Borreliella burgdorferi JD1: BbuJD1_0512
Help
Entry
BbuJD1_0512 CDS
T02081
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
bbj
Borreliella burgdorferi JD1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
DUF2802
SF-assemblin
SlyX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ30881
LinkDB
All DBs
Position
516203..522703
Genome browser
AA seq
2166 aa
AA seq
DB search
MIDFATILVNLFLVSIVLFVYRQYDKRSRALDKIKKFVDLTKVNLEDFIEDKTKEINDLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIEEVQQKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTFKVQENIQ
RLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFDKANKENLESIKIASWEKFDTNI
KELVFKIDNLNKEISLYEKDLANIEERKNDILVKGNEKLDLEFSDFLEKVEFNIGKYSKE
IESSFNFYENKYKLIENSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELQNKFKDIFVYVDDRS
KEIKDKLEDKLVLVDNEISSMSSFFKDNVYSRINSLEESMRIEMGKYEEQVDDVFDKFRS
QVELNLKNIYEDYEDKISQVDNNIRERVELSLLDLNSKMESVQSGAIDLIKRLEDDSNGI
YLEFKGKFGADIEVFSESFKGDINQLKMQLESQLLDVDSNIQEKLIKLNDNLISNFEEIN
GRFNNNYSNLNDNINAKYTALFESLDSSSSKFENQMESKYKSFTDKLTAGMDEFSLMYGE
KFETLSQEATNNYQEFQDLNKKLENEIESFYNMFEKTQETLKVDFNASLINIKDEIGKNI
VEFKDRYYDEVNIFVTQLEESKLQYSKWQGEMDSNLKNIESQINKTNEEFLSLIQIQKDK
GIELSESVFNDLSDHIQKKAIDMHGSWKDELIALNKSLLDIKVSSEELLSSATLKIESLE
KDVNDRMEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILGIKEFINRQTEIIKDKSIF
MLEDLNKKFDDKNNFVISKIEECDYKLKDFKIESEDILNNFKSDLNEFIESKLQIVSNIK
SDNQKQIDDFLDRISKDILNRKDSINNEVDSKLSDWQSKLNEITVKIENLLSSGKVDLDL
IDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGAIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL
SKKFAAVLNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLNVKFNDINKEINGKYNE
VISNYRGYSENISSKLENEIMHEIENLSRRLTDRIEGLSKGMDENLQKLKESFDVSKYQV
EKFELKVKDLTDDGEAKINELVKEIEQYYKSRLEEAIDYRRTIDSDIMQAKERFGEITNE
LKNNIESKSEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTSNDENL
QIKISEMDQNFEIIEQRSKDILEFEKELQDKIKDCYGFINSQFGEIKAGVEENIKNHFDV
CIKKANTLIDDDIVKYENEIHKRIDSLKSIESTFDSIEKNLNDKVSGCIDKIANDFNLKY
IELEERCNEGQLNLENKIDNKIKAIDNLALSQYDGLEKKYADMYDEFSERLNSYIATLSE
EFKSSNKEMIFELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL
KIRGEELKYSLENFIASYNDKIQNLEYDLSKNLEDKTELIQSFRLDIEQKMKDDKENFYL
DFTKEFSSKKKDMQSEIALMETNITGKVDEFVDFVNNKQSIIDSWFLNIKDDVKDWQEKS
YSTIEKRINLAELGIKSFENDIFNVKIGLESFKDGFEIKAEEIFSNLQNEAKKIEQSVHL
DFKNIGESLNLKVLDLEKFVDFKVEKIDEKVNKKTEDILIQAEVKFLTQQKDLEYKIFEL
NQKLEHEFTTLSSNLDKVRREMVDVISSDKESFEGQIELINKNISEFSEKISLYRNNIET
SIENEYNSFSKSIKSDLGLLEDELKKSLKHSTSEIETIKSGLQEQIDKFEVEFKKNHKEL
LKEVDNNILELESKILNCDVQFNKFISEIKDNLVEYKSDLRAEFEDSYDKINFQIENQIE
NFKKLDSELEKNNSIFLEAYSLKDKLEKLWETLKNEIELAQEYKNNFENVNKEFYNIQKE
TLGIIEIFNELKVEQESIKSIKNDFNRFFEFYSSFDSRYKSLIESYDEMQIYKAKIKEIA
DEQRTILDNYERISNKESILKSTIESVDKNFDLINEVEKRFNNLSKESAKFQDNLKDMEN
VVSSLLLNKGLSEEVLINAQNLKEMLLDIENKLKNTLTMREKVVKSETRLENLNIAAEER
IKTLGILVKTDSKYQDNVGLNNETVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELG
ISNKGD
NT seq
6501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgcgactattttagttaacctttttttggtttcaatagttttatttgtt
tataggcaatacgataaacgttctagagcattagataaaattaaaaagttcgttgatctt
acaaaggttaatcttgaagattttattgaagataagacaaaagagattaatgatcttgct
gttgatatggaagcttatcaaagatctagtatagaaataataaaaaagattgaggaagtt
cagcaaaagattaaaaataaaagcaatgattttgcagaggttgaaaaaaagatagcctat
catgattctatgcttaaggatcttgatgaaatgacttttaaagttcaagagaatatacaa
agattgcaagttgatgggaaaatagtagataaactttcaaaaactttaaaaggatttaat
actcagattgattcggttgaatcaaatttgaattcagtgttagaaaaatttgacaaggct
aataaagaaaatctcgagtctattaaaattgctagttgggaaaagtttgacactaatatt
aaggaacttgtttttaaaatagataatttaaataaagagattagtctttatgaaaaagat
ttagcaaatattgaagagagaaaaaatgatattttagttaagggtaatgagaaattagat
ttagaatttagcgattttcttgaaaaggtcgaatttaatattggcaaatacagcaaagag
attgaaagttcttttaatttttatgaaaacaaatataagttaatagaaaattctatagag
cttattatggagagtgtgaagaataaaattaatgaaaaagaagattttattttaaataga
ctgaatgaagaattgcaaaataaatttaaggatatctttgtatatgttgatgatcgctct
aaggaaattaaagataagcttgaagataaattggttttggtggacaatgaaatttcttct
atgagttctttctttaaagacaatgtttattcaagaattaattcacttgaggagtcaatg
cgaatagagatgggaaagtatgaagagcaagtcgatgatgtttttgataaatttagatct
caagttgagttgaatcttaaaaatatttatgaggattatgaagataaaataagtcaagtt
gataataacattagagaaagggtagagcttagtttgttagatttgaattctaaaatggaa
agtgttcagtctggtgctattgatttaataaagaggcttgaagatgattctaatggaata
tatcttgaatttaaaggtaagtttggggcagatattgaagtttttagtgaaagttttaaa
ggtgatattaatcaacttaagatgcagttagaatcccaactcttagatgttgattcaaat
attcaagaaaagcttattaagcttaatgataatttgatttctaattttgaagaaattaat
ggtaggtttaataataattactcaaatttaaatgataatataaatgccaagtacacagct
ctttttgaatctttggattctagcagctctaaatttgaaaatcaaatggaatctaaatat
aagagctttacagataaattaacagcaggaatggatgaattttctttaatgtatggtgag
aaatttgagacactctctcaagaggcgactaataattatcaagaatttcaagatttaaac
aaaaaattagaaaatgaaattgaatctttttataatatgtttgaaaaaacccaagagact
ttaaaggtagattttaatgctagtttaattaatattaaagatgaaattggtaaaaatata
gtagagtttaaagatcgttattacgatgaggtaaatatttttgttactcagctagaagaa
agcaagcttcaatattcaaagtggcaaggtgaaatggattctaatttaaagaatattgaa
tctcaaataaataaaacaaatgaagaatttttaagtttaattcagattcaaaaagacaaa
ggaatagagcttagtgagagcgtttttaatgatctgtctgatcatattcaaaaaaaagct
attgatatgcatggcagttggaaagatgagcttattgctttaaataaatctttgcttgat
attaaggtctctagtgaagagctactttcatctgctactttaaaaatagaaagtttagaa
aaagatgttaacgatagaatggaatatgttttattaaaaacaggcgatattgagagttta
gtgatagaaaaatataaagaattaaaagatatgtcatattcacaaagtgatgaggctata
ttaggaattaaagagtttattaatagacaaacagaaataattaaagataaaagcatattt
atgcttgaggatttgaataaaaaatttgacgataagaataattttgttataagcaagatt
gaagaatgtgattataaattaaaagatttcaagattgaatcagaagatattttaaataat
tttaagtctgatcttaatgaatttattgagtcaaaactacaaattgtctctaatataaaa
tcggacaatcaaaagcaaattgatgattttttagatagaatttctaaagatattttaaac
aggaaagattcaattaacaatgaagtagatagcaagcttagcgattggcaaagtaaatta
aatgaaataactgttaaaattgaaaatttattgtcttcaggtaaagttgatctggattta
atagattctgaggtgactacaaaaattaaagagctcaaattttctatagaaagtcttgag
agttattatcttgagaaaatagatgagtttagaaatcaaggtgccatatactctgatgag
cttttgcaagacataatgaaccattttaataaagagactagagaacttgaggaaaattta
tcaaaaaaatttgctgcagttttaaataattcagaggaatttgttaaagaggttgatagt
ttgttgcaggacaaaagaaccgatattgcttcttttcaggctaatatagatattactctt
gattctcttaatgtgaagtttaatgatataaacaaagaaattaatggaaaatacaatgag
gtgatatctaattatagggggtattcagagaatatttctagtaaacttgaaaatgaaata
atgcatgagattgaaaatctaagcagaagattgacagatagaatagagggccttagtaag
ggtatggatgaaaatcttcaaaagcttaaggaatcttttgatgtgtcaaaatatcaagtt
gaaaaatttgaattgaaagttaaagatttaacagatgatggagaggcaaaaattaacgag
cttgttaaagagatcgaacagtattataaatctagattagaagaggcaattgattataga
agaacgattgatagcgatattatgcaagcaaaagagagatttggggagataacaaatgag
cttaaaaataatattgagagtaagtctgagtttttgaacgatctttataaagaaagattt
aaacttattgagagtaattttgaagagagatattctacatttttaattgaaagcgaggga
gctatttcaaaaattagagatgaaatctataaaacacttacaagcaatgatgaaaatttg
caaattaagatttctgaaatggatcaaaattttgagataatagagcaaagatcaaaagat
attttagaatttgaaaaagaattgcaagataaaattaaagattgttacggttttataaat
tctcaatttggagagattaaggcaggtgttgaagagaatataaaaaatcattttgatgtt
tgtataaaaaaggcaaacaccttgattgatgatgacattgtaaagtatgaaaatgaaatt
cacaagagaattgattctttaaaatcgattgagagtacttttgatagcatagagaaaaat
ttaaatgataaggtaagtgggtgtattgataaaatagctaatgattttaatcttaagtat
attgaacttgaagaaaggtgtaatgaagggcaattaaatttagagaataaaattgacaac
aaaattaaagccattgataatttagctttaagtcaatatgatggacttgagaaaaagtat
gctgatatgtacgatgagttttcagagagattaaattcttatattgcaactttaagtgaa
gagtttaagagttcaaataaagagatgatttttgaacttgaatctcaactgaaaaatctt
aaaaatcttgaatctgatttaaataatgttgaaaaggatgttattagattgaaagaagag
tcttatcacaatgtttcatcacatcttaaactattagaagaagacttttttaaggattta
aaaattagaggcgaagagcttaaatattctttggaaaactttattgcctcatataatgat
aaaattcaaaatttagaatatgatttatctaaaaatttggaagacaaaacagaacttatt
caaagtttccgtttagatattgaacaaaaaatgaaagatgataaagagaatttttattta
gattttactaaagaattttcttctaaaaaaaaagacatgcagagtgagatagctttaatg
gaaaccaatattacagggaaagtagatgaatttgttgattttgtaaataataagcaaagt
attattgattcttggtttttgaatattaaagatgatgtaaaagattggcaagaaaaatct
tatagcacaatagagaagagaataaatcttgctgagcttggaattaaatcatttgagaat
gatatttttaatgttaagattggtttagaatcttttaaagatggttttgagattaaggct
gaggagatttttagtaatttgcaaaacgaggctaaaaaaattgaacaatcagttcatctt
gattttaaaaatattggcgaatcattaaatcttaaagttttagatcttgaaaaatttgtt
gattttaaagtagaaaagatagacgaaaaggttaataaaaaaacagaagacatcttaatt
caagcagaagtgaaatttttaactcagcaaaaggatcttgaatataagatttttgagctt
aatcagaaattagagcatgaatttacaaccttgtcttctaatcttgataaagtaaggcgg
gaaatggttgatgtaatttctagtgataaagaaagctttgaagggcaaattgaattaatt
aataaaaatatttcagaattttctgagaaaattagtttatacagaaataatattgagaca
tcaattgagaatgaatataattcgttttctaaatctataaaatcagatctcggcttactt
gaagatgagcttaaaaaaagtttaaaacattcaacatcagagattgaaaccataaagagt
ggtttgcaagaacaaattgataaatttgaggttgaatttaagaaaaatcataaagaatta
ttaaaagaagttgataataatattttagaacttgaatctaaaatattaaattgtgatgtt
caatttaacaaatttattagtgagattaaagacaatttagttgaatacaaatctgatttg
agagcagaatttgaagatagttatgataaaataaattttcaaatcgaaaatcaaattgaa
aattttaaaaaattggattctgaacttgaaaagaataattcaatatttttggaggcttat
tctcttaaggacaagttggaaaaattatgggaaactttaaaaaatgagatagagcttgct
caggaatataaaaataattttgaaaacgttaacaaagaattttataatattcaaaaagaa
acattaggtattattgaaatttttaatgagctaaaggtagaacaagaatcaattaaatct
attaaaaatgattttaatagattttttgaattttactcttcatttgatagtagatataag
agtttaattgaatcttatgatgaaatgcagatatataaagctaaaataaaagagatagct
gacgagcagagaactattcttgataattatgaaagaattagcaataaagagagtatatta
aagagtactatagagtctgttgataaaaattttgatttaataaatgaagtggagaaaaga
tttaataatttaagcaaagagagtgctaagtttcaagacaatctcaaggatatggaaaat
gttgtttcgagtctcttattaaacaaagggttgtcagaagaagtgttgattaatgctcaa
aatttaaaggaaatgctattagatattgaaaataagttgaaaaatactttgactatgaga
gagaaggtggtgaaatctgagacaaggttggagaatttaaatattgcagcagaagagaga
ataaaaactcttggtattcttgtcaaaactgattctaaatatcaagataatgttggtctt
aataatgaaactgttaggaattctgtaataaaattaatgaggcagggatggagtgctgaa
gaaatttctagagctaccaaattatctattggggaagttgagcttattttagagcttggt
ataagtaataaaggtgattga
DBGET
integrated database retrieval system