Borreliella afzelii Tom3107: P612_02965
Help
Entry
P612_02965 CDS
T03256
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
baft
Borreliella afzelii Tom3107
Pathway
baft03030
DNA replication
baft03430
Mismatch repair
baft03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baft00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
P612_02965
03430 Mismatch repair
P612_02965
03440 Homologous recombination
P612_02965
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
baft03032
]
P612_02965
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
baft03400
]
P612_02965
Enzymes [BR:
baft01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
P612_02965
DNA replication proteins [BR:
baft03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
P612_02965
DNA repair and recombination proteins [BR:
baft03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
P612_02965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
GHMP_kinases_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIK18871
LinkDB
All DBs
Position
594782..598267
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MLKIKFYFDKIILGMSFRAKFIHLHVHSDYSLLDGAAKISDIISKAKKCNMSHIALTDHG
NLFGAIKFYKEAKKAGIKPIIGIEAYMAKTSKFLKKHDDLGKMSYHLILLAKNELGYKNL
LKLTSISYLEGFYYRPRIDKEDLEKYSEGLICTSACIGGLIPRLILANRFEDAKNEILWF
KKVFGNDFYLELQRHGIKDQDIVNERLVEYSKELGVPLTVANDSHYVNREDASAQDIIVC
IGTGAKKSDENRLKMETNEFYIKSQEEMCELFNDLPEALENTVRIAEKCDDFKITFPGPI
LPDYQIPIEFNTLGEYLEYLTLEGLKFRYKTLTSKIKDRAFYELSVIIRMGFEGYFLIVW
DFIKFAHDHDIPVGAGRGSGAGSIVAYALRITDIDPLKYNLLFERFLNPERISMPDFDID
FCFEGRDEIIKYVTNKYGEDKVAQIITFGTLKAKAVVKDVARVLDIPFAESNELTKFIPD
GPKVSLKEVLDDNSLKEYFTSKPVYKELMNAALVLEGMNRHASTHAAGIVISKTPLTDYV
PLYKDYKQGSISTQYTMDLLEECGLVKMDFLGLKTLTLIKNAENLIRSVNPDFKIKNIPD
NDVKTFKMLGEGRSASVFQFESEGMQQILKDAKPDNIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFIA
AKKGVKRIKYPHPDLKEVLRPTYGVIVYQEQVMEVAKIIGGFSLGKADILRRAMGKKKED
EMNEMKVDFLRGAIEKGYDKEIASEIFELLKPFSGYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANY
PEYFMAANLTNEINNNDKLSYYIEESKAMGINVLKPDINRSFREFRVTDSGISYGLNGIK
NLGGIVVDLIIDEREKNGKYSSFEDFIRRVDDKVINKKFLESAIKSGLFDSLNQNRKTLF
ENLDRLIEVVSEDKNNKRLGQNSLFDVLESQESIQQSFNYQVLKEYSYSELLGFEKELLG
FYVSGHPLDPYKKAINNFSSLNVLKDLAAKKDSIVQFSGILNSVKIIQTKRNNSRMAFGV
IEDFKGAIDIVVFTESYERYKNFLLEGNVIGVIGRLTFNRDKFSIVVEKVVNIERLSEDK
VNNIHIKFLSNKLNDLQLLNSLKESISNFEDNSGFSNVYFYLRENGKDLKLKMNSILNFG
PDEDKLDKLRRCVIVEDVWVD
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaaaaatcaagttttattttgataaaataattttaggtatgagttttagggctaag
tttattcatcttcatgttcattcagattattctcttttggatggagctgcaaaaatatca
gatattatatcaaaagcaaaaaaatgcaatatgtcacatattgcattaacagatcatggt
aatctttttggagctattaaattctataaagaagctaaaaaagcggggattaagccaata
attggcattgaagcttatatggcaaaaacttctaagtttttaaaaaaacatgatgatctt
ggaaaaatgtcttaccatttaattttgcttgccaagaatgagctgggttataaaaactta
ttaaagttaacaagtatttcttatcttgaagggttttattatcgtccaaggatagataaa
gaggatcttgaaaaatattcagaaggtttaatttgtacttcagcttgcattgggggactc
atcccaagacttattttggccaatagatttgaagatgctaagaacgaaattctttggttt
aaaaaagtttttggcaatgatttttatcttgagcttcaaaggcatggcattaaagatcaa
gacattgtaaatgaacggttagttgaatattctaaggagcttggagttcctttaacagta
gctaatgattctcattatgttaatagagaagatgcatctgctcaagatatcattgtttgt
attgggactggtgctaaaaaaagcgatgagaatagattgaaaatggagacaaatgaattt
tatattaaatctcaagaggagatgtgtgaactttttaatgatttgcccgaagctttagaa
aatactgtaaggattgcagaaaagtgtgatgattttaaaataacttttccaggccctatt
ttacctgattatcaaattcccattgaatttaatactcttggtgaatatttagaatatctc
actcttgaggggttaaaatttagatataaaactttgacaagcaaaataaaagatagagcc
ttttatgaattgagcgtgataattaggatgggttttgaaggctattttttgattgtttgg
gattttattaaatttgctcatgatcatgatattcctgttggagctgggcgtggctctggt
gcgggttcaattgtagcctatgctcttaggattaccgatattgatcctttaaagtataat
ttgctttttgagagatttttaaatcccgagcgcatttctatgccagattttgatattgat
ttttgttttgaaggcagagatgagattataaaatatgttaccaataaatatggagaagat
aaggtagctcaaataattacttttggaaccttaaaggctaaggctgtggttaaagacgta
gctagagttttagacattccatttgctgaatcgaatgaacttactaagtttattcctgat
ggtcctaaagtttctttaaaagaggttttagacgacaattccttgaaagagtattttact
agcaaacctgtttataaagaattaatgaatgctgcattagttcttgaaggaatgaataga
catgcttcaactcatgctgcaggaattgtaatttctaaaacccctttaaccgattatgta
cctctttataaggattataagcaaggttctatttctactcaatatacaatggatttactt
gaagaatgtggacttgttaagatggattttcttggcttgaaaacattaactttaataaaa
aatgcagaaaatcttattagaagtgtaaatccagattttaaaataaaaaatattccagat
aatgatgttaagacttttaagatgttaggagaagggagaagcgcatctgtttttcagttt
gaatctgagggaatgcagcaaattctaaaagacgcaaagcccgataatattgaagatttg
atagccttaaatgctctttataggccaggccctatgcaatttattcctcaatttattgct
gctaaaaaaggtgttaagaggattaagtatccccatccagatttaaaggaagttttaagg
ccaacttatggagttattgtttatcaagaacaagtaatggaagttgcaaaaataattggg
ggtttttctcttggtaaggctgatattttaagacgtgctatgggtaaaaagaaagaagat
gagatgaatgaaatgaaggttgactttttaagaggcgctattgagaaagggtatgacaaa
gaaattgctagtgaaatttttgaacttttaaagcctttttctgggtatggatttaataaa
tcacatgcggcagcgtattctttaatagcgtatcaaactgcttatcttaaggctaattac
cctgagtattttatggctgctaacttgacaaatgaaattaataataacgataagctgtct
tattacattgaagaatcaaaagctatgggtataaacgtgcttaagcctgatataaatcga
tcatttagagaatttcgtgtaactgactctggaatttcttatgggcttaatgggattaaa
aatcttggaggaattgttgttgatttaataattgatgagagagagaaaaacggcaaatat
agttcttttgaggattttatcagacgtgtagatgataaagtaattaataagaaattttta
gaatctgcaataaaatctggactttttgatagtttaaatcaaaatagaaaaactttattt
gaaaatcttgatcgtttgattgaagttgtttcagaagataaaaataataaaaggcttggt
caaaatagtttgtttgatgttcttgaaagtcaagagtcaattcagcaaagttttaattat
caggttttgaaagaatattcttattctgagcttttaggatttgaaaaagagcttttagga
ttttatgtatcagggcatcctcttgatccttataagaaggcgattaataatttttccagt
ttaaatgttttaaaagatcttgctgctaaaaaagatagcattgttcaattttctggcatt
ttaaattcagtaaaaattattcaaactaaaagaaataattcaagaatggcttttggtgtt
attgaagattttaaaggcgcaatagatattgtagtttttacagaaagctatgaaagatat
aagaattttttacttgaaggtaatgttattggggttataggtagacttacgtttaataga
gacaaattttcaattgtagttgaaaaagttgtaaatattgagagactctcagaagataaa
gtaaataatattcatattaaatttttaagtaataaattaaatgatttgcaattacttaat
tctttaaaggaaagtataagtaattttgaggacaattctggattttcaaatgtttatttt
tatttaagggaaaatggtaaggatttaaaattaaaaatgaattcaattttaaattttggg
ccagatgaagacaagcttgataagttaagaaggtgtgtgatagttgaagatgtttgggtt
gattag
DBGET
integrated database retrieval system