KEGG   Buchnera aphidicola F009 (Myzus persicae): BUMPF009_CDS00355
Entry
BUMPF009_CDS00355 CDS       T03020                                 
Symbol
dnae
Name
(GenBank) Dnae
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
bapf  Buchnera aphidicola F009 (Myzus persicae)
Pathway
bapf03030  DNA replication
bapf03430  Mismatch repair
bapf03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bapf00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    BUMPF009_CDS00355 (dnae)
   03430 Mismatch repair
    BUMPF009_CDS00355 (dnae)
   03440 Homologous recombination
    BUMPF009_CDS00355 (dnae)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:bapf03032]
    BUMPF009_CDS00355 (dnae)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bapf03400]
    BUMPF009_CDS00355 (dnae)
Enzymes [BR:bapf01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     BUMPF009_CDS00355 (dnae)
DNA replication proteins [BR:bapf03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     BUMPF009_CDS00355 (dnae)
DNA repair and recombination proteins [BR:bapf03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     BUMPF009_CDS00355 (dnae)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6 tRNA_anti-codon DNA_pol_IIIA_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHG61862
LinkDB
Position
264463..267948
AA seq 1161 aa
MNEPKFVHLNVHSDYSIIDGLSKPEDLVKKAAFFGMSALAITDYNNLYGVIKFYNAAHRL
GVKPIIGITVNFFSNLLNNELTKLTLLASTEIGYKNLILLISRAYQKGYINNYNVTIEKR
WLLEINKGIILLSGGSQGEIGKILLNGELSLVYNCLSFYQKYFPNAYYLELFRTDRDNEE
KYLNLAIDLSFSKKIPVVATNDVCFLSKEDFKVHKIRIAINEGEILQESKIQHNYSNEQF
LKSEEEMCRLFSDIPEALINSVEIAKRCNVFICSGKYFLPQFPTGNISVENYLILEAYKG
MKKRLNLFNLNDKKSQFIYEKYKNRLDMELNVINEMKFPGYFLIVMEFIKWAKDNNIPVG
PGRGSGAGSLVAYALNITEIDPLFFNLLFERFLNPERVSLPDFDIDFCMDKRDKVIDHVS
DIYGRNAVAQIITFGTMTAKAVIRDVGRVLGYPYGFINKLSKLVPLDPGITLNDAFSKEP
ELYNLYKNNEDVKILIDLAKKLEGTNRNVGKHAGGVVISPTKITDFCPLYCDENGNNPVT
QFDKNDIEYIGLVKFDFLGLRTLTIISYAMEMINFKLKINKKKSININSIPLNDDKCFNL
LKKSETTAVFQLESYGMKELIKRLKPDCFEDIIALLALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGRE
KISYPDHKWEHILLKPILESTYGIILYQEQVMQIAQVLAGYTLGGADILRRAMSKKNLKD
MGKQRAIFQEGALKNGINQKLAIKIFDLLEKFAGYGFNKSHSVAYALVSYQTLWLKSHYP
AEFIAAAMTSDIDNTEKIVILVNESFKMGIKIIPPNVNLSRYQFYVNDENNIVYGIGAIK
GIGENSVLNLIKERKKNGFFVDLFDLCIRMDSNKITRRVLEKLIMSGSCDCFNKPRNYLL
RSIDDAIKASKEFIKIKYFKQESLFGSFSNELKQVKKNNFINLAYSEVDQLEDEYQVLGF
YLTGHPINQYKTELKHYLNGITLSSLEHLIKNKQVLIAGIVVSIKIKLTKNKNRIAFLIL
DDNTSRLEVVIFTSLLDIYEPLLKLNKILLVRGILHTSVVNKNIKMTASEIMSLDIAREK
YIQKLTIILEEKKIDTLFLKKLYRYLEKQPKGNVSIHISYYNKTICLNFKLNEKWFVKIT
DVFLNKLKELERSKKIKLKFC
NT seq 3486 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgaaccaaaatttgttcatcttaatgtacatagtgactattcaattattgatgga
ttatctaaacctgaagatttagttaaaaaagcagcattttttggtatgtctgctcttgca
ataacagattataacaatttgtatggagtaattaaattttataatgctgcacatagactt
ggtgtcaaacctattattggtattacagtaaattttttttctaatttattaaataacgaa
ttaacaaaattaactttattagcttcgactgaaataggatataaaaatttaattttatta
atttctagagcatatcaaaaaggatatattaataattataatgtcactattgaaaaaaga
tggttattagaaattaataaaggaataatactattatctggaggatctcaaggtgagatt
ggaaaaatcttactaaatggagaattatcattagtttataattgtttatctttttatcaa
aaatattttcctaatgcttattatttagaattatttcgtacagatcgagataacgaagaa
aaatatttaaatttagcaatagatttgtctttttctaaaaaaattcctgttgtagcgact
aatgatgtttgttttttaagtaaagaagattttaaagttcacaaaattagaattgctatt
aatgaaggtgaaatattacaagaatcgaaaattcaacataattatagtaatgagcaattt
ttaaaaagtgaagaagaaatgtgtcgtcttttttctgatattccagaagctcttattaat
agtgtagaaattgcaaaacgttgtaatgtttttatttgttctgggaaatattttttacca
cagttcccaacaggaaatataagtgttgaaaattatttaatattagaagcatataaaggt
atgaaaaaacgtttaaatttatttaatttaaatgataaaaaaagtcaatttatatatgaa
aaatataaaaatcgtctggatatggaattaaatgtaattaatgaaatgaagtttcctgga
tattttttaattgtaatggaattcataaaatgggctaaagataataatataccagtaggt
ccaggacgaggttctggtgcaggttctcttgtcgcttatgcattaaatattacggaaata
gatcctttattttttaatcttttatttgaaagatttttaaatccagaacgtgtttcatta
cctgattttgatattgatttttgtatggataaacgtgataaagtcattgatcatgtttca
gatatatatggtagaaatgcagtcgctcagattattacttttggtactatgacagcaaaa
gctgtgattagagatgttggtcgagtcttgggatatccatatggttttataaataaatta
tctaaattagtaccattagatcctggtataacattaaatgacgctttttctaaagaacca
gaattatataatctttataaaaataatgaagatgttaaaattttgattgatttagctaaa
aaattagaaggaacaaatagaaatgtgggtaagcatgcaggaggtgtggttatttctcct
actaaaattactgatttttgtccattgtattgtgatgaaaatggaaataatccagtaact
cagtttgataaaaatgatatagaatatatagggttagtaaaatttgattttcttggctta
cgtactttaactataattagttacgctatggaaatgattaattttaagttaaaaattaat
aaaaagaaatctatcaatattaattctattcctcttaatgatgataaatgctttaattta
ttaaaaaaatctgaaactactgctgtctttcaattagaatcttatggtatgaaagagcta
attaaaagattaaaacctgattgttttgaagatataattgctttattggcactttttaga
cctggtcctttgcaatctggtatggttgataattttattaatagaaaacatggacgtgag
aagatttcatatcctgatcacaaatgggaacatatattattaaaaccaatattagaatcc
acatatggtattattttatatcaagaacaagtgatgcaaattgctcaagttttagcaggt
tacactttaggtggtgcagatattttaagacgtgcaatgagcaaaaaaaatcttaaagat
atgggtaaacaacgagctatatttcaagaaggagctttgaaaaacggtattaatcaaaaa
ttagcaataaaaatttttgatttattagaaaaatttgcaggatatggatttaataaatct
cattctgtagcttatgccttagtttcttatcaaactttatggttaaaatcacactatcct
gctgaatttatagctgcggctatgacttctgatatagataatacagaaaaaattgtaatt
ttagttaatgaaagtttcaaaatgggtattaaaattatacctcctaatgtcaatttaagt
agatatcaattttacgttaatgatgaaaataacatagtttatggtataggagctattaaa
ggtataggagaaaattcagtattgaatcttattaaggaaagaaaaaaaaatggatttttt
gttgatttatttgatctttgtattcgtatggattctaataaaattacacgtcgagtatta
gaaaaattaataatgtctggaagttgtgattgttttaacaaacctagaaattatttactt
agatcgattgatgatgctataaaagcgtcaaaagagtttattaaaattaaatattttaaa
caagaaagtctttttggttctttttcaaatgaattaaaacaagttaaaaaaaataatttt
attaatctagcatattctgaagtcgatcaattagaggatgaatatcaagtattaggattt
tacctaactgggcatcctattaatcaatataaaacagaattaaaacattatttaaatggt
attacattatcaagtttagaacatttgatcaaaaataaacaagttttaatagcaggaata
gtagtttctatcaaaattaaattaactaaaaataaaaatcgtatagcttttttaatatta
gacgataacactagccgattagaagtagtcatttttactagtttattagatatatatgaa
cccttattaaaattaaataaaattttacttgtaagaggaatattacatactagtgttgtt
aacaaaaatattaaaatgactgcttctgaaattatgagtttagatatagcacgtgaaaaa
tacatacaaaaattaactattatattagaagaaaaaaaaatagacactttgtttttaaaa
aaattatatagatatttagaaaaacaacctaaaggaaatgtttctattcatatttcttac
tataataaaacaatctgtttaaattttaaattaaatgaaaaatggtttgttaaaattaca
gatgtttttttaaataaattaaaagaattagaaagatcaaaaaaaataaaattaaaattt
tgctaa

DBGET integrated database retrieval system