Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126920328
Help
Entry
126920328 CDS
T09368
Name
(RefSeq) VPS35 endosomal protein-sorting factor-like isoform X1
KO
K25731
VPS35 endosomal protein-sorting factor-like
Organism
baff
Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baff00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
baff04131
]
126920328
Membrane trafficking [BR:
baff04131
]
Protein recycling
Others
Retriever complex
126920328
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps35
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126920328
NCBI-ProteinID:
XP_050586464
LinkDB
All DBs
Position
9:2375979..2381508
Genome browser
AA seq
981 aa
AA seq
DB search
MTEINWIAKPMNYKTIQFANLEEVSDHPLKPVTVMLIDGRSGIKRNVLRSTSTGSSTATS
TPTHTPIPGSSLVDPLLSHCSFDGSDPLSQFAKEELDPLSKMAADEWDYSCNAVVTNKKS
MDTAEELVEPWLARRTTILNKYTTSEKLSIVTSFLPGGEKVIVKVQPSGGVVDKVRTRLE
QLDDFEEGSVRQMLDLSQQQYTARVEQLNNELVQAWHSDQRVKALKIAIQCAKLLVDTSV
MAFYPGKFVLITDILDIFGKLVYERLKVKAEYYKPGNKMPTSLPDNFTPDMVPENAKETC
RNWFYKIASIRELVPRLYVEMAIIKSYSFLTTSEFNTALLRITRMIRGIGNPLIAVYARC
YLCRVGLALNKTSDFEFVRENFYDFLFTYQQLFGQFVKTELIEQNMTLYSYLNLYLPALD
WILQVLVATTSENFLEDVLSRCKNQANSSLLLNSILTAFKPTYIGERAMDFVNLITTIED
DGFPQYLLYRSLGESLVLESPPKEDCQSILNMVWKYITELTNPSKFMHCVEIWIQFTAIH
FSVNELNLFFGKIIDRLNPNKSFEHFYPQLQNIIEKVVSHTQDFESLLAMDNFLPLIDLF
HKESIKVEVCKTVIEGISVQTSPITDPIFINALMFIARIMHDSVSALTVEDEKRQIGQLI
CGLVQRVDYGRDFEKQLNFYAEARAAFPNLDSVHTQLVQCVNRLSVDTRRIVRGHHTRRT
SAFVRACAAFCFITIPSLTLVHTRLQLYLLSGQVALLNQCLGQADACFKAALSLVPEMPK
TIDIDGRQKSSQPYLLSYLSNFLSTLLVVPDSPEHGVLYLMRGLLNAVQRCFDENTSMKT
YLYLRVLDLLSAIVQENYPYHVEKVDSNDKLYGSDQKFISEVNKISSKIVEEILSHLKYL
GSTDQLEKQVALALELFNCFIIRADLRDPQLAHMAVNLWNLSVRHGSIDSKVKMKMIAYI
VQKGHHKGYEHFGDILRKMLK
NT seq
2946 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagaaataaattggattgccaaacctatgaattacaaaacaatacagtttgcaaat
ttagaagaagtaagtgaccatcccttaaaacctgtcacagtgatgttaattgatggtcgt
agtgggataaagcgtaatgtgttacgaagtaccagtactggttcttcaactgctacatca
acaccaactcatacacctattccaggaagttctttagtagatccattattaagtcattgt
tcctttgatggttcagatcctctttcacaatttgctaaagaagaactagacccattatct
aaaatggctgcagatgagtgggattactcttgtaatgcagtagtcactaacaaaaaatct
atggatactgcagaagaattagtagaaccatggttagcaagacgtactacaatattaaac
aaatacacaacatcagaaaaattgtcaatagttactagtttcttaccaggtggtgaaaaa
gttattgttaaagttcaaccaagtggtggagttgttgataaagtacgaacaagattggaa
cagttagatgattttgaagaaggatctgtcagacaaatgttagatttatctcaacaacaa
tatactgcgagagttgaacaattaaataatgaacttgtacaagcctggcattctgatcaa
agggttaaagcacttaaaatagcaattcagtgtgcgaagttattagtagatacatctgtt
atggctttttatcctggcaagtttgttcttatcacagatattttagatatttttgggaaa
ctggtttatgaacgattaaaggttaaagctgaatattacaaaccaggaaacaaaatgccc
acaagtttacctgataatttcacaccagatatggtacctgaaaatgcgaaagaaacttgt
agaaattggttttacaaaatagcatcaataagagaactagttccacgtctttatgtggaa
atggcaataataaagtcttatagctttttaacaacaagtgaatttaacactgctttactg
cgaataacgcgaatgataagaggtatcggaaatcctctcatagctgtatatgctagatgt
tatttatgccgagttggactagctttaaataaaacatctgattttgagtttgtgagggag
aacttttatgatttcctctttacataccaacagctgtttgggcaatttgtgaaaactgaa
ttaattgagcaaaatatgactctatattcttatttaaacctttatctaccagctttggat
tggattttgcaagtattggtagctacaacctctgaaaattttttagaagatgtactttct
cggtgtaaaaaccaagcaaatagttcattattattaaacagtattttgacagcatttaaa
cctacatatattggagagcgtgcaatggattttgtaaatttaataactacaatcgaggat
gatggttttccacagtatctattataccgaagtttaggtgaaagccttgtattagaatca
ccaccaaaagaagactgtcaatcaattcttaatatggtgtggaaatatataacagagtta
acaaaccctagcaaatttatgcactgtgttgaaatctggattcaatttaccgctattcat
ttttccgtaaatgaattgaatttgttctttggaaaaataattgatcgacttaatccaaac
aaaagctttgagcatttttatccacagttacaaaatattattgaaaaagtggtatctcat
acgcaagattttgaatcattacttgctatggataatttcttacctctaatagatttgttt
cacaaagaaagtattaaggttgaagtgtgtaagactgttatagaaggtataagtgttcaa
accagccctattactgaccctatttttataaatgctcttatgttcatcgctaggataatg
catgattctgttagtgctctaactgttgaagatgaaaaacggcaaattggccaacttata
tgtggtttagttcaacgtgttgattatggtcgtgactttgaaaagcaacttaatttttat
gccgaagctagagctgcttttcctaatctcgatagtgttcatacacaacttgtacagtgt
gtaaatagactatcagtcgatactcgaaggattgttcgtggacatcacacaagaagaacg
tcggcgtttgtacgcgcttgtgccgcgttttgttttattactattccatcattaacttta
gttcatacacggctgcagttatatttactttcaggccaagttgcactcctaaatcaatgc
ttgggtcaagctgatgcatgttttaaagctgcattaagcttagttccggaaatgcccaaa
acaatagatatagatggaagacaaaaaagttcacaaccttatttactttcatatttatca
aactttttatcgacgttgcttgttgtcccggatagtccagaacatggtgttttatattta
atgcgaggtttacttaatgctgttcaacggtgttttgatgaaaatacgtcaatgaagaca
tacttgtatttacgggtacttgacttattgtcagcaattgttcaagaaaactatccatat
catgttgaaaaggttgattctaatgataaattatatggatctgatcaaaaatttataagc
gaagtgaacaaaataagttcgaaaattgtagaagaaattttatctcatttgaagtatctt
ggctctaccgatcaattggaaaagcaagtagctcttgcattagaactttttaattgcttt
attattagagccgatttgcgcgatccacaattagcgcacatggctgtaaatttatggaat
ttatctgttcggcatggttcgatagattcaaaagtgaagatgaagatgatagcgtatata
gtacaaaaaggtcaccacaaaggatacgaacattttggggacattttaagaaaaatgtta
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system