Bartonella sp. 1-1C: B11Cv2_013430
Help
Entry
B11Cv2_013430 CDS
T05463
Name
(GenBank) autotransporter secretion inner membrane proteinTamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
baro
Bartonella sp. 1-1C
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
baro00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
baro02000
]
B11Cv2_013430
Transporters [BR:
baro02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B11Cv2_013430
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
CsiV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATO58079
UniProt:
E6YT95
LinkDB
All DBs
Position
1512321..1516976
Genome browser
AA seq
1551 aa
AA seq
DB search
MKKMWYLRFFLFGFSLLMMISFVFVQRGNSFVGEEIENDRSWLVSFIERKLSAPNRQIRL
HNVHGALSSQTSIDTITISDNKGIWLKINNAKIDWNRLALLRGHVKINQLSAEKIIFLRK
PQNSSSISFFEADQFSIPKLSMAIFVNTLMVECLTFEKDIFGFVSDVSLKGHLTLGNDEL
DTNIEFQRLNELGYFSILTKISKNDRTAKIDIIADEPQNGIIANILELEKRPALNLSIKG
NGTFDDLVIMLNLKANQQPILEGNFTLVEAAEGHSLVTNLDGTIGRLMPVQSQYRSFFES
NFALKAKVTMTNEGAMHLNHMTIQGDTIDVVANAEIANDGFLRRLFVDGKIAFDKEKAST
RLPRLKTQTRAGNLALTVDYGRKGQQNWKGRLAVHHLSNDNIHIRDAVFDMGGVSENLDN
LVSRHVGIQINGMLQGITRIKDGFAEDLNQPVYIHLDTDILSGKPMSIHDFSVKAQDFSI
WLKGQMDRFIFKGDLGVKAQTLAPLGLLNGQSFSGGADIKAKGNFNLIKGTFDLKFLGTT
NNAKIGRAAVDHLLKGELFLSGDIARNRIGLIVNDFHLKNQFANLKADGYFGRESAEMDF
SAQISNLSLLDPRMDGSATIKGAARGHNSLITISTKAQIVEAFLVGKKLQNTIFNMNVLM
DNTSPVSSYLTGFIEGEGTFSKKPLQLSAVFNNADHIWKLQGINIKGGNARITGDITQTF
EHFLKGNLHIDADDISTLSALFLQKGSGKVKGDFIFDERNNQQIANLKANVNHLIFAKNE
IKKLAIQADILNPFGAIQFKGSVNAEHIRTPFMMVNHLNAQALNNNGQTVFNVQAVLHND
TDAKLSGRVITEGLSEDVKQKLELETIDVKQVGLHAALLKPVTILFDKNGITMSKLGISV
NEGEIVLSGNIQDTLNLHLKMSAVPATLANLWKSDLDAAGTLTGDIMVHGSFTKPEIIYD
VRGQDLMIASLQEKKIKPFAFSAKGKTVNQALLLSAELSGDGLQVQAQGKVPLDKSNFDL
HVNLKNFPAYLVNSFIKGEPLGGEVIGKVDVGGNWKSLSTHFDLSSQNLTVMTHKGPESI
NMNIRGFSKKSTFHIEHMIASGSKDLDLSVNGQISLNNSKVELHVRGMMPLSFMNQFVAE
RGAHVAGMVKIESTISGVLPQPQLKGHFSVYNGHFLDTQTNLELNNIRFEGKLNGDHIIL
ENAYASSSYGGSLSASGRISNDLQTDLVIQLDHAHYNDGSMIFATLTGEMTVTGYFLRDL
VIGGDITIEKAELLIPDNFKNAAFLNLKHKNLIIPIQKTLERANVKTYSHNQSVSEESSS
VVRLDVKINAHNKFFVRGRGVDAELGGSINLKGPLQGIRPVGELQMIRGRFDILSQRLNF
DKGQVSFNGNLNPTVYFITNNNNGDIHVNVIVRGTIDNLDIQFSSQPVLPQDEILARFIF
NRSLNELSPFQIVQLTAAAAELAGASNTSLLNTLRSRIGLDDLDVVVDKKGNTGLRVGRY
IHSNIYLGFEAGSKGTTKGTINLDISRHLKAKGAIGSEENTSFGLFYEKDY
NT seq
4656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatgtggtatttgaggttttttttatttggattttctcttttaatgatgatc
tcttttgtctttgttcaaagaggaaattcattcgtcggagaggaaatagaaaatgatcgt
tcatggcttgtttcttttattgaacgtaaactttccgcacctaatcgacaaattcgtttg
cataatgtccatggggcattatcttcacagacgtctattgatacaattactataagtgat
aacaaaggtatttggcttaaaattaacaatgctaagatcgattggaatcgtttagcttta
ctaagaggacatgttaaaattaatcagctttcagcagaaaaaattatatttttacgtaaa
ccacaaaattcatcctcaatttccttttttgaagctgatcagttttccatacctaaattg
tctatggcaatttttgttaatacattgatggttgagtgtctgacctttgaaaaagacatt
tttggctttgtttctgatgtatcattaaaagggcatttaaccttaggtaatgatgagctg
gatactaatatagaatttcaacgtttaaatgaattaggttatttttctatcttaacaaaa
atatccaaaaacgatcgtacagctaaaattgatattattgccgatgaaccacaaaatggt
attatagctaatattcttgagcttgaaaagcgtcctgcattaaacctctccattaaaggt
aatggaacttttgatgatttggttattatgcttaacttaaaagctaatcagcaacctatt
ttggagggaaattttactctcgtagaggctgcagaaggtcatagtctcgtaacaaattta
gatggaacaattggtcgtttaatgcctgttcaatctcaatatcgtagtttctttgaatct
aattttgctttaaaagcaaaagtaacgatgacaaacgaaggtgcaatgcatcttaatcat
atgactattcaaggcgatacaattgatgttgtagctaatgctgaaatagcgaatgatgga
tttttacgacgtctttttgttgatggcaaaatagcttttgataaagaaaaagcatcaact
cgcttaccacggctaaagacacaaacacgtgcaggtaatcttgctttaacagttgattat
ggccgtaaaggacaacaaaattggaaagggcggcttgctgtacatcatttgagcaatgac
aatattcatattcgtgatgctgtttttgatatggggggggtgagtgaaaatcttgataat
ttagtttctcgtcatgtaggtattcagattaatggtatgcttcagggaattacaaggatt
aaggatggttttgcagaagatttaaatcaaccagtttatatacatcttgatacggatatt
ctttctggaaaaccaatgtcaatccatgattttagtgttaaagctcaggatttttctatt
tggttaaaaggacaaatggatcgttttatttttaaaggagatcttggtgtaaaagcacaa
acattagcacctttgggtttgttgaatggacagtcattttctggtggtgcggatattaaa
gcaaaaggaaattttaatttaattaaagggacttttgatcttaaatttttaggcacaact
aacaatgctaaaataggaagggcagcagttgatcatttattaaagggagaactttttctt
tcaggtgatattgcgcggaatagaataggtttaatcgtcaatgatttccacttaaaaaat
cagtttgccaatttaaaagctgatggctattttggcagagaaagtgctgaaatggatttt
tctgctcaaatatctaatctttctctgttagatccaagaatggatggatctgctacaatt
aaaggcgctgctagaggacataatagtcttataacaatcagcacaaaggctcaaattgtt
gaagcctttttggttggtaaaaaacttcaaaatacaatattcaatatgaatgtgcttatg
gataatacatcaccagtttcctcctatttaacgggttttatagaaggagaagggactttt
tctaagaagccattgcagctatctgctgtttttaacaatgccgatcatatctggaagctt
cagggtatcaatattaaaggaggtaatgcacgtataaccggtgatattactcaaactttt
gaacattttttaaaaggaaatttgcatattgatgcggatgatatttcaactctttctgca
ttatttttgcaaaaaggaagcgggaaagtgaagggagattttatctttgatgaaagaaat
aaccaacaaatagccaatttaaaagctaatgttaatcatttaatatttgcaaaaaatgaa
ataaaaaaattggctatacaagctgatatactcaacccttttggtgcaatacaatttaaa
ggttctgttaatgcagaacatattcggacaccctttatgatggtcaatcatttgaatgct
caagctttgaataacaatggacaaaccgtttttaatgttcaagcagtgctgcataatgat
acagatgcaaagctttctggacgcgttataacagagggattatctgaagatgtgaaacaa
aaattggagcttgaaactatagatgtgaaacaagttggtttgcatgcagcattacttaaa
ccagtgaccatcctctttgataaaaatggaataacgatgagtaagttgggaatttctgtc
aatgagggtgaaatcgtgctttcaggcaatattcaagatactcttaatttgcatcttaaa
atgagtgctgtgcctgctacattagcgaatctttggaagtcagatcttgatgctgctggg
actttaacaggagatattatggtccatggtagttttacaaagcctgagataatctatgat
gtaaggggtcaagatttaatgattgcttctttgcaagaaaagaaaataaagccttttgct
ttttctgctaagggtaaaacagtcaatcaagctcttcttttatctgctgagctaagtgga
gatggattgcaagtacaagcacaaggaaaagtccctctagataagagcaattttgattta
catgttaatttaaaaaattttcctgcatatttggtcaatagttttatcaaaggagagcct
cttggaggagaagtgattggtaaggttgatgttggtggaaattggaagagtttgtctacc
cattttgatctttctagtcaaaatttgacagtaatgactcacaaaggaccagagtcgatt
aatatgaatatccgtggtttttctaaaaaatcaacatttcatattgagcatatgatagca
tcgggttctaaggatttggatctttctgttaatggacaaatttctttgaataactcaaaa
gttgagttgcatgttagaggcatgatgcctcttagttttatgaatcaatttgtagctgaa
cgtggtgcacatgtagcgggaatggtaaaaatagagagcaccatcagtggtgtattgcct
cagccacaattaaaaggacacttttccgtatataatggccattttttagatacacaaaca
aatttagaattgaataatataaggtttgaaggaaaactgaatggcgatcatataatttta
gagaatgcttatgcttcgtcctcttatggagggtctctttctgcttcaggtcgcatttct
aatgatttacagactgatctagttattcaacttgatcatgctcattataatgacgggtct
atgatttttgcaacattaacaggcgaaatgacagtgactggttattttttgcgtgatctt
gttattggtggtgatatcacaattgaaaaagcagagcttcttattcctgataattttaaa
aatgctgcatttttaaatcttaaacataaaaacttaatcataccgattcaaaaaacactt
gaacgagctaatgttaaaacttatagtcataaccaaagcgtttctgaagagtcttcttct
gttgtgcggttggatgtaaaaattaatgcacacaacaagttttttgtgcgtggtcgaggg
gtcgatgctgaattaggaggaagcattaatttaaaaggtcctttgcagggtatacgtcca
gttggtgaattacaaatgattcgcggaagatttgatattctttcacaacgtctcaatttc
gataaaggacaggtaagctttaacggtaatcttaatcctactgtttattttattaccaac
aataataatggtgatattcatgttaatgtaatagtaagaggaacaattgataatcttgat
attcagttttcttcacaacctgttttgccacaggatgagatattagcgcgttttattttc
aatcgttcccttaacgaattatcaccatttcaaattgttcaacttacagcagcagctgct
gagcttgctggtgcttctaatacatctttattaaatactttacgatctcgtattggtctt
gatgatcttgatgttgttgttgataaaaaaggcaacacaggtttacgtgttggacgctat
atccattctaatatttacttgggttttgaagcgggatcgaaaggaacaacgaaaggaaca
attaatttggatatttcacgtcatcttaaagctaaaggggctataggaagtgaagaaaat
acgagttttggtttgttctatgaaaaagattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
