Bartonella sp. 1-1C: B11Cv2_000720
Help
Entry
B11Cv2_000720 CDS
T05463
Name
(GenBank) 23S rRNA pseudouridine2605 synthase
KO
K06178
23S rRNA pseudouridine2605 synthase [EC:
5.4.99.22
]
Organism
baro
Bartonella sp. 1-1C
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baro00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
baro03009
]
B11Cv2_000720
Enzymes [BR:
baro01000
]
5. Isomerases
5.4 Intramolecular transferases
5.4.99 Transferring other groups
5.4.99.22 23S rRNA pseudouridine2605 synthase
B11Cv2_000720
Ribosome biogenesis [BR:
baro03009
]
Prokaryotic type
rRNA modification factors
23S rRNA modification factors
B11Cv2_000720
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
S4
PseudoU_synth_2
SYY_C-terminal
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO56860
UniProt:
E6YTP4
LinkDB
All DBs
Position
79151..80632
Genome browser
AA seq
493 aa
AA seq
DB search
MTNDCTSSFSFRNKRHSVRDKFSIQFKKNCNEKRVSEKSESERIAKRLARAGLASRRDAE
MMIVAGRIVVNGTVVTTPAFNVSRSDVIMVDGKPLPPIERTRLWLYYKPIGFVTTNRDPQ
GRPTVFDNLPKGMPRVLSVGRLDINTEGLLLLTNDGGLARVLELPLTGWVRKYRVRAHGK
VKQSALQDLKNGIAVNGIFYGSIEASIEREQGSNVWLSVALREGKNREIKNVLGALGLSV
NRLIRVSYGPFQLSDLKEGAVRELKGRMLRDQLGERLIVQANADFDAPILKPFSNSAVVA
KQNITKSSVIEDSWIVSSKENLLYGRKSRFLGHSQVRLSKKIDTKLRAKDHNKGGKEERA
FLRSRCSNVWMAPGACPQIARKKSSSDADNHYDRKSNWVGKRSTDRGKEKRSERQVEKAK
CIDFSKKHSKTSFVESRIFSKKDQLLKKERKVVKDDRDEHFLNNKRKSRPFDKAMKRFKK
YNNGARVSQRSGG
NT seq
1482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaatgattgcacttcttctttttcttttcggaataaacgacatagtgtgcgtgat
aaattttctatacaatttaaaaaaaattgcaatgaaaagagagtgagtgaaaagagtgaa
agtgaaagaattgctaaaaggttggcacgtgctggattagcatcacgccgtgacgcagag
atgatgattgttgcaggccgtattgttgttaatggtacagttgtaactacacctgctttt
aatgtttctcgctctgatgttattatggttgatggtaagcctttaccccctatagaacga
acacggctatggctttattacaaaccaataggatttgttacaaccaaccgtgaccctcaa
gggagaccaacagtatttgataatttgccaaaaggtatgcctcgtgttctttctgtgggg
aggcttgatattaatacagaaggacttttgcttttaaccaatgatggtggtttagcacgt
gtattggagcttcctttaacgggatgggtgcgtaaatatcgggttcgtgctcatggaaaa
gttaaacagagtgcacttcaagatttaaagaatggtattgcagttaatgggattttttat
ggttcaattgaagcttcgattgaacgtgagcaaggatcaaatgtatggctttctgtagct
ttgcgtgaaggaaaaaatcgtgaaatcaagaatgttttgggagctttaggattatctgtt
aatcgcttaattcgcgtgtcttatggtccatttcaattatctgatttaaaagaaggtgca
gttcgtgagttaaaaggtcgaatgttgcgcgatcaattaggagaacgtttgattgtgcaa
gctaatgcggattttgatgcacctattttaaagcctttttcaaattctgctgttgttgca
aaacaaaacattacaaaatcttctgtgattgaggatagttggattgtctctagcaaagaa
aatctattgtatggaaggaaaagcagatttttggggcacagtcaggtacgattgagtaaa
aaaattgatacaaaattaagagctaaagatcacaacaaaggtgggaaggaagagcgtgct
tttttacgttcacgttgttctaatgtttggatggctcctggtgcttgtccacagattgca
cgtaagaagtcctcttctgatgcagataatcattatgatcgtaaaagtaattgggttggt
aagagatctactgatagagggaaggaaaaacgatcagaaagacaagtagaaaaagctaag
tgcattgatttttctaaaaaacatagcaaaacatcttttgttgaatcacgtatttttagc
aagaaagatcaattattaaaaaaagagaggaaggttgttaaagacgatcgtgatgaacat
tttttgaataataagcggaaatctaggccatttgataaggccatgaagagatttaagaaa
tataataatggtgcaagagtatctcagcgatctggaggataa
DBGET
integrated database retrieval system