Bombus bifarius (two-form bumblebee): 117215582
Help
Entry
117215582 CDS
T07537
Name
(RefSeq) probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X1
KO
K10615
E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
bbif
Bombus bifarius (two-form bumblebee)
Pathway
bbif04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bbif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
117215582
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
bbif04121
]
117215582
Enzymes [BR:
bbif01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
117215582
Ubiquitin system [BR:
bbif04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
117215582
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117215582
NCBI-ProteinID:
XP_033317822
UniProt:
A0A6P8NUN5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1086 aa
AA seq
DB search
MANWNKKRRMACEPVIKGQKSLLKKGDMFCWGNTRHGELGLGGIEDEIILVPCQVDFKKA
SEIQQIACGENYTVVITHDGKIYSCGNNDYGQLGHEQGRKRLQLILGLDAFVFKKVACGA
YHTIAVNEWGQLFSWGSNSEGQLGLNSKNFMECSPRMVKTLGTSIIVQVACGMKHALALT
NNGELYSWGSNSEGQLGLGVDIRCEIKPKLINTLAGVPIAFIACGGYHSIAISKSGAIFG
WGKNTFGQLGLNDTQNRNLPHQLQTLRNAKICYAACGEEFSVFLTVDGGVFTCGAGMYGQ
LGHGSNNNEILPRQVMELMGSTVTQISCGKRHTLALVPSQGRVYAWGLGGAGQLGNNSTR
SIPTPQVVRGPWVVPNGSSMMDLDKQFSSCTVGYVVKHIFTGGDHCFATVVTQNDNIKPD
DCRTLESSSQILTITEEQLMACQRVPPYSSVDHELMTYLETVFKSLSCVNGSFLFKNDAR
YGCSSKHHGVDLDQATKLFGIIRELDNSTIQELIFTCISDSLISSFVNLPPKIISPECLR
IYLILPLYHGFVNPLNCNLLHKPFCKAILALHPEVLEIVRNWWLEAPPHYFERLVRVHKS
VVLHYVKQSKPNKGILWDVTLQVILDSLYLLNKLNNEDSEGNKVPYSTFHLPELVELIDI
RADYIKWISEKESFSARYYQKVFCNYPFLLDANAKIILLETDQAIQMQSAMNEAATRAVM
NQIFLDPFSVDSRHHNQFVILNVSRENIVADTLRELGHYNSSDLKKPLRVKFHGEEAEDA
GGVKKEFFMLLLREILDPKYGMFKQYEETRVIWFSEDSFEDEKMYFLIGILCGLVIYNFI
IIDLPFPLALYKKLLREPVALNDIKDMSPVFAKSMQNILDYEEADFEEVFGLHFEVVREV
FGEKKIYELTPNGSKVPVTLKNKKQFVDLYVDYTLNKSVENHFYAFNQGFHKVCGGRVLE
LFHSYELMAVVVGNEDYDWEELERNASYKEGYTKDDPTIALFWQVFRELTLEEKKKFLLF
LTGSDRIPIQGMRAIRITIQPMSDERLLPVAHTCFNLLDLPRYQTRERLRYKLLQAIQQT
HGFSLV
NT seq
3261 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaattggaataaaaaacgacgcatggcctgtgagcctgttataaaagggcaaaaa
tctttacttaaaaagggagatatgttttgttggggtaatactagacacggagaattaggt
ttaggtggtatagaggatgaaattattttagttccatgtcaagttgattttaaaaaagct
tcagaaattcagcaaattgcttgtggtgaaaattatacagtggttattactcatgatggt
aaaatatattcatgtggaaataatgactatggacaacttggtcatgaacaaggaaggaaa
agattacaattaatacttggattagatgcatttgtatttaaaaaagtagcttgtggagca
tatcataccatagcagtaaacgaatggggtcaattgtttagttggggatctaattcagaa
ggtcaactaggtttaaattccaaaaattttatggaatgttcaccacgtatggtaaagact
ctaggtacaagtattatagtacaagtagcttgtggtatgaaacatgctcttgcattaaca
aataatggagaattatacagctggggttctaatagtgaagggcaacttggtttaggtgtt
gatattagatgtgaaataaaacctaaacttatcaatactttagctggtgttcctattgct
tttattgcctgtggaggatatcatagcatagctatatcaaaatcaggagctatatttgga
tggggaaaaaatacatttgggcagttagggctaaatgatacacaaaatagaaatttacca
catcaattgcaaacattacgaaatgcaaaaatatgttatgcagcttgcggagaagaattt
tctgtatttttaacagttgatggtggagtatttacatgtggtgcgggaatgtatggtcaa
ttaggacatgggagtaataataatgaaattttacctcgtcaagttatggaacttatgggt
agcacagttacacagatctcatgcggcaaaagacataccttggcattggtaccatcacaa
ggtagagtttatgcatggggcttgggtggtgcaggccaattaggtaacaattctactcga
agcataccaactccacaagtagtacgtggtccatgggttgtaccaaatggctcttcgatg
atggaccttgataagcaattcagttcttgtacagttggctatgtcgttaaacatattttc
actggtggagatcattgttttgctacagtagttacacaaaatgataatataaaaccagac
gactgtagaacattggaaagctcctctcaaattcttacgataactgaagaacaattaatg
gcatgtcaacgagttccaccatattcatctgttgatcatgaacttatgacatatctagaa
acggtatttaaaagtctatcctgtgtaaatggatcattcttatttaaaaacgatgctcgt
tatggatgttcaagtaagcatcatggagtggatcttgatcaagcaactaaattattcgga
attattagagaattggataacagcacaattcaagaattgatatttacttgcatatcagac
agcttgatttcttccttcgttaacttgccacctaaaataatttctccggaatgtttaaga
atctatttaatattacccctgtatcatggtttcgtaaatccacttaattgtaatttatta
cataagccattctgcaaagctattttagcattacatccagaagtccttgaaattgttaga
aattggtggcttgaagcaccgcctcattattttgagagattagttagagttcataagtca
gttgttctgcattatgtaaaacaatctaaaccaaataagggtatattatgggatgtgacg
ttgcaagttatattagattctttatacttgctaaataaattgaacaatgaagattctgaa
ggcaataaagtaccttattctacatttcatttgccagaattagtagagcttatagacata
agggccgattacataaagtggatttcagagaaagaatctttttcagcacgttattatcag
aaggtgttttgtaattatccattccttcttgacgcaaatgctaaaattatattgcttgaa
acggatcaagctattcagatgcaatcagcaatgaatgaagcagcaacccgagctgtaatg
aatcaaatatttcttgatccattttctgtagactcacgacatcataatcagtttgtaata
ttaaacgtttcacgggaaaatatagttgctgatactttacgagaattgggacactataac
tctagtgacttaaaaaagcctcttcgagtaaaatttcacggcgaggaagcagaagatgca
ggtggagttaaaaaggagttttttatgttattactgagagaaattctagatcccaaatat
ggcatgttcaaacaatatgaagaaactagagttatttggttcagtgaagattcatttgag
gatgaaaagatgtattttttaattggaatcctttgtggactagttatttataattttata
attattgatttaccatttccattagctctatataagaaattgttacgtgaaccagttgcc
ttaaatgatatcaaagatatgtcaccagtttttgccaagagtatgcaaaatatacttgat
tacgaagaagcagattttgaagaagtctttggtttacacttcgaagtggtcagggaagtg
tttggagaaaaaaagatatatgaacttacaccaaatggtagtaaagttcctgttacattg
aaaaataagaaacaatttgttgatttatatgtagattatacattaaacaaatccgtggaa
aatcatttttatgcttttaatcaaggttttcataaagtttgtggcggtcgtgtattggaa
ttatttcacagttatgaacttatggccgttgtagtaggaaatgaagattacgattgggag
gaattagaaaggaatgcaagttataaagaaggatatacaaaagatgatcctacgattgcg
ctattttggcaagtgtttcgcgaacttacattagaagaaaagaaaaagtttttgttattt
ttaacaggaagtgatagaatacctatacaaggcatgagagcgattaggattacaatacaa
ccaatgagtgatgaacgtttactacccgttgctcatacatgttttaatttacttgattta
ccacgatatcaaacccgagaaaggttacgatataaactattacaagcaattcagcaaacc
catggcttttctttagtataa
DBGET
integrated database retrieval system
