaaactcaattttatgt
tcaccttcacaacctggtcctagtacaagtacacctacatgtttcaattctgaatctaat
aacactgtaggtcgtgcttcaagagttagaagactttccagtttctttcaaaatgaaaat
gaactatttgatcacgaaataagagaaagaaatatttcccaggttcaagatgatagtgag
tctgattag
DBGET
integrated database retrieval system
