Bartonella sp. JB63: BJB63x_012420
Help
Entry
BJB63x_012420 CDS
T05552
Name
(GenBank) autotransporter secretion inner membrane proteinTamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
barj
Bartonella sp. JB63
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
barj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
barj02000
]
BJB63x_012420
Transporters [BR:
barj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BJB63x_012420
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Beta-prop_RIG_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX29893
UniProt:
A0AAC9QQM5
LinkDB
All DBs
Position
1407694..1412340
Genome browser
AA seq
1548 aa
AA seq
DB search
MKKIWYLRFFLFGFSFFMMSSFIFAQRGNSLAKEEIGDSGSWLVSFIERKLSTPNRQIRL
HNIKGALSSQASIDTITVSDNKGIWLKIKNTKVDWNRLALLRGHVEINQLSAEKIIFLRK
PQSSSSISFFAADQFSIPKLPIAIFVNTLMVDCVTFEKDIFGLASDVSLKGHLTLDSDEF
DSNIEVQRLDESGYFSILTRISNNSRTAKIDIIADEPQNGIMANILELEKRPALNLTVKG
NGTFDDLVVMLHLEANQQPILEGNFILTGVSEGHSLLTNLGGKIGLLMPAQYRSLFESNV
ALKAKTTMTNEGAMQLNHMTIQGDAIDVVANAEITNDGFLRRLFVDGKIAFDKGKSSTRL
PRETKIHLNNLALTIDYGRKGQKTWKGRLAIHNLNNDNVHIRDAVFDMGGMSENLDNLVS
RHVGIQINGTLQGIKSIKDGFAENLNQPVHIHFDTDILSGKPMLIHDFSITAQDFSIWLK
GQMDRFIFKGDLGIQAQTLAPLGLLNGKSFSGSADIKARGSFNLIEGAFDLKLLSTTNNA
KIGREAVDHFLKGKLLLSGDIAWNTMGLIIHDFHLKNQFADIKADGHFSRESAEIDFSAQ
ISKLALLDPRMDGTLTIKGAARGHNSLITISTNAHIAEAFLVGKKLQNTILNVNALMDNT
SPVASYLTGFIEGKGTFAEKPLQLSAAFDNTNHIWKFQGINIKGGNGSITGNIAQTFERF
LKGNLHIDANDISTLSALFLQKGNGKVKGDFIFDEINNQQIANLKANVDHLILAKNEIKK
LAIQADIFDPFGAIQFKGSFNAEHIRTPLMIINRLNAQAINNNGQTVFNVQASFHNNTNA
KFSGRVIAERLSTGVKQKVQLETIDVKQANFHAALLKPATIIFDKNEITISKLGISINEG
EIALAGNIQDTLNLHLTMSAVPANLANFWKSDLGAIGTLTGDIMICGSLIKPEIIYDVKG
QDLTIASFQEKKIMPFAFSAKGKTVDQALLLYAELSGDGLQAQAEGKVPLDKSDFDLHVN
LKNFPVRLINGFIKGQPLGGEVVGKVDIGGDWKSLSTHFELYSQNLTVMTHKGLESINMN
ILGSYKKSTFHIEHMIAFGAKELDLSVNGQISLNDSRAELNVKGTMPLTFMNQFIAERGA
NVTGTLKIDSTLSGALSKPQLGGHFSVSNGHFLDTQTNLELNNIRLEAKLNGDHMILEHA
YASSFYGGSLSASGRIFNDLQTDLVIYLDHAHYNDGSMIFATLTGKMAVTGYFLRDLVIG
GDIIVEKAELLIPDNFQNAAFLDFKHKNLIVPIQKTLERANVKNYNHNQNASEKSSSVVQ
LDIKINAHNKFFVRGRGVDAELGGSINLKGPLHGVHPVGELQMIRGRFDILSRRLNFDKG
QASFNGNLNPTVYFITNSNNGDIRVNMIISGTINNLDIQFSSQPVLPQDEILARLIFNRS
LNELSPFQIIQLTAAAAELFSTSNTSLLNTLRTRIGLDDLDVVVDKKGNTGLRVGRYIHD
DIYLGFEAGSNGTTKGTINLDVSRHLKAKGAIGGEENTSFGLFYEKDY
NT seq
4647 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatatggtatttaaggttttttttatttggattttctttttttatgatgagc
tcttttatatttgctcagagaggaaattcattagctaaagaggaaataggtgatagtggt
tcatggcttgtctcttttattgagcgtaaactttcaacacctaatcgacaaattcgttta
cataatatcaaaggagcattatcttcacaagcgtcgattgatacgattactgtgagtgat
aataaaggtatttggcttaaaattaaaaatactaaggtagattggaatcgtttagcgtta
ctgcgaggacatgttgagattaatcaactatcagcagaaaaaattatatttttacgcaaa
ccacagagttcttcctcaatttctttttttgcagctgatcagttttccatacccaaattg
cctatagcaatttttgtcaatacactgatggttgattgtgtaacctttgaaaaagatatt
tttggccttgcttctgatgtatcattaaaaggacatttaaccttagatagtgatgagttt
gattccaatatagaggttcaacgtttagatgaatcaggttatttttctatcttgacaaga
atatcgaataacagtcgtacagctaaaattgatattattgctgatgagccacaaaatggt
attatggctaatattcttgagcttgaaaagcgtcctgcattaaacctcactgttaaaggt
aatggaacttttgatgatttggttgttatgcttcatttagaagctaatcagcagcctatt
ttagagggtaattttattcttacaggtgtttcagaaggccatagtcttttaactaattta
gggggaaaaattggtcttttaatgcctgctcaatatcgtagtctatttgaatctaatgtt
gcattaaaagcaaaaacaacgatgacaaatgaaggtgcgatgcagcttaatcatatgact
attcaaggagatgcaattgatgttgtggctaatgctgagataacgaatgatggattttta
cgacgtctttttgttgatggcaaaatagcttttgataaaggaaaatcatctactcgctta
ccacgagagacaaaaatacatttgaataatcttgctttaacaattgattatggccgtaaa
ggacaaaaaacctggaaaggtcggcttgctatacataatttgaacaatgacaatgttcat
attcgtgatgcagtttttgatatggggggtatgagtgaaaatcttgataatttagtttct
cgtcatgtaggtattcagattaatggtactcttcaaggaattaaaagtattaaggatggt
tttgcagaaaatctaaatcaaccagttcatatacattttgatacggatattctctctgga
aagccaatgttaattcatgattttagtattacagctcaggatttttctatttggttaaaa
gggcaaatggatcgtttcatttttaaaggtgatcttggtatacaagcacagacattagca
cctttgggtttattgaatggaaagtcattttctggcagtgcagatattaaagcgagagga
agttttaatttaattgaaggggcttttgatcttaaactattaagcactaccaacaatgct
aaaataggaagggaagcagttgatcattttttaaaaggaaaacttcttctttcaggtgat
attgcgtggaatacaatgggtttaattatacacgatttccatttaaaaaatcagtttgcc
gatataaaagctgatggccatttttccagagaaagtgctgaaatagatttttctgctcaa
atatctaaactagctcttttagatccaagaatggatggtactcttacgattaaaggggct
gctagaggacataatagtcttataacaatcagtacaaatgctcatattgcggaagccttt
ttggttggtaagaagcttcaaaatacaatattaaatgtgaatgctcttatggataataca
tcaccagttgcctcctatttaacaggttttatagaaggaaagggaacttttgctgagaaa
ccattgcagctatctgctgcttttgataacaccaaccatatttggaagtttcaaggtatt
aatattaaaggaggtaatggaagtataaccggtaatattgctcaaacatttgaacgtttt
ttaaaaggaaacttgcatattgatgcgaacgatatttcaacactttctgcactatttttg
caaaaagggaatggaaaagtgaagggagattttatctttgatgaaataaataaccaacaa
atagcaaatttaaaagcgaatgttgaccatttgatacttgcaaaaaatgaaataaaaaaa
ttagcaatacaagctgatatattcgatccttttggcgcaatacaatttaaaggttctttt
aatgcagaacatatccgaacgccattaatgataataaatcgtttgaatgctcaggctata
aataacaatggacaaacagtttttaatgttcaggcgtcattccataataatacgaatgca
aagttttctgggcgcgttattgcggaaaggttatccacaggtgtgaaacaaaaagtgcag
cttgaaactatagatgtaaaacaagccaattttcatgcagcattacttaaaccagcaacc
atcatctttgataaaaatgaaataacaataagcaagttaggaatttctatcaatgaaggt
gaaattgctcttgcaggcaatattcaagatactcttaatttgcatcttacaatgagtgct
gttcctgctaatttagctaatttttggaaatcagatcttggtgctatcgggactttgaca
ggagatattatgatttgtgggagtttaataaagcctgagataatctacgatgtaaagggc
caagatttgacgattgcttcttttcaagaaaagaaaataatgccttttgctttttctgcc
aaaggaaaaacagtcgatcaggctcttcttttatatgcagaattaagtggagacggattg
caagcgcaagcagaaggaaaagttcctttagataagagcgattttgatttgcatgttaat
ttaaaaaatttccctgtccgtttgatcaatggttttattaaggggcaacctcttggagga
gaagtagtcggtaaagttgatattggtggggattggaagagtttgtctacccattttgag
ctttatagtcaaaatttgacagtaatgactcataaaggactagagtcaattaatatgaat
atccttggttcttataaaaaatcgacatttcatattgagcatatgatagcattcggtgca
aaggaattggatctttctgttaatggacagatttctctaaatgattcgagagctgaattg
aatgttaaaggcacgatgcctcttacttttatgaatcaatttatagctgagcgtggtgca
aatgtaacgggaacgttaaaaatagatagcactctcagtggtgcattgtctaaaccacag
ttgggaggccatttttctgtatctaatggccattttttagatacgcaaacaaatttagaa
ttgaataatataaggcttgaagccaaactgaatggcgatcatatgattttagagcatgct
tatgcttcttcattttatggaggatctctttctgcatcaggtcgcatctttaatgattta
cagacagatttagttatttatctcgatcatgcccattataatgatgggtctatgattttt
gcaacattaacaggcaaaatggcagtaactggttattttttacgtgatcttgttattggt
ggtgatatcatagttgaaaaagcagagcttcttattcctgataattttcaaaatgctgca
tttctggattttaaacataagaatttaatcgtgccgattcaaaaaacacttgaacgagct
aatgttaaaaattacaatcataaccaaaatgcttctgaaaaatcttcttctgttgtgcag
ttggatataaaaattaatgcacacaacaaattttttgtccgtggtcgaggggtagatgct
gaattaggaggaagcattaatttaaaaggtcctttgcatggtgtgcatccggttggtgaa
ctgcaaatgattcgcggaaggtttgatatcctttcacgacgtcttaatttcgataaagga
caagcaagctttaacggtaatcttaatcctactgtttattttattaccaacagtaataat
ggcgatattcgtgttaatatgataataagcggaacaattaataatcttgatattcagttt
tcttcacaacctgttttgccacaggatgaaatattagcgcgtttgatttttaatcgctct
cttaacgaattgtcgccatttcagattattcagcttacagcagcggcagctgagcttttt
agtacttctaatacatctttattaaacactttacgcacccgtattggtctcgatgatctt
gatgttgttgttgataaaaaaggtaatacaggtttacgtgttggacgctatatccatgat
gatatttacttgggttttgaagcaggatccaatggaacaacaaaaggaacaattaatttg
gatgtttcacgccatcttaaagctaaaggggctataggaggtgaagaaaatacgagtttt
ggcttgttctatgaaaaagattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
