Bartonella sp. CDC_skunk: Bcsk_008910
Help
Entry
Bcsk_008910 CDS
T11834
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein
Organism
bars Bartonella sp. CDC_skunk
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Pertactin
AIDA
SHE10_OSW_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX21528
LinkDB
All DBs
Position
complement(1002082..1004022)
Genome browser
AA seq
646 aa
AA seq
DB search
MRYKLISAMLVIDIFLVQAISSNSDTDKVKASVPVLLSVSSNGLKTFPRDQGYITEEQNV
SGNEVVWNAKVMEGGMQNLCAKSNQEVCAKSNQEGGGVAVNTEVFRDGGQRVFAEGTAII
VTLNDNAVQEIHKDGYVYGLTVNDHASSWAFSGATLEGDTTINDFGKFHLYAGDKEHRST
IENFILKGKETELSVISELDGDGALIKKLSGQGTVSFIPYQAQPRYSHLYIEKLSGELGS
LHFRFNTTIAEDRGDYLFIESGDGHHMISVADSGAEITNPLSQHRDLVTDKSAGSHFTLV
DLSGVKINAVDGGTYMYTLKQRRDDASKIWYLAAGHFDKPTSSTTPSTDAVLSLAVAPEL
VFNNELQSLRVGRGILGRNKKNTAFWTYGIKGRDRLATGHTHFRLDQTGIILGVDWLQEL
MKGDFYIGGFGSYDQARITHARGGVSNMDTYSAGAYATYFDNQGWYLDSVLKYNYYTNNL
KAISTNSLGVQGDYNQWAIGTSFEAGYYFNVAPDTWIQPYTQLTGVRVSGKEVKLSNQMV
GNVNSSTSLRSEAGLSVGHKFNLNDDAHLMTYITTAWLREYIDRNHTTINNQHKFITDLS
RDAGKLGIGLHSLIGDNLSLYAEAQYLKGHKVEQSLQGIVGLRYSF
NT seq
1941 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgctataaattaatttctgcgatgctagtcatagatatttttcttgtacaagctatt
tcatctaattctgataccgataaagtgaaagcatctgtaccggtattgctatctgtatct
tcaaatggtttaaaaacttttcctcgggatcaaggttatataacagaagaacagaatgta
tctggaaacgaggtggtatggaatgcgaaagtgatggaaggaggcatgcaaaatctttgt
gcaaaaagtaatcaagaagtttgtgcaaaaagtaatcaagaagggggaggggttgcagta
aatactgaagtttttagggatggaggacagcgcgtttttgcagaaggtacagctattatt
gttactttaaatgataatgctgttcaagaaatacataaggatggttatgtatatggtcta
actgttaatgatcatgcgagttcatgggcattttcgggtgcaacattagaaggagatacg
acaattaatgattttggaaagtttcatctttatgctggagataaagagcatcgctctaca
atagaaaactttattttaaaaggaaaagagacagaattatctgttattagtgaacttgat
ggagatggcgctttgattaagaaattaagtggtcagggaactgttagttttattccttat
caagctcaaccccgttattctcatctttatattgagaagctttctggtgaattaggaagt
ttacattttagatttaataccactattgcagaggatcgcggtgattatctttttattgaa
agtggtgatggtcatcacatgataagcgtagctgattcaggtgctgaaattaccaatcct
ctttcacagcaccgtgatttggttactgataaaagtgcaggctctcattttactttagtg
gatctttctggtgtaaagattaatgctgttgacggtggcacttatatgtataccttaaag
caaagacgagatgatgctagcaagatttggtatttagcagcaggtcattttgataagcca
acttcgtctacgacaccatcgacagatgcagtgttatctttggcagtagctcctgaactt
gtttttaataatgagttgcaaagtttgcgtgttggaagaggtattttaggcaggaacaag
aagaatacggctttctggacgtatgggatcaagggtcgcgatcgtttggctacaggtcat
acgcattttagacttgatcagacaggtatcatattaggtgttgattggctgcaagaactg
atgaaaggggatttttacattggtggttttggaagttatgatcaagcgcgtattacccat
gcacgaggcggtgtcagtaatatggacacttatagtgccggggcttatgcgacttatttt
gataatcaagggtggtatttagatagcgttttaaaatataattattacacaaataattta
aaggctatttcgacaaatagtttgggtgttcaaggtgattataaccaatgggcaataggg
acttcatttgaagcagggtattattttaatgtagcaccagatacctggatacagccttat
actcaactaacaggagtccgtgtttcgggtaaggaagtaaagctttctaatcagatggtt
ggtaatgtgaatagttctacttcattgcgcagtgaagctggattatctgttggtcataag
tttaatttgaatgatgacgctcacttaatgacttatataacaacggcttggttacgtgaa
tatatagataggaatcatacgacaattaataatcagcataaatttatcactgatttatcg
agagatgcaggaaaattaggaattggtttgcatagccttattggtgataacttatcgctt
tatgctgaagctcagtatctcaaagggcataaggtggaacagtcccttcaaggtattgta
gggttacgctatagtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
