Buchnera aphidicola W106 (Myzus persicae): BUMPW106_CDS00355
Help
Entry
BUMPW106_CDS00355 CDS
T03023
Symbol
dnae
Name
(GenBank) Dnae
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bapw
Buchnera aphidicola W106 (Myzus persicae)
Pathway
bapw03030
DNA replication
bapw03430
Mismatch repair
bapw03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bapw00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
03430 Mismatch repair
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
03440 Homologous recombination
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bapw03032
]
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bapw03400
]
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
Enzymes [BR:
bapw01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
DNA replication proteins [BR:
bapw03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bapw03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BUMPW106_CDS00355 (dnae)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DNA_pol_IIIA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG60717
LinkDB
All DBs
Position
264463..267948
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MNEPKFVHLNVHSDYSIIDGLSKPEDLVKKAAFFGMSALAITDYNNLYGVIKFYNAAHRL
GVKPIIGITVNFFSNLLNNELTKLTLLASTEIGYKNLILLISRAYQKGYINNYNVTIEKR
WLLEINKGIILLSGGSQGEIGKILLNGELSLVYNCLSFYQKYFPNAYYLELFRTDRDNEE
KYLNLAIDLSFSKKIPVVATNDVCFLSKEDFKVHKIRIAINEGEILQESKIQHNYSNEQF
LKSEEEMCRLFSDIPEALINSVEIAKRCNVFICSGKYFLPQFPTGNISVENYLILEAYKG
MKKRLNLFNLNDKKSQFIYEKYKNRLDMELNVINEMKFPGYFLIVMEFIKWAKDNNIPVG
PGRGSGAGSLVAYALNITEIDPLFFNLLFERFLNPERVSLPDFDIDFCMDKRDKVIDHVS
DIYGRNAVAQIITFGTMTAKAVIRDVGRVLGYPYGFINKLSKLVPLDPGITLNDAFSKEP
ELYNLYKNNEDVKILIDLAKKLEGTNRNVGKHAGGVVISPTKITDFCPLYCDENGNNPVT
QFDKNDIEYIGLVKFDFLGLRTLTIISYAMEMINFKLKINKKKSININSIPLNDDKCFNL
LKKSETTAVFQLESYGMKELIKRLKPDCFEDIIALLALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGRE
KISYPDHKWEHILLKPILESTYGIILYQEQVMQIAQVLAGYTLGGADILRRAMSKKNLKD
MGKQRAIFQEGALKNGINQKLAIKIFDLLEKFAGYGFNKSHSVAYALVSYQTLWLKSHYP
AEFMAAAMTSDIDNTEKIVILVNESFKMGIKIIPPNVNLSRYQFYVNDENNIVYGIGAIK
GIGENSVLNLIKERKKNGFFVDLFDLCIRMDSNKITRRVLEKLIMSGSCDCFNKPRNYLL
RSIDDAIKASKEFIKIKYFKQESLFGSFSNELKQVKKNNFINLAYSEVDQLEDEYQVLGF
YLTGHPINQYKTELKHYLNGITLSSLEHLIKNKQVLVAGIVVSIKIKLTKNKNRIAFLIL
DDNTSRLEVVIFTSLLDIYEPLLKLNKILLVRGILHTSVVNKNIKMTASEIMSLDIAREK
YIQKLTIILEEKKIDTLFLKKLYRYLEKQPKGNVSIHISYYNKTICLNFKLNEKWFVKIT
DVFLNKLKELERSKKIKLKFC
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaaccaaaatttgttcatcttaatgtacatagtgactattcaattattgatgga
ttatctaaacctgaagatttagttaaaaaagcagcattttttggtatgtctgctcttgca
ataacagattataacaatttgtatggagtaattaaattttataatgctgcacatagactt
ggtgtcaaacctattattggtattacagtaaattttttttctaatttattaaataacgaa
ttaacaaaattaactttattagcttcgactgaaataggatataaaaatttaattttatta
atttctagagcatatcaaaaaggatatattaataattataatgtcactattgaaaaaaga
tggttattagaaattaataaaggaataatactattatctggaggatctcaaggtgagatt
ggaaaaatcttactaaatggagaattatcattagtttataattgtttatctttttatcaa
aaatattttcctaatgcttattatttagaattatttcgtacagatcgagataacgaagaa
aaatatttaaatttagcaatagatttgtctttttctaaaaaaattcctgttgtagcgact
aatgatgtttgttttttaagtaaagaagattttaaagttcacaaaattagaattgctatt
aatgaaggtgaaatattacaagaatcgaaaattcaacataattatagtaatgagcaattt
ttaaaaagtgaagaagaaatgtgtcgtcttttttctgatattccagaagctcttattaat
agtgtagaaattgcaaaacgttgtaatgtttttatttgttctgggaaatattttttacca
cagttcccaacaggaaatataagtgttgaaaattatttaatattagaagcatataaaggt
atgaaaaaacgtttaaatttatttaatttaaatgataaaaaaagtcaatttatatatgaa
aaatataaaaatcgtctggatatggaattaaatgtaattaatgaaatgaagtttcctgga
tattttttaattgtaatggaattcataaaatgggctaaagataataatataccagtaggt
ccaggacgaggttctggtgcaggttctcttgtcgcttatgcattaaatattacggaaata
gatcctttattttttaatcttttatttgaaagatttttaaatccagaacgtgtttcatta
cctgattttgatattgatttttgtatggataaacgtgataaagtcattgatcatgtttca
gatatatatggtagaaatgcagtcgctcagattattacttttggtactatgacagcaaaa
gctgtgattagagatgttggtcgagtcttgggatatccatatggttttataaataaatta
tctaaattagtaccattagatcctggtataacattaaatgacgctttttctaaagaacca
gaattatataatctttataaaaataatgaagatgttaaaattttgattgatttagctaaa
aaattagaaggaacaaatagaaatgtgggtaagcatgcaggaggtgtggttatttctcct
actaaaattactgatttttgtccattgtattgtgatgaaaatggaaataatccagtaact
cagtttgataaaaatgatatagaatatatagggttagtaaaatttgattttcttggctta
cgtactttaactataattagttacgctatggaaatgattaattttaagttaaaaattaat
aaaaagaaatctatcaatattaattctattcctcttaatgatgataaatgctttaattta
ttaaaaaaatctgaaactactgctgtctttcaattagaatcttatggtatgaaagagcta
attaaaagattaaaacctgattgttttgaagatataattgctttattggcactttttaga
cctggtcctttgcaatctggtatggttgataattttattaatagaaaacatggacgtgag
aagatttcatatcctgatcacaaatgggaacatatattattaaaaccaatattagaatcc
acatatggtattattttatatcaagaacaagtgatgcaaattgctcaagttttagcaggt
tacactttaggtggtgcagatattttaagacgtgcaatgagcaaaaaaaatcttaaagat
atgggtaaacaacgagctatatttcaagaaggagctttgaaaaacggtattaatcaaaaa
ttagcaataaaaatttttgatttattagaaaaatttgcaggatatggatttaataaatct
cattctgtagcttatgccttagtttcttatcaaactttatggttaaaatcacactatcct
gctgaatttatggctgcggctatgacttctgatatagataatacagaaaaaattgtaatt
ttagttaatgaaagtttcaaaatgggtattaaaattatacctcctaatgtcaatttaagt
agatatcaattttacgttaatgatgaaaataacatagtttatggtataggagctattaaa
ggtataggagaaaattcagtattgaatcttattaaggaaagaaaaaaaaatggatttttt
gttgatttatttgatctttgtattcgtatggattctaataaaattacacgtcgagtatta
gaaaaattaataatgtctggaagttgtgattgttttaacaaacctagaaattatttactt
agatcgattgatgatgctataaaagcgtcaaaagagtttattaaaattaaatattttaaa
caagaaagtctttttggttctttttcaaatgaattaaaacaagttaaaaaaaataatttt
attaatctagcatattctgaagtcgatcaattagaggatgaatatcaagtattaggattt
tacctaactgggcatcctattaatcaatataaaacagaattaaaacattatttaaatggt
attacattatcaagtttagaacatttgatcaaaaataaacaagttttagtagcaggaata
gtagtttctatcaaaattaaattaactaaaaataaaaatcgtatagcttttttaatatta
gacgataacactagccgattagaagtagtcatttttactagtttattagatatatatgaa
cccttattaaaattaaataaaattttacttgtaagaggaatattacatactagtgttgtt
aacaaaaatattaaaatgactgcttctgaaattatgagtttagatatagcacgtgaaaaa
tacatacaaaaattaactattatattagaagaaaaaaaaatagacactttgtttttaaaa
aaattatatagatatttagaaaaacaacctaaaggaaatgtttctattcatatttcttac
tataataaaacaatctgtttaaattttaaattaaatgaaaaatggtttgttaaaattaca
gatgtttttttaaataaattaaaagaattagaaagatcaaaaaaaataaaattaaaattt
tgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
