Bacillus carboniphilus: LC087_02490
Help
Entry
LC087_02490 CDS
T09277
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
bcao
Bacillus carboniphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Ntox8
DUF6531
Beta-prop_EML_2
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLR43096
LinkDB
All DBs
Position
487425..492086
Genome browser
AA seq
1553 aa
AA seq
DB search
MNWDAIEGATGYKVWMFNGRAYQEFDAGANTTWTTQNKGIWPTKEEIKNGQFTLHYDQKG
SELALNPSDVYKNAGYGYEKYQKYWFRLSAYDDNGETVYSSKAFEPSFSEPTEFLGKEEY
WSFTDVPNGEVNIATGNLIISEDDISISGRGPSLGVARTYNSLSPAIGMFGAGWHSDLEM
SIVASSDQLKLIDEDSTLHIFNKQADGSYKPPTGIYLELTETENEYILKSKDQTKVFFNK
TSGKIEKMMDGHNNTLKYYYDQERLSKMEDASGRALSFAYTEDGKVKEIIAPENRKIVYE
YSNDFLTKVTQTAGEVTQYEYNDAMRLSKLYEPTHQEKNPSVTTFLYQDQRLAQVVNAEN
HAYSLTYDKEKNEVDFINPNGSKDRYRFNEAANPIVITQDVDQLNITTSYIYEGNNLKET
KVPNDQGSSKPTESYQYDENGNVTSATDSYGTETYQYNENNDVTKIIDTENEETTIAYDD
LNPVSETSPSDQTSSVAKYDSYGNVIESSSALSNATNLLENASFEQSEGLSSWNVTTYND
SGSLKIDSTTQASNIAGQKSLKIQSTSTTKTGQLGYVAATQEVTVSPNTTYTLSGRMKTD
LTNANAFFNVKFLDKDKKGIGWQDNRYSQMTKKHDWMDRQLTFTTPSNTASILIYLEVDH
FNDQATGEAWFDGIQLEKSDVSSTYNPIINSSFEKTFNGWTGSGGSIDSSGFDGSASLKA
TGSMEYKQTLELNQNDKMTLKALTLTGLSKALNVTEKGSVSSSDYALTAKVVYQDGTTKD
YVASFPKGSQEWNRSAVKIPASKPIKKLEVILSFKGNYSDTVWFDAIRLIEGSVLTKNSY
DENHNYVTKVEDAKGNIVQNKYDTYGNKMEAIDEKNQSITYAYDKADQLQSLNLPNGASV
NYQYDLNGNMTSKEIVSNGKKQPFQYQYNGLNQLLKTTGPLNDITVNEYDENGNKIKTTL
PRGNDIKWSYDGFDRINTISYNDKGYYRFAYDKNGNETTVEALIDGYTKTREYDKSNRLT
KVVQKNSKQDWLYPTESDKLKTFTFTHKDFSQTNEFSYNKQDSNTLVKNGSFTFRFDYDE
DGNVQTFTSGNGAGSTFSYDDLGLVDSLNIGTDDGQEILFETYEYDANGNRTKIESSKGT
NKIYAYDSLDQLVKETRSDGTLIEYEYDGFGNRVLEKGTNTSPIVSSYNLANQLVQYGDE
RLSYDDNGNRLEDGKFIYHWNDADQLASVTKKGASSPIATYRYDEDGRRIQKVVNGKTIN
YYYHGDSLNVLYETNENDEVIRSYTYSESGILLSMNQGNSTYFYHYNAHGDVIALTDKDS
KVVAEYEYDAWGNVLKAEEADEVKTNPYRYAGYQYDHETGLYYLIARYYQPTHGVFLSLD
PDPGDDDDILTQNGYTYANNNPVMLVDPDGHWVWLAVNAGFAVYDGYKAYKSGGNWKQVA
WAAGSNFIKLGYIKKASRTLSAVKKGRTGRQGKLKALVSDPKAPKHVKGFIKNQMRHRKI
NGKKRHLNNPPGYELAHKRGYEARKGYSYRYTVLQNTKNHKLQHKYDRYGKKR
NT seq
4662 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaattgggatgcgattgaaggagcaacgggatataaggtttggatgttcaatggtaga
gcttatcaagagtttgatgcaggggccaatacaacatggacaacacaaaataaaggcata
tggccaaccaaagaagagattaaaaatggacagtttacgttacattatgatcaaaaagga
agtgaactagcacttaatccttctgatgtttataaaaatgccggatacggctatgaaaag
tatcaaaagtattggttcagattaagtgcttatgatgacaacggagaaaccgtttattcg
agtaaagcctttgaaccttcatttagtgaaccaactgaatttttagggaaagaagaatat
tggtcttttacagatgtaccgaatggtgaggttaacatagcgacaggaaaccttataatt
tctgaagatgatatctcaatctctggtagaggtcctagccttggagtcgcacgaacgtat
aatagcctttcaccggcaattgggatgttcggagctggatggcactctgatcttgaaatg
agtattgtcgcttcatccgatcaattaaaacttattgatgaagatagtacccttcatatt
tttaacaagcaagcggatggatcgtataaaccaccaacagggatttatctagaattaacg
gaaacagaaaacgaatatatactcaagtcaaaagatcaaaccaaagtatttttcaataag
acctcaggaaaaattgagaaaatgatggatggtcataataatacacttaaatactattat
gatcaggaacgactttccaagatggaagatgcttcaggacgggcactttcttttgcttat
acggaagatggaaaagttaaagaaatcattgccccagaaaaccggaaaatcgtctatgag
tattctaatgacttcttgactaaagtgactcaaacagctggagaagtgactcaatacgaa
tataacgatgcaatgcgactttcgaaattatatgaaccaacgcatcaagaaaagaaccct
agtgtcaccacgtttctttatcaagaccaaaggctagctcaagtagtaaatgcagagaac
catgcttactcattaacgtatgacaaggaaaaaaatgaagttgactttattaatccaaat
ggaagtaaagatcgctatcgatttaatgaagcagctaatcctattgtaattacccaagat
gtagatcaattaaacattacaactagctatatttatgaaggaaataatttgaaagaaacg
aaagttccaaatgaccaaggctcaagtaagccaacggaaagctatcaatatgatgagaac
ggtaatgttacaagtgcaacggatagctatggaactgaaacctatcagtataatgaaaat
aatgatgtaacaaagattatcgacactgaaaatgaagaaacgacgattgcttatgatgat
ttgaaccctgtttcagaaacaagcccaagtgatcagacctcttctgtagctaagtatgat
agttatggcaatgttattgaatcgagttcagcgctttctaatgctacaaacttactggaa
aatgcaagctttgaacaatctgaaggtctttcttcgtggaatgtaacaacctataatgat
tcaggcagtttaaagattgactcgactacacaggcaagtaatatagctggtcaaaaatcg
ctcaaaattcaatcaacatcaacaactaaaacaggacaattagggtatgtagcggccact
caagaagtgacagtaagtccgaatacgacctatacgttaagtggtcgaatgaagacagat
cttacgaatgcgaatgccttttttaacgttaagtttttagataaagataaaaaaggaatt
ggctggcaagataatcgttatagtcaaatgactaaaaagcatgattggatggatcgtcaa
ctaacgttcactacgccttcaaatacagcatctatattaatttatttggaagtggatcac
tttaacgatcaagcgacaggtgaagcgtggttcgatggaatacagctcgaaaagtcagat
gtttcgtctacgtataatccaatcattaatagtagtttcgaaaaaacgtttaatggttgg
acgggctcaggtggctccattgattcaagtggttttgatggaagtgcttctttaaaagct
acaggttctatggaatacaaacaaacgcttgaacttaaccaaaatgataagatgacgctt
aaggctttaacgttaacagggctatcaaaggcactcaacgtgactgaaaaaggttctgta
agtagtagtgactatgcattaacagcaaaagtagtttatcaagatggaaccacgaaagac
tatgttgctagcttccctaaaggttctcaggagtggaatcgatctgccgtcaaaattcct
gcttcaaaaccaattaagaagttggaagtaatcctttcttttaaagggaattactcagat
acggtttggtttgatgccattcgtttgattgaaggtagtgtcttaacgaaaaacagttat
gatgaaaatcataattatgtgacaaaagttgaagatgctaaaggaaacatcgtacaaaat
aagtacgatacctacgggaataaaatggaggcaattgatgaaaaaaatcaatcgataact
tatgcttacgacaaagcagatcaattgcaatccttgaaccttccgaacggagcatcggtc
aactatcaatacgatttaaatggaaatatgacaagtaaagagattgtttccaatggaaaa
aaacaaccatttcagtaccaatacaatgggttgaaccagcttcttaaaacaacgggacca
ttaaatgatataacggtaaacgaatatgatgaaaatgggaataaaatcaaaaccactttg
ccaagaggaaatgatatcaaatggtcgtatgatggcttcgatcgtatcaataccataagc
tataatgacaaaggttattatcgttttgcttatgataaaaatggcaacgaaacgactgtt
gaggcgcttatagatggttacacaaaaacaagagagtacgataagtccaatcgtttaaca
aaagtcgtacaaaaaaatagcaagcaagattggctatacccaactgagtctgataaatta
aaaacgttcacgttcacacacaaagatttctctcagacaaatgaattttcttataataag
caagattccaatacacttgtaaaaaatggttcattcacgttccgttttgattacgatgaa
gatgggaacgtacaaaccttcacttctggtaatggtgcgggatcgaccttttcgtatgat
gatttagggttagttgattcgctaaatattggaactgatgatgggcaagaaatcttgttt
gaaacgtatgagtatgatgccaacggcaatcgaacaaagattgaatcatctaaaggtaca
aataaaatctatgcatatgattcgttagatcaattagtgaaagaaacccgttcagacggt
actttgattgaatatgagtatgatgggtttggtaatcgtgttttggaaaaaggaacaaac
acttctcctatcgtttctagctataatcttgctaatcagctagtccaatatggcgatgaa
agactctcttacgatgataatggaaatagattagaggatgggaaatttatttatcattgg
aatgatgcagatcagttggcatctgtgacgaaaaagggtgcatcatccccaattgcaacc
tatcgttatgatgaagacggacgacgtattcaaaaagttgtcaatgggaaaacgatcaat
tactattatcatggagatagtttaaatgtcctgtatgaaacgaatgagaatgatgaagtc
atcagatcttatacgtattcagaatctggcattttactatcgatgaaccaaggaaatagc
acctatttttatcattataatgcccatggagatgttattgctttaacagataaggacagc
aaggttgttgctgaatatgagtatgacgcatggggaaatgtattaaaagctgaagaagca
gatgaagtaaaaacgaatccgtatcgttatgcaggataccaatatgatcatgaaacgggt
ctgtattatttaatcgctcgatattatcaacccacgcatggcgtatttttatcattagac
ccagatcctggtgatgatgacgatatcttaacacaaaacggttacacatacgccaataac
aatcctgtcatgttagtggatccagatggccactgggtttggttagctgttaatgctggc
tttgcagtttatgatgggtataaggcatataagtcaggagggaattggaagcaggttgct
tgggctgcaggctcaaattttataaagttaggttatataaaaaaggcttctagaacatta
agtgctgttaagaaggggagaactggcagacaaggaaaacttaaagcactagtatcagat
cctaaagctcctaaacatgtaaaagggtttattaaaaatcagatgagacacagaaaaatt
aatgggaaaaagagacatttaaataacccacctggatatgaactagctcataagagaggt
tatgaagctagaaaagggtattcatatagatacactgtgttgcaaaatacgaaaaatcac
aaacttcaacataagtacgatagatatggtaagaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
