Bartonella sp. 1-1C: B11Cv2_001690
Help
Entry
B11Cv2_001690 CDS
T05463
Name
(GenBank) Head domain of trimeric autotransporter adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
baro
Bartonella sp. 1-1C
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baro00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
baro02000
]
B11Cv2_001690
Transporters [BR:
baro02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B11Cv2_001690
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO56953
LinkDB
All DBs
Position
167717..175387
Genome browser
AA seq
2556 aa
AA seq
DB search
MKKKSTQNIIKTVSLGAAVSALLSSASPVFSANLAITGATNQSSNGTASHYPNGSHGSIV
FNGDDDFCGVDNVAGRGGAQKPGTAITAEEQYNRFINNETFSGRNPYGSSTKKVNWLSEG
VTEGNVGYMGTATGGVANAMPEAFGVYSFATGCGSYASGNYSTAFGAGATAKAGGAQAFG
VSSLATGEASVAMGVGTEATGKSAAAFGSLAKAEGLNSVALGTKAHAESINSVALGHKAH
AYVEGAVAIGHDSVAGTTSSVAIGSGAQVTTESGVALGGNSVAVTAPGIRGYDPRAHGEA
AINDFVWKSTKGVVSVGNPQHGVTRQIVGVAAGTDLTDAVNVAQLQALREMILTGGGGDS
LIQQDSQTGLITIGQSVSGDTINIANNEKKSRKISGLGGGDISEHSTDAVNGSQLWEANE
KISELDTEIDNIETNITKIEANITTVAQNTSKYFGGGADVLTGKAPTYTINGSKYNDVGS
AFEGVDNSFTEINNKISNMTGNSLVQQDVDRNNLITIGAKTGGILIDITNSEGKNRQITG
VYGGDISEYSTGAVNGSQLWDITSKISEYLGGGADVLHGIKPDYEINGITYNDVGSAFEG
IDVVFTEIRDEIGNTSEYFGGGADVLNGKAPTYTVNGSDYNDVGSAFAGVDTAITEINNK
ISNMTGNDLVQQDAAQDNLITIGAKTGGTLIDITNNENDYRKITGVEDGDISEDSVDAVN
GYQLWKVANNTSNYFGGGADVLNAEKPSYEISGITYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNI
TENSLVQQNATQNNLITIGAKTGGTLIDITNSEGENRQITGVYDGDISEDSEDAVNGAQL
WQVASNISKYFGGGADVVNDKAPTYSVNGSDYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKILNITENS
LVQQHSNQDNVITIGEKTAGTLIDITNSKGENRQITGVDDGGISENSTDAINGAQLWEVA
SNTSKYFGGGADILNGKAPTYIINGSKYNNVGSAFEGVDDSFTEINNKISNMMGNSLVQQ
DVDQDNLITIGAKTGGTLIDITNNEDESRQITGVEDGRIAEDSVDAINGYQLWQVASNTS
KYLGGGADVLNDKAPTYSVNGSDYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNITENSLVQQNATQ
NNLITIGAKTGGTLIDITNNEDESRQITGVYDGDISEDSEDAVNGAQIWQVASNISKYLG
GGADVLNDKAPTYSVNGSDYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNMTANSLVQQDADRNNLI
TIGAKTGGILIDITNNENDYRKITGVEDGDISEDSVDAVNGYQLWKVANNTSNYFGGGAD
VLNAEKPSYEISGITYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNITENSLVQQNATQNNLITIGA
KTGGTLIDITNNEDESRQITGVYDGDISEDSEDAVNGAQIWQVASNISKYLGGGADVLND
KAPTYSVNGSDYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNMTANSLVQQDADRNNLITIGAKTGG
ILIDITNNENDYRKITGVEDGDISEDSVDAVNGYQLWKVANNTSNYFGGGADVLNAEKPS
YEISGITYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNITENSLVQQNATQNNLITIGAKTGGTLID
ITNSEGENRQITGVYDGDISEDSEDAVNGAQLWQVASNISKYFGGGADVVNDKAPTYSVN
GSDYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKILNITENSLVQQHSNQDNVITIGEKTAGTLIDITNS
KGENRQITGVDDGGISENSTDAINGAQLWEVASNTSKYFGGGADILNGKAPTYIINGSKY
NNVGSAFEGVDDSFTEINNKISNITENSLVQQDSAQGGLITIGKNVNGTEISILNNKKKQ
RKITGVADGLIFEQSTDAVNGGQLWKTNQDVEKLNHSVEKTETDITNLQGDLSKVAVYTS
KYFGGGADVLSGKAPTYTINGSKYNDVGSAFKGVDGSMKDIRNQITNITENSLVQQDIDT
KLITIGARRGGTKIDISDRPGKDRTLSGVKAAVKGNEAVNKDQLDKSLREINKDFESMSA
AAVLYDKRQNGSIDYKNITLGGQNNKGPVAIHNLKDGVISSESSDAVNGKQINKLSEDIA
NIFGGSTEFRNGVFTRPVYDLSHVTTEGIVTRKIYNDVGSAFAGLDANIKNVNTRIQYVI
DDFNDKIANISSDALLWSAQEGAFVALHGSKGQAKRNSKLTFLLDGEIDINSTDAITGKQ
LFQMSNKLASYFGGGAQYRDGKWTDPTFTIYKFGANGSISETAYKDVASAFAGVNGGMSV
LNDRIKKLENQGGQGGPDSDSLKWNEEKGAYDANREGKDSKITGIANGKVEKDSKEAVNG
GQLWETNERVTNVENKVDHMSNTINGIAENTVQYDKDENGKKTNKITLVGGDAGKPVVID
NVADGKIETGSKEAINGGQLHDYTKQQMEIILDDAKRYTDEKVKNIVVDAIDDAVEKAKD
YTDMKFDALNYNIQEVRKEARQAAAIGLAVANLRYNNIPGALSVAFGTGLWRSQSALAFG
AGYTSINGNIRSNVSVTGAGGHWGVGAGVSFTLPVR
NT seq
7671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaatcaacacaaaatatcattaaaacggtgtcattaggagcagcagtatct
gcccttttgtctagtgcctctcctgttttttcagctaatcttgcaataacaggagcgact
aatcaaagttcaaatggtaccgcttctcattatccaaatgggagtcatggtagtattgtt
tttaacggtgatgatgatttttgtggtgttgataatgttgcgggtcgtggtggcgctcag
aaacctggtacggccataactgcagaagagcaatataataggtttatcaataacgaaaca
ttttctggtcgcaatccttatggctcttcaacaaaaaaagttaattggcttagtgaaggc
gtaactgaaggtaatgttggttatatgggaacagcgacaggtggggttgctaatgctatg
cctgaagcttttggtgtttattcttttgcaacgggttgtggttcttatgcgtctgggaat
tattctacagcatttggtgcaggtgcgactgcgaaggctggtggagcacaggcttttggg
gtttcttctcttgcaactggggaagcaagtgttgctatgggagttgggactgaagcgacg
ggtaaatctgcagctgcatttggttctcttgcaaaggcagaaggtttaaatagtgttgct
ttaggtacaaaagcacatgcagaaagcattaacagtgttgctttggggcacaaagcgcat
gcatatgttgaaggagcagttgctataggacatgattctgtagctggaacaacatcttcg
gttgctattggtagtggtgcgcaggtaactactgaaagtggtgttgcgttaggaggaaat
tctgttgcagttactgctcctggtattcgtggttatgatcctagagctcacggtgaagct
gcgataaatgattttgtatggaaaagtactaaaggcgtagtcagtgttggtaatcctcag
catggagtaactagacagattgtgggagtagcggctggtactgatttgactgatgcagta
aatgttgcacagctacaagcattaagagagatgatacttacagggggtggtggtgatagc
cttattcaacaagatagccagacaggtttgattactattggtcagagtgttagtggagat
acaatcaatattgcaaacaatgaaaagaaatcgcgaaagatttctggtcttgggggtgga
gatatttctgaacattctactgatgcagtaaatggatctcagctttgggaggctaatgaa
aaaatttcagaattagatactgagattgataatatagagacgaatataactaagattgaa
gctaatataacaacagttgcacaaaatacatcaaagtattttggaggtggtgcggatgtt
ttaactggtaaagcaccaacgtataccatcaatggctctaagtataatgatgttggttca
gcgtttgaaggtgttgataatagttttacagaaattaataataaaatatctaatatgaca
ggaaatagccttgttcagcaagatgtggatcggaataatcttattaccattggagcgaaa
acaggaggtattttaattgatattaccaatagtgaaggtaaaaaccggcaaattactggt
gtttatggtggagatatttctgaatattcgactggtgcagtaaatggatctcagctttgg
gatattacaagcaagatatcagagtatttaggtggtggtgcggatgttctgcatggtata
aaaccggactatgaaattaatggtatcacttataatgatgttggatcagcatttgagggt
attgatgttgtttttacagagattcgtgatgaaataggcaatacatcagagtattttgga
ggtggtgcggatgttctgaatggtaaagcaccaacgtataccgttaatggctctgattat
aatgatgttggctcagcatttgcaggtgttgacactgctattacggaaattaataataaa
atatctaatatgacaggaaatgaccttgttcagcaagatgctgctcaggataatcttatt
acgattggagcgaaaacaggtggtactctaattgatattaccaacaatgaaaatgactac
cggaaaattactggtgttgaggatggagatatttctgaagactcagtggatgcagtaaat
ggttatcagctttggaaggttgcaaacaatacatcaaattattttggtggtggtgcagat
gttctgaatgccgaaaaaccgagctatgaaattagtggtatcacttataatgatgttggt
tcggcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatatccaatatc
acggaaaatagccttgttcagcaaaatgcgactcagaataatcttattacgattggagcg
aaaacaggtggtactctaattgatattaccaacagtgaaggtgaaaatcggcaaattact
ggtgtttatgatggagatatttctgaagactcagaagatgcagtaaatggtgctcagctt
tggcaggttgcaagcaatatatcaaagtattttggaggtggtgcggatgttgtgaatgat
aaagcaccaacgtatagcgttaatggctctgattataatgatgttggctcagcgtttgaa
ggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatactcaatataacggaaaatagc
cttgttcagcaacattctaatcaggataatgttattaccattggagagaaaacagcaggt
actttaattgatattaccaatagtaaaggtgaaaaccggcaaattactggtgttgatgat
ggaggtatttctgaaaactcaacagatgcaataaatggtgctcagctttgggaggttgca
agcaatacatcaaagtattttggaggtggtgcggatattctgaatggtaaagcaccaacc
tatatcattaatggctctaagtataataatgttggctcagcatttgaaggtgttgatgat
agttttacggaaattaataataaaatatccaatatgatgggaaatagccttgttcagcaa
gatgtggatcaagataatcttattaccattggagccaaaacaggtggtactctaattgat
attaccaacaatgaagatgaaagtcggcaaattactggtgttgaagatggacgtattgct
gaagactcagtggatgcaatcaatggttatcagctttggcaggttgcaagcaatacatca
aagtatttaggtggtggtgcggatgttttgaatgataaagcaccaacgtatagcgttaat
ggctctgattataatgatgttggttcggcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaa
attaataataaaatatccaatatcacggaaaatagccttgttcagcaaaatgcgactcag
aataatcttattacgattggagcgaaaacaggtggtactctaattgatattaccaacaat
gaagatgaaagtcggcaaattactggtgtttatgatggagatatttctgaagactcagaa
gatgcagtaaatggtgctcagatttggcaggttgcaagcaatatatcaaagtatttaggt
ggtggtgcggatgttttgaatgataaagcaccaacgtatagcgttaatggctctgattat
aatgatgttggttcggcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaaattaataataaa
atatccaatatgacggcaaatagccttgttcagcaagatgcggatcggaataatcttatt
accattggagcgaaaacaggtggtattctaattgatattaccaacaatgaaaatgactac
cggaaaattactggtgttgaggatggagatatttctgaagactcagtggatgcagtaaat
ggttatcagctttggaaggttgcaaacaatacatcaaattattttggtggtggtgcagat
gttctgaatgccgaaaaaccgagctatgaaattagtggtatcacttataatgatgttggt
tcggcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatatccaatatc
acggaaaatagccttgttcagcaaaatgcgactcagaataatcttattacgattggagcg
aaaacaggtggtactctaattgatattaccaacaatgaagatgaaagtcggcaaattact
ggtgtttatgatggagatatttctgaagactcagaagatgcagtaaatggtgctcagatt
tggcaggttgcaagcaatatatcaaagtatttaggtggtggtgcggatgttttgaatgat
aaagcaccaacgtatagcgttaatggctctgattataatgatgttggttcggcgtttgaa
ggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatatccaatatgacggcaaatagc
cttgttcagcaagatgcggatcggaataatcttattaccattggagcgaaaacaggtggt
attctaattgatattaccaacaatgaaaatgactaccggaaaattactggtgttgaggat
ggagatatttctgaagactcagtggatgcagtaaatggttatcagctttggaaggttgca
aacaatacatcaaattattttggtggtggtgcagatgttctgaatgccgaaaaaccgagc
tatgaaattagtggtatcacttataatgatgttggttcggcgtttgaaggtgttgataat
agttttacggaaattaataataaaatatccaatatcacggaaaatagccttgttcagcaa
aatgcgactcagaataatcttattacgattggagcgaaaacaggtggtactctaattgat
attaccaacagtgaaggtgaaaatcggcaaattactggtgtttatgatggagatatttct
gaagactcagaagatgcagtaaatggtgctcagctttggcaggttgcaagcaatatatca
aagtattttggaggtggtgcggatgttgtgaatgataaagcaccaacgtatagcgttaat
ggctctgattataatgatgttggctcagcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaa
attaataataaaatactcaatataacggaaaatagccttgttcagcaacattctaatcag
gataatgttattaccattggagagaaaacagcaggtactttaattgatattaccaatagt
aaaggtgaaaaccggcaaattactggtgttgatgatggaggtatttctgaaaactcaaca
gatgcaataaatggtgctcagctttgggaggttgcaagcaatacatcaaagtattttgga
ggtggtgcggatattctgaatggtaaagcaccaacctatatcattaatggctctaagtat
aataatgttggctcagcatttgaaggtgttgatgatagttttacggaaattaataataaa
atatccaatatcacggaaaatagccttgttcagcaggattcagcccaaggtggtcttatt
acaattggtaagaatgtgaatggtactgaaattagcatcctaaacaataaaaagaagcaa
cggaagattactggtgttgcggatgggcttatttttgaacaatcaaccgatgccgtgaat
ggcggacagctttggaaaacaaatcaagatgttgagaaactcaatcatagtgtagaaaaa
acagagacagatataacgaatcttcaaggtgatttatcaaaggttgcagtgtatacatcg
aaatattttggaggtggtgcggatgttctgagtggtaaggcaccaacctataccattaat
ggttctaaatataatgatgttggctcagcatttaagggtgttgatggctctatgaaggat
attcgtaatcaaataaccaatatcacggaaaatagtcttgttcagcaagatatagatacg
aaacttattactattggtgcgagaagaggtggcactaagattgatatttcagatcggcca
ggaaaagatagaactctttctggtgtaaaagctgcggtaaaaggcaacgaagctgttaac
aaagaccaacttgataaaagtttaagagagatcaataaagattttgagtctatgagtgct
gctgcagttctttatgataagaggcaaaatggcagcattgattataaaaacattactttg
ggtggacagaataataagggaccggttgctattcataatcttaaagatggtgtaatttct
agtgagtcgagtgatgctgttaacggaaaacagattaataaactctctgaagatattgcg
aacatttttggtggtagtacagaattcagaaatggtgtttttacgcggccagtctatgat
ttatcacatgtaacaacagaaggaattgtaacaagaaagatctataatgatgttggttca
gcttttgcagggcttgatgcgaatattaaaaatgtgaatacgcgtatacagtatgtgatt
gacgactttaatgacaagattgccaatatttctagtgatgctttgttatggagtgcacaa
gaaggagcttttgttgcacttcatggatctaaaggccaagcaaaacgaaatagtaaactg
acatttcttttagatggggaaattgatattaattcgacagatgccattacagggaaacag
ctttttcagatgagtaacaagcttgcttcttattttggtggcggtgctcaatatagagat
ggaaaatggacagatcctacttttacgatttataagtttggtgccaatggttctatttct
gaaacggcctataaggatgttgccagtgcttttgctggtgtgaatggaggtatgtctgtt
ttaaatgaccgaattaaaaagcttgaaaaccaaggtggacaaggtggccctgattcagat
tctttaaaatggaatgaagaaaaaggcgcttatgatgcaaaccgagaaggaaaggacagt
aagattactggtattgcaaatggtaaagttgaaaaagactcgaaagaggcagttaacggt
gggcaactttgggagaccaacgagcgcgttacgaatgttgaaaataaagtagaccatatg
tccaacacgattaacggtatagctgagaatactgttcaatatgataaagatgaaaatggc
aaaaaaaccaataaaatcactttagtagggggtgatgctgggaagcctgttgtcattgac
aatgttgcagatggtaagattgaaacaggatcgaaagaagcaattaatggtggtcagtta
catgactataccaagcaacaaatggagattattcttgatgatgcaaaaagatatacagat
gaaaaggtcaaaaatattgttgtagatgctattgatgatgcggtagagaaggcaaaagac
tacacagatatgaagtttgatgctttaaattataacattcaggaagtacgaaaagaagca
agacaagctgcagcaattggtttagcagtcgctaacttgcggtataacaatattcctggt
gcattaagtgttgcatttggaaccggtttatggcgtagtcaatctgctcttgcttttggt
gctggttatacatctataaatggaaatatccgttctaatgtttctgtgacaggtgcggga
ggtcattggggtgttggtgcaggagttagctttaccttgccggtgcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system