Buchnera aphidicola Ak (Acyrthosiphon kondoi): BAKON_240
Help
Entry
BAKON_240 CDS
T01825
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bak
Buchnera aphidicola Ak (Acyrthosiphon kondoi)
Pathway
bak03030
DNA replication
bak03430
Mismatch repair
bak03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bak00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BAKON_240 (dnaE)
03430 Mismatch repair
BAKON_240 (dnaE)
03440 Homologous recombination
BAKON_240 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bak03032
]
BAKON_240 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bak03400
]
BAKON_240 (dnaE)
Enzymes [BR:
bak01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BAKON_240 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
bak03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BAKON_240 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bak03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BAKON_240 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DNA_pol_IIIA_C
tRNA_anti-codon
HROB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEO08595
UniProt:
G2LMV7
LinkDB
All DBs
Position
263943..267428
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MNEPKFIHLHVHSDYSIIDGLSKPEELVKKAAFLNMPAIAITDYCNLYGVIKFYNIAHKV
GLKPIIGITVKFFSDLINNELTKLTLLASTQEGYKNLILLISYAHQKGYINNNEVTIEKK
WLSEINKGLILLSGGPQGELGKVLLHGQSSLTFNCLSFYQKYFPDSYYLELFRTNRNNEE
TYLDLAIDLSLSTGIPVVATNDVCFLNKEDFKVHKIRIAINEGETLQNSKIQNNYSNQQF
LKSTKEMCDLFSDIPEALINSVEIAKRCNVFISSGKYFLPQFPTGEISVENYLIAQAYRG
IKKRLSLWCLDNKKYKSIYNQYKNRLDMELNVINKMGFPGYFLIVMEFIQWAKDNSIPVG
PGRGSGAGSLVAYALNITEVDPLSFNLLFERFLNPERISMPDFDIDFCMEKRDKVIDHVS
DIYGRNAVAQIITFGTLTAKAVIRDVGRVLGYPYGFINKLSKLVPLDPGITLNEAFSKES
ELSNLYKNNEDVKILIDIAKKLEGTNRNVGKHAGGVVISPTKITDFCPLYCDEKGDNPVT
QFDKNDIEYVGLVKFDFLGLRTLTIISYAVEMINIKLKFNKKNLININLIPLDDIASFDL
LKKSETTGVFQLESYGMKDLIKRLQPDCFEDIIALVALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGRE
NISYPDHKWQHVLLKPILESTYGIILYQEQVMQIAQVLAGYTLGSADILRRAMSKKNLKD
MSKQRAIFESGALKNGIDKKLSIKIFDLLEKFAGYGFNKSHSVAYALVSYQTLWLKAHYP
AEFIAAAMTSDIDNTEKLVILVNESFNMRVKIIPPNINISKYEFYVNHESNIVYGIGAIK
GIGENSVRDLIREREKNGLFHDLFDLCMRMDSNKITRRVLEKLIMSGSCDCFNTNRNYLL
KSIDDAINASKESFRTKFFKQESLFGVFKNQLNQVKKNNFVNLSCSEKNKLENEYQVLGF
YLTGHPIDQYVKELKNYVNGMTLSQLKFAEKRKEFLVVGIIVSIKIKTTKNKNRIAILTL
DDNTGRLEVLIFTALLDIYESLLKINKLLFVKGVLNISFINKYINMTAHDLMSLSMVRDK
NIHKLTIILSEDKKDTSFLKKLYQCLDKQPKGNVPVCISYNKKRVCLNLTLNQKWFVIIT
DDFLNELKLLVGSKKIKLEYA
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaaccaaaatttattcatcttcatgtacatagtgattattcgattattgatgga
ttgtcaaaacctgaagaattagtcaaaaaagcagcatttttaaatatgcctgctattgca
ataactgattattgcaatttatatggtgtaattaaattttataacatagcgcataaagtg
ggtttaaagcctattatcggtattacagtaaaatttttttctgatttaattaataacgag
ttaacaaaattaactttattagcctctactcaagaaggctataaaaatttaatattatta
atttcttatgcacatcaaaaaggatatattaataataacgaggttactattgaaaaaaag
tggttgtcagaaatcaataaaggattaatattactttctggaggtcctcaaggtgaactt
ggaaaagttttgcttcatggtcaatcctcattaacatttaattgtttatcgttttatcag
aaatattttcctgattcttactatttagaattatttcgtacaaaccgaaataatgaagag
acatatttagatttagctatagatttatctttatctacaggaattcctgttgttgcgact
aatgatgtttgtttcttaaataaagaagattttaaagttcataaaattagaattgctatt
aatgaaggtgaaacattacaaaattcaaaaattcaaaataattatagtaatcaacaattt
ttaaaaagtacaaaagaaatgtgtgatcttttttcagatattccagaagcacttattaat
agtgtagaaattgcgaaacgttgtaatgttttcatatcttctggaaagtattttttacca
cagtttccaactggagaaattagtgttgaaaattatttaattgcacaagcatatagaggc
ataaaaaaacgtttaagtctttggtgcttagataataaaaaatataaaagtatttataat
caatataaaaatcgtctagatatggaattaaatgtaattaataaaatgggttttcctgga
tattttttgattgttatggaatttatacaatgggcaaaagataatagtattccagtaggt
ccaggacggggttctggtgcaggttctcttgtagcctatgctttgaatattacagaagtt
gatccgttatcttttaatcttttattcgaaagatttttgaatccagagcgtatttcaatg
cctgattttgatattgatttttgtatggaaaaacgtgacaaagtaattgatcatgtttca
gatatatatggtagaaatgcggtagcgcaaattattacttttggaacattaacagcaaaa
gctgttattagagatgtaggtcgagttttaggatatccatacggatttatcaataaactg
tctaagttagtacctttagatcccggtataactttgaatgaagctttttctaaagaatct
gaattatctaatctttataaaaataatgaagatgttaaaattttaattgatattgctaaa
aaattagaaggaacaaatagaaatgttggtaaacatgcaggtggtgtagttatttctcct
actaaaattactgatttttgtccattatattgtgatgaaaaaggggataatccagtaact
caatttgataaaaatgatatagaatatgtaggattagtaaaatttgattttcttggttta
cgtacacttacgattattagttatgcagttgaaatgattaatataaaattaaagtttaat
aaaaaaaacttaataaatattaatttaattcctcttgatgatattgcatcttttgattta
ttaaaaaaatctgaaactactggtgtattccaattagaatcctatggcatgaaagattta
atcaaaagattacaacctgactgttttgaagatattattgctttagtagcactttttaga
ccaggtcctctacagtctgggatggttgataattttattaatcgaaaacacgggcgtgaa
aatatttcatatcctgatcataaatggcaacatgtattattaaaacctatattagaatca
acgtatggtattatattataccaagaacaagtcatgcaaatagcacaggttttagcaggt
tatacacttggaagtgcagatattttaagacgagcaatgagtaaaaagaatttgaaagat
atgtcaaaacaacgtgctatttttgaatcaggagctttaaagaatggtattgacaaaaaa
ttatcaataaaaatttttgatttattagaaaaatttgcaggatatggttttaataaatct
cattctgttgcttatgctttagtttcgtatcaaacattatggttaaaagcacattatcct
gctgaatttatagctgcagctatgacatctgatatagataatacagaaaaacttgttatt
ttagttaatgaatcttttaatatgagagtaaaaattataccaccaaatatcaatataagt
aaatatgaattttatgtgaatcatgaaagtaatatagtttatggtattggtgctattaaa
ggtataggagaaaactcagtacgagatcttatccgagaacgtgagaaaaatggattgttt
catgatttatttgatctttgtatgagaatggattctaataagataactcgtagagtctta
gaaaaattaattatgtctggtagttgtgactgttttaatacaaatagaaattatttgctt
aaatcaattgatgatgctataaatgcatcaaaagaatcttttagaacaaaattttttaaa
caagaaagtcttttcggtgtctttaaaaatcaattaaatcaagtgaagaaaaataatttt
gttaatctttcttgttctgaaaaaaataaattagaaaatgaatatcaagtattaggattt
tatcttacaggacatcctattgatcaatatgtaaaagaactaaaaaattatgtgaatggt
atgacattgtcacaattaaaatttgctgagaaaagaaaggaatttttagttgtaggaatt
atagtttctattaaaattaaaactactaaaaataagaatcgaatagctattttaacatta
gatgataatactggtcgtttagaagtcttaatttttacagctttattagatatatatgaa
tctcttttaaaaataaataaacttttatttgtaaaaggagttttaaacattagttttatt
aacaaatatattaatatgacggctcatgatcttatgagcttaagtatggtaagagacaaa
aacatacataaactaacaattatattaagtgaagataaaaaagatacatcttttttaaaa
aaattgtatcaatgtttagataaacaacctaaaggaaatgtgcccgtttgtatttcttat
aataaaaaaagagtatgtttaaatttaacattgaatcaaaagtggtttgttataattacc
gacgattttttaaatgaattaaaattactagtaggatcaaaaaaaataaaattagaatac
gcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
