KEGG   Buchnera aphidicola JF98 (Acyrthosiphon pisum): CWU_01740
Entry
CWU_01740         CDS       T01826                                 
Name
(GenBank) exoribonuclease II
  KO
K01147  exoribonuclease II [EC:3.1.13.1]
Organism
baw  Buchnera aphidicola JF98 (Acyrthosiphon pisum)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:baw00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:baw03016]
    CWU_01740
Enzymes [BR:baw01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.1  exoribonuclease II
     CWU_01740
Transfer RNA biogenesis [BR:baw03016]
 Prokaryotic type
  3'processing and CCA adding factors
   3'processing factors
    CWU_01740
SSDB
Motif
Pfam: RNB OB_RNB CSD2 S1 OB_RNR_1st
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADP67772
LinkDB
Position
292662..294611
AA seq 649 aa
MFQNNPLLTQLKKNLHAKSPRVEGIVKSTERGFGFLEVDPQKSYFIPPKNMKNVMHGDKI
IALLTTEKDREIVEPEKLIEPFLNRFVGKIEKKDNRLFIVPDYPFLKDLITCQPNKNCIN
IFQNGDWAVAQLKKHKLKGDHLFYAELTEKITQEDDPLIPWWVTLARHDLDRKEPLAEED
DLILKESDNRKDLTDLDFITIDNTNTKDIDDALFVSEKNNGDISLIVAIADPTAYIKHGS
KLDVIASKRIFTNYLPGFNIPMLPRNLSEDICSLNPNKRRPVLACHITVLKNGNISNKIE
FFLAWIKSKSKLSYDHVSDWIEKIGSWIPPTKSIANQILILHRLCLLRIKWRKKNAVLFK
DSIEYRFHVSEHGKIIDVLIEKRRIAHKIIEESMIVANISAANFLSKNIGFGIYNVHSGF
DLVNAENAVSFLRSYNLNFTVKEITTLKGFCNLRRVLNIISNNYIDSRIRRFQSFGDFST
IPGPHFALGFSEYATWTSPIRKYSDMINHRLLKSIIKKEKSIKPGEDIKIKISEQRRRNR
MAERDVSDWLYTIFLQKKKYQNQKFNAEITDISRSGIRARLIENGANVFIPGTLIHPIRE
ELNFNQESGKVFINGIMHYKISDLIQVTLSDIRLKTRSIIAKPVFEKFK
NT seq 1950 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttcaaaataatccattacttacacagttaaaaaaaaacctacatgctaaatcacca
cgtgttgaaggcatagtaaaaagcactgaaagaggatttggatttttagaagttgatccg
caaaaaagttattttatacctccaaaaaatatgaaaaatgttatgcatggagataaaata
attgcattattaacaacagaaaaagatcgagaaatagttgaacctgaaaaattaattgaa
ccttttctaaatagatttgttggaaaaatagagaaaaaagacaatcgcttatttattgtt
ccagattatccgtttttaaaagatcttataacatgtcaacctaataaaaattgtatcaat
atttttcaaaacggagattgggctgtagctcaattaaaaaaacataaactcaaaggagat
catcttttttatgctgagttaactgaaaaaattactcaagaagatgatccattaatacca
tggtgggtaactctagcacgtcacgatcttgacaggaaagaacctttagcagaagaagat
gatcttatattaaaagaaagcgataatagaaaagatttaacagatttagattttattact
atcgataatacaaatacaaaagatattgatgatgctctttttgtaagtgaaaaaaataat
ggagatatttctttaattgtcgctattgcagatccaaccgcttatattaaacatggtagt
aaattagatgttatagcatctaaaagaatatttacaaattatttaccaggttttaacatt
cctatgttaccccgtaatttatcagaagatatatgttcattaaatcctaacaaacgtcgc
cctgtattggcatgtcatatcacggttttaaaaaatggaaatatctctaataaaattgag
ttttttttagcctggattaaatcaaaatcaaaattatcttacgatcatgtttcagattgg
attgaaaaaatagggtcatggataccaccaacaaaatctattgcaaatcaaatattaatt
ttacatcgtctgtgtttattacgtataaaatggcgcaaaaaaaatgcagtgttatttaag
gatagcatagaatatcgcttccatgtatcagaacatggaaaaatcatagatgtgttaatt
gaaaaaaggcgtattgctcataaaattattgaagaatctatgatagtagcaaatatatct
gctgctaattttttatctaaaaatattggttttggtatatataatgttcattctggtttt
gatcttgttaatgctgaaaatgcagtatcctttttgagaagttacaatttaaactttact
gtgaaagaaataactacattgaaaggtttttgtaatctaagacgtgtattgaatattata
tctaataattacatcgatagtcgtatccgtcgttttcaatcttttggagatttcagtact
ataccaggaccacattttgcacttggtttttcagaatatgcaacctggacttctcctatt
cgtaaatatagtgatatgattaatcatcgtttattaaaatctattataaaaaaagaaaag
tcaattaaacctggtgaagatattaaaataaaaataagtgaacaaagacgacgtaataga
atggctgaaagagatgtttcagattggctttatactatatttttacagaaaaaaaaatat
caaaaccaaaaatttaacgcggaaataactgatatttctaggagtggaataagagccaga
ttaatagaaaatggtgctaatgtttttattcctggaactttaatacatcctattagagaa
gaattaaattttaatcaagaatcaggaaaagtttttattaatggtattatgcattataaa
atatctgatttgattcaagtcactttatcagatattcgtttgaaaactcgtagtattatt
gccaaacctgtatttgaaaaatttaaataa

DBGET integrated database retrieval system