Borreliella carolinensis: QIA18_02860
Help
Entry
QIA18_02860 CDS
T09353
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bcaz
Borreliella carolinensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Baculo_PEP_C
DUF2802
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKC90886
LinkDB
All DBs
Position
515676..522176
Genome browser
AA seq
2166 aa
AA seq
DB search
MIDFATILVNLFLVSIVLFVYRQYDKRSRALDKIKKFVDLTKVNLEDFIEDKTKEINDLA
VDMEAYQRSSIEIIKKIDEVQQKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTFKVQENIQ
RLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFDKTNKENLESIKIASWEKFDTNI
KGLVFKMDNLNKEISLYEKDLANIEERKNDILVKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIDKYSKE
IESSFNFYENKYKLIEDSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELQNKFKDIFEYVDDRS
KEIKDKLEDKLVLVDNEISSMSSSFKDNVYSRINSLEESMRIEMGKYEEQVDDVFDKFRS
QVELNLKNIYEDYEDKISQVDNNIRKRVELTLLDLNSKMESVQVGAIDLVKRLEDDSNGI
YLEFKDKFGADIEVFSESFKGDINQLKMQLESKLLDVDSNIQGKLIKLNDNLISNFEEIN
GKFNNNYSNLSDSINAKYKSLFESLDSSSSKFENQMESQYKSFTDKLTAEMDEFSLIYGE
KFDTLSQEATNNYQEFQDLNKKLEDEVGSFYNIFEKTQETLKEDFNASLINIKDEIGKNI
VEFKDSYYNEVNVFVTQLEESKLQYLKWQDEMDSNLKNIESQINKTNEEFLSLIQIQKDK
GIELSESVFNDLSDHIQKKAIDMHGNWKDELIALNKSLLDIKISSEELLSSATLKIENLE
KDVNDRMEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILGIKEFIDRQTEIIKDKSVF
MLEDLSKKFDDKNNFVISKIEECDYKLKDFKIESEDILNNFKSDLNEFVESKLQIVSNIK
SDNQKQIDDFLDRISKDILNKKDSINNEVDSKLSDWQSKLNEITIKIENLLSSGKVDLDL
IDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGSIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL
SKKFASILNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLSVKFNDINKEINGKYNE
VISNYRGYSENISSKLENEIMHEIENLNRRLTDRIDSLGKGMDENLQKLKESFDVSKYQV
EKFELKVKDLTDDGEAKINDLVKEIEQYYKSRLEEAIDYRRTIDSDIMQAKERFGEITNE
LKNNIESKAEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTSNDESL
QIKISEMDHNFEIIEQRSKDILDFEKELQDKIKDCYGVINSQFRDIKASVEENIKNHFEV
CMKKANTLIDDDIVKYENEIHKRIDSLKSIESTFDSIEKNLNDKVSGCIDKIANDFNLKY
IELEERCNEGQLNLEDKIDNKIKAIDNLALSQYDGLEKKYADMYDEFSEKLNSYIATLSE
EFKSSNKEMIYELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL
KVRGEELKYSLENFIASYNDKIQNLEYDLSKNLENKTELIQNFHLDIEQKMKDDKENFYL
DFTKEFSSKKKDMQSEIALMETNITGKVDEFVDFVNNKQSIIDSWFLNIKDDVKNWQEKS
YSTIEKRINLAELGIKSFENDIFNVKIGLESFKDGFETKAEEIFSNLQNEAKKIEQSVQI
DFKNIGESLNLKVLDLEKFVDFKVEKIDEKVNKKTEDILIQAEVKFLTQQKDLEDKIFEL
NQKLEHEFTTLSSNLDKARREMIDVISSDKESFEGQIELINKNISEFSEKISLYRSNIET
SIENEYNSFSKSIKSEFGLLEDELKKSLKHSTLEIETIKNGLQEQIDKFEVEFKKNHKEL
LKGVDTNILELESKILNYDIQFNKFVSEIKDNLVEYKSDLRAEFEDSYDKINFQIENQIE
NFKKLDAELEKNNLIFLEAYSLKDKLEKLWETLKNEINLAQEYKNNFENVNKEFYNIQKE
TLDIIETFNELKLEQESIKSIKNDFNKFFEFYSSFDSRYKSLVESYDEVQIYKAKIKEIA
EEQRTILDNYERISNKESILKSTIESVDKNFDLINEVEKRFNTLSKESAKFQDNLKDMEN
IVSNLLLNKGLSEEVLINAQNLKEILLDIENRLKNTLIMREKVVKSETRLENLNTAAEER
IKTLGILVKTDSKYQDNVGFNNETVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELG
ISNKGD
NT seq
6501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagattttgcgactattttagttaacctttttttggtttcaatagttttatttgtt
tataggcaatatgataagcgttctagagcattagataaaattaaaaagttcgttgatctt
acaaaggttaatcttgaagattttattgaagataagacaaaagagattaatgatcttgct
gttgatatggaagcttatcaaagatctagtatagagataataaaaaaaattgatgaagtt
cagcaaaagattaagaataaaagcaatgattttgcagaggttgaaaaaaagatagcttat
catgattctatgcttaaggatcttgatgaaatgacttttaaagttcaagaaaatatacaa
agattgcaagttgatgggaaaatagtagataagctttcaaaaactttaaaaggatttaat
actcagattgattcagttgaatcaaatttgaattcagtgttagaaaaatttgacaagact
aataaagaaaatctagaatctattaaaattgctagttgggaaaagtttgacactaatatt
aagggccttgtttttaaaatggataatttgaataaagagattagtctttatgaaaaagat
ttagcaaatattgaagagagaaaaaatgatattttagttaagggtaatgaaaaattagat
ttagaattcaacgattttcttgaaaaggtcgaatttaatattgacaaatatagcaaagag
attgaaagttcttttaatttttatgaaaacaaatataagttaatagaagattctatagag
cttattatggagagtgtaaagaataaaattaatgaaaaagaagattttattttaaataga
ctgaatgaagaattacaaaataaatttaaagatatttttgaatatgttgatgatcgttct
aaggaaattaaagataagcttgaggataaattggttttggtggacaatgaaatttcttct
atgagttcttcttttaaagacaatgtttattcaagaattaattcacttgaggagtcaatg
cgaatagagatgggaaagtatgaggagcaagttgatgatgtttttgataaatttagatct
caagttgagttgaatcttaaaaatatttatgaggattatgaagataaaataagtcaagtt
gataataacattagaaaaagggtagagcttactttattagatttgaattctaaaatggaa
agtgttcaggtaggtgctattgacttagtaaagaggcttgaagatgattctaatggaata
tatcttgaatttaaagataagtttggagcagatattgaagtatttagtgaaagttttaaa
ggcgatattaatcaacttaaaatgcagttagaatctaaactcttagatgttgattcaaat
attcaaggtaagcttattaaacttaatgataatttgatttctaattttgaagaaattaat
ggtaagtttaataataattattcaaatttaagtgatagtataaatgccaagtacaagtct
ctttttgaatctttggattctagtagttctaaatttgaaaatcaaatggaatcccaatat
aagagttttacagataaattaacagcagaaatggatgaattttctttaatttatggtgaa
aaatttgatacactctctcaagaggcaaccaataattatcaagaatttcaagatttaaac
aaaaaattagaagatgaagttggatctttttataatatttttgaaaaaacccaggagact
ttaaaagaagattttaatgctagtttaattaacattaaagatgaaattggtaaaaatata
gtagagtttaaggatagttattacaatgaagtaaatgtttttgttactcagctagaagaa
agtaagctccaatatttaaagtggcaagatgaaatggattctaatttaaaaaatattgaa
tctcaaataaataaaacaaatgaagaatttttaagcttaattcagattcaaaaagacaaa
ggaatagagcttagtgagagcgtttttaatgatctttcagatcatattcaaaaaaaagct
attgatatgcatggcaattggaaagatgagcttattgctttaaataaatctttgcttgat
attaagatttctagtgaagagctactttcatctgctactttaaaaatagaaaatttagaa
aaagatgttaacgatagaatggaatatgttttattaaaaacaggcgatattgagagttta
gtgatagaaaaatacaaagaattaaaagatatgtcatattcacaaagtgatgaggctata
ttgggaattaaagaatttattgataggcaaacagaaataattaaagataaaagtgtattt
atgcttgaagatttgagcaaaaaatttgatgataagaataattttgttataagcaagatt
gaagaatgtgattataaattaaaagatttcaagattgaatcagaagatattttaaataat
tttaaatctgatcttaatgaatttgttgagtcaaaactacaaattgtctctaatataaaa
tcggacaatcaaaagcaaattgatgattttttagatagaatttctaaggatattttaaac
aagaaggattcaattaacaatgaagtagatagcaagcttagtgattggcaaagtaaatta
aacgaaataactattaaaattgaaaatttattatcttcaggtaaagttgatctggattta
atagattctgaggtaactacaaaaatcaaagagcttaaattttctatagaaagtcttgag
agttattatcttgagaaaatagatgagtttagaaatcaaggatctatatattctgatgag
cttttgcaagacataatgaatcattttaataaagagactagagaacttgaagagaattta
tcaaagaagtttgcctcaattttaaataattcagaagaatttgttaaagaggttgacagt
ttgttgcaggataaaagaaccgatattgcttcttttcaggccaatatagatattactctc
gattctcttagtgtgaagtttaatgatataaacaaagaaattaatggaaaatataatgag
gtgatatctaattatagggggtattcagaaaatatttctagtaaacttgaaaatgaaata
atgcatgagattgaaaatcttaatagaagattgacagatagaatagatagtcttggcaaa
ggcatggatgaaaatcttcaaaaacttaaggaatcttttgatgtatcaaaatatcaagtt
gaaaaatttgaattgaaagttaaagatttaacagatgatggagaggcaaaaattaacgat
cttgttaaagagattgaacagtattataaatccagactagaagaagcaattgattataga
agaacaattgatagtgatattatgcaagcaaaagagagatttggagagataacaaatgag
cttaaaaataatattgagagtaaagccgagtttttaaacgatctttataaggaaaggttt
aaacttattgagagtaattttgaagagagatattctacatttttaattgaaagcgagggg
gctatttcaaaaattagagatgaaatctataaaacacttacaagcaatgatgaaagtttg
caaattaagatttctgaaatggatcataattttgagataatagagcaaagatcaaaagat
attttagattttgaaaaagaattgcaagataaaattaaagattgttacggtgttataaat
tctcaatttagagatattaaggcaagtgttgaagagaatataaagaatcattttgaggtt
tgtatgaaaaaggcaaacactttaattgatgatgacattgtaaagtatgaaaatgaaatt
cacaagagaattgattctttaaaatcgattgaaagtacttttgatagcatagagaagaat
ttgaatgataaagtgagtgggtgtattgataaaatagccaatgattttaatcttaagtat
attgaacttgaagaaaggtgtaatgaagggcaattaaatttagaggataaaattgacaac
aaaattaaagccattgataatttagctttaagtcaatatgatggacttgagaaaaagtat
gctgatatgtacgatgagttttcagagaaattaaattcttatattgcaactttaagtgaa
gagtttaagagttcaaataaagagatgatctatgaactagaatctcaactgaaaaatctt
aaaaaccttgaatctgatttaaataatgttgaaaaggatgttattagattaaaagaagag
tcttatcacaatgtttcatcgcaccttaaactattagaagaagacttttttaaagatttg
aaagttagaggtgaagagcttaaatattctttagaaaactttattgcctcatataatgat
aaaattcaaaatttggaatatgatttgtctaaaaatttggaaaacaaaacagaacttatt
caaaatttccacttagatattgaacaaaaaatgaaagatgataaagaaaatttttatttg
gattttaccaaagaattttcttctaaaaaaaaagatatgcagagtgagatagctttaatg
gaaaccaatattaccgggaaagtagatgaatttgttgattttgtaaacaataagcaaagt
attattgattcttggtttttaaatattaaagatgatgtaaaaaattggcaagaaaaatct
tatagcacaatagagaagagaataaatcttgctgaacttggaattaaatcatttgagaat
gatatttttaatgtaaagattggtttagaatcttttaaagatggttttgaaactaaggca
gaagagatttttagcaatttgcaaaatgaggctaaaaaaattgaacaatcagttcaaatt
gattttaaaaatattggtgagtcattaaatcttaaagttttagatcttgaaaaatttgtt
gattttaaagtagaaaagatagacgaaaaggttaataagaaaaccgaagatatcttaatt
caagcagaagtgaaatttttaactcagcaaaaggatcttgaagataaaatttttgagctt
aatcaaaaattagagcatgaatttacaactttgtcttctaatcttgataaagcaaggcgc
gaaatgattgatgtaatttctagtgataaagaaagctttgagggacaaattgaattaatt
aataaaaatatttcagaattttctgaaaaaattagtttatatagaagtaatattgagaca
tcaattgagaatgaatataattccttttctaaatctataaaatcagaattcggtttactt
gaagatgaacttaaaaaaagtttaaaacattcaacattagagattgaaaccataaaaaat
ggcttacaggaacaaattgataaatttgaggttgaatttaagaaaaatcataaagaattg
ttgaaaggagttgataccaatattttagaacttgaatctaaaatattaaattatgatatt
caatttaacaaatttgttagtgagattaaagacaatttagttgaatataaatctgattta
agagcagaatttgaagatagttatgataaaataaattttcaaattgaaaatcaaattgag
aattttaaaaaattggatgccgagcttgaaaaaaataacttgatatttttggaggcttat
tctcttaaggacaagttggaaaaattatgggaaactttaaaaaatgagataaatcttgct
caggagtataaaaataattttgaaaacgttaataaagaattttataatattcaaaaagaa
acattagatattattgaaacttttaatgagttaaagttagaacaagaatcaattaaatct
attaagaatgattttaataaattttttgaattttactcttcatttgatagtagatataag
agtttagttgaatcttatgatgaagtgcaaatttataaagctaaaataaaagagattgcg
gaggagcagagaactattcttgataattatgaaagaattagcaataaagagagtatatta
aagagtactatagaatctgttgataaaaattttgatttgataaatgaagtggaaaaaaga
tttaatactttaagcaaagaaagtgctaagtttcaagacaatctcaaggatatggaaaat
attgtttcaaatctcttattaaacaaagggttgtctgaagaagtgttgattaatgctcaa
aatttaaaggaaatattattagatattgaaaataggttaaaaaatactttgattatgaga
gagaaggtggtgaaatctgagacaaggttggagaatttaaatactgcagcagaagagaga
ataaaaacccttggtattcttgtcaaaaccgattctaaatatcaagataatgttggtttt
aataatgaaactgttagaaattctgtaataaaattaatgaggcagggatggagtgctgaa
gaaatttctagagctaccaaattgtctattggggaagttgagcttattttagagcttggt
ataagcaataaaggtgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
