Borreliella andersonii: QIA45_02880
Help
Entry
QIA45_02880 CDS
T09475
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
band
Borreliella andersonii
Pathway
band03030
DNA replication
band03430
Mismatch repair
band03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
band00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
QIA45_02880 (dnaE)
03430 Mismatch repair
QIA45_02880 (dnaE)
03440 Homologous recombination
QIA45_02880 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
band03032
]
QIA45_02880 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
band03400
]
QIA45_02880 (dnaE)
Enzymes [BR:
band01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
QIA45_02880 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
band03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA45_02880 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
band03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA45_02880 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
GHMP_kinases_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNY66011
UniProt:
A0ABZ0CFC1
LinkDB
All DBs
Position
589387..592830
Genome browser
AA seq
1147 aa
AA seq
DB search
MSFRSRFIHLHVHSDYSLLDGAAKVSDIISKAKKCNMSHIALTDHGNLFGAIKFYKEAKK
AGIKPIIGIEAYMAKTSKFLKKQDDLGKMSYHLILLAKNELGYKNLLKLTSISYLEGFYY
RPRIDKEDLQKYSEGLICTSACIGGLIPRLILANRFEDAKDEILWFKKVFGSDFYLELQR
HGIKDQDIVNERLVEYSRELGVPLTAANDSHYVNREDAAAQDIIVCIGTGAKKSDENRLK
METNEFYIKSQEEMCELFSDLPEALENTVKIAEKCDDFKITFPGPILPDYQIPVEFNTLG
EYLEHLTLEGLKFRYKNLTSKIKDRAFYELSVIIGMGFEGYFLIVWDFIKFAHDHDIPVG
AGRGSGAGSIVAYALRITDIDPLKYNLLFERFLNPERISMPDFDIDFCFEGRDEIIKYVT
NKYGEDKVAQIITFGTLKPKAVVKDVARVLDIPFAESNELTKFIPDGPKVSLKEVLDDSS
LKEYFTSKPVYKELMDAALILEGMNRHASTHAAGIVISKTLLTDYVPLYKDYKQGSVSTQ
YTMDLLEECGLVKMDFLGLKTLTLIKNAENLIRSVNPDFKIKDIPDNDVKTFNMLGEGRS
ASVFQFESEGMQQILKDAKPDSIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFIAAKKGVKKIKYPHPD
LKEVLRPTYGVIVYQEQVMEVAKIIGGFSLGKADILRRAMGKKKEDEMNEMKVDFLRGAI
ENGYDKEIASEIFELLKPFSGYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANYPEYFMAANLTNEIN
NNDKLSYYIEESKAMGINVLKPDINRSFREFRVTDPGISYGLNGIKNLGGIVVDLIIDER
EKNGKYSSFEDFIRRVDDKVINKKFLESAIKSGLFDSLDQNRKTLFENLDRLIEVVSEDK
NNKKIGQNSLFGALESQDPIQQSFNYQTFKEYSYSELLGFEKELLGFYVSGHPLDPYKKA
IDNFSSLNVLKDLATKKDSIVQFAGILNSVKVIQTKRNNAKMAFGVIEDFKGAIDIVAFT
ESYERYKNFLLEGNVIGVVGRLTFNRDKFSIVVEKVVNIERLSEDKISNIHIKFLNNKLN
DLQLLNSLKESISNFEDNSGFSNVYFYLRENGKDLKLKMNSILNFMPDEDKLDKLRKCVI
VEDVWVD
NT seq
3444 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttaggtctagatttattcatctccatgttcattcagattattctcttttggat
ggggctgcaaaagtatcagatattatatcaaaagcaaaaaaatgtaatatgtcgcatatt
gcattaacagatcatggcaatctttttggagctattaaattttataaagaagctaaaaaa
gcaggaattaagccaataattggtattgaagcctatatggcaaaaacttctaagttttta
aaaaaacaggatgatcttggaaaaatgtcttaccatttaattttgcttgccaagaatgag
ctgggttataagaacttattaaagttaacaagcatttcttatcttgaagggttttattat
cgcccaaggatagataaagaggatcttcaaaaatattcagagggtttgatttgtacttca
gcttgcattgggggactcattccaagacttattttagccaatagatttgaagatgctaag
gatgaaattctttggtttaaaaaagtttttggcagtgatttttatcttgaacttcaaagg
catggcattaaagatcaagacattgtaaatgaaaggttggttgagtattctagggaactt
ggagttcctttaacagcagccaatgattctcattatgttaacagagaagatgcagctgct
caagacattattgtttgtattggtactggtgctaagaaaagcgatgagaatagattaaaa
atggaaaccaatgaattttatattaaatctcaagaggaaatgtgtgaactttttagtgat
ttgcctgaagctttagaaaatactgtaaagattgcagaaaagtgtgatgattttaaaata
acttttccaggccctattttgcctgattatcaaattcctgttgaatttaatactcttggt
gaatatttagaacatctcactcttgaagggttgaaatttagatataaaaatttgacaagc
aaaataaaagatagagctttttatgaattgagcgtaataattggaatgggttttgaaggc
tactttttgattgtttgggattttattaaatttgctcacgatcacgatattcctgttgga
gctgggcgtggttctggtgctggttccattgtagcttatgctcttaggattactgatatt
gatcctttaaagtataatttgctttttgagagatttttaaatcctgaacgtatttctatg
cctgattttgatattgatttttgctttgaaggcagagatgagattataaaatatgttacc
aacaaatatggagaagataaagtagctcaaataattacttttggaactttaaagcctaag
gctgtagttaaggatgtggctagagttttagatattccatttgctgaatcaaatgaactt
actaagttcattcctgatgggcctaaagtttctttaaaagaggttttagatgatagttct
ttgaaggaatattttactagcaagcctgtttataaagaattaatggatgctgcattgatt
cttgagggaatgaataggcatgcttcaactcatgctgcaggaattgtaatttctaaaacc
cttttaaccgactatgtgcctctttataaagattacaagcaaggttctgtttctactcaa
tacacaatggatttgcttgaagaatgtggacttgttaagatggattttcttggcttgaaa
acattgacgttaataaaaaatgcagaaaatcttattagaagtgtaaatccagattttaag
ataaaagatattccagataatgacgttaagacttttaatatgctaggagaaggaagaagt
gcgtctgtttttcagtttgaatctgaaggaatgcaacaaattctaaaagacgcaaagcct
gatagcattgaagatttaatagccttaaatgctctttataggccagggcctatgcaattt
attcctcaatttattgcagctaaaaaaggtgttaagaaaattaaatatcctcatccagat
ttaaaagaggttttaaggccaacttatggggttatcgtttatcaagagcaagtaatggaa
gttgcaaaaataattggaggcttttctcttggcaaggcagatattttaagacgtgctatg
ggcaaaaagaaagaagatgaaatgaatgaaatgaaggttgactttttaagaggtgctatt
gagaatggatatgacaaagaaattgctagtgaaatttttgagcttttaaagcctttttca
gggtatggatttaataaatcgcatgcagcagcgtattcgttaatagcatatcaaactgct
tatcttaaggctaattaccctgaatattttatggctgccaatttgactaatgaaattaat
aataatgataagctttcttattacattgaagagtcaaaagctatgggtataaacgttctt
aaacccgatataaatcgatcatttagggaatttcgtgtaactgatcctggaatttcttat
ggacttaatgggattaaaaatctgggaggaattgttgttgatttaataattgatgaaaga
gaaaaaaacggcaaatatagttcttttgaagattttataagacgtgtagatgataaagta
attaataagaaatttttagaatctgcaataaaatctggactttttgatagtttggatcaa
aatagaaaaactttatttgaaaatcttgatcgcttgattgaagttgtttcagaagataaa
aataataaaaaaattggtcaaaacagcttatttggtgctcttgaaagtcaagatccaatt
cagcaaagttttaattatcaaacttttaaagagtattcttattctgagcttttaggattt
gagaaagagcttttaggattttatgtgtcggggcatcctcttgatccttataaaaaggca
attgataatttttccagtttaaatgttttaaaagatcttgctactaaaaaagatagcatt
gtccaattcgctggcattttaaattcagtaaaagttattcaaactaaaagaaataatgca
aaaatggcttttggtgttatagaagattttaaaggtgcaatagatattgtagcttttaca
gaaagctatgaaaggtataaaaattttttacttgaaggtaatgttattggggttgtaggc
aggcttacgtttaatagagacaaattttcaattgtagttgaaaaagttgtaaatattgaa
agactttccgaagataaaataagtaatattcatattaaatttttaaataataaattaaat
gacctacaattacttaattctttaaaagaaagtataagtaattttgaggataattctgga
ttttcaaatgtttatttttatttaagggaaaatggtaaggatttaaaattaaaaatgaat
tcaattttaaattttatgccagatgaagacaagcttgataagttgagaaagtgtgtaata
gttgaagatgtttgggttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
