Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina): BCTU_173
Help
Entry
BCTU_173 CDS
T01528
Symbol
rnb
Name
(GenBank) exoribonuclease II
KO
K01147
exoribonuclease II [EC:
3.1.13.1
]
Organism
baj
Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
baj03016
]
BCTU_173 (rnb)
Enzymes [BR:
baj01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
BCTU_173 (rnb)
Transfer RNA biogenesis [BR:
baj03016
]
Prokaryotic type
3'processing and CCA adding factors
3'processing factors
BCTU_173 (rnb)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
OB_RNB
S1
CSD2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH39758
UniProt:
F7WZA0
LinkDB
All DBs
Position
207997..209943
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MFQNNPLLMKLKKKLNKKNITVEGIVRSTTKKYGFLELDSQKTYFISAKNMKKVMDGDRI
IGILNIKNNREMVYPKKLIEPFLKKFVGNIYKINDSIFIQPSYPYMKNVKIRCVCDFNKN
TLENGDWVLGKLTQHYLKQKNSFKVKIIEFIVQKTNPLAPWYVILTRYNLEKHPPDIKKI
NQIYNNNFNKLRKNLTHLDFVTIDNCNTKDIDDAVFVKKTLNNNFSLTIAIADPTEYISN
NTELDDIAKQRSFTNYLPGLNIPMLPKILSEDLCSLKQYKIRPVLACRVIIDIKGNILYK
DLKFFLAYIQSKEQLSYDNVSNWLEKTGKWNPKNEEIKKTIIFIKKIYEIRSVWRKKNAL
TFINSPDYRFNLSEKREVLGIFIEHRRVAHKIIEECMITANICAAFFLKKNLGFGLYNTH
IGFDIFNATAASNFLRKYNIIFKSHEIMTLKGFCKLHKYLKNLSNKYIYNRICKFQAFGE
ISLIPQEHFALGLEYYATWTSPIRKYSDIINHRLIKSVLMGLSNIKKPDPKIITHITNRR
RCYRIAGKELEKWLYVQFFLKFYKNNQYLQGIITDIFKNGIQVRLIKHGAFVFIPASFMH
KLKKELSFNTELGVVYIYNKIYYYVTDIIKVRLLSIKKENNTIIASII
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcaaaataaccctttacttatgaagttaaaaaaaaaattaaataaaaaaaatata
acagtggaaggtattgtaagaagtacaaccaaaaaatatggttttttagaacttgattct
caaaaaacatattttatttctgctaaaaatatgaaaaaagttatggatggagatagaatt
atcgggattttaaatataaaaaataaccgagaaatggtttatccaaaaaaattaatagaa
ccttttttaaaaaaatttgtaggaaatatttataaaattaatgattctatttttattcaa
ccaagctatccatacatgaaaaatgttaagattcgttgtgtctgtgattttaataaaaat
actttagagaatggtgattgggttcttggaaaattaacacaacattatttaaaacaaaaa
aattcttttaaagtaaaaattattgaatttattgttcaaaaaacaaatccattagcacca
tggtatgtaattttaacgagatataatttagaaaaacatcccccagatataaaaaaaatt
aatcaaatatataataataattttaacaaacttcgcaaaaatttaactcatttagatttt
gttacaatagataattgtaatactaaagatatagatgatgctgtgtttgttaaaaaaaca
ctaaataataatttttctttaacaatagctattgctgatcctaccgaatatatatctaat
aatacagaattagatgacatagctaaacaacgtagttttactaattatttaccgggactt
aacatacctatgttgcccaaaatactttcagaagatttatgctctttaaaacaatataag
atacgtcctgtgttggcatgtcgtgttattattgacataaaaggaaatatattatataaa
gatttaaaattttttttagcttatattcaatctaaagaacagttatcatatgataatgtg
tcaaattggttagaaaaaacaggaaaatggaatcctaaaaatgaagagattaagaaaaca
attatatttattaaaaaaatatatgaaattagaagtgtatggagaaaaaaaaatgcatta
acatttattaattctcctgattatcgttttaatttatctgaaaaacgagaagttttaggg
atctttattgaacatcgaagagtagcacataaaattattgaagaatgtatgattactgct
aatatatgcgcagcattcttcttaaaaaaaaatttaggatttggattatataatacacat
attgggtttgatatttttaatgctactgctgcatctaattttttaagaaaatataatatt
atatttaaatctcatgaaattatgacattaaaaggattctgtaaattacataaatattta
aaaaatttatctaataagtatatttataatcgaatttgtaaatttcaagcttttggtgaa
ataagtttaatacctcaagaacattttgctttaggattagaatattatgctacttggact
tctcctattagaaaatacagcgatattattaatcatcgtttaattaaatctgttcttatg
ggattaagtaacataaaaaagccagatcctaaaattattactcatattacaaatcgcaga
cgttgttatcgaatagcaggtaaagaattagaaaaatggttatatgttcaattttttttg
aaattttataaaaataatcagtatttacagggtattattactgatatttttaaaaatggt
attcaagtacgtttaataaaacatggtgcttttgttttcatacctgcatcgtttatgcat
aaattaaaaaaagagttaagttttaatacagaattaggtgtagtatatatatataataaa
atttattattatgttacagatattattaaagtacgtttattaagtataaaaaaggaaaac
aatacaattattgctagtataatataa
DBGET
integrated database retrieval system