Bacteroides caccae: CGC64_12985
Help
Entry
CGC64_12985 CDS
T05064
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein
Organism
bcac
Bacteroides caccae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
RmlD_sub_bind
GDP_Man_Dehyd
3Beta_HSD
adh_short
KR
NAD_binding_4
ThiF
NAD_binding_10
CoA_binding_3
Ldh_1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM66781
LinkDB
All DBs
Position
3173306..3175231
Genome browser
AA seq
641 aa
AA seq
DB search
MEKTLKGIVQYARKNYFSYWVILGIDTALSVLCSLVAYAVIHYMAHVPISDWMLCKFICV
SLVSSVAGALIFHTYRNTIRFSQARELWRVMCAVLFKVACLVAISYWVIYETELPDNYRI
SYLLFDGLLTLATLTAFRVSLIIVYDLLLDWVNKKNTRILIYGIDEKSVALKFRLRDSAH
YKVAGFYTYGKNNSRRRLTDLPIYYFETEEDFNRVIKKHGIHGILFSCYEDTRLEENRLL
EYCKSNAVKTFIAPTISEADSDGNFHQWIRPIKIEDLLGRAEININLSQVAEEFRGKVVL
VTGAAGSIGSELCRQLVQMGIQKLIMFDSAETPLHNVRLEFEKNYPAIDFVPVIGDVRVK
ERVRMVFELYHPQIVFHAAAYKHVPLMEENPCEAVLVNVTGSRQVADMAVEYGAEKMIMV
STDKAVNPTNVMGCSKRLAEIYVQSLGCAIREGKIKGHTKFITTRFGNVLGSNGSVIPRF
KEQIENGGPVTVTHPDIIRFFMTIPEACRLVMEAVTMGEGNEIFVFEMGKAVKIVDLATR
MIELAGYRPDEDIKIEFTGLRPGEKLYEEVLSDKENTIPTENKKIMIAKVRRYEYADILD
IYAEFEKLSRAVRIIDTVRLMKKVVPEFKSKNSKFEVLDKE
NT seq
1926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaacattgaagggcatagtacaatatgctcgtaaaaactatttcagctattgg
gttattttaggtattgatacggcactgtctgttttatgttcattggtcgcttatgccgta
attcactatatggcacatgttccgataagtgactggatgctttgcaaatttatttgcgtc
tctttagtgtcaagtgttgcaggggcattaatattccacacttatcgtaatacaattcgt
ttttcacaggcacgtgaactttggcgtgtcatgtgtgccgtcctattcaaggtagcctgt
ctggtggctatttcttattgggttatttatgagactgaattgccggataattataggata
tcttatctcttgtttgatggtttattgactttggcgacactgacagccttccgtgtatca
ctgataattgtctatgacctgttgctggattgggtgaataagaagaatacccgcattctt
atttatggtattgacgaaaagagtgtggccttaaaattccgtctccgcgacagtgcacat
tataaagttgcaggtttctacacttacggtaaaaacaacagtagacgtcgtctgacagac
cttcctatctattattttgaaacagaagaagactttaatcgtgtcataaaaaaacatggt
attcatggtattctgttttcctgttatgaagatacccgtctggaggagaaccgcctttta
gagtattgtaaaagtaatgctgtcaagacttttattgctcctactatcagtgaagcggat
tctgacgggaactttcatcagtggatacgtcctattaaaattgaagatttattgggacgt
gctgaaatcaatataaaccttagtcaggtcgcagaagaattcagaggaaaagttgtatta
gtgaccggtgctgcaggtagtatcggtagcgagctttgccgtcaattggtgcaaatgggt
attcaaaaactcatcatgtttgactctgcagagactcctttgcataatgtccgtttggaa
tttgagaaaaattatcctgctatcgattttgttccggtgattggtgatgtacgtgtgaaa
gaacgtgtgcgtatggtattcgaactttatcatcctcaaattgtcttccacgccgctgct
tataaacatgttcctttaatggaagaaaatccttgcgaagctgtacttgtcaatgtcacg
ggttcgcgtcaggtcgccgatatggcggtggagtatggtgcagaaaaaatgataatggtt
tctaccgacaaagctgtgaacccgactaatgtgatgggatgttccaaacgtttggcggaa
atctatgtacagagcttggggtgtgctatccgtgagggaaagataaaaggacatactaaa
ttcattactacacgttttggaaacgtattaggcagtaacggttctgtaatcccgcgcttc
aaggaacagattgagaacggtggtcctgtcacagtgactcaccctgatattattcgtttt
tttatgacgattcccgaagcttgtcgtttggttatggaggctgttacaatgggagagggt
aatgaaatctttgtctttgaaatgggcaaggccgttaagattgtcgacttggctacccgt
atgattgaattggcgggttatcgcccggatgaagatataaagattgaatttactggcttg
cgaccgggtgagaaactctatgaagaagtgctgagtgataaagaaaatacgattcctacc
gagaataaaaaaattatgatagctaaagtacgtcggtatgaatatgctgatattcttgat
atatatgcggagtttgagaagttgtcccgtgctgtgcggattatagacacggtcagattg
atgaaaaaagttgttccggagttcaaatcgaagaattcgaaatttgaggtactggataaa
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system