KEGG   Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina): BCTU_247
Entry
BCTU_247          CDS       T01528                                 
Symbol
nusA
Name
(GenBank) transcription elongation factor
  KO
K02600  transcription termination/antitermination protein NusA
Organism
baj  Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:baj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:baj03021]
    BCTU_247 (nusA)
   03009 Ribosome biogenesis [BR:baj03009]
    BCTU_247 (nusA)
Transcription machinery [BR:baj03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   Other transcription-related factors
    RNA polymerase-associated proteins
     BCTU_247 (nusA)
Ribosome biogenesis [BR:baj03009]
 Prokaryotic type
  rRNA transcription factors
   BCTU_247 (nusA)
SSDB
Motif
Pfam: NusA_N KH_5 HHH_5 KH_NusA_C S1 S1_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEH39828
UniProt: F7WZG6
LinkDB
Position
complement(295772..297271)
AA seq 499 aa
MNKKILSVVDAVSNEKSLPQEKIFEALESALAIATKKKYQKDINIRVNINRKNGILTTFR
RWLVVQVVLNPTKEITLEAAKFENNTIQLSDYIEDRINSVTFDRITTQTAKQIIVQKVRE
AERDMIIEQFRTQKNRIIVGIIKKINRDGVLLDLGSNIEGLMKKKEMLPRENFRIGDRVR
GILYKISSEIYGTQLLISRSNPIMLIELFRIEVPEISEQLIDIKAISRDPGSRSKIAVKT
NDKRIDPVGACVGMRGSRVQAVSNELCGERIDIILWHEKSENFVINAMAPAEVLFIIANK
ENHSMDIAVETCHLAQAIGRNGQNVRLASQLTGWELNVKTLESFQKKKEQDNFSSLEILK
KYLDINDLDISILMKSRFNSLELISRASLSELFSVLGIKKDILLKIQTCAKNILKKYLCK
QKKIFLDASIQNNFIKLNCINNVIIQKLIEKKIYTVEQLAEQSIDDLRDFKMLTNKQIGQ
LIMEARQVCWFNKKTENEK
NT seq 1500 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaaaaatcttatctgttgtggatgctgtttcaaatgaaaaatcgcttccgcaa
gaaaaaatttttgaagctttagaaagtgctttagctatcgctactaaaaaaaaatatcag
aaagatataaatattcgggttaatattaatcgaaaaaatgggattttaacaacatttcgt
agatggttagtagtacaagttgttttaaatcctacaaaagaaattacattagaagcggca
aaatttgaaaataacacaattcaattatctgattatattgaagatcgtattaactcagta
acatttgatcgtattacaactcaaacagctaaacaaataattgtacaaaaagttcgtgaa
gcagaacgcgatatgatcatagaacaatttcggacacaaaaaaatcgtattattgttgga
attataaaaaaaattaacagagatggtgtattgcttgatttaggtagtaatattgaaggt
ttaatgaaaaaaaaggaaatgttaccccgagaaaattttaggattggagatagagtaaga
ggaatattatataaaatatcttcagaaatatatggtacacaattattgattagtcgatcg
aatcctataatgttaattgaattatttcgaatagaagtacctgaaatttcagagcaattg
attgatattaaagctatttcacgtgatcctggatcaagatcaaaaattgctgttaaaaca
aacgataagcgaattgatcctgtaggtgcgtgcgttggaatgcgaggatctcgtgtacag
gcggtatctaatgaattatgcggagaacgtatcgatattattttatggcacgaaaagtct
gaaaattttgtaattaatgctatggcaccagctgaagtattatttattattgcaaataaa
gaaaatcattctatggatatagcagtggaaacatgtcatttagctcaagctattggtcgt
aatggacaaaatgttcgcttagcatcacaattaacaggatgggaattaaacgttaaaact
ttagaatcttttcagaaaaaaaaagaacaggataattttagttctttagaaatattaaaa
aaatatttagatattaatgatttagatatttctattttaatgaaatctagatttaattct
ttagaattaatttctagagcttctttgtctgaattattttctgtgcttggaattaaaaaa
gatatattactaaaaattcaaacatgtgctaaaaacattttaaaaaaatatttatgcaaa
caaaaaaaaatatttttagatgcgtctatacaaaataattttattaaattaaattgtatt
aataatgttattattcaaaaattaatagaaaaaaagatatatacagtagaacaattagca
gaacaaagtattgatgatctaagagattttaaaatgttaacaaataaacaaattggtcaa
ttaattatggaagctagacaagtatgttggtttaataaaaaaacagagaatgaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system