Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina): BCTU_042
Help
Entry
BCTU_042 CDS
T01528
Symbol
fliF
Name
(GenBank) flagellar basal-body MS-ring and collar protein
KO
K02409
flagellar M-ring protein FliF
Organism
baj
Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina)
Pathway
baj02040
Flagellar assembly
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baj00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
02040 Flagellar assembly
BCTU_042 (fliF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
baj02044
]
BCTU_042 (fliF)
02035 Bacterial motility proteins [BR:
baj02035
]
BCTU_042 (fliF)
Secretion system [BR:
baj02044
]
Type III secretion system
Flagellar export apparatus
BCTU_042 (fliF)
Bacterial motility proteins [BR:
baj02035
]
Flagellar system
Flagellar assembly proteins
M, S, P and L rings
BCTU_042 (fliF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YscJ_FliF
YscJ_FliF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH39635
UniProt:
F7WYY5
LinkDB
All DBs
Position
51157..52830
Genome browser
AA seq
557 aa
AA seq
DB search
MQKKILNIGIIFFCYLLKNFQFFMISFSVFLSFIIVFFLWFNTINYVVLYNHLSDKDEFW
VISQLQSMKIPYKFNNITGALLVPENKIHELRFQLLNNNLNKEKIYGFDFLNNDKFNVGQ
FNENLNYHRGLEGELSKTLMNIFPIKYARVHLSYQKDTNFLQKKEIPSVSIVITLYPNTC
LKKNQVNSIISLITGSITNLSSDHIVIVDQNGTLLNQLFLNKKRFFNNNIQKHADFLKDY
YWNRINKALKPLLGSKNFFIQITPYIMSYVKKNNMIYKNKKNKSKAVNLLNLVPDYLNNL
GISKKNNSLKNISSHNISKNINDVNLIKVNKNINSKAITKNYIINKEHSGNFNTSKLIDH
SQFNNNNVYMKKNHIITRDVNFYERILNNKFIHFSIKILANYKKNDLGILVPLTEKEKEN
IKTIIKSVVNFSHKHGDILEIINMLFFQPHKSTHMYSLFDYKNFFISYKWTFVFLFLFLF
FFFVLRKIFLIYIKRNNIMKKEPLKNKDNLSTVFVTQKLCSTEVKEKNILLNSQYFFKNK
KNWILILKLSQKFFGYG
NT seq
1674 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaaaagaagatattaaatattgggataatatttttttgttatttattaaaaaatttt
caattttttatgattagtttttctgtttttttatcttttataattgtattttttttatgg
tttaatacaattaattatgttgtgttatataatcatttgtctgataaagatgaattttgg
gtaatatcacaattgcaatctatgaaaattccatataaatttaataatattactggagct
cttttagttccggaaaataaaatacatgagttacgttttcaattattaaataataattta
aataaagaaaaaatttatggttttgattttttaaataatgataaatttaatgtaggtcaa
tttaatgaaaatttaaattatcatcgaggattagaaggtgaattatcaaaaacgttaatg
aatatttttcctattaaatatgctcgcgtacatttatcttatcaaaaagatactaatttt
ttacaaaaaaaagagataccatcagtctctattgtaattactttgtaccctaatacttgt
ttaaaaaaaaatcaagtcaattccattatttccctaattacaggtagtataactaattta
tcttcggatcatattgtaattgttgatcaaaatggaactttattaaatcaattattttta
aataaaaaacgattttttaataataatatacaaaaacacgcagattttttaaaagattat
tattggaatcgtattaacaaagctttaaagcctcttttgggttcgaaaaatttttttatt
caaattactccgtatattatgtcatatgtaaaaaaaaataatatgatatataaaaataaa
aaaaataaaagtaaagctgttaatctattaaatttagttccggattatttaaataattta
ggaatttcaaaaaaaaataattctttaaaaaatatttcttcgcataatatatctaaaaat
attaatgatgttaatctgataaaggtaaataaaaatattaattctaaagctattactaaa
aattatataattaataaagaacattcaggaaacttcaatacatcaaaattgatagatcat
agtcaatttaataataataacgtatatatgaaaaaaaatcatataataacgcgtgatgta
aatttttatgaacgtatattaaataataaatttattcatttttcaattaaaatattagcg
aattacaaaaaaaatgatttagggattttagttccattgacagaaaaagaaaaagaaaat
attaaaacgattattaagtcagtagtaaacttttcacataaacatggagatattttagaa
ataataaatatgttattttttcaacctcataaatctactcatatgtattctttatttgat
tataaaaatttttttatatcttataaatggacttttgtttttttatttttatttcttttt
ttcttttttgtgttaagaaaaatttttttaatatatataaaaagaaataatataatgaaa
aaagaaccattaaaaaataaagataatttatctacagtttttgttacacaaaaattatgt
tctacagaggtaaaagaaaaaaatattttattaaattcacaatatttttttaaaaataaa
aaaaattggatattgatcctaaaattatcgcaaaagttcttcggttatggatga
DBGET
integrated database retrieval system