Bartonella sp. 1-1C: B11Cv2_000140
Help
Entry
B11Cv2_000140 CDS
T05463
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein
Organism
baro
Bartonella sp. 1-1C
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AC_1
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO56803
UniProt:
E6YTI5
LinkDB
All DBs
Position
14343..17387
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MLKVFKNYTYVCACTTSAFFFLHNIDVNATSEMTDCSESSSFLKCSDGKTHTFTSKSYQL
NEQKGSSFSKAVSAEKSGTVINAENITITNSKTGVFAKEYGKVILQNSTIKEVAEGLSAN
ENGAIKMVGGTINLNYDQRSIGVSSWSSQGVELENVHITLSEGKEQRANMGLYAGCSSNK
MCNSKITMINGSIDVVGTGVVIDKASQGDISLTNVKITVKSGGSNEYPYDSLGMYIANNN
SKLEMINGSIDFTNGVGVFVGEKGHTDLDGVIITGKNNDGKGTTDDRGGLYLDTGGSIFL
KDGRVSVSNTYGITMYQPVNRNMVGEKVDIENSTITAEKYPAIYITKQNALMEDFYAHEK
TSIVKLSKNSNISGDLLLKAKGGIIDIQADQSILKGGVSIANGALVNFSLKNNSNWTLTT
RKNNTSTSQRHLNNIAWFITSLELDHSIVQFDAPKNFVYQTLNVGKGSGVVYNAVNDAKL
YLNVFISKENNINDQKTDRLLIHGNVSGTTTVYVTGQNGSSKDDIGRNGNTQGISLIQVS
GTAQEHSFKLEGDYITIDGSPYQYVLSAYGPSSSHGQASLDQKLVSGNGSNFWDYRLQSK
YISPRVQPSPPKPAPVPPESLPPVSEPPAPIPPVLPASPVPEPPAPIPPVLPASPVPEPP
APIPPVPPAPPVPKPPTPSKPQDPRTPDLPEKRVPAVVPQLPSYLLLPHALFHTGLVDVS
NQHELLEIIQNASHEPDKNRKTSFFVRGYGSNHHYTSNLSVFEHGYGADLDYNNVTVGIV
LNTLESKHSASSFGFMGGYGQLSLQPREVKQSQKSVFNKWSGKLYANLHHDTGVYANGFI
SYDFFKGDVVTLSRGKTAELKGGLLNASLMGGHAIITGYNGLILEPQLQVVYQSLLFDKA
RDIDRFDIELGSHNQLIGRIGGCLTKVVSSSEKAHVVSFYSKLHVAHSYDVKRIVHFKDA
FQLGAFGSTVETGMGVHAQLSNTITFHGDLLYQHKLTKAGFSGISISGGLRYQF
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaagtttttaaaaattacacttacgtttgtgcttgtacaacaagtgcttttttc
tttttgcacaatatagatgttaatgcgacatctgaaatgacagattgttcagagagtagt
tcttttcttaaatgttctgatggtaaaacacatacttttacgagtaagagctatcaatta
aatgagcagaagggttcttcattttctaaggcagtatccgcagaaaaatcagggacagtt
attaatgcggagaacattaccattactaactctaaaacaggcgtatttgcaaaagagtat
gggaaagttattttgcagaattcaactattaaggaagtagcagaaggcctttccgctaat
gaaaatggggcaattaaaatggtgggtggaacaattaatttaaattatgatcaaaggagt
ataggagtaagctcgtggagtagtcaaggagtagagttagagaatgtccatattacattg
agcgaagggaaggagcagcgtgctaatatgggtttatatgctggatgttcttctaataag
atgtgtaattccaaaattacaatgatcaatgggtcaatagatgttgttggtacaggtgtt
gtaatagataaggcatctcagggtgatatttccttaactaatgtaaaaattacagtgaag
agtggtggaagtaatgagtacccttatgattctttagggatgtatatcgccaataataac
agtaagcttgaaatgataaatgggtcaattgattttacaaatggagtgggggtgtttgta
ggagaaaagggacatactgatttagatggtgtcataattactggaaaaaacaacgatggt
aagggaacaacagatgatagaggtggattgtatctagatacaggaggatctattttttta
aaggatgggcgagtttctgtttctaatacttatggtataacaatgtatcagcccgtgaac
agaaatatggtgggggaaaaggtcgatattgaaaactcaactattacagctgaaaaatat
ccagcgatatatatcacaaaacaaaatgctttaatggaagatttttatgctcatgagaaa
acatctattgttaaattatcaaaaaattccaatatctccggcgatcttttgttaaaagcc
aaaggaggaattatagacattcaggctgatcagtctatcctcaaagggggagtttctatc
gctaatggagctcttgtaaattttagtttgaaaaataattcaaactggactttgacaaca
agaaaaaataacacttctacaagtcaaaggcatttgaataacattgcatggtttataaca
tctttagaattggatcatagtattgttcagtttgatgcaccaaaaaattttgtttatcaa
acacttaatgttggaaaaggatcgggtgttgtttataatgctgtgaatgatgcaaagctt
tacttgaacgtttttattagtaaagaaaataacattaacgaccaaaagactgataggctt
ttgattcatggcaatgtgtctggtacgaccactgtttacgttactggccaaaatggaagt
tcgaaagatgatatagggaggaatgggaatactcagggtatttcgcttattcaggtttcc
ggtacggcacaagaacattctttcaaattggaaggtgattatattacaattgatggttca
ccttatcagtatgttctttctgcttatggcccaagttcttctcatggtcaggctagtctt
gatcaaaagttagttagtggtaatggaagtaatttttgggattatcgtctgcagagtaaa
tatatttctccacgagtacaaccatcaccaccaaaaccagcgccagtaccaccggaatca
ttaccaccggtgtcggaaccaccagcgccaatcccaccagttctaccagcatcaccagta
ccggaaccaccagcgccaatcccaccagttctaccagcatcaccggtaccggaaccacca
gcgccaatcccaccagttccaccggcaccaccggtaccgaaaccaccaacgccatccaaa
ccacaggatcctagaacaccagatttacctgaaaaaagagtaccagcggttgtgccacaa
ctgccaagttatttgcttttacctcatgctttatttcacacaggtttggtagatgtaagt
aatcaacatgaactgttggaaatcatacaaaatgcttctcatgagcctgataaaaataga
aagacaagcttttttgtccgtggttatggtagtaaccatcattatacttcaaatttatcc
gtttttgaacatggttatggagctgatcttgactataataatgtgacagtaggtattgta
ttaaatacattagagagtaaacatagtgcttcgtcttttggatttatgggcggttatggt
cagctctctcttcagcctcgtgaggttaaacaaagtcaaaagagtgtttttaataaatgg
tcaggaaagctttatgctaatttgcatcatgatacaggcgtttatgcaaatggctttatc
tcttatgatttttttaagggcgatgttgtcactctttctcgtggaaaaacagcagaatta
aaagggggacttttgaatgcttctttgatgggcggtcatgcaattataacaggctataat
ggtcttattcttgaaccgcagcttcaagttgtttatcagtctctcctgtttgataaagcg
cgtgatatagatcggtttgatattgagttaggaagccataatcaattgataggacgtatt
ggtggttgtttaacgaaagttgtttcttcttccgaaaaggcacatgttgtttccttttat
agcaaacttcatgttgcgcatagttatgatgtcaagcgaatagtgcattttaaagacgct
tttcagttaggtgcatttggttctacagttgaaacagggatgggtgttcatgctcaattg
tctaatactataacattccatggcgatttgttataccaacataaattaaccaaagctggc
ttttctggaattagtatttcgggtggtttacgttatcaattttag
DBGET
integrated database retrieval system
