KEGG   Bartonella sp. A1379B: BA1379B_002940
Entry
BA1379B_002940    CDS       T05185                                 
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein
  KO
K12678  autotransporter family porin
Organism
bara  Bartonella sp. A1379B
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bara00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:bara02000]
    BA1379B_002940
   02044 Secretion system [BR:bara02044]
    BA1379B_002940
Transporters [BR:bara02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   BA1379B_002940
Secretion system [BR:bara02044]
 Type V secretion system
  Autotransporter-1 (AT-1) family
   BA1379B_002940
SSDB
Motif
Pfam: AC_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AQX18140
LinkDB
Position
352436..355357
AA seq 973 aa
MLRVSFFLSFFLSFFLILNTLLVSPSNVSFANEAGSVKKCQKSNAANGKASSSSNKTTMK
LGSRTFIVKECKESVNGQINDRKYQMGNHSERNNSRKRTDSETSETGGVIGIYSSSSDEE
NESEKEKKNTTSNVDVNNVQILGPVHSDDDIYIGILLGEWGTIVANELTLKDLTIGISVV
ENSSVNADKTLISNNKIAVKAKGSSSIVELLDTNILVLKGDKGLFTTKGGYIDMQGIDKS
DAGINFTLSSAVYMNTGEVSLEKVNIINDTINDNTSVQTNENVDYSRSAAVYMHPQSTFE
MKEGKVHLKSGNGFVFDFSPYEDTEDYETADEDGDEDESDDEEDDEEEEKKENVNLENVD
VKIEGDKYYGMYGVPSVSDDKDKEFERSATISLKKTNFIVPNSTAIYNGVKAELTFNLSD
TKLSGGLLLEGTSGIINIKANNSQLEGGALISGSAEAHLKLENNSMWTLTKRKSRGDRGN
EGTDNNKSFISTVTLKNSKIIFEKPSDNVYQTLSIGTGNSLVYTAEGNAELYLNSYLDQS
NSDTDRLLIDGDVSGVTVVSVSTTAGHLGDKTGSGNTQGVSLIQVSGTAQEDSFKLKDDY
ITADNLPYQYVLSAYGPSSQLGQADPGQKLVGQNGKEGEHSSSNFWDYRLQIVPTVVPQL
PSYLLLPHALFHTGLVDVSNQHELLEIMQSAFHEAAKKRKTNFFIRGYGSNHSYTSNLSV
FEYGYGADLDYNNATAGIVFNTLESKDSTSSFGVMGGYGQLSLHPRAVKHSQKSVFDKWS
GKLYVNLDHDTGFYANGFLSYDFFKGDVVTLSRGKTAELKGRLLNAALSGGQAIITGYHG
FILEPQLQVIYQSLLFDEARDIDRFDIDLGKHDQLIGRIGGRLIKAFASSEKGHVVSFYS
KLHVAHSYEKKRIVHFKDAFQLGAFGSTVETGAGVHAQLSNAIALHGDLLYQHKLTKAGF
SGISVSGGLRYQF
NT seq 2922 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttgcgcgtttctttctttctttctttctttctttctttctttctcatacttaatact
cttttagttagtccttctaatgtttcttttgctaatgaggctggttctgttaagaagtgt
cagaaaagtaacgctgcgaacggtaaagcttcttcaagttcgaacaagaccactatgaaa
ttgggtagccgtactttcattgtgaaagagtgtaaagaaagtgtaaatggacagataaat
gaccgaaaatatcaaatgggaaatcattctgaacggaataatagtaggaaacggacagac
agtgaaacttctgaaaccggtggagtaattggtatatattcgagttcgagtgatgaagag
aatgagagtgaaaaagagaaaaaaaatacgactagtaatgttgatgtaaataacgtgcaa
attctaggccccgtacacagtgatgatgatatttatattggtatactgctcggggaatgg
ggaacaattgttgctaatgaattgaccttaaaagacctaacgataggtatttctgttgta
gaaaatagttcggtaaacgcagataagacattgataagtaataataagattgctgttaaa
gctaagggttcaagttctatagttgagctattggatacaaatattttagtattaaaaggg
gataaaggtcttttcactacaaaaggtggctatattgatatgcagggtatagataaatcg
gatgcaggcattaattttactctaagttccgcagtttatatgaatacaggagaggtttct
ttagagaaagttaatattattaatgatactattaatgataatacttctgtccagacgaac
gagaatgtagattatagtcgtagtgctgccgtttatatgcatccacagagtacttttgag
atgaaggaagggaaagttcatctcaaaagtgggaatggatttgtatttgacttttcacca
tatgaggatacagaagattatgagacagcagatgaagatggtgatgaagatgagagtgac
gatgaagaagatgatgaggaggaggagaagaaagagaatgtaaatcttgaaaatgtagac
gttaaaatagagggtgataaatattatggcatgtatggagtaccttctgttagtgatgac
aaggacaaggagtttgaaagatctgcaactatttctttgaaaaaaacaaattttattgtt
cctaatagtaccgctatttataatggtgttaaggcggagcttacttttaatttatcagat
acaaaactttccggtggtcttttgctagaaggtactagcgggattataaacattaaagct
aataactcacagctcgaagggggtgctttaatttctggttcagctgaagcgcatttgaaa
ttagagaataactcgatgtggactttaacaaaaagaaaatcacggggtgatcgagggaat
gagggaactgataataataaatcatttatttctactgtgacacttaagaatagtaaaatt
atttttgaaaagccaagcgataatgtttatcaaacactctctattggcacagggaatagt
cttgtttatacagcagagggtaatgcggagctttatcttaatagttatttagatcaaagt
aactcggatacagatcggcttttaatcgatggtgatgtatctggtgttactgtagtttct
gtttctacaactgcaggacatctaggagataaaacgggttcaggtaatacccagggtgtt
tcgcttattcaagtttcaggtacagcgcaagaagattccttcaaactgaaggatgattat
attacagcagataatttaccttatcagtatgttctttctgcgtatggtccaagttcccaa
ttagggcaagcggatccaggacaaaagttggttgggcagaatggaaaagaaggtgagcac
tctagtagtaatttttgggattatcggctgcaaatagtaccgacagttgtgccacaactc
ccaagttatttgcttttacctcatgctttatttcatacaggtttggtcgatgtaagtaat
caacatgaactgttggaaatcatgcaaagtgcttttcatgaagcggctaaaaagagaaag
acaaactttttcatccgtggttatggcagtaaccatagttatacttccaatttgtctgtt
tttgaatatggttatggagctgatcttgactataataatgcgacagcaggaattgtattc
aatacattagagagtaaagatagtacttcgtcctttggagttatgggcggttatggtcag
ctctctcttcatcctcgtgcagttaaacacagtcaaaagagtgtttttgataaatggtca
ggcaagctttatgtgaatttggatcatgatacaggcttttatgcgaatggctttctctcg
tatgatttttttaagggcgatgttgtcactctttctcgtggaaaaacagcagaattaaaa
gggagacttttgaatgctgctttatcgggtggtcaggccattatcacaggctatcatggt
tttattcttgagccacagcttcaagttatttaccagtctctcctgtttgatgaagcgcgt
gatattgatcggtttgatattgatttaggaaagcatgatcaattgatagggcggataggt
ggtcgtttaataaaagcttttgcttcttccgaaaagggacatgttgtttctttttatagt
aaacttcatgttgcgcatagttatgaaaagaagcggatagtgcattttaaagatgcattt
cagttaggtgcattcggttctacagttgaaacaggtgcgggtgttcatgctcaattgtct
aatgctatagcacttcatggtgatttgttataccaacataaattaaccaaagctggcttt
tctggaattagtgtttcgggtggcttacgttatcaattttaa

DBGET integrated database retrieval system