Borreliella americana: QIA01_05420
Help
Entry
QIA01_05420 CDS
T09264
Name
(GenBank) variable large family protein
Organism
bame
Borreliella americana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lipoprotein_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOU12964
LinkDB
All DBs
Position
lp28-8:2305..8445
Genome browser
AA seq
2046 aa
AA seq
DB search
MGESVANSVKADAASVKGIAIGIKGIVDAAAEGGVKLETAAVAVDDVSNKDAGKMFGSGG
AAGADAAAEGGVKLEPAAAVDDDVSNKEAGKMFGTGGAGGAAAAADVAKAAAAVGVVSGE
QILKAIAAAAAAADSGNHEGKKGGEAENAIQAAVGGDGKIGESATNGAKADAASVKGIAI
GIKGIVDAAAEGGVKLETAAVADVDNKDAGKMFGAGVGAGANAGEVAKAAAAVGVVSGEQ
ILKAIAAAAADSSNHDGKKGGDAENAIQAAIGGNNQQGENFADGKLGKKSDQIAAALVLR
GMAKDGKFSVADAADAAAADVAKAAADGVGKIGESVANGAKADAASVKGIAIGIKGIVDA
AAEGGVKLETAAVAVDDVSNKDAGKMFGTAGGADAAAGDVAKAAAAVGDGKIGESVANGV
KADAESVKGIAIGIKGIVDAAAEGGVKLETAAVVDDVSNKDAGKMFGAGVGGDAAAGDVA
KAAAAVGGGKHDGKKGGDAENAIQAAIGGNQQGGEAFVDGKLGKKSDQIAAALVLRGMAK
DGKFSVANAAKKTAKSTVEAAVDDDSSKHDGKKGSDAENAIQAAIGGNQQGGEDFNDGKL
GKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVTAGDAEKTAKSTVEAAANGAKADAESVKGIAIGIKG
IVDAAAEGGVKLEPVAAAVDDDVSNKEAGKMFGAGVGAGANAGEVAKAAAAVGVVSGEQI
LKAIADAAGDSSNHDGKKGNQAENAIRAAIGGDNQGGEDFDDNKLGKKSDQIAAALVLRG
MAKDGKFSVADAGAQKTAKSTVEAAVDDDSSNHDGKKGDDAENAIQAAIGDGQGEAFNDG
KLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVANAAGAKKTAKSTVEAAAEGGVKLEPAVAVDVDN
KEAGKMFGTAGGGAAAAAVAKAAAAVGVVSGEQILKAIADAAGDSSKHEGKKGGDAENAI
QAAIGGDNQGGEDFNDSKLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVNADAAGAQKTAKSTVEA
AANGAKADAASVKGIAIGIKGIVDAAAEGGVKLETAAVDNVDNKEAGKMFGTAAGDAADA
SEVAKAAAAIGGDNQGEAFDDNKLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVNADAAGAQKTAK
STVEAAVDADSSKHDGKKGDEAENAIQAAIGGDGQGGEDFNDGKLGKKSDQIAAALVLRG
MAKDGKFSVNAADAAAQKTAKSTVEAAANGAKADAESVKGIAIGIKGIVDAAAEGGVKLE
TAAVAVDNVSNKDAEKMFGTGGVGGGDAAAGDVAKAAAAVGVVSGEQILKAIAAAADSGK
HDGKKGSQAENAIQAAIGGDQGGEAFADEKLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVNAGAA
KKTAKSTVEAAGDDDSSKHDGKKGDDAENAIQAAIGGDQGEAFDDGKLGKKSDQIAAALV
LRGMAKDGKFSVNADDAAKKTAKSTVEAAAEGGVKLEPVAVAVDVDNKEAGKMFGTASGG
ANAAANDVAKAAAAVGVVSGEQILKAIAAAADSGKHEGKKGGDAENAIQAAIGGNHQGEA
FNDDKLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVNDAGDAKKTAKSTVEAAANGAKADAESVKG
IAIGIKGIVDAAAEGGVKLETAAVDNVDNKDAGKMFGTAAGDAGAGDVAKAAAAVGVVSG
EQILKAIAAAAADSSKHEGKKGDDAENAIQAAIGGDNQQGEAFDDDKLGKKSDQIAAALV
LRGMAKDGKFSVTADDAQKTAKSTVEAAANGAKADAESVKGIAIGIKRIVDAAAEGGVKL
EPVVVGDVSNKEAGKMFGTAAGDDADASEVAKAAAAIGGDNQGEAFNDEKLEKKSDQIAA
ALVLRGMAKDGKFSVTAGAAAKKTAKSTVDAAAEDGVKLKPAAVVGDDVSNKEAGKMFGT
AGGAGAANAGEVAKAAAAVGVVSGEQILKAIAAAAGDSSNHEGKKGGDAENAIQAAIGGD
NQQGENFADDKLGKKSDQIAAALVLRGMAKDGKFSVNDAAAKKTAKSTVEAAVEGGVNWR
LLLLLM
NT seq
6141 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ataggagagagtgttgctaatagtgtaaaagcggatgctgcgagtgttaaggggattgct
atagggattaagggaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagactgct
gctgttgctgttgatgacgtaagcaataaggatgcgggaaagatgtttggttctggtggt
gctgctggtgctgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagcctgctgctgctgtt
gatgacgatgtaagcaataaggaagcgggaaagatgtttggtactggtggtgctggtggt
gctgctgctgctgctgatgtagcgaaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggtgag
cagattctaaaagcaattgctgctgctgctgctgctgctgatagtggtaatcatgagggg
aagaagggtggtgaagctgaaaatgctatccaggctgctgttggtggtgatggcaaaata
ggagagagtgctactaatggtgcaaaggcggatgctgcgagtgttaaggggattgctata
gggattaagggaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagactgctgct
gttgctgacgtagacaataaggatgcgggaaagatgtttggtgctggtgttggtgctggt
gctaatgctggtgaggtagcgaaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggtgagcag
attttaaaagcaattgctgctgctgctgctgatagtagtaatcatgatgggaagaagggt
ggtgatgctgaaaatgctatccaggctgctattggtggtaataatcagcagggtgagaat
tttgctgacggcaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagg
gggatggctaaggatggaaagttttctgttgctgatgctgctgatgctgctgctgctgat
gtagcgaaagctgctgctgatggtgttggcaaaataggagagagtgttgctaatggtgca
aaagcggatgctgcgagtgttaaggggattgctatagggattaagggaattgttgatgct
gctgctgaaggtggtgtaaagttggagactgctgctgttgctgttgatgacgtaagcaat
aaggatgcgggaaagatgtttggtactgctggtggtgctgatgctgctgctggtgatgta
gcgaaagctgctgctgctgttggtgatggcaaaataggagagagtgttgctaatggtgta
aaggcggatgctgagagtgttaaggggattgctatagggattaagggaattgttgatgct
gctgctgaaggtggtgtaaagttggagactgctgctgttgttgatgacgtaagcaataag
gatgcgggaaagatgtttggtgctggtgttggtggtgatgctgctgctggtgatgtagcg
aaagctgctgctgctgttggtggtggtaaacatgatgggaagaagggtggtgatgctgaa
aatgctatccaggctgctattggtggtaatcagcaggggggtgaggcttttgttgacggc
aaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagggggatggctaag
gatggaaagttttctgttgctaatgctgctaaaaagactgcaaaaagtactgttgaggct
gctgttgatgatgatagtagtaaacatgatgggaagaagggtagtgatgctgaaaatgct
atccaggctgctattggcggtaatcagcagggtggtgaggattttaatgacggcaaactg
ggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagggggatggctaaggatgga
aagttttctgttactgctggtgatgctgaaaagactgcaaaaagtactgttgaggctgct
gctaatggtgcaaaggcggatgctgagagtgttaaggggattgctatagggattaaggga
attgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagcctgttgctgctgctgttgat
gacgatgtaagcaataaggaagcgggaaagatgtttggtgctggtgttggtgctggtgct
aatgctggtgaggtagcgaaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggtgagcaaatt
ctaaaagcaattgctgatgctgctggtgatagtagtaatcatgatgggaagaagggtaat
caagctgaaaatgctatccgggctgctattggtggtgataatcagggtggtgaggatttt
gatgacaacaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgaggggg
atggctaaggatggaaagttttctgttgctgatgctggtgctcaaaagactgcaaaaagt
actgttgaggctgctgttgatgatgatagtagtaatcatgatgggaagaagggtgatgat
gctgaaaatgctatccaggctgctattggtgatggtcagggtgaggcttttaatgacggc
aaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagggggatggctaag
gatggaaagttttctgttgctaatgctgctggtgctaaaaagactgcaaaaagtactgtt
gaggctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagcctgctgttgctgttgatgtagacaat
aaggaagcgggaaagatgtttggtactgctggtggtggtgctgctgctgctgcggtagcg
aaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggtgagcagattctaaaagcaattgctgat
gctgctggtgatagtagtaaacatgaggggaagaagggtggtgatgctgaaaatgctatc
caggctgctattggtggtgataatcagggtggtgaggattttaatgacagcaaactggga
aagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagggggatggctaaggatggaaag
ttttctgttaatgctgatgctgctggtgctcaaaagactgcaaaaagtactgttgaggct
gctgctaatggtgcaaaggcggatgctgcgagtgttaaggggattgctatagggattaag
ggaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagactgctgctgttgataac
gtagacaataaggaagcgggaaagatgtttggtactgctgctggtgatgctgctgatgct
agtgaggtagcgaaagctgctgctgctattggtggtgataatcagggtgaggcttttgat
gacaacaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagggggatg
gctaaggatggaaagttttctgttaatgctgatgctgctggtgctcaaaagactgcaaaa
agtactgttgaggctgctgttgatgctgatagtagtaaacatgatgggaagaagggtgat
gaagctgaaaatgctatccaggctgctattggtggtgatggtcagggtggtgaggatttt
aatgacggcaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgaggggg
atggctaaggatggaaagttttctgttaatgctgctgatgctgctgctcaaaagactgca
aaaagtactgttgaggctgctgctaatggtgcaaaggcggatgctgagagtgttaagggg
attgctatagggattaagggaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggag
actgctgctgttgctgttgataacgtaagcaataaggatgcggaaaagatgtttggtact
ggtggtgttggtggtggtgatgctgctgctggtgatgtagcgaaagctgctgctgctgtt
ggtgttgttagcggtgagcagattctaaaagcaattgctgctgctgctgatagtggtaaa
catgatgggaagaagggtagtcaagctgaaaatgctatccaggctgctattggcggtgat
caggggggtgaagcttttgctgacgaaaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgct
gctcttgttttgagggggatggctaaggatggaaagttttctgttaatgctggtgctgct
aaaaagactgcaaaaagtactgttgaggctgctggtgatgatgatagtagtaaacatgat
gggaagaagggtgatgatgctgaaaatgctatccaggctgctattggcggtgatcagggt
gaggcttttgatgacggcaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgtt
ttgagggggatggctaaggatggaaagttttctgttaatgctgatgatgctgctaaaaag
actgcaaaaagtactgttgaggctgctgctgaaggtggtgtaaagttggagcctgttgct
gttgctgttgatgtagacaataaggaagcgggaaagatgtttggtactgctagtggtggt
gctaatgctgctgctaatgatgtagcgaaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggt
gagcagattctaaaagcaattgctgctgctgctgatagtggtaaacatgaggggaagaag
ggtggtgatgctgaaaatgctatccaggctgctattggtggtaatcatcagggtgaggct
tttaatgacgacaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgttttgagg
gggatggctaaggatggaaagttttctgttaatgatgctggtgatgctaaaaagactgca
aaaagtactgttgaggctgctgctaatggtgcaaaggcggatgctgagagtgttaagggg
attgctatagggattaagggaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttggag
actgctgctgttgataacgtagacaataaggatgcgggaaagatgtttggtactgctgct
ggtgatgctggtgctggtgatgtagcgaaagctgctgctgctgttggtgttgttagcggt
gagcagattctaaaagcaattgctgctgctgctgctgatagtagtaaacatgaggggaag
aagggtgatgatgctgaaaatgctatccaggctgctattggtggtgataatcagcagggt
gaggcttttgatgacgacaaactgggaaagaagagtgatcagatcgctgctgctcttgtt
ttgagggggatggctaaggatggaaagttttctgttactgctgatgatgctcaaaagact
gcaaaaagtactgttgaggctgctgctaatggtgcaaaggcggatgctgagagcgttaag
gggattgctatagggattaagagaattgttgatgctgctgctgaaggtggtgtaaagttg
gagcctgttgttgttggtgacgtaagcaataaggaagcgggaaagatgtttggtactgct
gctggtgatgatgctgatgctagtgaggtagcgaaagctgctgctgctattggtggtgat
aatcagggtgaggcttttaatgacgaaaaactggaaaagaagagtgatcagatcgctgct
gctcttgttttgagggggatggctaaggatggaaagttttctgttactgctggtgctgct
gctaaaaagactgcaaaaagtactgttgatgctgctgctgaagatggtgtaaagttgaag
cctgctgctgttgttggtgatgacgtaagcaataaggaagcgggaaagatgtttggtact
gctggtggtgctggtgctgctaatgctggtgaggtagcgaaagctgctgctgctgttggt
gttgttagcggtgagcagattttaaaagcaattgctgctgctgctggtgatagtagtaat
catgaggggaagaagggtggtgatgctgaaaatgctatccaggctgctattggtggtgat
aatcagcagggtgagaattttgctgacgacaaactgggaaagaagagtgatcagatcgct
gctgctcttgttttgagggggatggctaaggatggaaagttttctgttaatgatgctgct
gctaaaaagactgcaaaaagtactgttgaggctgctgttgaaggtggtgtaaattggaga
ctgctgctgttgttgatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
