Bacteroides caccae: CGC64_10975
Help
Entry
CGC64_10975 CDS
T05064
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bcac
Bacteroides caccae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BppU-like_C
CBM_5_12
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM66428
LinkDB
All DBs
Position
2733879..2737436
Genome browser
AA seq
1185 aa
AA seq
DB search
MTLILSLLKLHKIMVKINGSSFALQYKRTTGRPIDSTETFKTLEDATSYARNTDAEEYFP
YAGQIISVEKGEGVYKLVKDDTISEEDGRKHYRLSPIITEEESGNKYLSKIEDDEARGLI
TFLAGINVKIKAVIQKLIAEDATFSKEISSKDYVQNLLGWLITPEGHIDAKSLRLRDFLE
VPELRYNRVSIVSGEEWNAPGGGIIESVDVANKTVHLKLEPGEVSQVEIDDICKGVFNND
TGFQTAYFRITEKIDNASFKYVLRSGYTFNPCKAMHFVAYGNFTNAERQKSCYSTQNYIR
FLKGVNNWEITKEMIAMQLGDLSNLKLFGIDMSGHSAYLNRVYMTGTIRQISSDGVTEAP
VPVFKGKWKSGTYWYYDEVTHNGSTWICIESTTTQEPSDSSTDWLKAISKGDTGSQGAPG
KDGIPGKDGADGKTSYFHIKYSPVQNPTASQMTDTPNKYIGTYVDFVQASSSDPSKYTWT
KFEGGDGIPGTNGENGKTSYLHIKYSDDGKTFTANNGETPGVYMGVYVDFVQADSNVFAD
YTWSKIKGEAGKDGKGVQSVDVLYYLSSSSTSLSGGSWSTNSPTWVDGKYIWSKTKVVYT
DGSSIETNPACITGGKGSTGDNGRGVSSIVEEYYLSTSSNSLVGGSWSTTPPTWENGKYI
WTRSVITYTDSASTTTDPICVTGGKGATGIGVKSVSEQYYLSTSYSTTTGGSWSTTVPAW
KDGKYIWTRSIITYTDNSYTETTPVCVTGGKGPSGNDGKGVKAVDVLYYLSTSSSSLVGG
SWSSTSPTWQNGKYLWSKTKVTYTDNSTWESDPACITGSQGQTGLPGAMIRPRGKWDKNT
EYYHNDAFVDVVIYDGLNWLCKTTHTSTSSFDSTKWEDFHDFENVATNVLLAQNATIDVL
GTSGIFVGNLEKTEGWMITEGGIKHNQTGFELTPDGGINTANGQLILTANSTLIRTNTGK
DIALFKEVDGVPMIDAKNINTENLVVTTGAKIGGFTVEGDNLITLSSGYIGVGVDSGTRF
LRINEYGDSAPVNELLNIRNDTGAAVVLSGGGGMPTLSILANNNARAAIESAGAHFFKCR
KGERWNAPGVLAAGTSNGSSFGYWSQGAPLSARKEGTGRWIITHNLGTNDYYVMITARED
TWDTWAGATIRWSNANEFAFRVRYGRTEADFAWDMVIIGNNSNLW
NT seq
3558 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccctgatactttcacttttaaaactgcataagattatggtgaagataaacggaagt
agttttgcattacaatataaaagaacaacgggaagacctattgattccactgaaaccttc
aagacattggaggatgcgacatcgtatgcccgcaatacggacgcggaagagtatttcccg
tatgccggtcagattatttctgtcgaaaaaggcgaaggcgtgtataaactggtgaaggat
gatactatatctgaagaagatggtagaaagcattatcgattatctccgattattacggaa
gaagaatccgggaacaaatatcttagcaagatagaggatgatgaagctagagggttgata
actttccttgccggtattaatgttaagatcaaggctgttattcagaaattgatagctgaa
gacgcaactttctcaaaggaaatatcatcaaaagactacgtgcagaacctcctaggctgg
ctgattactcccgaaggccatattgacgcaaagtctttgcggctgcgtgatttcttggaa
gtaccggagttgcggtataaccgtgtgtctattgtatccggtgaagaatggaatgctccc
ggcggtggtatcattgaatcagtagatgtagcgaacaagaccgttcatttaaagctggaa
cccggggaggtatcacaagtagagattgatgatatctgtaagggagtattcaataacgat
accggtttccagactgcgtattttcggattacagaaaagatagacaacgcttcctttaaa
tacgtcctccgtagtggatatacttttaatccttgtaaggcgatgcattttgttgcatac
ggtaatttcactaacgctgagcgccaaaagtcatgttactctacacagaattacattcgc
ttccttaagggtgttaataactgggaaataacgaaggaaatgatagccatgcagttgggt
gacttatctaacctgaagctgtttggcattgatatgtccggtcatagcgcatatctcaat
agagtatatatgaccggaactatcaggcagatatccagtgacggtgtgactgaggctccc
gttccggtattcaagggtaaatggaagtctggtacgtattggtactacgatgaagtgact
cataacggcagtacatggatatgtattgagtctactactacgcaggaaccgtcagattct
tctacggactggttgaaagctatatctaaaggggatacaggctcacaaggagcgcccgga
aaggatggaatacccgggaaagatggtgctgacggaaaaacttcatattttcatatcaag
tattctcccgtccagaatcctacggcttctcaaatgactgatacccccaataaatatatt
ggtacttatgttgactttgttcaagcaagtagcagcgatccttctaagtatacatggact
aaatttgaaggaggtgatggcatacctggtacaaatggagaaaatgggaagaccagctac
cttcacatcaaatactctgatgacgggaaaaccttcaccgctaataatggtgagactccc
ggtgtatacatgggtgtatatgtagattttgtacaggcagatagcaatgtgtttgccgat
tatacttggtctaaaatcaagggcgaagcaggaaaagacggtaaaggtgtacagagcgtt
gatgttctttattatctttccagttcttcaacctccctttccggtggttcatggtctacg
aactcaccaacttgggtagatgggaaatacatttggagtaaaaccaaagtggtctataca
gacggttcgtctattgaaaccaatccggcttgtatcaccggaggtaaaggcagtactgga
gataatggtaggggagtctcaagcattgtcgaagagtattatctatctacttcttctaat
tccttggttggtggctcttggagtacaacacctccgacatgggaaaatgggaaatatatc
tggactaggtcagtaataacatatacagatagtgcatcaacgacaaccgatccgatatgt
gttacgggtggtaagggggctacgggaattggcgttaagagtgtttccgagcaatactat
ttgtctacatcatatagtaccactacgggtggctcatggtctactactgttccggcatgg
aaggacggtaaatatatttggacacgttccattataacttatacagacaattcttatacg
gaaactacccccgtatgtgtgacaggcggaaagggacctagcggtaatgacggcaaagga
gtgaaagcagttgatgtcttatactacctttctacttcttccagttctttggttggtggc
tcttggtctagcacttctcccacgtggcaaaacggcaaatacttatggtctaagaccaag
gtcacttatacagataattctacatgggaaagcgatccggcttgcatcactggaagccaa
ggacaaacaggattacccggtgctatgattcgtccacgaggtaaatgggataaaaatact
gagtattatcataatgatgcatttgtagatgttgtaatatacgacggcttaaattggtta
tgtaagacaactcatacgtctacctcttctttcgattcaacgaaatgggaagatttccac
gattttgaaaacgtagctaccaacgtccttttggctcagaacgcaactattgatgtcctc
ggtacttcggggatatttgtgggtaatctggagaagacagagggttggatgataactgaa
ggaggtatcaagcataaccagacaggttttgaattaactcctgatggtggaataaatact
gccaacggtcaattgatattgactgctaatagtactctaatccgcactaatacaggtaaa
gatatagctctatttaaagaggttgacggtgttccgatgattgatgcaaagaatatcaat
acggagaatctagtggttactacgggagcgaagattgggggatttacagttgaaggagat
aacttaattactttaagttctggatatattggtgttggtgttgatagtgggacccgattt
cttaggataaatgaatatggagattcagctccagtaaatgagcttcttaatattcgaaac
gatactggagcagccgtggttcttagtggaggtggaggtatgcctacgttgagtatttta
gcaaacaacaatgctagggctgcgattgaaagcgcgggtgcacatttttttaaatgccgt
aaaggagaacgttggaacgcccctggagtattggcggctggtacttctaatggatctagt
ttcggatattggtcacaaggagccccactaagtgcacgcaaagaaggaactggtaggtgg
attataacgcataatctaggcaccaatgactactatgtgatgattacggctcgagaagat
acttgggatacatgggccggtgccaccattaggtggagcaatgctaacgaatttgcattt
cgagttcggtatggaaggaccgaagcggacttcgcatgggatatggtgataataggtaat
aattcaaacctttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system