Burkholderia ambifaria AMMD: Bamb_4575
Help
Entry
Bamb_4575 CDS
T00398
Name
(GenBank) hemagluttinin domain protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
bam
Burkholderia ambifaria AMMD
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bam00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bam02000
]
Bamb_4575
Transporters [BR:
bam02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Bamb_4575
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
ESPR
YadA_head
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI90125
UniProt:
Q0B6U8
LinkDB
All DBs
Position
2:1529890..1537371
Genome browser
AA seq
2493 aa
AA seq
DB search
MNRTYRSIWNEALGAWVAASEHDSARGKPNKSAVVVAAVAALTIGLPGFAEANTLNTQQT
CFTGSNSAVGRVNPGGTQNQAGDGSGTYSVVAGCNSNGNGWTGVTVYGSFAQATGNGAVA
TGMQSSAGLWGVAAGLETTASGTGATALGFGSTASALNSVAIGGAGGNGTTPLSQANSTL
ASGAGAIAIGSNATKGAQSAASDGIAIGGQSSVASTATSGIAIGRGATVNGAYGIAQGDG
VISGATGQNVAIGSSGTTANSATATGGAVAIGRGQVASGDGAVAIGDPNSATGTGALAIG
ANNTSSGSGALALGNGNSASGTGAVALGNSSTATNSSVAIGNAATSNVANSVALGGGSVT
TSAASATTGGTTTVSNTTIGGQTFGNYAGAGSAGGVVSVGQPNAERRIQNVAAGLVSATS
TDAINGSQLFAVASTTTSSITSLSTSASTGLSSANSSISSLSTSTSTGINSLSTGLSSTN
SSVTSLSSSTSTGLSSANSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSSSASTGLSSA
NSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANSSIGSLSTSTSTGINS
LSTGLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANSSIGSLSTGLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANS
SIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSSSTSSGLSSANSSIGSLSTGLSSTNSSVT
SLSSSTSTGLSSANSSISSLSTSTSTVLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANSSIGSLSTST
STGLSSTNSSVASLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANSSIGSLSTS
TSTGLSATNSSVASLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSSSTSTGLSSANSSISSLST
STSTGLSSTNSSVASLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVVSLSTSTSTGLSSANSSIGSLS
TGLSTVTTKTDNLGNSTAAALGGGASYNPATGSVSAPSYTTYNANGTTSTANSVGSAIDS
INNQGIKYFHANSTGTDSQALGTDSVAIGPHAIANHTGDVALGSGSVTGTPNATPTGTVG
GVTSTFAGGNPTSVVSVGDASTGTTRQITNVAAGQITATSTDAINGSQLFATNSAVDSLS
TTVSSSSNAIASLSTGITSLSTGLSSTNSSVTSLSSSASTGLSSANSSITSLSTSTSTGI
NSLSTGLSSTNSSVTSLSTSTSTGLSSANSSITSLSTSTSTGINSLSTGLSSTDSSVASL
STSTSTGLSSANSSISSLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVTSLSTSTSTGLSSANSSITS
LSTSTSTGINSLSTGLSSTDSSVASLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLS
STDSSVASLSTSTSTGISSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTNSSVASLSTSTSTGL
SSATSSIGSLSTGLSSTDSSVASLSTSTSTGLSSATSSISSLSTGLSSTDSSVASLSTST
STGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTDSSVASLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTS
TSTGINSLSTGLSATDSSVASLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTDS
SVASLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSATDSSVASLSTSTSTGLSSAT
SSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTDSTVTSLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSL
STGLSSTDSSLTSLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTSTSTGINSLSTGLSSTDSSLTSLSTS
TSTGLSSATSSISSLSTSTSTGLSSATSSIGSLSTGLSSTNSSLTSLSTSTSTGINSLST
GLSSTNSSVASLSTSTSTGLSSATSSISSLSTSTSTGLSSATSAIGSLSTGLSSTDSTVT
SLSTSTSTGLSTATSSITSLSTSTSTAIDAAKTHYYSVNDNGTQQANYANDGATGINSLA
AGVNASAAGASSVAVGDGSNAQTAGAVAIGQNASATGGKAVSIGSGNTASGDGAVAIGDP
SVATGTGAVAMGANDTATGDGAVALGNANTATGNSALALGSSSQATADNTIALGNKAVAS
AIGAQAYGSAASATAADALAFGTNATANVANSIALGANSVTSAAVGTSSATIGGVSYLFA
GSSPVGVVSVGQPGQERQITNVAAGRISPTSTDAINGSQLNATNQAVSSLSTSTASNISS
LSTGIGSLSTGLSSTNSSVTSLSTSTSTAISSLSTGLSSTNSNLTSLSTSTSTGIGSLST
GLSTTNSTVASLSTGVTNLGDQVSQLSTTINNNTTRSLSNNGVAVDMNGTGNDRPTVTAG
TNSVAIGANSNDGGRSNVVSVGSDTQQRQITNVAPGTQGTDAVNVNQLTQVQTTLSTALS
GQQTQINSLGSQLQQTDQMAKQGIAAVGAMASIPQLDRDANFGMGVGTSTFLGQKAMAVN
MQARITENLKASINGGFSGGQKVIGAGMLYQWK
NT seq
7482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccgcacataccgctcgatctggaacgaagcccttggcgcctgggtcgcggcatcc
gaacacgattcggcacggggtaagccgaacaagtcggccgttgtggtcgccgcagtcgcg
gcactgacgatcgggctgcccggcttcgccgaggccaatacgctcaacacacagcagacc
tgctttacgggcagcaacagcgcggtcggccgcgtgaatccgggcggcacgcaaaaccag
gccggcgacggctccggcacgtattcggtcgtggccgggtgtaactccaacggcaacggc
tggaccggcgttacggtttatggctcgttcgcacaggcgaccggcaacggcgcggtcgcc
accggcatgcagtcgtcggcgggcctgtggggcgtcgcggccggcctcgaaaccaccgcc
agcggcaccggtgcgaccgccctcggcttcggctcgacggcgagcgcgctgaactcggtc
gcgatcggcggcgcgggcggcaacggtacgacgccgctctcgcaggcaaactcgacgctc
gcgtcgggcgcaggcgcgatcgcaatcggcagcaacgcaacgaagggcgcgcagtcggcc
gcctccgacggcatcgcgatcggcggacagtcgtccgtcgcatcgaccgccacgtcgggt
atcgccatcggccgcggcgcgaccgtcaatggggcgtatggcatcgcacaaggtgacggc
gtcatctcgggcgcgacgggccagaacgtggcgatcggttcgtccggcacgaccgcgaac
agcgccacggctaccggcggcgcggtcgcaatcggcagaggccaggttgcaagcggcgac
ggcgccgttgcgatcggcgatccgaacagcgcgaccggcacgggcgcactggcgatcggc
gcgaacaacacgtcgagcggttcgggcgccctcgcgctcggcaatggcaactcggcgagc
ggcacgggcgccgtcgcgctgggcaacagcagcacggcgaccaacagctcggttgccatc
ggcaacgccgcgacctcgaacgtcgcgaattcggtcgcactcggcggcggttcggtgacg
accagcgccgcatcggcgacgacgggcggcacgacgaccgtcagcaacacaacgatcggt
ggccagacgttcggcaactacgcgggcgcgggatcggcaggcggcgtcgtcagcgtcggt
cagccgaatgcggaacgccggatccagaacgtcgcggcgggcctcgtcagcgcgacgagc
acagacgcgatcaacggcagccagctcttcgccgtggcaagcaccacgacgtcgagcatt
acgagcttgtcgacttccgcgtcgactggtttgtcgtcggcgaatagctcgatctcgtca
ctgtcgacttccacttcgaccgggatcaactcgttgtctaccggcctgagctcgaccaat
agctcggttacgtcgctttcgtcgtcaacgtccaccgggctgtcgtcggctaacagctcg
atcggctcgctctccacgtcgacctcgacgggcatcaactcgctgtcgaccggcctcagc
tccaccaatagctcggttacgtcgctttcgtcgtccgcgtccaccggactctcgtcggct
aatagctcgattggctcgctctccacgtcgacctcgaccggcatcaactcgctgtcgacc
ggcctcagctccaccaatagctcggttacgtcgctttcgtcgtcaacgtccaccggactg
tcgtcggctaacagctcgatcggttcgctctccacctcgacctcgacgggcatcaactcg
ctgtcgaccggcctcagctcgaccaatagctcggttacgtcgctttcgtcgtccacgtcg
accggtctctcgtcggctaatagctcgatcggctcgctctcgactggcctgagctcgacc
aacagctcggttacgtcgctctcgtcgtccacgtccaccggactctcgtcggctaatagc
tcgatcggctcgctctccacgtcgacctcgacgggcatcaactcgctgtcgaccggcctc
agctccaccaatagctcggttacgtcgctttcgtcgtcaacgtccagcggactctcgtcg
gctaatagctccatcggttcgctctcgaccggcctcagctcgaccaacagctccgttact
tcgctgtcgtcgtcgacctcgacggggctttcgtcggcaaacagctcgatctcgtcgctg
tctacctccacttcgacggttctcagctccacgaacagctcggttacttcactttcgtcg
tcgacatcgacgggtctttcgtcggcaaacagttcgatcggctcgctctcgacttccact
tcgacgggtctcagctcgaccaatagctccgttgcttcactgtcgacttccacctcgacc
ggcatcaattccttatccacgggcctgagctcgaccaacagctcagttacgtcgctctcg
tcgtcgacctcgacgggtctttcgtcggcaaacagctcgatcggctcgctctcgacttcc
acttcgacgggtctcagcgcgaccaatagctccgttgcttcactgtcgacttccacctcg
accggaatcaactccttgtccacgggactgagctccaccaacagctccgtcacttcactt
tcgagctccacgtcgacgggtctgtcttcggctaacagctcgatctcgtcgctgtcgact
tccacctcgacaggtctcagttcgacaaacagctccgttgcttcgctgtcgacttccacc
tcgaccggcatcaactcgttgtccacgggcctgagctccaccaacagctccgtcgtttcg
ctgtcgacctccacgtcgaccggcctctcgtcggcaaacagctcgatcggttcgctgtcg
acgggcctcagcacggtcacgaccaaaaccgacaatctcggcaacagcaccgccgcggcc
ctcggcggcggcgcgagctacaacccggcgaccggctcggtttccgctccgtcgtacacc
acgtacaacgcgaatgggacgacgtcgaccgccaacagtgtcggctcggcaatcgacagc
atcaacaaccagggcatcaagtacttccacgcgaattcgacgggcacggacagccaggcg
ctcggcaccgactcggtcgcgatcggtccgcacgccatcgccaaccacaccggcgacgtc
gcgctcggcagcggctccgtcaccggcaccccgaacgcaacgccgaccggtaccgtcggc
ggcgtgacgagcacgttcgcgggcggcaatccgaccagcgtcgtgagcgtcggcgacgcg
agcacgggcaccacgcgtcagatcaccaatgtcgcggcaggtcaaatcacggcgaccagc
accgacgcgatcaacggctcccagctcttcgcgaccaattcggccgtggattcgctgtcg
acgacggtgtcgtcatccagcaacgcaatcgcgtcgctgtcgaccggcatcacttcgttg
tcgacaggcctcagctcgactaacagctcggttacgtcgctctcgtcgtccgcgtcgacc
ggcctctcgtcggctaatagctcgatcacatcgctctccacgtcgacttcgaccggtatc
aactcgctgtcgactggcctgagctcgaccaacagttcggttacctcactgtcgacctcc
acgtcgacgggtctctcgtcggctaatagctcgatcacgtcgctctccacgtcgacctca
accggtattaactcgttgtcgaccggtctgagctccaccgatagctcggtcgcctcactg
tcgacctcgacgtcgaccggcctgtcgtcggcgaatagctcgatctcgtcgctctccacg
tcgacctcaaccggtattaactcgttgtcgactggcctgagctcgaccaacagttcggtt
acctcactgtcgacctccacgtcgacgggtctctcgtcggctaatagctcgatcacgtcg
ctctccacgtcgacttcgaccggtatcaactcgctgtcgactggcctgagctcgaccgac
agctcggtggcgtcgctgtcgacttcgacgtcgaccggcctgtcgtcggcgacgagctcg
atcggttcgctgtctacgtcgacttcgacgggcatcaactcgctgtccacgggcctcagc
tccaccgacagctcggtggcttcgctgtcgacctccacgtcgaccggcatctcgtcggca
accagctcgatcggttcgctgtccacgtcgacttcgacgggcatcaattcgctgtccact
ggcctcagctcgaccaatagctcggtggcttcgctgtcgacttccacgtcgaccggcctc
tcgtcggcgacgagctccatcggttcgctgtcgacgggcctgagctcgaccgatagctcc
gtcgcttcgctgtcgacttcaacgtcgacgggtctgtcgtcggcgacgagctcaatcagt
tcgctgtccacgggcctcagctccaccgacagctcggtggcgtcgctgtcgacttccacg
tcgactggcctctcgtcggccacaagctcgatcggttcgctgtccacgtcgacctcgacg
ggcatcaactcgttgtcgacgggtctgagctccacggatagctcggtcgcttcgttgtcg
acctcgacgtcgaccggcctctcgtcggcgaccagctcgataggttcgctgtccacgtcg
acttcgaccggtatcaactcgttgtcgactggcctcagcgcgaccgacagctcggttgct
tcgctgtcgacttccacgtcgacgggcctctcgtcggccacaagctcgatcggttcgctg
tccacgtcgacctcgacgggcatcaactcgttgtcgacgggtctgagctccacggatagc
tcggtcgcttcgttgtcgacctcgacgtcgaccggcctctcgtcggcgaccagctcgata
ggttcgctgtccacgtcgacttcgaccggtatcaactcgttgtcgactggcctcagcgcg
accgacagctcggttgcttcgctgtcgacttccacgtcgacgggcctctcgtcggccaca
agctcgatcggctcgctgtccacctcgacgtcgacgggcatcaactcgctgtcgactggc
ctgagctcgactgacagcacagtaacgtcgctctcgacctccacgtcgacgggcctgtcg
tcggccacaagctcgatcggctcgctgtccacgtcgacctcgacgggtatcaactcgctg
tccacgggcctcagctccaccgacagctcgctcacgtcgctctcgacctccacgtcgacc
gggctgtcgtcggcaaccagctcgatcggctcgctgtccacgtcgacttctaccggcatc
aactcgttgtcgacgggcctcagctcgaccgatagctcgctcacgtcgctctcgacttca
acgtcgacgggtctctcgtcggcgaccagctcgatcagctcactgtccacctcgacctcg
actggcctctcgtcggccaccagctcgatcggctcactgtccaccggcctcagctcgacc
aacagttcgctgacgtcgttgtccacgtcgacctccaccggcatcaactccttgtcgacg
ggcctgagctccacgaacagctctgtcgcatcgctgtcgacctcgacgtcgaccggcctc
tcgtcggcgacaagctcgatcagctcgctgtccacctcgacgtcgaccggcctctcatcc
gcaaccagcgcgatcggttcgctgtccaccggcctgagctcgaccgacagcacggtaacg
tcgctgtccacctccacgtcgacgggtctgtcgacggccaccagctcgatcacgtcgctg
tccacctcgacgtcgaccgcgatcgacgccgcgaaaacgcactactacagcgtcaacgac
aacggcacgcagcaagccaactacgccaacgacggcgcaacgggcatcaactcgctcgca
gccggcgtgaacgcgagcgccgcaggcgccagcagcgtcgcggtcggcgacggctcgaac
gcgcagacggcgggtgcagtcgcgatcggccagaacgcgtcggccaccggcggcaaggcg
gtgtcgatcggctccggcaacaccgcgagcggcgacggcgcggtcgcgatcggcgacccg
agcgtcgcaacgggcaccggcgcagtggcgatgggcgcgaacgacacggcgaccggcgac
ggcgcagtggcgctcggcaacgcgaacaccgcaaccggcaacagcgcgctcgccctcggc
agctcgagccaggccaccgcggacaacacgatcgcgctcggcaacaaggcagtcgccagc
gccatcggcgcccaggcctacggctcggctgcatcggccaccgcggcggatgcgctcgcc
ttcggcacgaacgccacggcgaacgtcgcgaactcgatcgccctcggtgcgaactcggtc
acgagcgcggcagtcggcacctcgagcgccacgatcggcggcgtctcgtacctgttcgcg
ggcagctcgccggtgggcgtggtgagcgtcggccagccggggcaggaacgccagatcacg
aacgtcgcggcaggccggatctcgcccaccagcacggacgcgatcaacggcagccagctc
aacgcgacgaaccaggcagtcagcagcctgtccacgtcgaccgcgtcgaacatctcgtcg
ctgtcgaccggcatcggttcgctgtccacgggcctcagctcgaccaacagctcggtgacg
tcgctgtccacgtcgacgtcgacggcgatcagctcgctgtcgacgggcctcagctcgacg
aacagcaatctgacgtcgctgtccacgtcgacctcgaccggcatcggctcgctgtcgacc
ggcctgagcacgacgaacagcacggtggcgtcgctgtcgacgggcgtgacgaacctgggc
gatcaggtatcccaactgtcgacgacgatcaacaacaacacgacgcgctcgttgagcaac
aacggtgtcgcggtcgacatgaacggcacaggcaacgatcggccgaccgtcaccgccggc
acgaactcggtggcgatcggcgcgaattcgaatgacggcggtcgttcgaacgtggtgtcg
gtcggcagcgacacgcagcagcgccagatcacgaacgtcgcgccgggcacgcaaggcacc
gatgcggtgaacgtgaaccagctgacgcaggtgcagacgacgctgtcgacggcactgtcg
ggccagcagacgcagatcaactcgctgggttcgcaactgcagcagaccgaccagatggcg
aagcagggtatcgcggccgtcggcgcgatggcgtcgatcccgcagctcgatcgcgacgcc
aacttcgggatgggtgtgggcacatcgaccttcctcggccagaaagcgatggcggtcaac
atgcaggcgcggatcaccgagaacctgaaggcgtcgatcaacggcggcttcagcggcggt
cagaaggtgatcggcgcgggcatgctgtatcagtggaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system