Bartonella sp. Raccoon60: Bra60_005220
Help
Entry
Bra60_005220 CDS
T05326
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
barr
Bartonella sp. Raccoon60
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
DUF1664
TBCC_N
Collagen_mid
ApoLp-III
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX26533
LinkDB
All DBs
Position
complement(560356..564945)
Genome browser
AA seq
1529 aa
AA seq
DB search
MARRTKLQTFEIEVEEALEKAMNFDFDNAEIEEIISSDSENLINVDDLIQKIATSEEEIL
SENETSVLTSSNIHDNAVVDESVAELLFGQKPIHELSGGTVRGTLLPTQPLPANDDITVP
FNFKSLKQNGASRIYWSTTALSALWATGGAFIAHKLAPSGLSSLANIITFITSPLGLAVA
AGTTIPILMSWGVTQLIKRSNELRNIAILMTNAAQRLSEPQNISEKQAIAISQTLRKEVA
AMNEGIERTLGRAVELEAIIQSEVHNLERAYSENESRIYTLIKELNNERTAILNHADRVQ
TVIKGTQEQLSDEFDLATSKIATNVEKLAQTLTQTLQQQGEDLVKKLSYAGDGVTNQLFE
QFNETTLQVQQKNTEFFHVLGKTFDTFAERFDNNEKQLEKTFDETAAKAELHIAKLATRI
QTATDQTLYSVDEKFKTLDEAIIDRNNQSLQDFDEKIKQLDQQAYKLSSKFDNITSEAIE
AFGNRLVNVDLSLKEHSDTIIESFVARSKELENNAEKLGNFLEAHASQINVNLKEITTDI
SNVFTNGHDQIFSAVDASKKVLQEEIKNVDNAIIDIINERSQDFKTQIANQRDVMASMLD
SENNKIADTLKDQIDVLTKNVSDVEKTLSQNIQIVDQHAKDHANNIIQCTEKLQESITQS
CDTTKNALEEQIKNIDIRADALRDSLAINSFALNEVLADQARTLEQRMETIHNIIAKSDI
HVDMALKQQADLVENAITNNNKAVTETVQNHIKNLEGHTDLLKNTLSQSHDVFLDTLQTR
VGLFDENLESRARQVFERAATLEETLSEKLEKVCETIDMQTSTFEERSNNLKKSIVLNNE
HNQAIQKALEESADNIRLSLENSVDTVTDNVQEKFTNISEKLVSIIANETEKSEASLATA
GNQFISSFADVVIKATNIISESSNRIALNVEQTVNETSEKVISALTEQTAHTANAFTTVS
NDAQALINETIHASAEAVNQLLSERSNVLHQSMLDFQNNLSHQLANVNNRLEEAKDETSA
KISGHMEQLTELTDYLNQTVYNTTETVSNLTQQIGEQLSLSTQEVEQRIYAQNESLVNTL
TQKNSETIQTMATVQEDLIKNVSGVIEQLNQSIYNIHENSNILISTVQSLDGQLNETANN
FFHNTNQVAEYLSTSNQELNSNVETLQGLSQNTFEQISHITNNFGEHAKTLSEAIRVLEQ
SENTLNITLQEKQNALSVLSNALISKSDEVNQLIKHYENVLSLTFERADENTRNSTHLMQ
RTLHELINEASTRFSDAAENIRFSANEIRSELSKVNNDFNESIQKLPEKAKETTQTIRHA
LSEQIVALKDLTNIMHNTEKEQSTPTISPSLMSNSATSGVNKKIVPPQPIVQSGQHKTKQ
NKWVSDLLERVSREEILYSEKDNNFSSSPEKEKSDSMNESLNSLVNSIVQTINHNAAVEL
WNRYKRGQKNIIAEHLYTPNGKIIFETIRKKYLNDIDFKDSVNQYISEFEKLLRDISRNS
GNTHLARQYLTSDTGKVYTMLAHVSGRIQ
NT seq
4590 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacgcagaaccaaattgcaaacatttgaaatcgaagtcgaagaagctcttgaaaaa
gcaatgaactttgactttgataacgcagagatcgaagaaataatatcaagtgactctgaa
aatctaattaatgtagatgatttgattcaaaaaattgcaacttcagaagaagaaatcctt
tctgaaaatgaaacttcagttctcacctcatctaatattcatgataatgctgttgttgat
gaatcagttgctgaattactttttggtcaaaaaccgattcatgagctttcaggtggaact
gtacgtggtacactattacctacacaacctctccctgctaatgatgatataacagtacct
ttcaatttcaaatcattaaaacaaaatggtgcttctcgaatttattggagcacgacagct
ctcagtgctctatgggcaacaggtggtgcttttattgctcataaactagctccttctggt
ctaagctctttagcaaatataattacttttattacatcccccctcggattagctgtagcg
gcaggaactacaattcctatccttatgtcttggggagttacccaacttataaaacgttca
aatgaattgcgtaatattgccattcttatgaccaatgctgcacaacgccttagcgaacca
cagaatatttctgaaaaacaagcaattgctataagtcaaactcttcgtaaagaagtagct
gcgatgaatgaaggaatcgaacgcaccctcggccgtgctgttgaactcgaagctatcatt
caaagtgaagttcataatcttgaacgagcctattctgaaaatgaatcacgtatttatacc
ttaattaaggagttaaataatgaacgtacagcaatcttgaatcatgctgatcgcgtacaa
acagtaatcaaaggaacacaagagcaactgagtgatgaatttgacttagctacttccaaa
attgcaaccaatgttgagaaacttgcgcaaactcttacccaaaccttacaacaacaaggg
gaagatcttgttaaaaagctctcttacgcaggtgatggtgtaacaaatcaactctttgaa
caatttaatgaaacaacattacaagttcagcagaaaaatacagaattttttcatgtatta
ggaaaaacctttgatacttttgcagagcgttttgataataatgaaaaacaattagaaaaa
actttcgatgaaacagctgctaaagctgaattgcatattgctaagcttgcaacgcgtata
caaactgcaacagaccaaactttatatagtgttgatgagaaatttaaaacattagatgaa
gcaattattgaccgtaataatcaatcattacaagattttgatgaaaaaattaagcagctt
gatcaacaagcatataaactctcttctaaatttgataatatcacctcagaagcaattgaa
gcgtttggaaatcgcctagtaaacgttgacttatctcttaaagaacacagtgataccatt
atcgaatccttcgttgcacgtagtaaagaattagaaaacaacgctgaaaagcttggtaac
tttctggaagctcatgcctctcaaatcaacgtaaatcttaaagaaataactactgatatt
agtaatgtatttacaaacggacatgatcagattttttctgcagttgatgcaagcaaaaaa
gttttacaagaagaaatcaaaaatgtcgataatgcaattatagacataataaatgagcgc
tcgcaagactttaaaacacaaatcgctaatcaaagagatgtcatggcgagcatgttggac
agcgaaaacaataaaattgctgacacattaaaagatcaaattgatgtattgaccaaaaat
gtttcagatgttgaaaagacgttgagtcaaaatattcaaattgttgatcaacatgctaaa
gatcatgctaataacataattcagtgtacagaaaaactacaagaatccatcacacaaagc
tgtgatacaactaaaaatgctttagaagaacaaattaaaaatattgatatacgtgccgat
gctcttcgtgattccttagctatcaatagttttgctcttaatgaagttcttgcagatcaa
gcgcgcacacttgagcaacgtatggaaacaattcataatatcatcgctaaaagcgatata
catgttgatatggcattaaaacaacaagcagacttagtcgaaaatgcaattactaataat
aacaaagccgttactgaaaccgttcaaaaccatataaaaaatcttgaaggacatactgat
ctccttaagaacactctttctcaatcacatgatgtattccttgatactcttcagacacgc
gtaggattattcgacgaaaatttggaaagtcgtgcacgtcaagtttttgaacgtgccgct
acattggaagaaacgttatccgaaaaacttgagaaagtatgtgaaaccatcgacatgcaa
acatctacttttgaagaacgatccaataacctaaaaaaatctatagtccttaataatgaa
cataatcaagcaatccaaaaagcactagaagaaagtgcagataacatacgtctctcattg
gaaaattctgttgatacagttacagataacgtacaagagaagtttaccaatatttctgaa
aaattagtatcaataatagctaatgaaacagaaaagtcagaggcttctcttgctactgct
ggtaatcaatttatttcatcttttgctgatgttgttatcaaagcaacaaatattatctca
gaatctagtaaccgtattgcattgaatgttgaacaaacggtcaatgaaactagtgagaaa
gtcatttctgccctaactgagcagacagctcacactgcaaatgccttcacaacagtaagt
aatgatgcgcaagcattgattaatgaaacaattcatgcttcagcagaagcagttaatcaa
ttactcagtgaacgttctaatgttcttcatcaatcgatgttagattttcaaaataattta
agtcatcaattagctaatgtaaacaatcgcttagaagaagcaaaagatgaaacatccgcg
aaaatttcaggacatatggaacaattaacagaattaacagattatttgaatcaaacagta
tacaatacaactgaaacggttagtaacttaacccagcaaattggtgaacagctctcgctt
tcaacacaagaagttgaacaaagaatttatgcacaaaatgaatccttagtgaatactctt
acacaaaaaaattccgaaactattcaaactatggctactgtacaagaagatcttattaag
aatgtgtcaggtgtcatcgagcaattgaaccaatccatttataatattcatgaaaacagt
aacattttgatatcaacggttcaaagccttgacggtcagttgaatgaaactgctaataat
ttcttccataataccaatcaagtagcagaatacttatcaacgtcaaatcaagagctcaat
agcaatgtagagacgttacaaggactttctcaaaatacatttgaacaaattagtcatata
acaaacaattttggtgaacatgctaaaacgctttctgaagctattcgcgttcttgagcaa
tcagaaaacacacttaatataacactccaagaaaagcaaaatgcactttccgtattaagc
aatgcccttatttcgaaatctgatgaggttaatcaacttataaaacattacgaaaatgtt
cttagcttaacatttgaacgtgctgatgaaaatacacgtaactcgacacatttaatgcaa
cgaacacttcatgaattgattaatgaagcttcaacacgtttttcagatgctgcagaaaat
atacgcttttcagccaatgaaattcgctcagaactttcaaaagttaataatgattttaat
gaaagtattcaaaaattaccagaaaaagcgaaagaaacaacacagacaattcgacatgcc
ttaagtgaacaaattgtagcattaaaagacttaacgaatattatgcacaatactgaaaaa
gaacaatcaacaccaacaatatccccatcgttaatgtcaaatagtgcaacttctggagtc
aataaaaaaatagtgccaccacagcctattgtacaatcaggacaacacaaaacaaaacaa
aataaatgggtatcagaccttttagaaagagtctcacgtgaagaaatattatactcagaa
aaagataataatttctcttcctcaccagaaaaagaaaagtctgattctatgaatgaatcc
ctgaactcactagtaaatagtattgttcaaaccattaatcataatgctgctgtcgagtta
tggaatcgttataaacgtggacaaaaaaatatcatagctgaacatctttatacaccgaat
ggaaaaataatatttgaaacaattagaaaaaaatatctaaatgatatagattttaaagat
tcagttaatcaatatatttcagagtttgaaaaattattacgtgatatatctcgcaattct
ggaaatacccatttagcccgccaatatttaacatcagatactggaaaagtttatactatg
cttgctcatgtaagtggacgaattcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
