KEGG   Bombus affinis (rusty patched bumble bee): 126925980
Entry
126925980         CDS       T09368                                 
Name
(RefSeq) putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12 isoform X1
  KO
K18409  ATP-dependent RNA helicase TDRD12 [EC:5.6.2.5]
Organism
baff  Bombus affinis (rusty patched bumble bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:baff00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:baff03036]
    126925980
Enzymes [BR:baff01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.5  RNA 5'-3' helicase
     126925980
Chromosome and associated proteins [BR:baff03036]
 Eukaryotic type
  Gene silencing
   piRNA pathway
    126925980
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 126925980
NCBI-ProteinID: XP_050597951
LinkDB
Position
17:complement(1907247..1915845)
AA seq 1005 aa
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NT seq 3018 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system