Bombus bifarius (two-form bumblebee): 117216715
Help
Entry
117216715 CDS
T07537
Name
(RefSeq) putative elongator complex protein 1
KO
K11373
elongator complex protein 1
Organism
bbif
Bombus bifarius (two-form bumblebee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bbif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
bbif03016
]
117216715
Transfer RNA biogenesis [BR:
bbif03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Elongator complex
117216715
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_ELP1_1st
A-sol_ELP1
HB_ELP1
Beta-prop_ELP1_2nd
TPR_ELP1
TPR_GEMI5
TPR_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117216715
NCBI-ProteinID:
XP_033319549
UniProt:
A0A6P8NHD5
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1314 aa
AA seq
DB search
MKNLVVKQRASRLLNILENQMLNVKDLKILYTVDSTNDDFYMLLKNKLCKIPSSYVENIS
FFEIDENLEFIGLEYCSVTQELYGVCKSGSIIRINLEPEFRYELIIDLNIDLQCMKLSPD
HEIIILVTISGIVITMVSTFEIISEVDLHAQYFGQKQFVTVGWGKKETQFHGSEGKKAAI
SKPTEICENDLDDGLYKITWRDDGLLFAVGLLHPENKVRQFKVFNREGILQYTSEIANGL
EESLSWRPSGSLIAATQISQNKHLVVFFEKNGLKHREFSLPFKPKEIRVKDLFWSPDSEI
LTIWCQIQADSSSVLQLWTENNYHWYLKQTIKFPTDNLLICATWSTTSCFKKLIVLTYKE
LITFDYNWSVDHSRGITVHDKSVIGIIDGNKSLMTGLRVGIVPPPMAHKTLETSESINAI
VFAPDIKGKATWIDSNAFFCVSASKKLIFYKYLVDSFLLDYEHVGTYDIKWDILLEHKNF
FYNMHHFLWLNENNVLCSLSINDQSFLCVLMLSAIEDQTQGQVILRRIHIMDGLIQHIVR
SPDSDEAYIIVDNSIIKYTKETELVPVDTQLQGYTYKVEVVKIGTKHMVLSLYHRNCFAI
NGKQIANNITSFFVHSEFLLLTTAQNTLICVNLNENDFEELIKQDLTVKPWENRLNDKSF
SDMNIRRVERGSQLIAAIPKDSKVVLQMPRGNLECIQPRALSLYIIGFYLDNCNYLSAFD
LMRRQRINLNLIYDYNPKKFIENANKFVEQVSKASWLSLFLSELADEDVTMTIYANYYRR
HQSESRNLEINKIESICSLLRNIMEERNNSDHLIQPILISLVKDKKKRGIEAALTKIKEI
QKLEEKSTGYEKHIMSDEALKYLLYIMDVNVLFDIALGMYDFDLTMFIASKSQKDPKEYI
PFLNGLKKLDENYMKYSIDLHLKRYESALEHIAKESNRFNECINLIRNYNLYTKALKLFE
KKSKMYKEVARSYGEYLLNKRHYHEAGIMFHRSGDIKEALNAYKLANCWQDVIILSTQME
LSETEKHVIYQDLVERLKTNKKYEEAAHILMNYFRDAKEAIISLCNGKQWKDAVRIAHDT
KNLDLIECHIKPNVYEYADHALSQIKKNRQDFERYKLRLATVRHNISQRNIKSYNEILCD
NESICNKGISDILSDTSSVVSSTLSQRSRLSTISGKSYRSSKNRRKQERKFLSLKEGSVF
EDLALIQTLYQIISNTYKERDDLHILIQMLLYFDDDEYAEKIQNSMEELLLIIEKNKSEI
WDKSAPSSLADMENTELTTMTDSQGFSTCYKLVESYITHPPVANSSPWKLNIFY
NT seq
3945 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatttggtagtaaaacaacgcgctagtcgtcttttaaatatcctagaaaaccaa
atgttaaatgtaaaagatttaaaaatattgtatactgttgactcaactaatgatgatttt
tatatgcttttaaaaaataagttatgtaaaattccatcgagttatgtggaaaacataagc
ttcttcgaaatcgatgaaaatttagaattcatcggtttggaatattgtagtgtaacacaa
gaactatatggtgtctgtaaatctggcagtattataagaataaatctagaacctgaattt
agatacgaattgataattgatttaaacatagatttacaatgcatgaaactaagcccagat
catgaaataatcatattagttacaattagtggtattgtgattacaatggtatctactttt
gaaataatctcagaggtagatctgcatgcacaatattttggtcaaaagcaatttgtaact
gttggttggggtaagaaggaaactcagtttcatggttcagaaggaaaaaaagcagcaata
tctaaaccgacagaaatatgtgaaaacgatctagatgatggattatataaaataacttgg
cgtgatgatggtttgttatttgctgttggtttattgcatcccgaaaataaagttagacag
tttaaggtatttaatagagaaggtattttacaatacaccagtgagatcgctaatggtttg
gaagaatcattgtcatggagaccatctggtagtttaattgcagcaacacagatttcacaa
aacaagcaccttgttgtattctttgagaaaaatggtttaaaacacagagaattttcactt
ccttttaaaccaaaagaaattagggtgaaagatttattttggtctccagattcagaaatt
ttgactatttggtgtcaaattcaggcagattcttcttcagttctacaactatggacagaa
aataattatcattggtatttgaaacaaactattaaatttcccacagataacttactgata
tgtgccacatggagtacaacatcttgtttcaaaaaactgattgttttaacatacaaagaa
cttatcacgtttgactataattggtctgttgatcatagtagaggcataactgtacatgat
aaatctgttattggcatcattgatggaaataagtcattaatgactggtcttagagtagga
attgtaccaccaccaatggcacataaaactttagaaacttctgagtccataaatgctatt
gtttttgcacctgatataaaaggcaaagctacctggatagacagcaatgcattcttctgt
gtttctgccagtaaaaaattaatattttacaagtatttagtggactcattcctcttagac
tatgaacatgttggaacatatgatattaaatgggatattctactagaacataaaaatttc
ttttacaatatgcatcactttttatggcttaatgaaaacaacgttttatgttcattgtca
ataaatgatcagagcttcctttgtgttttgatgttaagtgcaatagaagatcaaacacag
ggacaagttatattgaggcgaatacacattatggatggtttaattcaacacatagttcgt
tctccagattcagatgaagcatacataattgtagacaattccattataaaatatacaaaa
gaaacagaactagttccagttgatacacaattgcaaggatatacgtataaagtagaagtt
gtgaaaattggtacaaagcacatggtactgtcattatatcataggaactgttttgcaatt
aatggaaagcaaattgctaacaatatcacaagttttttcgttcactcggaatttttactt
cttacaactgcacaaaatactttaatatgcgttaacttgaacgagaatgattttgaagaa
ttaataaagcaagatttgactgtaaagccatgggaaaatcgactcaatgataaatcattt
tcagatatgaatattagaagagtggaaaggggatctcaattgattgcagctattcctaaa
gattccaaagttgttttgcaaatgcctcgtggaaacctagaatgcattcaaccaagggca
ttgtctttatatattatcggattttacttagacaattgcaattatttatctgccttcgat
ttaatgcggagacaacgaataaacttgaacttgatctatgactataatccaaaaaaattt
atcgagaatgcaaataaattcgtggaacaagtttccaaagcgagttggttgagtttattc
ttgtctgagttagcagatgaagacgttaccatgacaatatatgcaaattactatcgaaga
catcagtcagaatcaagaaaccttgaaataaataaaattgaatcgatttgcagtttactg
cgaaacattatggaagaaaggaataattctgatcatttaattcaaccaatattaatcagt
ttggtaaaagataaaaaaaagcgaggaatagaagctgcgttaacgaaaataaaggaaatt
cagaagttagaggaaaaaagtacgggatatgagaaacacataatgtctgatgaagcacta
aaatatttattatacataatggatgtaaatgtactatttgatatagctttaggaatgtac
gattttgatttgactatgttcattgcttctaagtcacaaaaagatcccaaagaatatatt
ccattccttaatggcttgaaaaagcttgatgagaattatatgaaatattctattgattta
catttgaaacgttatgagtctgctcttgaacatattgcaaaagaatcaaacagatttaac
gaatgtataaatttgatacgcaattataatctgtacacaaaagctttaaaattatttgag
aagaaaagcaaaatgtataaggaggtagccagaagttatggtgaatatttattgaataaa
cgacactatcatgaagctggaattatgtttcatagatctggtgatatcaaagaagcttta
aatgcttataaattagctaattgttggcaagatgttattatattatctactcaaatggaa
ctaagtgaaacagaaaaacacgtgatttaccaggatcttgtagaacgtctaaaaactaat
aaaaagtatgaggaagctgcacatattttaatgaattatttcagagatgcgaaggaagct
ataatttctttatgtaatggtaaacaatggaaagatgctgtaagaattgcgcatgatacc
aaaaatctagatttgatcgaatgtcatataaaacctaatgtatacgaatatgcggatcac
gctctatcacaaataaaaaaaaatagacaagattttgagcgatataaattgcgtcttgca
acagtcaggcacaatatttctcagagaaacataaaatcatacaatgaaatactttgtgac
aatgagtcgatatgtaacaaaggcatttcagatattcttagcgatacaagtagcgttgtt
agttcaactttgagtcaaagatcgagattgtccactatatctggaaaaagttatagatcc
agcaaaaatcgaagaaagcaggaaaggaaatttttaagtttaaaagaaggcagtgtcttc
gaggatctggcattaatacaaactttgtatcaaattatcagcaatacgtacaaagaacga
gatgatttgcacatattgatacaaatgcttttgtatttcgatgacgatgaatatgcggaa
aaaatacaaaattccatggaagagttacttttaataatagaaaaaaataaatctgaaatc
tgggataaatctgcaccttcaagcttagcagacatggaaaatacagaacttacgacgatg
acagattcacaaggattctctacctgctacaaattagttgaatcttatattacacatcca
ccggtagctaattcttcaccttggaaattgaacatattttactaa
DBGET
integrated database retrieval system