Buchnera aphidicola F009 (Myzus persicae): BUMPF009_CDS00146
Help
Entry
BUMPF009_CDS00146 CDS
T03020
Symbol
recc
Name
(GenBank) Recc
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
bapf
Buchnera aphidicola F009 (Myzus persicae)
Pathway
bapf03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bapf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BUMPF009_CDS00146 (recc)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bapf03400
]
BUMPF009_CDS00146 (recc)
Enzymes [BR:
bapf01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BUMPF009_CDS00146 (recc)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bapf03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BUMPF009_CDS00146 (recc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
DUF5903
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG61668
LinkDB
All DBs
Position
496895..500053
Genome browser
AA seq
1052 aa
AA seq
DB search
MFIVYRSNKIETLFLKAHKIIEKNPLSNIFEQEIFLHDNKILFQYLNVFIANQKGISANI
KYYHPYNFILKLFQKFFGIKEYKNIFTQSIMTWKIMKILDEKKICEYINIKENKMKKFKF
SFLMANIFEQYLFYRPDWINTWEKEKLITSIGNSDQWQIKLWKEIINNYQNMNPLKYHFS
SLLYKFQLLIKQDKIKKKHFPKRCFIISSPQLNPVFIEIFKKISIYFNIYFLQVKFSKKN
RFQNPLMRLCKNQELFKKINILDSKKIKIINYFEKNKNNNLLNHIKNDFLEDKFFKKKRI
IELTDNSISINICYNRKNEIEILHEKLLLFLEKNQYIKLSDIVVTSFSMDDYISSIDTIF
NAAHKKNKLPFFISTKKSKKTEIIFSVFKNLLNLSNSRFENEEILELFDIPEIADRFDIS
EEEINILYYWIKEVNIRWAINEKHKKKFSFSQNKQNTWFYGIEKLLLSYAMNDTENIWND
ILSSTLIHGSRADLIGKLVIFINVLKKWQKKLSKLQNLIYWRSLSKNIINDFFLKSERIN
DCLQIIQKKWIEMIDDALLSNYKKKISIEILKKNFIIKNNPTNNKKFLPGVINFCHPSSI
CFIPFKIICFIGADNKNIPKQNTLDNFNLLNKYPITSDFNAYQKYYFLFLQNISCAQKYF
YISYVGYSIKDNSKIYPSVMVDQLLSYIISNFYLMGDQNLTTNEKRRKITKHLCKTYTKE
YFYTIKNTDDFKIENSIGRLKNTEIKIYESKLLKKKCFDRIDLIDLICFWKNPIHYFFKN
HLNIKFDLPKQELIITEPFSVHQLDAFEIKKILLNKAIKCEDTKKIFQYYRLCGKLPYNF
FGTVFWKDKIKEMQSISKLVNKYRNCTEEKKINIHIQKYRINGILSEIQSTGLLRWKPTL
INYSDRISLWIEHLIYTLICGTGESKIIGYKNQMWSYICLDPNTAYDYLLKYIEGYVKGS
QKPLFLIKSGAAWLDQIYDIKNNVIKQDNNSIRKGYKKLLETWMGNNYFKGEKKDIYIRS
LIKTLNEKNIKKICQTAQIWLTPLLKNKKILK
NT seq
3159 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttatcgtttatagatcaaataaaattgagacactatttttaaaagcacacaaaata
atcgaaaaaaacccactgtctaatatttttgaacaagaaatttttcttcatgataataaa
atattatttcaatatttaaatgtttttattgctaaccaaaaaggtatttctgctaatata
aaatattatcatccttataattttatattaaaattatttcaaaaattttttggaataaaa
gaatataaaaatatatttactcaatctattatgacttggaaaattatgaaaattttagat
gaaaaaaaaatttgtgaatatattaatataaaagaaaataagatgaaaaaatttaaattt
tcatttttaatggctaatatatttgaacaatatcttttttatcgtccggattggattaat
acatgggaaaaagaaaaacttataacttctattggtaatagtgatcaatggcaaattaaa
ttatggaaagaaataatcaataattatcaaaatatgaatccgttaaaatatcacttttca
agtctattatataaatttcaattacttatcaaacaagataaaataaaaaaaaaacatttt
cctaaacgttgttttattatttcttctcctcaattaaatcctgtttttattgaaattttt
aaaaaaattagtatttattttaacatttattttttacaagttaagttctctaaaaaaaat
agatttcaaaatccattaatgagattatgtaaaaatcaagaattatttaaaaaaataaat
attctggactctaaaaaaattaaaataataaattattttgaaaaaaacaaaaataataac
ttattaaatcatattaaaaacgattttcttgaagacaaattctttaaaaaaaaaaggatt
atagaattaactgataattcaatttctataaatatttgttataatagaaaaaatgaaatt
gaaattttacatgaaaaattattattatttttggaaaaaaatcaatatattaaattaagt
gatatagtcgttacttctttttctatggatgattatatttcatctattgatacaattttt
aatgcagcgcataaaaaaaacaaactgcccttttttatttctacaaaaaaatctaaaaaa
acagaaataatattttccgtttttaagaatttattaaatctatccaatagtcgatttgaa
aatgaagaaatattagaattatttgatattccagaaatagcagatcgttttgacatttct
gaagaagaaataaatattttatattattggatcaaagaagtaaatattagatgggctatt
aatgaaaaacataaaaaaaaattttcattttctcaaaacaaacagaatacctggttttat
ggtattgaaaagttattacttagttatgcaatgaatgatacagaaaatatttggaatgat
attttatcatctactttaattcatggttctcgagcagatttaataggaaaattagtaatc
ttcattaatgtactaaaaaaatggcaaaaaaaattatcaaaattacaaaatttaatatat
tggcgctcattatcaaaaaacattattaatgatttttttcttaaaagtgaacgcataaat
gattgtcttcaaatcattcaaaaaaaatggatagaaatgatagatgatgctttactatct
aattataaaaaaaaaatttctattgaaatattaaaaaaaaactttattattaaaaataat
cctacgaataataaaaaatttttacccggtgtaataaatttttgccatccttcttctatc
tgttttattccatttaaaataatatgttttattggagctgataacaaaaatattccaaaa
caaaatactttagataattttaatttattaaacaaatatcctataacaagtgattttaat
gcctatcagaaatattactttttattccttcaaaacatttcttgtgctcaaaaatatttt
tacataagttacgtcggatattcaatcaaagataatagtaaaatatatccttcagttatg
gttgatcaactattatcttatataatatcaaatttttatttgatgggtgaccaaaattta
actacaaatgaaaagagaagaaaaataactaaacatttatgtaaaacatatacaaaagag
tatttttatacaataaaaaatacagatgattttaagattgaaaattctataggtaggtta
aaaaatactgagataaaaatttatgaatctaaattattgaaaaaaaaatgttttgataga
attgatttaatagatctaatctgtttttggaaaaatccaattcattacttttttaaaaat
catttaaatattaaatttgatttacctaaacaagaacttattatcacagagcctttttca
gttcatcaattagatgcttttgaaataaaaaaaattctattaaataaagctataaaatgt
gaagatacaaaaaaaatatttcaatattatcggctttgtggaaaattaccgtataacttt
tttggaacagtattttggaaagataaaataaaagaaatgcaatctatatcaaaattagtt
aataaatacagaaattgtacagaagaaaaaaaaattaatatacacatacaaaaatacaga
ataaatggaattttatctgaaatacaaagtacaggtttacttcgttggaaacctacttta
atcaattatagtgatcgtatatctttatggatagaacatctaatttatactcttatatgt
ggtacaggagaaagcaaaattataggttataaaaatcaaatgtggtcttatatttgttta
gatcctaatacagcatatgattatcttttaaagtatattgaaggttatgttaaaggttct
caaaaacctttatttctgataaaatcaggtgctgcttggcttgatcaaatttatgatata
aaaaataatgttataaaacaagataataattccatacgtaaaggatataaaaaattatta
gaaacttggatgggaaataattattttaaaggagaaaaaaaagatatatatattagaagt
cttattaaaacattaaatgaaaaaaatataaaaaaaatttgtcaaacagctcaaatatgg
ttaactccattattaaaaaacaaaaaaattttaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
