Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126917177
Help
Entry
126917177 CDS
T09368
Name
(RefSeq) rabankyrin-5 isoform X1
KO
K20129
rabankyrin-5
Organism
baff
Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baff00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
baff04131
]
126917177
Membrane trafficking [BR:
baff04131
]
Endocytosis
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
126917177
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
FYVE
BTB
ANK_LRRK2
Ank_KRIT1
BACK
FYVE_2
FYVE_CARP1-2
BBS2_hp
BTB_KLHL33
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126917177
NCBI-ProteinID:
XP_050579716
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(1702848..1712390)
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MEDSTEAQKWQQHLSLLREQYVNLYNTNTELQREYAIVAANKQDTGFIGRLLTTIGSLYS
QQRYSDVIIKLKNQEIPAHKFILSARTDFFSEGTLSEVTILDWTYLEPKIGLILLKWIYT
GKVPQENLTLELMKAASNFQLTELVELCEKYLIGIVGFKDCVQLYAAAEELGAQKLKEHC
SSLISAHWEDLTGEDFKEMPGSLLYKLLQTKSKYPLHAAVRLKREDVVFLYLVENNSGLT
KAINALDHKGEMPLEVALKTRQPSLARTLVEHGADLSSKDSRGLSLLQAAIFKGDSYSAE
FIIEQLENNGNMKELCEPMKLTRNVKDIKNPEELEGCTALHLITKHNSENMLTVASRLLH
AGIDPNLQNHRGWTALHNCIQERNEPLFDVLLECQSIDLDKRTNENDTPLCIAMKTDPFN
GFFAKKLLIKGATPNPVYKNTGDTLLHVLIREYKEEAALFLIDYCKDNLMQKNNDGYLVL
HEACKVGSKNLTRALLKTGFPVDEVALSTGDAPIHIAVSNLYFDIVMELLHAPNSNSQLN
LKNNVNETPLSLAIKAPFKKGKDIVLALIKAGANINKCNNDGLTLLHQAILKEDSATAIF
LLENGADMNTRTADGETPLQLSIHCRLGEVVEALCKRGVDTSIGCPLWDALDSDQEDVAS
ILVKYGADTDCWGPGPDDCQQTLLHKAIDHNKEDIAQFLIRSGCDLNTPRKLGPDGIGGD
EARDECTPLHLCCQWGLEQVVQTLIEHGADVNARDVEGKTPVHVAIQNQHSQIISLLLCH
PNIDLNKRDKKGLTPFATALTFRNNKAAQAILERLPKAAEQYDNKGRNFLHTAIQKNDME
SILFLLSIQVDVNSRVHDVTQTPPLHLAAVSGNEMLVRSLILAGARVNDTDANRNTALHA
AAKAGHAAIVSALLQNNINFDAVNADGDNALHVAVREGHVSVVRALLTECTLDAEAVNLK
GRNPLHELARCGKDNAATICELFLECMSQYPVNNADLDGNTPLLIAYMKGNGQLCRTLVK
AGACLGSMNKEGITIFNYQVATKQLLYRLLDSLTQEAPWADKDLCLECGTKFSLTMRKHH
CRHCGRILCNKCSDQDVPIVKFGLNKPVRVCAVCFDVLQLGAE
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagattctacagaggctcaaaagtggcaacagcatttatctttattaagggagcag
tatgttaatttatacaatacaaatacggaacttcaacgtgaatatgcaattgttgctgca
aataaacaagatacaggatttattggtagacttttgacaaccattggatctctatatagt
caacaacgttatagcgatgtgatcatcaaattgaaaaatcaggaaataccagcacataaa
tttatattgtctgctagaacagattttttcagtgaaggaacactatcagaagtgaccatt
ttagattggacttatttggaacctaagattggattaatattgttgaaatggatatacaca
gggaaggtccctcaagaaaatttaactttagaattaatgaaagcagcatctaattttcag
ctgacagaattagttgaactgtgtgaaaaatatttaattggaattgtaggattcaaagat
tgtgttcaattgtacgcagctgctgaggaattaggcgcacagaaattaaaagaacattgc
agttctttgatttctgcacattgggaagatttaacaggagaagactttaaagaaatgcct
ggatctctattatacaaattattacagactaaaagtaaatatccattgcatgccgctgtt
cgactaaagagagaagatgtggtttttttatatttagtggaaaataattcagggttaacg
aaagccattaatgctttggatcataaaggagaaatgcctttggaagttgctttaaaaact
cgtcaaccatcattggcgcgcactttagttgaacacggggccgatttaagctcaaaagat
tcaagaggtctttctttactccaagctgctatttttaaaggagattcttattcagctgaa
ttcataatagaacagctagaaaataatggaaatatgaaagaattatgcgagcccatgaaa
cttacccgaaatgtgaaggatataaaaaatcccgaagaacttgaaggatgtactgcgtta
catttaataacaaaacataattcagaaaatatgttaacagtcgcatccaggttacttcat
gctggtattgaccctaatttacaaaatcacagaggatggactgccttacataattgtatt
caggagagaaatgaaccactttttgatgtcttattagaatgtcagagtatagacttggac
aaaagaactaatgaaaatgatactccattgtgtatcgcaatgaaaacagatccatttaat
ggattttttgctaagaaacttttaatcaaaggtgcaactccgaatcctgtatataagaat
acaggggacactctactacatgttttgataagagaatataaagaagaagctgcattattt
ttaatcgattattgtaaggataacttaatgcaaaagaataatgatggatatttggtttta
cacgaagcttgtaaagttggttcgaagaatttaacgcgagctttattgaaaactggtttc
ccagtcgacgaagttgcattgtctactggcgatgcaccgatacatattgctgtttccaat
ttgtattttgatattgtaatggaattgttacatgcacctaattcgaattcccaattgaat
ttaaaaaataacgtgaatgaaacccctttaagtttggctattaaggctccatttaagaag
ggcaaagatatagttttggctttaataaaagctggagcaaatatcaataagtgcaataat
gatggtttaacattgttgcatcaagcgatattaaaagaggattcggcgacagcgattttt
ttattagaaaatggtgccgatatgaatactagaactgcagatggagaaactccactgcaa
ctttccatacactgtagactgggtgaagttgtagaagcactttgtaaaagaggagtagat
acttctataggatgtccattatgggatgcactggattcagatcaagaggatgtagcatct
attctagttaaatatggagcagacactgactgttggggtcctggtccagatgattgccaa
caaacattgttacacaaagcaattgaccacaacaaagaagatattgcacagttccttata
agaagtggctgtgatttaaacacacctagaaaacttggcccagatggtattggaggtgat
gaagcaagggatgaatgtactccattacatttatgttgtcagtggggtttagaacaagtt
gtacagacacttattgaacatggtgctgatgtgaatgcacgagatgttgagggcaaaact
ccagtgcacgttgccatacaaaatcaacattcacaaattatttctcttctactttgtcat
cctaatatagatttaaataaacgagataagaaaggtttaacaccatttgcaacagcttta
acatttcgaaacaacaaagctgctcaagcgatattggaacgactacctaaagctgctgaa
caatatgacaataaaggcagaaattttttacatactgctattcaaaagaatgacatggaa
agcatattatttctattatctatacaggtagacgtaaattccagagttcatgatgttaca
caaactccacctttacatcttgctgcggtttctggaaatgaaatgttagtgagaagttta
atattggctggtgcacgtgttaatgatacagatgcaaacagaaatactgcattgcatgct
gctgcaaaagctggtcatgcagcaattgtatctgctttattgcagaacaatataaacttc
gatgcagtaaatgcagatggtgacaatgcattgcatgtagctgtaagagaaggtcatgta
tcagtggtaagagcacttttgactgaatgtacattagatgcagaggctgtaaatcttaaa
ggaagaaatcccttacacgaattagctaggtgtggaaaagataatgctgcaactatatgt
gaacttttcttggaatgtatgtcacaatatccagtaaataacgcagatttggatggcaat
actccattactgatagcttatatgaaaggaaatggtcaactttgtcgtactctggtaaag
gctggtgcatgcctaggttctatgaataaagaaggcattacaattttcaattatcaagta
gcaacaaaacaattactatacagattactagattccttgacacaagaagcaccatgggca
gataaagatctttgtctggaatgtggtacaaaattttcccttacaatgcgaaaacatcac
tgccgccattgtggtcgaattttatgtaataaatgctccgatcaagacgttccaatcgta
aaatttggattaaataaacctgtgcgtgtttgtgcagtatgttttgatgtattgcaacta
ggtgctgaatga
DBGET
integrated database retrieval system