Bacillus altitudinis: CFN77_09750
Help
Entry
CFN77_09750 CDS
T05199
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
balt
Bacillus altitudinis
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
balt00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
CFN77_09750
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
BclA_C
CBM_5_12
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATH72477
LinkDB
All DBs
Position
1903519..1907193
Genome browser
AA seq
1224 aa
AA seq
DB search
MGNLYNQYDNKCPFCGKKHDWQPHYRKSRHDRPLFDDCPLLKRECKKKKVVKHHSTCAKA
KGRKKTNTKIVKRGPTGATGPTGATGDTGPTGAGLTGIEAFDPVVSPTYPVGQVVTFNGS
TYVVNTAPPTGTPDTSPDYTLLAAAGSTGVTGDTGSTGVTGDTGATGVTGDTGPTGATGV
TGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGAGLTGIEAFDPVVSPTYPVGQVVTFNGSTYVVNTAPP
TGTPDTSPDYTLLAAAGSTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGDTGP
TGPTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGDTGATGATGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGP
TGATGPTGATGDTGATGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTSPTGATGVTGD
TGPTGATGVTGDTGPTGATGDTGATGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGP
TGPTGATGDTGPTGATGDTGSTGATGATGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGDTGPTGP
TGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGATGDTGPTGPTGATGPTGATGDTGATGATGV
TGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTSPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGV
TGDTGSTGATGATGATGATGPTGATGVTGDTGPTGPTGATGVTGVTGDTGPTGATGVTGD
TGPTGATGATGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGD
TGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGD
TGSTGATGATGATGPTGATGVTGDTGPTGPTGATGVTGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGA
TGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGATGVTGDTGPTGAGLTGIEAFNPVVSPSYQVGQVVTF
NGSTYVVNTAPPTGTPDTSSDYTLLAAAGLTGSTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGP
TGATGSTGPTGATGSTGPTGSTGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGSTGPTGATGS
TGPTGASGPTDTALYAGNTTGPTIITIAGGTNIALPSNQNINGFTPNGLNDTFTVQQTGK
YYITYQVNTTAALLVSTRLWLNGSTAIPGSIQSSAVSTTFMSNTVIVNLTAGNTISLQFF
GAVVTAILIGGGATGASLTIIRLS
NT seq
3675 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaatttgtataatcagtacgataacaaatgtcccttttgcggaaaaaagcatgat
tggcaacctcattacagaaaatctcgtcacgatagacctttatttgatgattgccctctt
cttaaacgagaatgtaaaaagaaaaaagttgttaaacatcacagcacttgtgctaaagca
aaaggacgaaaaaaaacaaatactaagattgtaaaaagaggtccaactggtgcaactgga
cctaccggagctactggagatactggacctaccggtgcaggattaacaggaattgaagcg
tttgatccggtagtaagtcctacttacccggtagggcaagtagtgacctttaatggcagt
acgtatgtagtaaatactgcaccaccgacaggtacaccagatacttccccagactacaca
ttactggctgcagcaggatcaactggagtaactggagatacgggttctaccggtgtaact
ggagataccggtgccactggtgtaactggtgataccggacctaccggagctactggtgta
actggagttactggagataccggacctactggagccactggtgcaactggagataccgga
cctaccggtgcaggattaacaggaattgaagcgtttgatccggtagtaagtcctacttac
ccggtagggcaagtagtgacctttaatggcagtacgtatgtagtaaatactgcaccaccg
acaggtacaccagatacttccccagactacacattactggctgcagcaggatcaactgga
gtaactggtgataccggacctactggtgcgactggtgtaactggtgataccggacctacc
ggtgcgactggtgtaactggtgatacgggtccaactggagccactggagataccggacct
accggacctactggtgtaactggagataccggacctaccggtgcgactggtgtaactggt
gatacgggtccaactggagccactggtgataccggtgcgactggagccactggtgtaact
ggagataccggacctactggagccactggtgcaactggagataccggacctactggtcca
accggtgctactggtccaactggagccactggtgataccggtgcgactggagccactggt
gtaactggagataccggacctaccggtgcgactggtgtaactggtgatacgggtccaacc
ggtgcgactggagtaactggtgatacgagtcctaccggagctactggtgtaactggagat
accggacctaccggtgcgactggtgtaactggtgatacgggtccaactggagccactggt
gataccggtgctactggagccactggtgtaactggtgataccggacctactggagccact
ggtgtaactggtgataccggacctactggtgcgactggagtaactggagataccggacct
accggacctactggtgcaaccggtgatacgggtccaaccggtgcgactggtgatacgggt
tctaccggtgcaactggagccactggtgcaactggagataccggacctaccggtgcgact
ggtgtaactggtgatacgggtcctactggagccactggtgataccggacctaccggacct
actggtgcgactggtgtaactggtgatacgggtcctactggagccactggtgtaactgga
gataccggacctactggagccactggtgcaactggagataccggacctactggtccaacc
ggtgctactggtccaactggagccactggtgataccggtgcgactggagccactggtgta
actggagataccggacctaccggtgcgactggtgtaactggtgatacgggtccaaccggt
gcgactggagtaactggtgatacgagtcctaccggagctactggtgtaactggagatacc
ggacctactggtgcgactggagtaactggagataccggacctactggagccactggtgta
actggtgatacgggttctaccggtgcaactggagcaactggagccaccggagctactggt
ccaactggagccactggagttactggagatactggtcctactggtccaaccggtgccact
ggtgtaactggagttactggtgatacgggtcctaccggtgcaactggtgtaactggtgat
accggacctaccggtgcaactggtgcaaccggagatactgggcctaccggtgctactgga
gtaactggtgatacgggtcctaccggagctactggtgtaactggagataccggacctact
ggagccactggagtaactggtgatacgggtcctaccggtgccactggagtaactggagat
accggacctactggtgctactggagtaactggagataccggacctactggagccactgga
gtaactggtgatacgggtcctaccggtgccactggagtaactggagataccggacctact
ggtgctactggagtaactggagataccggacctactggagccactggtgtaactggtgat
acgggttctaccggtgcaactggagccaccggagctactggtccaactggagccactgga
gttactggagatactggacctactggtccaaccggtgccactggtgtaactggagtaact
ggtgatacgggtcctaccggagctactggtgtaactggtgataccggacctactggagcc
actggagtaactggtgatacgggtcctaccggtgccactggagtaactggtgataccgga
cctaccggagccactggagttactggagataccggacctaccggtgcaggattaacagga
attgaagcgtttaatccggtagtcagcccttcttaccaagtagggcaagtagtgaccttt
aatggcagtacgtatgtagtaaacactgcaccaccaacaggtacaccagatacttcctca
gactacacattactagctgcagcaggactaactggaagcactggagctactggaagcact
ggtccaactggagctaccggaagcaccggtccaactggagctactggaagcaccggtcca
actggagctactggaagcactggtccaactggagctactggaagcaccggtccaactgga
tctactggaagcactggtccaactggagctactggaagcaccggtccaactggagctacc
ggaagcactggtccaactggagctactggaagcaccggtccaactggagctaccggaagc
actggtccaactggagctagcggtccaactgatacggcactttatgctggaaatacaaca
ggtcctacaatcattactattgctggtggtacgaacattgctttaccaagtaatcaaaat
attaatggatttacgccgaatggtttaaatgatacattcacagtccagcaaacaggtaaa
tactatatcacatatcaagtaaataccactgctgcacttttagtgagcacaaggctatgg
ttgaatggatcaactgctattccaggttcaattcagtcgtctgccgtatctacaactttt
atgagcaatacagttattgtcaatttaacagcaggaaatacaatttcattacaatttttc
ggagcggttgtaacagccattctaataggtggtggtgcaaccggtgcatcgcttaccatc
atcagactcagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
