Bacteroides caccae: CGC64_16375
Help
Entry
CGC64_16375 CDS
T05064
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
bcac
Bacteroides caccae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bcac00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bcac02000
]
CGC64_16375
Transporters [BR:
bcac02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CGC64_16375
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Big_1
TTR_TEN1-4
CILP
DIM1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASM67992
UniProt:
A0A174RDY6
LinkDB
All DBs
Position
complement(3971762..3974974)
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MKNLLKVFLMCFITLFAFAGQMMGQQKTITGRVVDALNEGMPGVNVQVKGTTSGTITNID
GDFSISVPNTKSVLVFTFIGYVKQEVAVGNQTKLNIQMKDDTQSLDEVVVVAYGTARKGD
LTGALTTMRPDANEAAKAVSIDNLLEGKVAGLVVSTASSNPGAASSITIRGASSLRGDNQ
PLYVIDNIPQASTGEFSSSGISGDFQIAQDPLSSLNPADIEDITILKDASSTAIYGSRGA
NGVILITTKKGKEGKAKVNASATFTIANASRLLEMMNLEEYAAYHNSRITDGKVPFHIVG
DEVRYVFNGAYDKYDPADPETYNVVNYRNWQKEIYTSAFSQNYSLSVNGGAGKTTYYISA
NFKDINGTVKQTGLKQGDLRANLSAQLSKSVDLNMALSGSLRQNNMMAGGNTLGGATGAI
SRTALDYAPFELPENDPSFTNENKTNVFSWLNDYVDLTDDKTFKASLNLNWKINKFFTYS
LRAGGNINTNDRKRWYGMQLYQGMNNQGYLATSNLSKSNYSVENIVNYNTKLGSVGTLAA
TVGMTYDDYNFLNKNVIGKNFTMFEFRENGMHMAGDVITSQPIQKDYQLLSYLGRVNVSL
LDKYLITASLRADGSSKFAKNNRWGYFPSASIAWRMEQEEFLKDVSWLNQLKLRFSYGAT
GNQSIDPYTTFSMYGQGSGEISYADGTGNKTTAMVVTNLSNSSLKWEKTSSWNVGLDFGL
FNSRLSGTLDIYQKKTTDLLISRNLPGSAGFSSTYYNQGSLNNKGVEFSLNAQIIDSSSW
KWSVSGNIGVNRNEISDLGLLPADFGCLGERVGYYGNSLGDHFGVGHIFLAGEAPGLFYG
YVTQGIVQKEDITENGIKYIKQDGSVGYYQTVNKTTPVAGDVKYVDRNGDGVVDDNDRDI
IGNPNPDFTYGFQTKVSWKSLSLSASFNGVQGRDILNVGNRYNNTPGTKSNNVTRKAFQN
MWTDENPSNLYPKSTFVVQNMVMDRYVEDGSYLRCSDITLSYVLPAKWTNKIGIKNTSVY
ASVKNAFVITDYSGYDPEVNSFAFDGLRPGVDMNSYPTPRSFVFGLNLTF
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaacctattgaaagtttttctaatgtgtttcattacgttatttgcttttgcaggg
caaatgatgggacaacaaaagaccattacaggtagggtagtggatgctcttaatgagggt
atgcctggtgttaatgtacaagtaaaaggtactacctcaggaacaataactaatattgat
ggcgatttttcaatttccgtacctaatacaaagtctgtattagtatttacttttattgga
tatgtgaagcaggaagttgctgtgggaaaccaaacaaaactgaacattcaaatgaaagat
gatacacagagtttggatgaagtcgtggtagttgcttatggaacagctcgtaaaggtgat
ttgacaggagcactgacgacgatgagaccagatgcgaatgaagctgcaaaagccgtttcc
atagataatctgttggaaggaaaagttgccggtctagtcgtgagcacggcttcttccaat
ccgggagctgcttcgtccattacgattcgtggagctagttcgttgcgaggtgataatcag
cctctttatgtcattgataatattccgcaagcttcaactggagaattttcttcttcgggt
attagcggagactttcagattgctcaagatccgctgtcatcattgaaccctgccgatata
gaggatattacgatattgaaagacgcatcctctactgctatttacggttctcgtggtgcg
aacggtgttatattgataactactaaaaaaggtaaggagggcaaagctaaagtgaatgct
tcggctacttttactattgctaatgcaagcaggttgttagagatgatgaatttagaggaa
tatgctgcttatcataattcaagaattacggatggcaaagtgcctttccatattgttgga
gatgaggtgagatatgtatttaatggagcttacgataaatatgatcctgctgatcctgaa
acttataatgtagtaaattatcgtaactggcagaaagaaatctatacttctgctttttct
cagaactactctttatcagtaaatggtggtgcaggtaagacaacttattatatttccgct
aattttaaagatattaatggtactgtgaagcagaccggtttgaagcaaggagacttgcgt
gcaaatttgagtgcgcagctttccaaatctgtagatttaaacatggcgttaagcggatcc
ttgcgacagaataatatgatggcaggtggtaatactcttggcggtgctactggtgctatt
tcacgtactgctcttgattatgctcctttcgaattgccggagaatgacccgtcttttaca
aatgaaaataaaacgaatgtgttcagctggctgaatgattatgtggacttgacagatgac
aaaacttttaaagctagtttgaatctgaattggaaaataaataagtttttcacttatagt
cttcgtgcaggtggtaatatcaatacgaatgatcgcaaacgatggtatggaatgcaattg
tatcaaggaatgaataatcagggttatctggcaacctctaatctttcaaaaagtaattat
tcagtagaaaatatagtgaactataatacgaaacttggtagtgtaggtacattggctgca
acagtcggtatgacttatgatgattataattttctaaataaaaatgtgattggaaagaac
tttacgatgtttgagtttcgtgagaatggaatgcatatggcaggtgatgtaattacgtcg
cagcctatacaaaaagattatcagttactttcttatttgggacgagttaatgttagtttg
cttgataaatatttgattacagcttctttgcgtgccgatggttccagtaagtttgcgaaa
aataatcgttggggatatttcccttctgcatccatagcttggcgtatggaacaagaagaa
tttttgaaagatgtttcatggctgaatcaattgaagttgcgtttcagctatggtgcaacc
ggaaatcaaagtattgatccttatactactttttcgatgtatggacaaggatctggtgaa
atctcatatgcggatggaacaggaaataaaacgactgcaatggtggtgaccaacttgtca
aacagtagtttgaaatgggaaaaaacatcttcatggaatgtcggattggactttggtttg
tttaattcccgtttgagtggtaccttggatatctatcagaagaaaacaacagatttgctt
atttcaaggaatttgccgggatcagctggatttagttctacttattacaatcaaggttca
ttgaataataaaggtgttgaattttctttgaatgcacaaatcattgacagttcatcttgg
aaatggtctgtaagtggtaatatcggtgtcaataggaatgaaatttcagatttaggtttg
ttgcctgctgattttggatgcttgggtgagagagttgggtattatggtaatagtttaggg
gatcattttggtgtagggcatattttcttggcaggtgaagctccgggattattttatggt
tatgtgactcaagggattgtccaaaaggaagatataacagaaaatggaattaagtacatt
aaacaagatggaagtgtgggatattaccaaacggtgaataaaacgactccggtagccggt
gacgtgaagtatgtggatagaaatggagatggtgtagtggatgacaatgatcgcgatatt
attggtaacccgaatcctgattttacttatggttttcagactaaagtatcttggaaatcc
ttgtcgttgtctgcatcctttaatggggtacagggtagggatattttaaatgtaggtaat
cgttacaataacactccgggaactaaatcgaataatgtgacgcgtaaagcgttccaaaat
atgtggacggatgagaatccaagtaatttatatccgaaatcaacatttgtcgtacaaaat
atggtgatggatcgttatgtggaagatggcagttatttgcgttgttctgatattacactg
agttatgtacttcctgccaaatggacgaataagattggtataaagaatacatctgtttat
gcttctgtaaaaaatgcgtttgtgataacagattatagtggttatgatcctgaagtaaat
agttttgcttttgacggtttacgtccgggtgttgatatgaactcatatccgactcctcgt
tcatttgtttttggcttaaatttaacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
