Bartonella sp. Raccoon60: Bra60_001750
Help
Entry
Bra60_001750 CDS
T05326
Name
(GenBank) Coiled stalk of trimeric autotransporter adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
barr
Bartonella sp. Raccoon60
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
barr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
barr02000
]
Bra60_001750
Transporters [BR:
barr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Bra60_001750
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_anchor
VPS51_Exo84_N
BLOC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX26197
LinkDB
All DBs
Position
169096..174816
Genome browser
AA seq
1906 aa
AA seq
DB search
MKKKSTQNIIKTVSLGAAVSALLSSTSPVFSANVAITGATIYSSNDPASAYIAYIKGSHG
SIVLNGDNDYCGVDNVAGRGGAQKPGTAITAEEQYERFINNETFSGRNPYGSSTKKVNWT
GGGNSVAVTSYGIAGYDPRVNGSSAINDFVWKSTKGVVSVGNPQNGVTRQIVGVAADTDL
SDAVNVAQLQALREMILTGGDSLIQQDGQTGLITIGRSVNGDTIDIINNEKQSRKISGLG
GGEVSEHSTEAVNGSQLWETNGKISELETEIDNIETNITQIQANVTKVAQNTSAYFGGGA
DILNDKAPTYTVNGSKYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISDITENSLVQQDAAQDNLITIG
AETGGIEIHVNNNAGKRRRIVGVLGGAITKGSSEAVNGGQLWDTEQDIEELDYNTSKYFG
DGADVLVGKAPTYTISGSEYNDVGSAFKGVDTTFTEINNKISNITENSLVQQDSAQDDLI
TIGAKTGGTLIDITNSEDEYRKITGVDDGDVTEQSTDAINGGQFWRIASNISEYFGGGAD
VLGGKRPDYEIDGITYNDVGSAFEGVDVAFTEINNEISNITENSLVQQDSAQDDLITIGA
KTNGTVIDIKNSTGDLRKITGVDDGDVTEQSVDAINGGQLWQVASNTSKYFGGGADILND
KAPTYTVNGSKYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISNIAASSLVQQDEAQDNLITIGAETGG
IEIHVNNNAGKRRRIVGVLGGAITKGSSEAVNGGQLWDTEQDIEELDYNTSKYFGDGADV
LVGKAPTYTISGSEYNDVGSAFKGVDTTFTEINNKISNITENSLVQQDSAQDDLITIGAK
TGGTLIDITNSEDEYRKITGVDDGDVTEQSTDAINGGQFWRIASNISEYFGGGADVLGGK
RPDYEIDGITYNDVGSAFEGVDVAFTEINNEISNITENSLVQQDSAQDDLITIGAKTNGT
VIDIKNSTGDLRKITGVDDGDVTEQSVDAINGGQLWQVASNTSKYFGGGADILNDKAPTY
TVNGSKYNDVGSAFEGVDNSFTEINNKISDITENSLVQQDVAQDNLITIGAETGGIEIHV
NNNAGKRRRIVGVLGGAITKGSSEAVNGGQLWDTEQDIEELDYNTSKYFGGGADVLVGNA
PTYTISGSEYNDVGSAFKGVDTTFTEINNKISNITENSLVQQDSAQGGLITIGKNVNGTE
ISILNNKKKQRKITGVADGLVFEKSTDAVNGGQLWKTNQDIEKLNHSVEKAETDITNIQG
DLSKVAVYTSKYFGGGADVLSGKAPTYTINGSKYNDVGSAFKGVDGSMKDIRNEITNITT
NSLVQQDIDTKLITIGARRGGTKIDISDRPGKDRTLSGVKAAVQGNEAVNKDQLDKSLRE
INKDFETMSAAAVLYDKRPNGSIDYKNITLGGQKSKGPVAIHNLKDGVISNESSDAVNGK
QINKLSGDIANIFGGVTEFSNGAFTRPVYDLSHVTTEGIVTRKIYNDVGSAFAGLDANIK
NVNARVQYVIDDFNDKIANISSDALLWSEKEGAFVALHGSKGQAKQNSKLTFLLDGEIDI
NSTDAITGKQLFQMSNKLASYFGGGAKYRDGEWTDPTFTIYKFGANGSTSEAVYKDVASA
FAGVNGGMSILNDRIKKLEKQGGQGGPGSDALQWNEEKGAYDANREGKDSKITGVANGKV
EKDSKEAVNGGQLWDTNERVTNVENKVDHMSNTINGIAENTVQYDKDANGKKTNKITLAG
GDAGQPVVIDNVADGKIEAGSKEAVNGGQLHDYTKQQMEITLDDAKKYTDEKVKNIVVDA
IDDAVEKAKDYTDMKFDALNYNIEGVRKEARQAAAIGLAVANLRYNNIPGALSVAFGTGL
WRSQSALAFGAGYTSVNGNIRSNVSVTGAGGHWGVGAGVSFTLPVR
NT seq
5721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaatcaacacaaaatatcattaaaacggtttcattaggagcagcggtatct
gctcttttgtccagtacttctcctgttttttcagctaatgttgcaataacaggagcgact
atttacagttcaaatgaccctgcttctgcttatattgcttatataaaggggagtcatggt
agtattgttttaaacggtgataatgattattgtggtgttgataatgttgccggtcgcggt
ggtgctcaaaaacctgggacggccataactgcagaagagcaatatgagaggtttattaat
aacgaaacattttctggtcggaatccttatggctcctcaacaaaaaaagttaattggact
ggaggaggaaattctgttgcagttacttcttatggtattgctggttatgatcctagagtt
aacggtagctcggcgataaatgattttgtatggaaaagtactaaaggcgtagtcagtgtt
ggtaatcctcagaatggcgtaactagacagattgtgggagtagcggctgatactgatttg
tcagatgcagtgaatgttgcacagttacaagcattaagagagatgattcttacagggggt
gatagccttattcaacaagatgggcagacaggtctgattaccattggtcgtagtgttaat
ggagatacaatcgatattataaacaatgaaaagcaatcgcggaagatttctggtcttggg
ggtggagaagtttctgaacattcaactgaggcagtaaatggatctcagctttgggagact
aatggaaaaatttcagaattagagactgagattgataatatagagacgaatataactcag
attcaggctaatgtaacaaaagttgcgcaaaatacatcagcatattttggaggtggtgcg
gatattttgaatgataaagcaccaacgtataccgttaatggctctaagtataatgatgtt
ggctcggcgtttgaaggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatctccgat
atcacggaaaatagccttgttcagcaagatgcggctcaggataatcttattacaattgga
gcggaaacaggtggcattgaaatacatgttaataacaatgcaggtaaaaggcggaggatt
gttggtgttttgggaggagcgattaccaaaggatcctctgaggcagtgaatggtggacag
ctttgggatactgaacaagatattgaagaattggattataatacatcaaagtattttgga
gatggtgcggatgttttggttggtaaagcgccgacttacacaattagtggctctgagtat
aatgatgttggttcagcatttaaaggtgttgatacgacttttacggaaattaataataaa
atctctaatataacggaaaatagccttgttcagcaagattcagctcaagatgatcttatt
actattggagcgaaaacaggtggtactttaattgatattacgaacagtgaagatgaatac
cggaaaattactggtgttgatgatggagatgttactgagcaatcaacggatgcaataaat
ggtggtcagttttggcggattgcaagcaatatatcagagtattttggaggtggtgcggat
gttttgggtggtaaaagaccagactatgaaattgatggtattacctataatgatgttggc
tcggcgtttgaaggtgttgatgttgcttttacggaaattaataatgaaatctccaatata
acggaaaatagccttgttcagcaagattcagctcaagatgatcttattactattggagcg
aaaacaaatggtactgtaattgatattaaaaacagtacaggtgatctacggaagattact
ggtgttgatgatggagatgttactgagcaatcagtggatgcaataaatggtggtcagctt
tggcaggttgcaagcaatacatcaaaatattttggaggtggtgcggatattttgaatgat
aaagcaccaacgtataccgttaatggctctaagtataatgatgttggctcggcgtttgaa
ggtgttgataatagttttacggaaattaataataaaatatccaatattgcagcaagtagc
cttgttcagcaagatgaggctcaggataatcttattacaattggagcggaaacaggtggc
attgaaatacatgttaataacaatgcaggtaaaaggcggaggattgttggtgttttggga
ggagcgattaccaaaggatcctctgaggcagtgaatggtggacagctttgggatactgaa
caagatattgaagaattggattataatacatcaaagtattttggagatggtgcggatgtt
ttggttggtaaagcgccgacttacacaattagtggctctgagtataatgatgttggttca
gcatttaaaggtgttgatacgacttttacggaaattaataataaaatctctaatataacg
gaaaatagccttgttcagcaagattcagctcaagatgatcttattactattggagcgaaa
acaggtggtactttaattgatattacgaacagtgaagatgaataccggaaaattactggt
gttgatgatggagatgttactgagcaatcaacggatgcaataaatggtggtcagttttgg
cggattgcaagcaatatatcagagtattttggaggtggtgcggatgttttgggtggtaaa
agaccagactatgaaattgatggtattacctataatgatgttggctcggcgtttgaaggt
gttgatgttgcttttacggaaattaataatgaaatctccaatataacggaaaatagcctt
gttcagcaagattcagctcaagatgatcttattactattggagcgaaaacaaatggtact
gtaattgatattaaaaacagtacaggtgatctacggaagattactggtgttgatgatgga
gatgttactgagcaatcagtggatgcaataaatggtggccagctttggcaggttgcaagc
aatacatcaaaatattttggaggtggtgcggatattttgaatgataaagcaccaacgtat
accgttaatggctctaagtataatgatgttggctcggcgtttgaaggtgttgataatagt
tttacggaaattaataataaaatctccgatatcacggaaaatagccttgttcagcaagat
gtggctcaggataatcttattacaattggagcggaaacaggtggcattgaaatacatgtt
aataacaatgcaggtaaaaggcggaggattgttggtgttttgggaggagcgattaccaaa
ggatcctctgaggcagtgaatggtggacagctttgggatactgaacaagatattgaagaa
ttggattataatacatcaaagtattttggaggtggtgcggatgttttggttggtaatgcg
ccaacttacacaattagtggctctgagtataatgatgttggttcagcatttaaaggtgtt
gatacgacttttacggaaattaataataaaatctctaatataacggaaaatagccttgtt
cagcaagattcagcccaaggtggtcttattacaattggtaagaatgtgaatggtactgaa
attagcatcctaaacaataaaaagaagcaacggaagattactggtgttgcggatgggctt
gtttttgaaaaatcaaccgatgccgtgaatggtggacagctttggaaaacaaatcaagat
attgagaaactcaatcatagtgtagaaaaagcagagacagatataacgaatattcaaggt
gatttatcaaaggttgcagtgtatacatcgaaatattttggaggtggtgcggatgttctg
agtggtaaagcaccaacctataccattaatggctctaagtataatgatgttggttcagca
tttaagggtgttgatggttctatgaaggatattcgtaatgaaatcactaatatcacgacg
aatagtcttgttcagcaagatatagatacgaaacttatcaccattggtgcaagaagaggc
ggcactaagattgatatttcagatcggccaggaaaagatagaactctttctggtgtaaaa
gctgcggtacaaggcaatgaagctgttaacaaagaccaacttgataaaagtttaagagag
attaacaaagattttgagactatgagtgctgctgcagttctttacgataagaggccaaat
ggtagtattgattataaaaacattactttaggtggacagaagagtaagggaccagttgct
attcataatcttaaagatggtgtaatttctaatgaatcgagtgatgctgttaatggaaaa
cagattaataaactctctggagatattgcgaacatttttggtggtgttacagaattcagc
aatggtgcttttacgcgaccagtttatgatttatcgcatgtgacaacggaaggaattgta
acaagaaagatctataatgatgttggttcggcttttgcagggcttgatgcgaatattaaa
aatgtaaatgcgcgcgtacagtatgtgattgacgactttaatgacaaaattgccaatatt
tctagtgatgctttgttatggagtgaaaaagaaggagcttttgttgcacttcatggatct
aaaggccaagcaaaacaaaatagcaaactgacatttcttttagatggggaaattgatatt
aattcgacagatgctattacagggaaacagctttttcagatgagtaacaagcttgcttct
tattttggtggcggtgctaaatatagagatggagaatggacagatcctacttttacgatt
tataagtttggtgccaatggttctacttctgaagcggtctataaggatgttgccagtgct
tttgctggtgtgaatggcgggatgtccattttaaatgaccgaattaaaaagcttgaaaag
caaggcggacaaggtggtcctggttcagatgctttacaatggaatgaagaaaaaggcgct
tatgatgcaaaccgagaaggaaaggacagtaagattactggtgttgcaaatggtaaagtt
gaaaaagactcgaaagaggcagttaatggtgggcaactttgggataccaacgaacgcgtt
acgaatgttgaaaataaagtagaccatatgtctaacacgattaacggtatagctgagaat
actgttcaatatgacaaagatgcaaatggcaaaaagactaataaaatcactttagcagga
ggtgatgctgggcaacctgttgtcattgacaatgttgcagatggtaagattgaagcaggc
tcgaaagaagcagttaatggggggcagttacatgactataccaagcaacagatggagatt
actcttgacgatgcaaaaaaatacacagatgaaaaggtcaagaatattgttgtcgatgct
attgatgacgcagtagagaaggcaaaagactacacggatatgaagtttgatgctttaaat
tataacattgagggagtccgaaaagaagcaagacaagctgcagcaattggtttagcagtc
gctaacttgcggtataacaatattcctggtgcattaagtgttgcatttggaactggttta
tggcgtagtcaatctgctcttgcttttggtgctggttatacatctgtaaatggcaatatc
cgttctaatgtgtctgtgacaggtgcgggaggtcattggggtgttggtgcaggagtcagc
tttaccttgccagtgcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system